Doublet Group distance statistics: 52483

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 3, 7, 1, 5, 5, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.014, 0.037, 0.061, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.016, 0.045, 0.074, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.045 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.034, 0.101, 0.167, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.101 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.033, 0.122, 0.210, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.122 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.061, 0.158, 0.256, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.158 std_dev=0.098
C3'	A	0, 0.048, 0.173, 0.298, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.173 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.036, 0.182, 0.329, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.182 std_dev=0.146
O3'	A	0, 0.097, 0.261, 0.425, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.261 std_dev=0.164
C5'	A	0, 0.083, 0.284, 0.486, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.284 std_dev=0.202
OP1	B	0, 0.115, 0.330, 0.546, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.330 std_dev=0.215
P	B	0, 0.119, 0.343, 0.567, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.343 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.148, 0.424, 0.701, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.424 std_dev=0.276
C5'	B	0, 0.160, 0.452, 0.745, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.452 std_dev=0.292
OP2	B	0, 0.123, 0.433, 0.743, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.433 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.084, 0.407, 0.730, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.407 std_dev=0.323
P	A	0, 0.072, 0.399, 0.726, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.399 std_dev=0.327
O5'	B	0, 0.104, 0.461, 0.818, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.461 std_dev=0.357
O5'	A	0, 0.039, 0.396, 0.754, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.396 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.152, 0.512, 0.872, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.512 std_dev=0.360
O4'	B	0, 0.139, 0.501, 0.863, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.501 std_dev=0.362
C2'	B	0, 0.095, 0.470, 0.845, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.470 std_dev=0.375
O3'	B	0, 0.059, 0.479, 0.898, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.479 std_dev=0.420
N1	B	0, 0.158, 0.591, 1.025, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.591 std_dev=0.433
OP2	A	0, 0.063, 0.528, 0.994, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.528 std_dev=0.466
C6	B	0, 0.104, 0.603, 1.102, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.603 std_dev=0.499
O2'	B	0, 0.009, 0.522, 1.035, 2.298 max_d=2.298 avg_d=0.522 std_dev=0.513
C2	B	0, 0.153, 0.720, 1.286, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.720 std_dev=0.567
C5	B	0, 0.096, 0.683, 1.269, 2.505 max_d=2.505 avg_d=0.683 std_dev=0.587
OP1	A	0, 0.038, 0.637, 1.237, 2.807 max_d=2.807 avg_d=0.637 std_dev=0.600
C4	B	0, 0.136, 0.783, 1.431, 2.470 max_d=2.470 avg_d=0.783 std_dev=0.648
O2	B	0, 0.130, 0.794, 1.458, 2.533 max_d=2.533 avg_d=0.794 std_dev=0.664
N3	B	0, 0.138, 0.811, 1.484, 2.611 max_d=2.611 avg_d=0.811 std_dev=0.673
O4	B	0, 0.132, 0.911, 1.689, 2.934 max_d=2.934 avg_d=0.911 std_dev=0.779

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.20	0.31	0.28	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.03	0.31	0.45	0.37	0.14
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.09	0.33	0.27	0.12
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.04	0.06	0.09	0.02	0.01	0.02	0.06	0.29	0.24	0.13
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.37	0.53	0.41	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.20	0.18	0.06
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.38	0.51	0.40	0.19
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.13	0.06	0.06	0.05	0.02	0.01	0.19	0.09	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.36	0.44	0.37	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.30	0.41	0.34	0.13
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.35	0.51	0.40	0.17
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.04	0.38	0.56	0.43	0.21
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.04	0.28	0.43	0.35	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.07	0.05	0.11	0.00	0.05	0.05	0.04	0.29	0.25	0.12
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.05	0.09	0.03	0.06	0.08	0.11	0.05	0.00	0.01	0.19	0.27	0.29	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.00	0.20	0.22	0.24	0.07
O5'	0.20	0.31	0.09	0.06	0.37	0.02	0.38	0.01	0.36	0.30	0.35	0.38	0.28	0.04	0.19	0.20	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.31	0.45	0.33	0.29	0.53	0.20	0.51	0.19	0.44	0.41	0.51	0.56	0.43	0.29	0.27	0.22	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.37	0.27	0.24	0.41	0.18	0.40	0.09	0.37	0.34	0.40	0.43	0.35	0.25	0.29	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.12	0.13	0.19	0.06	0.19	0.01	0.16	0.13	0.17	0.21	0.14	0.12	0.19	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.30	0.28	0.10	0.35	0.12	0.39	0.26	0.35	0.28	0.33	0.34	0.42	0.28	0.39	0.12	0.20	0.13	0.18	0.09
C2	0.23	0.29	0.31	0.14	0.35	0.13	0.37	0.25	0.33	0.28	0.32	0.29	0.42	0.31	0.38	0.19	0.18	0.09	0.15	0.07
C2'	0.15	0.21	0.21	0.10	0.28	0.20	0.33	0.36	0.30	0.20	0.24	0.25	0.32	0.27	0.31	0.15	0.12	0.15	0.22	0.11
C3'	0.12	0.16	0.17	0.12	0.20	0.24	0.27	0.39	0.26	0.15	0.17	0.22	0.26	0.26	0.22	0.17	0.15	0.18	0.27	0.16
C4	0.26	0.30	0.34	0.19	0.33	0.16	0.32	0.22	0.29	0.28	0.32	0.30	0.41	0.30	0.36	0.25	0.20	0.09	0.16	0.09
C4'	0.17	0.26	0.19	0.08	0.25	0.15	0.29	0.28	0.27	0.21	0.27	0.34	0.32	0.23	0.28	0.09	0.18	0.15	0.23	0.10
C5	0.25	0.28	0.33	0.18	0.31	0.15	0.31	0.23	0.29	0.27	0.30	0.28	0.41	0.31	0.33	0.22	0.20	0.12	0.18	0.07
C5'	0.17	0.24	0.18	0.10	0.21	0.15	0.24	0.25	0.23	0.19	0.23	0.32	0.27	0.19	0.23	0.11	0.20	0.15	0.27	0.12
C6	0.23	0.28	0.31	0.14	0.32	0.13	0.34	0.24	0.32	0.27	0.30	0.29	0.42	0.31	0.34	0.17	0.20	0.14	0.20	0.08
N1	0.23	0.29	0.30	0.12	0.34	0.12	0.37	0.25	0.34	0.28	0.31	0.30	0.42	0.30	0.37	0.16	0.19	0.12	0.17	0.07
N3	0.25	0.30	0.33	0.17	0.35	0.14	0.35	0.23	0.31	0.28	0.33	0.29	0.42	0.31	0.38	0.23	0.19	0.09	0.16	0.09
N4	0.28	0.33	0.35	0.21	0.34	0.19	0.31	0.21	0.28	0.30	0.35	0.33	0.40	0.29	0.37	0.29	0.22	0.13	0.20	0.15
O2	0.23	0.29	0.30	0.14	0.37	0.13	0.39	0.25	0.34	0.28	0.33	0.30	0.42	0.31	0.40	0.18	0.17	0.09	0.15	0.07
O2'	0.15	0.25	0.20	0.08	0.30	0.19	0.35	0.35	0.31	0.21	0.28	0.31	0.33	0.26	0.35	0.12	0.14	0.14	0.19	0.10
O3'	0.15	0.18	0.17	0.16	0.19	0.28	0.26	0.43	0.25	0.16	0.18	0.26	0.25	0.24	0.21	0.22	0.19	0.21	0.30	0.20
O4'	0.25	0.33	0.28	0.09	0.35	0.10	0.38	0.22	0.35	0.29	0.35	0.39	0.43	0.26	0.38	0.11	0.26	0.17	0.19	0.12
O5'	0.17	0.21	0.23	0.22	0.24	0.11	0.25	0.25	0.23	0.20	0.22	0.24	0.24	0.02	0.26	0.08	0.29	0.28	0.38	0.27
OP1	0.35	0.32	0.34	0.25	0.32	0.42	0.37	0.49	0.39	0.34	0.31	0.36	0.44	0.03	0.32	0.42	0.46	0.55	0.52	0.49
OP2	0.13	0.15	0.09	0.15	0.13	0.21	0.15	0.33	0.15	0.12	0.13	0.20	0.09	0.02	0.14	0.18	0.27	0.40	0.41	0.31
P	0.07	0.10	0.07	0.03	0.09	0.15	0.12	0.21	0.12	0.07	0.09	0.15	0.17	0.01	0.10	0.12	0.12	0.20	0.29	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.17	0.03	0.00	0.12	0.11	0.49	0.17
C2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.18	0.01	0.10	0.17	0.26	0.54	0.30
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.11	0.08	0.02	0.07	0.14	0.00	0.03	0.06	0.02	0.35	0.18	0.38	0.17
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.12	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.13	0.01	0.22	0.15	0.34	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.09	0.00	0.03	0.28	0.24	0.38	0.22
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.13	0.04	0.05	0.12	0.10	0.03	0.08	0.01	0.02	0.08	0.38	0.10
C5	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.12	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.07	0.01	0.08	0.39	0.18	0.28	0.17
C5'	0.05	0.11	0.11	0.01	0.20	0.01	0.27	0.00	0.26	0.13	0.14	0.15	0.05	0.08	0.21	0.02	0.01	0.08	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.13	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.06	0.01	0.10	0.39	0.13	0.32	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.02	0.20	0.15	0.46	0.17
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.14	0.01	0.07	0.21	0.28	0.50	0.29
O2	0.03	0.01	0.14	0.07	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.27	0.01	0.16	0.22	0.30	0.60	0.38
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.18	0.10	0.20	0.05	0.19	0.10	0.18	0.23	0.00	0.07	0.21	0.06	0.36	0.20	0.35	0.19
O3'	0.17	0.18	0.03	0.01	0.09	0.03	0.07	0.08	0.06	0.11	0.14	0.27	0.07	0.00	0.10	0.14	0.16	0.26	0.37	0.15
O4	0.03	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.10	0.00	0.03	0.30	0.27	0.36	0.25
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.07	0.16	0.06	0.14	0.03	0.00	0.11	0.19	0.57	0.28
O5'	0.12	0.17	0.35	0.22	0.28	0.02	0.39	0.01	0.39	0.20	0.21	0.22	0.36	0.16	0.30	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.26	0.18	0.15	0.24	0.08	0.18	0.08	0.13	0.15	0.28	0.30	0.20	0.26	0.27	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.49	0.54	0.38	0.34	0.38	0.38	0.28	0.19	0.32	0.46	0.50	0.60	0.35	0.37	0.36	0.57	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.30	0.17	0.08	0.22	0.10	0.17	0.01	0.12	0.17	0.29	0.38	0.19	0.15	0.25	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00