Doublet Group distance statistics: 52486

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 3, 4, 4, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.016, 0.026, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.025, 0.035, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.035 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.015, 0.024, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.029, 0.040, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.040 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.034, 0.047, 0.059, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.047 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.028, 0.042, 0.055, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.042 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.039, 0.053, 0.067, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.053 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.049, 0.076, 0.103, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.076 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.046, 0.082, 0.118, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.082 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.114, 0.201, 0.288, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.201 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.181, 0.274, 0.367, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.274 std_dev=0.093
C3'	A	0, 0.255, 0.395, 0.535, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.395 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.246, 0.391, 0.537, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.391 std_dev=0.145
O3'	B	0, 0.242, 0.392, 0.542, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.392 std_dev=0.150
O3'	A	0, 0.271, 0.423, 0.574, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.423 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.223, 0.381, 0.540, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.381 std_dev=0.159
C3'	B	0, 0.282, 0.450, 0.619, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.450 std_dev=0.168
C4'	B	0, 0.338, 0.516, 0.694, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.516 std_dev=0.178
P	B	0, 0.381, 0.577, 0.773, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.577 std_dev=0.196
C5'	A	0, 0.321, 0.525, 0.729, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.525 std_dev=0.204
C5'	B	0, 0.337, 0.542, 0.747, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.542 std_dev=0.205
O5'	B	0, 0.477, 0.689, 0.900, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.689 std_dev=0.211
OP2	B	0, 0.259, 0.475, 0.691, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.475 std_dev=0.216
O5'	A	0, 0.317, 0.536, 0.755, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.536 std_dev=0.219
C2'	B	0, 0.425, 0.648, 0.871, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.648 std_dev=0.223
O2'	B	0, 0.338, 0.573, 0.808, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.573 std_dev=0.235
P	A	0, 0.411, 0.651, 0.891, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.651 std_dev=0.240
OP1	B	0, 0.333, 0.591, 0.849, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.591 std_dev=0.258
O4'	B	0, 0.488, 0.751, 1.015, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.751 std_dev=0.263
OP1	A	0, 0.388, 0.666, 0.944, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.666 std_dev=0.278
C1'	B	0, 0.534, 0.815, 1.097, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.815 std_dev=0.282
OP2	A	0, 0.462, 0.765, 1.068, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.765 std_dev=0.303
N1	B	0, 0.634, 0.979, 1.325, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.979 std_dev=0.346
O2	B	0, 0.634, 0.989, 1.345, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.989 std_dev=0.355
C2	B	0, 0.666, 1.037, 1.407, 1.453 max_d=1.453 avg_d=1.037 std_dev=0.371
C6	B	0, 0.662, 1.053, 1.444, 1.501 max_d=1.501 avg_d=1.053 std_dev=0.391
N3	B	0, 0.724, 1.153, 1.582, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.153 std_dev=0.429
C5	B	0, 0.719, 1.175, 1.632, 1.755 max_d=1.755 avg_d=1.175 std_dev=0.457
C4	B	0, 0.759, 1.234, 1.708, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.234 std_dev=0.474
O4	B	0, 0.815, 1.335, 1.854, 2.025 max_d=2.025 avg_d=1.335 std_dev=0.519

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.11	0.13	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.03	0.17	0.16	0.18	0.13
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.09	0.08
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.13	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.03	0.23	0.24	0.25	0.22
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.14	0.09	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.05	0.24	0.23	0.25	0.22
C5'	0.04	0.06	0.06	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.08	0.11	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.09	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.06	0.23	0.17	0.20	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.18	0.14	0.16	0.12
N3	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.21	0.20	0.22	0.18
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.03	0.24	0.27	0.28	0.24
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.07	0.14	0.15	0.15	0.10
O2'	0.04	0.06	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.08	0.09	0.00	0.06	0.03	0.10	0.13	0.10	0.10
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.11	0.06	0.00	0.04	0.07	0.14	0.09	0.07
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03	0.04	0.00	0.08	0.20	0.11	0.09
O5'	0.11	0.17	0.09	0.06	0.23	0.01	0.24	0.01	0.23	0.18	0.21	0.24	0.14	0.10	0.07	0.08	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.13	0.16	0.12	0.13	0.24	0.14	0.23	0.09	0.17	0.14	0.20	0.27	0.15	0.13	0.14	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.18	0.09	0.08	0.25	0.09	0.25	0.09	0.20	0.16	0.22	0.28	0.15	0.10	0.09	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.08	0.06	0.22	0.05	0.22	0.03	0.17	0.12	0.18	0.24	0.10	0.10	0.07	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.09	0.14	0.09	0.09	0.10	0.14	0.11	0.09	0.10	0.11	0.10	0.12	0.15	0.09
C2	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13	0.13	0.14	0.12	0.12	0.12	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.11	0.17	0.13	0.11
C2'	0.10	0.12	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.14	0.08	0.09	0.12	0.15	0.11	0.08	0.11	0.11	0.12	0.13	0.16	0.11
C3'	0.09	0.10	0.08	0.09	0.08	0.12	0.09	0.15	0.08	0.08	0.09	0.13	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.13	0.18	0.11
C4	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.18	0.18	0.17	0.15	0.18	0.14	0.14
C4'	0.08	0.08	0.07	0.09	0.08	0.11	0.10	0.15	0.09	0.07	0.08	0.10	0.09	0.08	0.10	0.10	0.09	0.12	0.19	0.11
C5	0.15	0.15	0.16	0.16	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.14	0.15	0.17	0.17	0.16	0.15	0.15	0.11	0.13	0.15	0.09
C5'	0.09	0.10	0.08	0.10	0.10	0.13	0.12	0.17	0.12	0.09	0.09	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.10	0.13	0.22	0.12
C6	0.12	0.12	0.13	0.13	0.11	0.13	0.11	0.15	0.11	0.11	0.12	0.14	0.14	0.12	0.12	0.12	0.09	0.12	0.16	0.09
N1	0.11	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.10	0.11	0.14	0.13	0.11	0.11	0.12	0.09	0.13	0.14	0.09
N3	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.13	0.20	0.14	0.14
N4	0.21	0.22	0.21	0.21	0.23	0.22	0.23	0.22	0.22	0.21	0.22	0.22	0.20	0.22	0.23	0.22	0.20	0.24	0.18	0.20
O2	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.13	0.12	0.14	0.11	0.11	0.12	0.14	0.12	0.13	0.12	0.13	0.11	0.18	0.13	0.11
O2'	0.17	0.20	0.17	0.17	0.16	0.17	0.14	0.17	0.14	0.17	0.19	0.23	0.17	0.15	0.17	0.17	0.18	0.17	0.16	0.16
O3'	0.11	0.13	0.11	0.11	0.10	0.13	0.09	0.15	0.09	0.10	0.12	0.16	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.15	0.10
O4'	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.12	0.15	0.11	0.10	0.11	0.13	0.12	0.09	0.12	0.12	0.11	0.14	0.18	0.12
O5'	0.09	0.09	0.08	0.11	0.10	0.15	0.12	0.21	0.12	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.11	0.13	0.15	0.16	0.26	0.16
OP1	0.17	0.18	0.18	0.18	0.16	0.18	0.17	0.22	0.17	0.17	0.17	0.20	0.25	0.17	0.16	0.18	0.18	0.18	0.31	0.19
OP2	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.14	0.12	0.21	0.12	0.08	0.08	0.09	0.15	0.10	0.11	0.12	0.16	0.19	0.32	0.20
P	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.14	0.11	0.19	0.11	0.08	0.07	0.08	0.13	0.10	0.11	0.11	0.15	0.16	0.29	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.03	0.15	0.03	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.03	0.07	0.15	0.05	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.12	0.08	0.08
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.02	0.11	0.14	0.09	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.09	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.03	0.12	0.13	0.09	0.09
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.05	0.02	0.03	0.08	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.03	0.11	0.13	0.07	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.01	0.07	0.15	0.05	0.05
N3	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.03	0.09	0.15	0.07	0.07
O2	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.06	0.16	0.05	0.06
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.09	0.02	0.09	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.00	0.06	0.10	0.02	0.07	0.13	0.11	0.10
O3'	0.07	0.11	0.04	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.06	0.08	0.11	0.13	0.06	0.00	0.10	0.04	0.04	0.08	0.07	0.04
O4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.03	0.11	0.14	0.10	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.03	0.00	0.05	0.17	0.08	0.09
O5'	0.03	0.07	0.05	0.05	0.11	0.01	0.12	0.01	0.11	0.07	0.09	0.06	0.07	0.04	0.11	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.15	0.15	0.12	0.07	0.14	0.09	0.13	0.04	0.13	0.15	0.15	0.16	0.13	0.08	0.14	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.05	0.08	0.06	0.09	0.05	0.09	0.05	0.07	0.05	0.07	0.05	0.11	0.07	0.10	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.08	0.05	0.08	0.04	0.09	0.02	0.07	0.05	0.07	0.06	0.10	0.04	0.09	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00