Doublet Group distance statistics: 52484

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 4, 7, 7, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.016 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.034 std_dev=0.025
P	B	0, 0.327, 0.493, 0.660, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.493 std_dev=0.167
OP2	B	0, 0.369, 0.540, 0.711, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.540 std_dev=0.171
OP1	B	0, 0.390, 0.572, 0.754, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.572 std_dev=0.182
O5'	B	0, 0.233, 0.439, 0.644, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.439 std_dev=0.206
C5'	B	0, 0.224, 0.462, 0.700, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.462 std_dev=0.238
OP2	A	0, 0.238, 0.524, 0.810, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.524 std_dev=0.286
C4'	B	0, 0.143, 0.465, 0.787, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.465 std_dev=0.322
C3'	B	0, 0.109, 0.458, 0.808, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.458 std_dev=0.349
O4'	A	0, -0.097, 0.280, 0.658, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.280 std_dev=0.377
P	A	0, 0.099, 0.482, 0.866, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.482 std_dev=0.383
C2'	A	0, -0.123, 0.293, 0.709, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.293 std_dev=0.416
O3'	B	0, 0.122, 0.544, 0.965, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.544 std_dev=0.421
O4'	B	0, 0.124, 0.546, 0.968, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.546 std_dev=0.422
O5'	A	0, -0.007, 0.435, 0.877, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.435 std_dev=0.442
C6	B	0, 0.082, 0.534, 0.987, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.534 std_dev=0.452
C2'	B	0, 0.064, 0.562, 1.061, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.562 std_dev=0.499
OP1	A	0, 0.074, 0.575, 1.077, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.575 std_dev=0.502
C1'	B	0, 0.056, 0.559, 1.063, 2.024 max_d=2.024 avg_d=0.559 std_dev=0.504
N1	B	0, 0.035, 0.559, 1.083, 2.132 max_d=2.132 avg_d=0.559 std_dev=0.524
C5	B	0, 0.031, 0.558, 1.086, 2.132 max_d=2.132 avg_d=0.558 std_dev=0.527
C4'	A	0, -0.109, 0.471, 1.052, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.471 std_dev=0.581
O2'	A	0, -0.166, 0.483, 1.132, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.483 std_dev=0.649
C2	B	0, -0.013, 0.636, 1.285, 2.614 max_d=2.614 avg_d=0.636 std_dev=0.649
C3'	A	0, -0.198, 0.473, 1.143, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.473 std_dev=0.671
C4	B	0, -0.050, 0.625, 1.300, 2.701 max_d=2.701 avg_d=0.625 std_dev=0.675
C5'	A	0, -0.070, 0.609, 1.288, 2.358 max_d=2.358 avg_d=0.609 std_dev=0.679
O2	B	0, 0.046, 0.731, 1.416, 2.880 max_d=2.880 avg_d=0.731 std_dev=0.685
O2'	B	0, -0.013, 0.702, 1.416, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.702 std_dev=0.714
N3	B	0, -0.063, 0.659, 1.382, 2.822 max_d=2.822 avg_d=0.659 std_dev=0.723
O4	B	0, -0.091, 0.705, 1.501, 3.218 max_d=3.218 avg_d=0.705 std_dev=0.796
O3'	A	0, -0.371, 0.731, 1.834, 3.008 max_d=3.008 avg_d=0.731 std_dev=1.102

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.26	0.00	0.23	0.20	0.26	0.19
C2	0.02	0.00	0.15	0.21	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.09	0.11	0.25	0.22	0.27	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.03	0.01	0.12	0.20	0.16	0.02	0.11	0.03	0.26	0.00	0.01	0.01	0.50	0.52	0.53	0.48
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.32	0.00	0.31	0.01	0.26	0.20	0.28	0.35	0.15	0.02	0.01	0.02	0.17	0.23	0.17	0.13
C4	0.02	0.01	0.03	0.32	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.30	0.16	0.04	0.29	0.25	0.30	0.25
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.06	0.05	0.09	0.05	0.28	0.02	0.00	0.01	0.10	0.17	0.02
C5	0.01	0.01	0.12	0.31	0.00	0.13	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.35	0.22	0.06	0.30	0.26	0.30	0.26
C5'	0.08	0.09	0.20	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.07	0.09	0.10	0.12	0.08	0.19	0.01	0.01	0.12	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.16	0.26	0.00	0.13	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.16	0.10	0.29	0.24	0.28	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.20	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.02	0.25	0.22	0.27	0.21
N3	0.02	0.01	0.11	0.28	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.21	0.06	0.10	0.27	0.23	0.28	0.24
N4	0.02	0.02	0.03	0.35	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.32	0.21	0.04	0.30	0.26	0.31	0.27
O2	0.03	0.01	0.26	0.15	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.23	0.17	0.23	0.21	0.26	0.20
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.30	0.28	0.35	0.08	0.32	0.18	0.21	0.32	0.14	0.00	0.03	0.20	0.41	0.44	0.58	0.41
O3'	0.26	0.09	0.01	0.01	0.16	0.02	0.22	0.19	0.16	0.06	0.06	0.21	0.23	0.03	0.00	0.20	0.18	0.37	0.35	0.26
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.17	0.20	0.20	0.00	0.06	0.08	0.16	0.05
O5'	0.23	0.25	0.50	0.17	0.29	0.01	0.30	0.01	0.29	0.25	0.27	0.30	0.23	0.41	0.18	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.20	0.22	0.52	0.23	0.25	0.10	0.26	0.12	0.24	0.22	0.23	0.26	0.21	0.44	0.37	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.27	0.53	0.17	0.30	0.17	0.30	0.20	0.28	0.27	0.28	0.31	0.26	0.58	0.35	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.21	0.48	0.13	0.25	0.02	0.26	0.01	0.23	0.21	0.24	0.27	0.20	0.41	0.26	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.53	0.18	0.12	0.69	0.13	0.54	0.17	0.41	0.39	0.68	0.49	0.47	0.16	0.77	0.20	0.20	0.18	0.18	0.14
C2	0.12	0.21	0.23	0.17	0.44	0.15	0.34	0.16	0.19	0.13	0.35	0.20	0.45	0.18	0.57	0.15	0.22	0.22	0.13	0.15
C2'	0.11	0.50	0.11	0.26	0.70	0.24	0.50	0.31	0.31	0.30	0.69	0.49	0.40	0.39	0.85	0.12	0.32	0.37	0.14	0.22
C3'	0.18	0.43	0.11	0.14	0.63	0.15	0.55	0.23	0.42	0.34	0.57	0.40	0.36	0.15	0.73	0.17	0.23	0.23	0.45	0.28
C4	0.19	0.17	0.28	0.21	0.25	0.20	0.19	0.20	0.14	0.15	0.22	0.19	0.39	0.21	0.33	0.23	0.27	0.27	0.13	0.19
C4'	0.14	0.37	0.10	0.13	0.47	0.13	0.38	0.18	0.28	0.26	0.47	0.39	0.35	0.15	0.54	0.11	0.21	0.17	0.27	0.17
C5	0.13	0.22	0.24	0.15	0.36	0.15	0.32	0.18	0.22	0.17	0.30	0.21	0.35	0.19	0.42	0.18	0.23	0.23	0.19	0.15
C5'	0.19	0.37	0.21	0.19	0.39	0.19	0.30	0.21	0.23	0.26	0.42	0.41	0.26	0.22	0.44	0.17	0.22	0.16	0.22	0.14
C6	0.17	0.36	0.22	0.09	0.51	0.12	0.45	0.17	0.34	0.29	0.46	0.32	0.40	0.14	0.56	0.17	0.21	0.19	0.22	0.14
N1	0.15	0.36	0.19	0.11	0.57	0.12	0.47	0.16	0.32	0.26	0.51	0.32	0.44	0.15	0.65	0.15	0.20	0.20	0.17	0.13
N3	0.19	0.17	0.28	0.21	0.27	0.20	0.19	0.18	0.14	0.14	0.22	0.19	0.43	0.20	0.38	0.22	0.25	0.26	0.14	0.18
N4	0.27	0.24	0.31	0.25	0.23	0.25	0.21	0.23	0.23	0.25	0.24	0.25	0.38	0.24	0.26	0.31	0.31	0.32	0.20	0.25
O2	0.12	0.21	0.23	0.18	0.45	0.15	0.34	0.15	0.20	0.14	0.37	0.20	0.47	0.19	0.62	0.15	0.21	0.22	0.13	0.15
O2'	0.33	0.74	0.23	0.17	0.79	0.17	0.52	0.30	0.38	0.48	0.89	0.81	0.45	0.27	0.92	0.19	0.38	0.55	0.28	0.37
O3'	0.14	0.30	0.12	0.13	0.38	0.14	0.31	0.23	0.23	0.19	0.37	0.36	0.40	0.15	0.45	0.10	0.23	0.30	0.40	0.28
O4'	0.21	0.42	0.16	0.16	0.49	0.17	0.40	0.20	0.32	0.31	0.50	0.41	0.46	0.15	0.53	0.20	0.22	0.17	0.23	0.18
O5'	0.25	0.35	0.27	0.11	0.45	0.09	0.40	0.19	0.34	0.32	0.42	0.32	0.43	0.02	0.49	0.15	0.21	0.22	0.32	0.21
OP1	0.13	0.20	0.16	0.03	0.29	0.06	0.25	0.20	0.20	0.17	0.26	0.19	0.21	0.01	0.33	0.05	0.17	0.18	0.20	0.13
OP2	0.08	0.13	0.15	0.10	0.24	0.22	0.22	0.38	0.15	0.09	0.20	0.11	0.26	0.02	0.28	0.18	0.24	0.23	0.25	0.20
P	0.09	0.18	0.13	0.01	0.28	0.08	0.25	0.22	0.20	0.15	0.24	0.15	0.22	0.00	0.31	0.03	0.17	0.18	0.22	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.05	0.06	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.12	0.02	0.03	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.06	0.14	0.14	0.17	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.02	0.12	0.06	0.13	0.03	0.06	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.14	0.14	0.19	0.14
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.01	0.13	0.09	0.13	0.13	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.15	0.11	0.12
C4	0.02	0.02	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.00	0.03	0.21	0.23	0.28	0.22
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.13	0.02	0.08	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03
C5	0.02	0.02	0.12	0.14	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.17	0.01	0.04	0.23	0.24	0.27	0.23
C5'	0.03	0.10	0.06	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.13	0.08	0.08	0.09	0.18	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.13	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.01	0.05	0.20	0.19	0.20	0.18
N1	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.02	0.14	0.13	0.15	0.13
N3	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.11	0.02	0.05	0.17	0.18	0.23	0.18
O2	0.05	0.01	0.16	0.13	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.09	0.03	0.09	0.12	0.12	0.15	0.12
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.14	0.13	0.17	0.08	0.16	0.07	0.09	0.14	0.00	0.04	0.15	0.10	0.10	0.13	0.19	0.10
O3'	0.07	0.08	0.01	0.01	0.15	0.02	0.17	0.09	0.14	0.06	0.11	0.09	0.04	0.00	0.17	0.05	0.17	0.24	0.18	0.17
O4	0.02	0.02	0.08	0.15	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.03	0.15	0.17	0.00	0.04	0.23	0.26	0.32	0.24
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.09	0.10	0.05	0.04	0.00	0.15	0.16	0.20	0.16
O5'	0.05	0.14	0.14	0.16	0.21	0.01	0.23	0.01	0.20	0.14	0.17	0.12	0.10	0.17	0.23	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.14	0.14	0.15	0.23	0.07	0.24	0.11	0.19	0.13	0.18	0.12	0.13	0.24	0.26	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.17	0.19	0.11	0.28	0.10	0.27	0.12	0.20	0.15	0.23	0.15	0.19	0.18	0.32	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.14	0.12	0.22	0.03	0.23	0.01	0.18	0.13	0.18	0.12	0.10	0.17	0.24	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00