Doublet Group distance statistics: 52497

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.011, 0.029, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.011, 0.031, 0.052, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.046, 0.110, 0.173, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.110 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.052, 0.116, 0.180, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.116 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.088, 0.178, 0.267, 0.290 max_d=0.290 avg_d=0.178 std_dev=0.090
C4'	A	0, 0.073, 0.172, 0.272, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.172 std_dev=0.100
C3'	A	0, 0.072, 0.173, 0.274, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.173 std_dev=0.101
O3'	A	0, 0.124, 0.281, 0.437, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.281 std_dev=0.156
C5'	A	0, 0.110, 0.269, 0.428, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.269 std_dev=0.159
O5'	A	0, 0.083, 0.270, 0.457, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.270 std_dev=0.187
P	A	0, 0.184, 0.426, 0.669, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.426 std_dev=0.243
OP2	A	0, 0.272, 0.523, 0.774, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.523 std_dev=0.251
OP2	B	0, 0.346, 0.600, 0.854, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.600 std_dev=0.254
OP1	B	0, 0.163, 0.427, 0.692, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.427 std_dev=0.264
O5'	B	0, 0.276, 0.555, 0.833, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.555 std_dev=0.278
P	B	0, 0.240, 0.519, 0.798, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.519 std_dev=0.279
OP1	A	0, 0.176, 0.473, 0.771, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.473 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.168, 0.505, 0.842, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.505 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.215, 0.582, 0.949, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.582 std_dev=0.367
O4'	B	0, 0.540, 0.949, 1.359, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.949 std_dev=0.410
C3'	B	0, 0.333, 0.814, 1.295, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.814 std_dev=0.481
C1'	B	0, 0.685, 1.215, 1.745, 1.775 max_d=1.775 avg_d=1.215 std_dev=0.530
C2'	B	0, 0.689, 1.249, 1.810, 1.898 max_d=1.898 avg_d=1.249 std_dev=0.561
N1	B	0, 0.730, 1.294, 1.858, 1.900 max_d=1.900 avg_d=1.294 std_dev=0.564
O3'	B	0, 0.556, 1.149, 1.742, 1.792 max_d=1.792 avg_d=1.149 std_dev=0.593
C6	B	0, 0.763, 1.391, 2.019, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.391 std_dev=0.628
C2	B	0, 0.812, 1.543, 2.273, 2.557 max_d=2.557 avg_d=1.543 std_dev=0.731
O2	B	0, 0.833, 1.651, 2.469, 2.913 max_d=2.913 avg_d=1.651 std_dev=0.818
C5	B	0, 0.846, 1.703, 2.560, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.703 std_dev=0.857
N3	B	0, 0.909, 1.826, 2.743, 3.034 max_d=3.034 avg_d=1.826 std_dev=0.917
C4	B	0, 0.921, 1.928, 2.935, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.928 std_dev=1.007
O2'	B	0, 1.014, 2.079, 3.144, 2.973 max_d=2.973 avg_d=2.079 std_dev=1.065
O4	B	0, 1.021, 2.309, 3.596, 3.793 max_d=3.793 avg_d=2.309 std_dev=1.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.04	0.07	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.07	0.09	0.11	0.09
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.10	0.11	0.10
C5'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.06	0.06	0.09	0.07
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.10	0.12	0.10
O2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.06	0.08	0.02	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
O5'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.08	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.03	0.04	0.03	0.03	0.09	0.04	0.10	0.05	0.08	0.04	0.06	0.10	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.07	0.04	0.03	0.11	0.02	0.11	0.01	0.08	0.06	0.09	0.12	0.06	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.07	0.04	0.07	0.10	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.19	0.46	0.09	0.48	0.05	0.36	0.08	0.15	0.07	0.38	0.15	0.91	0.70	0.64	0.04	0.06	0.14	0.11	0.10
C2	0.15	0.26	0.47	0.08	0.59	0.04	0.46	0.07	0.21	0.11	0.46	0.20	0.85	0.65	0.78	0.05	0.07	0.18	0.10	0.12
C2'	0.20	0.17	0.48	0.05	0.48	0.03	0.38	0.08	0.17	0.07	0.36	0.11	0.89	0.68	0.64	0.04	0.06	0.14	0.12	0.10
C3'	0.23	0.12	0.48	0.04	0.41	0.04	0.34	0.09	0.15	0.06	0.29	0.08	0.88	0.67	0.56	0.05	0.06	0.11	0.12	0.08
C4	0.14	0.24	0.48	0.07	0.59	0.05	0.49	0.08	0.23	0.12	0.45	0.17	0.79	0.61	0.76	0.05	0.08	0.20	0.11	0.13
C4'	0.21	0.13	0.44	0.06	0.38	0.07	0.30	0.12	0.13	0.07	0.28	0.10	0.90	0.71	0.51	0.05	0.05	0.10	0.11	0.07
C5	0.18	0.18	0.49	0.08	0.49	0.04	0.40	0.07	0.18	0.07	0.36	0.12	0.85	0.65	0.64	0.04	0.06	0.17	0.13	0.11
C5'	0.22	0.11	0.40	0.07	0.32	0.10	0.26	0.16	0.13	0.08	0.23	0.09	0.87	0.71	0.43	0.06	0.05	0.09	0.08	0.04
C6	0.19	0.17	0.48	0.09	0.45	0.05	0.36	0.08	0.16	0.07	0.34	0.12	0.89	0.68	0.60	0.04	0.06	0.15	0.12	0.10
N1	0.18	0.21	0.47	0.08	0.51	0.04	0.39	0.07	0.17	0.08	0.40	0.16	0.89	0.68	0.68	0.04	0.06	0.16	0.11	0.11
N3	0.14	0.28	0.48	0.07	0.63	0.05	0.50	0.08	0.24	0.13	0.49	0.21	0.80	0.61	0.82	0.05	0.08	0.20	0.10	0.13
N4	0.12	0.27	0.48	0.07	0.63	0.06	0.54	0.10	0.28	0.14	0.48	0.19	0.71	0.55	0.80	0.06	0.09	0.23	0.10	0.14
O2	0.15	0.28	0.47	0.08	0.62	0.04	0.47	0.07	0.22	0.13	0.49	0.22	0.85	0.65	0.82	0.05	0.07	0.19	0.10	0.13
O2'	0.20	0.18	0.47	0.05	0.49	0.03	0.38	0.08	0.16	0.07	0.37	0.13	0.90	0.69	0.66	0.04	0.06	0.14	0.12	0.10
O3'	0.25	0.10	0.50	0.07	0.39	0.04	0.33	0.09	0.15	0.07	0.26	0.08	0.87	0.64	0.54	0.06	0.07	0.11	0.14	0.09
O4'	0.19	0.17	0.43	0.11	0.41	0.07	0.31	0.10	0.13	0.07	0.33	0.14	0.92	0.72	0.56	0.05	0.05	0.12	0.11	0.08
O5'	0.22	0.12	0.41	0.07	0.33	0.11	0.28	0.17	0.15	0.09	0.23	0.10	0.86	0.71	0.44	0.07	0.06	0.08	0.07	0.03
OP1	0.27	0.14	0.37	0.10	0.19	0.13	0.18	0.21	0.12	0.15	0.13	0.18	0.81	0.62	0.25	0.11	0.10	0.10	0.05	0.05
OP2	0.26	0.13	0.41	0.08	0.21	0.14	0.21	0.22	0.13	0.14	0.15	0.16	0.85	0.70	0.27	0.09	0.09	0.10	0.05	0.05
P	0.23	0.11	0.36	0.09	0.24	0.14	0.22	0.21	0.13	0.11	0.16	0.12	0.84	0.70	0.31	0.08	0.08	0.09	0.05	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.41	0.01	0.00	0.11	0.12	0.12	0.12
C2	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.38	0.01	0.07	0.16	0.17	0.27	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.17	0.10	0.02	0.09	0.21	0.00	0.10	0.04	0.03	0.37	0.41	0.43	0.40
C3'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.32	0.01	0.37	0.01	0.34	0.19	0.22	0.03	0.02	0.01	0.34	0.03	0.03	0.12	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.32	0.00	0.15	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.07	0.00	0.05	0.36	0.43	0.54	0.46
C4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.15	0.00	0.23	0.00	0.22	0.08	0.06	0.11	0.27	0.07	0.16	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01
C5	0.02	0.01	0.08	0.37	0.01	0.23	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.40	0.14	0.01	0.12	0.41	0.47	0.53	0.48
C5'	0.05	0.06	0.17	0.01	0.20	0.00	0.27	0.00	0.23	0.08	0.11	0.12	0.09	0.21	0.23	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.34	0.01	0.22	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.10	0.01	0.14	0.32	0.32	0.34	0.34
N1	0.00	0.01	0.02	0.19	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.22	0.01	0.01	0.16	0.16	0.20	0.19
N3	0.01	0.00	0.09	0.22	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.25	0.01	0.03	0.25	0.29	0.42	0.34
O2	0.02	0.00	0.21	0.03	0.01	0.11	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.60	0.02	0.16	0.12	0.12	0.21	0.16
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.37	0.27	0.40	0.09	0.34	0.20	0.26	0.07	0.00	0.13	0.41	0.17	0.27	0.32	0.52	0.35
O3'	0.41	0.38	0.10	0.01	0.07	0.07	0.14	0.21	0.10	0.22	0.25	0.60	0.13	0.00	0.06	0.28	0.25	0.38	0.44	0.34
O4	0.01	0.01	0.04	0.34	0.00	0.16	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.41	0.06	0.00	0.05	0.41	0.51	0.64	0.53
O4'	0.00	0.07	0.03	0.03	0.05	0.01	0.12	0.02	0.14	0.01	0.03	0.16	0.17	0.28	0.05	0.00	0.07	0.07	0.08	0.09
O5'	0.11	0.16	0.37	0.03	0.36	0.01	0.41	0.01	0.32	0.16	0.25	0.12	0.27	0.25	0.41	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.12	0.17	0.41	0.12	0.43	0.04	0.47	0.03	0.32	0.16	0.29	0.12	0.32	0.38	0.51	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.27	0.43	0.10	0.54	0.04	0.53	0.02	0.34	0.20	0.42	0.21	0.52	0.44	0.64	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.40	0.05	0.46	0.01	0.48	0.02	0.34	0.19	0.34	0.16	0.35	0.34	0.53	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00