Doublet Group distance statistics: 52482

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 9, 13, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.008, 0.012, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.010, 0.016, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.014, 0.021, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.013, 0.021, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.021, 0.038, 0.055, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.032, 0.052, 0.072, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.052 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.027, 0.067, 0.108, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.067 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.043, 0.091, 0.140, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.091 std_dev=0.049
C4'	A	0, 0.065, 0.116, 0.168, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.116 std_dev=0.051
C3'	A	0, 0.051, 0.103, 0.154, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.103 std_dev=0.052
O3'	A	0, 0.078, 0.151, 0.224, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.151 std_dev=0.073
C5'	A	0, 0.108, 0.193, 0.277, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.193 std_dev=0.085
C5'	B	0, 0.169, 0.268, 0.367, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.268 std_dev=0.099
O2'	A	0, 0.093, 0.194, 0.296, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.194 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.147, 0.249, 0.351, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.249 std_dev=0.102
OP1	B	0, 0.251, 0.356, 0.461, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.356 std_dev=0.105
P	B	0, 0.270, 0.383, 0.497, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.383 std_dev=0.114
O5'	B	0, 0.197, 0.318, 0.440, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.318 std_dev=0.121
O3'	B	0, 0.112, 0.234, 0.356, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.234 std_dev=0.122
C4'	B	0, 0.166, 0.290, 0.414, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.290 std_dev=0.124
P	A	0, 0.212, 0.342, 0.472, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.342 std_dev=0.130
C3'	B	0, 0.139, 0.278, 0.417, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.278 std_dev=0.139
OP2	B	0, 0.357, 0.499, 0.641, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.499 std_dev=0.142
OP1	A	0, 0.200, 0.359, 0.518, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.359 std_dev=0.159
OP2	A	0, 0.241, 0.402, 0.563, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.402 std_dev=0.161
O4'	B	0, 0.221, 0.385, 0.548, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.385 std_dev=0.164
C2'	B	0, 0.219, 0.385, 0.551, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.385 std_dev=0.166
C1'	B	0, 0.261, 0.436, 0.611, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.436 std_dev=0.175
N1	B	0, 0.274, 0.466, 0.658, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.466 std_dev=0.192
O2'	B	0, 0.249, 0.442, 0.634, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.442 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.258, 0.453, 0.649, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.453 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.324, 0.540, 0.756, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.540 std_dev=0.216
C5	B	0, 0.288, 0.510, 0.731, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.510 std_dev=0.222
O2	B	0, 0.328, 0.559, 0.790, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.559 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.365, 0.599, 0.832, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.599 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.349, 0.588, 0.827, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.588 std_dev=0.239
O4	B	0, 0.379, 0.646, 0.913, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.646 std_dev=0.267

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.06	0.13	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.05	0.07	0.13	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.12	0.04
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.05
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.06	0.08	0.12	0.06
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.05
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.08	0.11	0.06
C5'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.07	0.11	0.05
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.13	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.05	0.08	0.13	0.06
N4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.09	0.11	0.06
O2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.03	0.05	0.08	0.15	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.05	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.13	0.04
O3'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.14	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.06	0.12	0.05
O5'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.07	0.03	0.03	0.08	0.04	0.08	0.02	0.07	0.06	0.08	0.09	0.08	0.03	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.04	0.11	0.13	0.13	0.11	0.15	0.13	0.14	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.06	0.01	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.06	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.10	0.07	0.06	0.06	0.07	0.11	0.12	0.09
C2	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.06	0.07	0.08	0.11	0.11	0.09
C2'	0.07	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.11	0.06	0.05	0.06	0.08	0.12	0.13	0.10
C3'	0.07	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.11	0.06	0.06	0.06	0.08	0.13	0.14	0.10
C4	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.06	0.06	0.07	0.10	0.10	0.08
C4'	0.07	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.10	0.07	0.06	0.06	0.08	0.13	0.14	0.10
C5	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.07
C5'	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.06	0.08	0.09	0.06	0.08	0.07	0.10	0.16	0.16	0.13
C6	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.09	0.07	0.09	0.08	0.08	0.09	0.11	0.09	0.08	0.07	0.07	0.11	0.11	0.08
N1	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06	0.06	0.07	0.11	0.11	0.08
N3	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.05	0.06	0.07	0.08	0.11	0.10	0.09
N4	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.10	0.06	0.07	0.07	0.07	0.12	0.10	0.09
O2	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08	0.09	0.09	0.11	0.11	0.10
O2'	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.10	0.06	0.07	0.06	0.08	0.11	0.13	0.09
O3'	0.06	0.06	0.07	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.10	0.06	0.05	0.06	0.08	0.12	0.13	0.10
O4'	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.07	0.11	0.13	0.09
O5'	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.07	0.07	0.08	0.10	0.07	0.09	0.06	0.07	0.11	0.13	0.08
OP1	0.09	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.07	0.12	0.07
OP2	0.10	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.15	0.15	0.13
P	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.08	0.09	0.06	0.08	0.06	0.06	0.09	0.12	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.02
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.05	0.06	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.05	0.03
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.07	0.08	0.07
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.07	0.08	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.06	0.07	0.05
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.07	0.05
O2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.03
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.08	0.06
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.07	0.08	0.09	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.04
O5'	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.05	0.05	0.07	0.07	0.04	0.07	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.08	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.06	0.05	0.06	0.08	0.02	0.08	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.08	0.09	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.03	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00