Doublet Group distance statistics: 52487

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 3, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.021, 0.042, 0.062, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.042 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.022, 0.047, 0.072, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.047 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.115, 0.237, 0.360, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.237 std_dev=0.122
C2'	A	0, 0.107, 0.236, 0.365, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.236 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.121, 0.272, 0.423, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.272 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.183, 0.364, 0.545, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.364 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.188, 0.392, 0.595, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.392 std_dev=0.203
OP1	B	0, 0.326, 0.598, 0.870, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.598 std_dev=0.272
C5'	A	0, 0.329, 0.624, 0.919, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.624 std_dev=0.295
P	B	0, 0.268, 0.564, 0.861, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.564 std_dev=0.296
O3'	A	0, 0.274, 0.574, 0.874, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.574 std_dev=0.300
OP2	B	0, 0.270, 0.609, 0.949, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.609 std_dev=0.339
O5'	B	0, 0.240, 0.614, 0.988, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.614 std_dev=0.374
OP1	A	0, 0.736, 1.199, 1.661, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.199 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.257, 0.737, 1.216, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.737 std_dev=0.479
OP2	A	0, 0.723, 1.238, 1.753, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.238 std_dev=0.515
O3'	B	0, 0.442, 0.973, 1.504, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.973 std_dev=0.531
C6	B	0, 0.427, 0.963, 1.499, 2.041 max_d=2.041 avg_d=0.963 std_dev=0.536
C3'	B	0, 0.393, 0.931, 1.469, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.931 std_dev=0.538
C4'	B	0, 0.338, 0.894, 1.450, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.894 std_dev=0.556
P	A	0, 0.529, 1.088, 1.647, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.088 std_dev=0.559
C5	B	0, 0.438, 1.006, 1.573, 2.127 max_d=2.127 avg_d=1.006 std_dev=0.567
O4'	B	0, 0.380, 0.986, 1.591, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.986 std_dev=0.605
C2'	B	0, 0.476, 1.104, 1.732, 2.285 max_d=2.285 avg_d=1.104 std_dev=0.628
N1	B	0, 0.445, 1.089, 1.733, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.089 std_dev=0.644
C1'	B	0, 0.452, 1.108, 1.764, 2.362 max_d=2.362 avg_d=1.108 std_dev=0.656
C4	B	0, 0.448, 1.123, 1.798, 2.434 max_d=2.434 avg_d=1.123 std_dev=0.675
O2'	B	0, 0.559, 1.248, 1.937, 2.517 max_d=2.517 avg_d=1.248 std_dev=0.689
O4	B	0, 0.467, 1.179, 1.890, 2.544 max_d=2.544 avg_d=1.179 std_dev=0.711
O5'	A	0, 0.484, 1.217, 1.950, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.217 std_dev=0.733
N3	B	0, 0.496, 1.251, 2.006, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.251 std_dev=0.755
C2	B	0, 0.512, 1.275, 2.038, 2.695 max_d=2.695 avg_d=1.275 std_dev=0.763
O2	B	0, 0.601, 1.487, 2.373, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.487 std_dev=0.886

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.43	0.27	0.10
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.13	0.02	0.08	0.44	0.22	0.10
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.04	0.19	0.00	0.01	0.00	0.12	0.38	0.29	0.04
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.13	0.02	0.10	0.05	0.18	0.01	0.01	0.01	0.25	0.35	0.30	0.09
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.14	0.44	0.20	0.14
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.36	0.29	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.05	0.15	0.44	0.21	0.15
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.33	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.05	0.13	0.45	0.23	0.13
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.44	0.23	0.09
N3	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.11	0.44	0.21	0.12
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.16	0.44	0.20	0.16
O2	0.03	0.00	0.19	0.18	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.23	0.04	0.07	0.43	0.23	0.10
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.04	0.16	0.00	0.02	0.03	0.07	0.36	0.33	0.08
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.04	0.03	0.13	0.04	0.16	0.03	0.12	0.05	0.23	0.02	0.00	0.02	0.40	0.32	0.36	0.17
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.19	0.43	0.29	0.14
O5'	0.07	0.08	0.12	0.25	0.14	0.01	0.15	0.01	0.13	0.07	0.11	0.16	0.07	0.07	0.40	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.43	0.44	0.38	0.35	0.44	0.36	0.44	0.33	0.45	0.44	0.44	0.44	0.43	0.36	0.32	0.43	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.22	0.29	0.30	0.20	0.29	0.21	0.26	0.23	0.23	0.21	0.20	0.23	0.33	0.36	0.29	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.10	0.04	0.09	0.14	0.05	0.15	0.01	0.13	0.09	0.12	0.16	0.10	0.08	0.17	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.15	0.20	0.17	0.17	0.17	0.25	0.13	0.12	0.16	0.18	0.18	0.28	0.21	0.11	0.24	0.37	0.20	0.25
C2	0.19	0.22	0.11	0.11	0.24	0.10	0.23	0.15	0.21	0.20	0.23	0.22	0.17	0.17	0.25	0.18	0.20	0.37	0.21	0.24
C2'	0.10	0.12	0.14	0.19	0.16	0.16	0.16	0.23	0.12	0.10	0.14	0.15	0.17	0.27	0.20	0.10	0.23	0.36	0.19	0.24
C3'	0.08	0.09	0.11	0.18	0.17	0.15	0.18	0.23	0.13	0.08	0.12	0.10	0.15	0.26	0.22	0.08	0.22	0.34	0.17	0.23
C4	0.12	0.15	0.08	0.14	0.19	0.09	0.20	0.16	0.17	0.14	0.17	0.14	0.11	0.21	0.21	0.13	0.20	0.36	0.21	0.23
C4'	0.11	0.09	0.16	0.22	0.14	0.21	0.15	0.29	0.11	0.08	0.10	0.12	0.18	0.30	0.19	0.12	0.27	0.38	0.20	0.27
C5	0.16	0.13	0.23	0.28	0.13	0.26	0.13	0.31	0.09	0.11	0.12	0.17	0.24	0.35	0.16	0.16	0.26	0.34	0.19	0.25
C5'	0.15	0.09	0.19	0.25	0.15	0.25	0.16	0.34	0.13	0.11	0.10	0.11	0.20	0.32	0.20	0.16	0.30	0.40	0.22	0.30
C6	0.17	0.14	0.23	0.28	0.13	0.26	0.12	0.32	0.09	0.12	0.12	0.19	0.25	0.36	0.16	0.17	0.27	0.35	0.19	0.25
N1	0.11	0.14	0.13	0.19	0.18	0.15	0.18	0.23	0.14	0.12	0.16	0.16	0.16	0.27	0.21	0.10	0.23	0.36	0.20	0.24
N3	0.22	0.24	0.13	0.10	0.25	0.12	0.25	0.13	0.24	0.23	0.24	0.24	0.18	0.14	0.26	0.23	0.19	0.37	0.22	0.23
N4	0.16	0.18	0.09	0.11	0.21	0.09	0.22	0.11	0.20	0.17	0.19	0.17	0.11	0.18	0.22	0.18	0.18	0.36	0.22	0.23
O2	0.26	0.28	0.18	0.13	0.28	0.15	0.27	0.15	0.26	0.26	0.28	0.29	0.25	0.14	0.28	0.25	0.20	0.37	0.22	0.23
O2'	0.13	0.15	0.16	0.21	0.17	0.17	0.17	0.24	0.13	0.12	0.15	0.18	0.20	0.29	0.20	0.12	0.24	0.37	0.20	0.25
O3'	0.08	0.09	0.10	0.16	0.19	0.13	0.21	0.20	0.15	0.09	0.13	0.09	0.14	0.24	0.25	0.07	0.20	0.31	0.15	0.20
O4'	0.11	0.12	0.16	0.22	0.15	0.20	0.15	0.29	0.11	0.10	0.13	0.15	0.18	0.30	0.20	0.11	0.26	0.38	0.20	0.27
O5'	0.22	0.23	0.20	0.20	0.24	0.21	0.22	0.30	0.21	0.21	0.23	0.26	0.22	0.25	0.28	0.18	0.29	0.44	0.26	0.33
OP1	0.40	0.36	0.46	0.54	0.34	0.56	0.33	0.64	0.33	0.35	0.34	0.41	0.48	0.60	0.38	0.46	0.63	0.69	0.47	0.59
OP2	0.14	0.15	0.17	0.23	0.17	0.23	0.18	0.32	0.14	0.11	0.15	0.21	0.17	0.27	0.24	0.16	0.31	0.37	0.25	0.31
P	0.14	0.14	0.19	0.27	0.19	0.28	0.18	0.38	0.14	0.12	0.16	0.19	0.19	0.33	0.25	0.19	0.38	0.46	0.29	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.07	0.07	0.09	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.12	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.08	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.03	0.05	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.09	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.05	0.06	0.09	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.02	0.05	0.06	0.08	0.07
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.02	0.06	0.06	0.07	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.07	0.07	0.10	0.08
O2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.13	0.02	0.05	0.09	0.08	0.10	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.04	0.08	0.00	0.03	0.07	0.03	0.03	0.08	0.06	0.03
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.11	0.03	0.06	0.13	0.03	0.00	0.09	0.01	0.06	0.12	0.11	0.07
O4	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.09	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.06	0.05	0.05
O5'	0.05	0.07	0.03	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.07	0.09	0.03	0.06	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.08	0.09	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.12	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.09	0.07	0.09	0.09	0.03	0.08	0.02	0.07	0.07	0.10	0.10	0.06	0.11	0.09	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.07	0.07	0.08	0.09	0.03	0.07	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00