Doublet Group distance statistics: 52479

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 16, 19, 6, 7, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.015 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.010, 0.040, 0.069, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.040 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.026, 0.080, 0.134, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.080 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.027, 0.091, 0.156, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.091 std_dev=0.065
C4'	A	0, 0.046, 0.123, 0.200, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.123 std_dev=0.077
C3'	A	0, 0.047, 0.148, 0.249, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.148 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.029, 0.131, 0.232, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.131 std_dev=0.101
C5'	A	0, 0.071, 0.208, 0.346, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.208 std_dev=0.138
P	B	0, 0.229, 0.377, 0.524, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.377 std_dev=0.148
O5'	A	0, 0.135, 0.291, 0.447, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.291 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.080, 0.242, 0.403, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.242 std_dev=0.161
O5'	B	0, 0.496, 0.709, 0.922, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.709 std_dev=0.213
OP2	B	0, 0.242, 0.459, 0.677, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.459 std_dev=0.218
OP1	B	0, 0.256, 0.478, 0.699, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.478 std_dev=0.222
P	A	0, 0.044, 0.320, 0.596, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.320 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.421, 0.709, 0.996, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.709 std_dev=0.287
O3'	B	0, 1.178, 1.526, 1.874, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.526 std_dev=0.348
C4'	B	0, 0.232, 0.600, 0.968, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.600 std_dev=0.368
OP2	A	0, 1.287, 1.687, 2.087, 2.947 max_d=2.947 avg_d=1.687 std_dev=0.400
OP1	A	0, 1.153, 1.600, 2.046, 3.288 max_d=3.288 avg_d=1.600 std_dev=0.446
C6	B	0, 0.284, 0.740, 1.195, 3.502 max_d=3.502 avg_d=0.740 std_dev=0.456
O4'	B	0, 0.294, 0.794, 1.293, 3.308 max_d=3.308 avg_d=0.794 std_dev=0.500
C1'	B	0, 0.303, 0.804, 1.306, 3.721 max_d=3.721 avg_d=0.804 std_dev=0.501
C2'	B	0, 0.237, 0.739, 1.241, 3.387 max_d=3.387 avg_d=0.739 std_dev=0.502
C5	B	0, 0.266, 0.778, 1.290, 3.950 max_d=3.950 avg_d=0.778 std_dev=0.512
N1	B	0, 0.271, 0.810, 1.348, 4.087 max_d=4.087 avg_d=0.810 std_dev=0.539
C5'	B	0, 0.041, 0.692, 1.344, 2.970 max_d=2.970 avg_d=0.692 std_dev=0.651
C4	B	0, 0.234, 0.895, 1.556, 5.074 max_d=5.074 avg_d=0.895 std_dev=0.661
C2	B	0, 0.243, 0.931, 1.618, 5.131 max_d=5.131 avg_d=0.931 std_dev=0.688
N3	B	0, 0.232, 0.970, 1.708, 5.554 max_d=5.554 avg_d=0.970 std_dev=0.738
O4	B	0, 0.189, 0.962, 1.736, 5.820 max_d=5.820 avg_d=0.962 std_dev=0.773
O2	B	0, 0.242, 1.022, 1.801, 5.676 max_d=5.676 avg_d=1.022 std_dev=0.780
O2'	B	0, 0.186, 1.099, 2.012, 4.818 max_d=4.818 avg_d=1.099 std_dev=0.913

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.18	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.08	0.12	0.23	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.11	0.24	0.10
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.24	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.11	0.16	0.27	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.05
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.12	0.16	0.26	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.09	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.11	0.14	0.21	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.11	0.20	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.09	0.14	0.25	0.13
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.12	0.18	0.29	0.16
O2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.03	0.07	0.12	0.24	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.04	0.02	0.03	0.10	0.24	0.09
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.07	0.03	0.06	0.09	0.08	0.04	0.00	0.02	0.07	0.18	0.27	0.13
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.10	0.14	0.06
O5'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.11	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.09	0.12	0.07	0.03	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.12	0.11	0.13	0.16	0.06	0.16	0.05	0.14	0.11	0.14	0.18	0.12	0.10	0.18	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.23	0.24	0.24	0.27	0.16	0.26	0.10	0.21	0.20	0.25	0.29	0.24	0.24	0.27	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.10	0.11	0.14	0.05	0.14	0.01	0.11	0.09	0.13	0.16	0.11	0.09	0.13	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.36	0.41	0.15	0.25	0.23	0.17	0.50	0.18	0.27	0.35	0.46	0.91	0.09	0.29	0.18	0.13	0.17	0.18	0.10
C2	0.26	0.32	0.47	0.14	0.24	0.26	0.19	0.52	0.18	0.23	0.31	0.39	0.93	0.14	0.28	0.26	0.13	0.18	0.20	0.10
C2'	0.25	0.31	0.34	0.13	0.21	0.26	0.14	0.58	0.14	0.21	0.29	0.40	0.78	0.10	0.25	0.17	0.14	0.16	0.17	0.09
C3'	0.21	0.25	0.25	0.13	0.17	0.26	0.13	0.59	0.12	0.17	0.24	0.33	0.63	0.11	0.20	0.14	0.14	0.18	0.16	0.10
C4	0.23	0.26	0.50	0.16	0.23	0.25	0.21	0.46	0.21	0.21	0.26	0.30	0.84	0.17	0.25	0.34	0.13	0.19	0.21	0.10
C4'	0.29	0.32	0.25	0.13	0.22	0.20	0.16	0.47	0.16	0.24	0.30	0.41	0.67	0.06	0.25	0.14	0.12	0.18	0.17	0.10
C5	0.24	0.24	0.49	0.16	0.19	0.25	0.18	0.46	0.18	0.20	0.23	0.29	0.83	0.15	0.21	0.30	0.12	0.17	0.19	0.10
C5'	0.26	0.27	0.16	0.13	0.21	0.18	0.16	0.42	0.16	0.21	0.26	0.34	0.48	0.09	0.23	0.14	0.11	0.22	0.17	0.11
C6	0.27	0.28	0.46	0.15	0.20	0.25	0.16	0.48	0.16	0.22	0.26	0.34	0.90	0.12	0.22	0.23	0.12	0.17	0.19	0.11
N1	0.28	0.32	0.45	0.14	0.23	0.25	0.17	0.51	0.17	0.24	0.30	0.40	0.93	0.11	0.26	0.22	0.12	0.17	0.19	0.10
N3	0.24	0.29	0.49	0.14	0.24	0.26	0.21	0.50	0.20	0.22	0.29	0.35	0.90	0.16	0.28	0.31	0.14	0.20	0.22	0.11
N4	0.22	0.25	0.49	0.18	0.26	0.24	0.26	0.39	0.24	0.22	0.26	0.27	0.77	0.19	0.28	0.39	0.15	0.23	0.25	0.13
O2	0.27	0.34	0.46	0.13	0.26	0.26	0.19	0.53	0.19	0.25	0.34	0.43	0.94	0.14	0.30	0.25	0.13	0.18	0.20	0.10
O2'	0.30	0.38	0.34	0.13	0.27	0.24	0.17	0.55	0.17	0.26	0.37	0.49	0.81	0.08	0.31	0.15	0.13	0.16	0.17	0.09
O3'	0.20	0.25	0.20	0.14	0.18	0.27	0.13	0.61	0.12	0.16	0.24	0.33	0.52	0.12	0.21	0.13	0.15	0.20	0.17	0.12
O4'	0.36	0.38	0.37	0.16	0.26	0.21	0.18	0.44	0.19	0.29	0.35	0.48	0.88	0.12	0.29	0.19	0.14	0.18	0.19	0.12
O5'	0.21	0.21	0.19	0.09	0.18	0.18	0.15	0.44	0.14	0.17	0.21	0.26	0.47	0.01	0.19	0.10	0.14	0.23	0.18	0.13
OP1	0.26	0.34	0.33	0.13	0.34	0.11	0.29	0.33	0.27	0.29	0.36	0.36	0.39	0.02	0.35	0.19	0.17	0.29	0.19	0.16
OP2	0.11	0.11	0.08	0.13	0.10	0.28	0.12	0.55	0.13	0.10	0.11	0.14	0.19	0.02	0.11	0.22	0.38	0.43	0.40	0.37
P	0.12	0.14	0.12	0.01	0.13	0.14	0.10	0.38	0.09	0.11	0.14	0.17	0.20	0.01	0.14	0.08	0.18	0.28	0.22	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.19	0.01	0.00	0.19	0.21	0.29	0.17
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.25	0.20	0.30	0.19
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.13	0.20	0.15	0.03	0.06	0.21	0.00	0.03	0.07	0.02	0.29	0.37	0.42	0.32
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.09	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.26	0.31	0.24	0.23
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.10	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.00	0.02	0.30	0.26	0.34	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.06	0.06	0.06	0.13	0.02	0.10	0.00	0.01	0.19	0.23	0.06
C5	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.13	0.00	0.43	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.01	0.05	0.30	0.28	0.36	0.27
C5'	0.13	0.25	0.20	0.02	0.39	0.00	0.43	0.00	0.40	0.27	0.32	0.17	0.10	0.17	0.40	0.02	0.01	0.29	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.15	0.08	0.01	0.12	0.00	0.40	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.13	0.01	0.07	0.28	0.24	0.35	0.24
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.01	0.24	0.21	0.31	0.19
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.13	0.01	0.05	0.28	0.22	0.32	0.22
O2	0.03	0.00	0.21	0.12	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.17	0.01	0.10	0.22	0.20	0.29	0.17
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.17	0.13	0.21	0.10	0.19	0.09	0.13	0.21	0.00	0.07	0.19	0.07	0.25	0.42	0.49	0.34
O3'	0.19	0.14	0.03	0.01	0.11	0.02	0.12	0.17	0.13	0.14	0.13	0.17	0.07	0.00	0.12	0.19	0.19	0.32	0.19	0.18
O4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.00	0.03	0.31	0.28	0.35	0.28
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.05	0.10	0.07	0.19	0.03	0.00	0.37	0.42	0.47	0.40
O5'	0.19	0.25	0.29	0.26	0.30	0.01	0.30	0.01	0.28	0.24	0.28	0.22	0.25	0.19	0.31	0.37	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.21	0.20	0.37	0.31	0.26	0.19	0.28	0.29	0.24	0.21	0.22	0.20	0.42	0.32	0.28	0.42	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.30	0.42	0.24	0.34	0.23	0.36	0.22	0.35	0.31	0.32	0.29	0.49	0.19	0.35	0.47	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.19	0.32	0.23	0.26	0.06	0.27	0.01	0.24	0.19	0.22	0.17	0.34	0.18	0.28	0.40	0.00	0.00	0.01	0.00