Doublet Group distance statistics: 52503

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.013, 0.060, 0.108, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.060 std_dev=0.048
N4	A	0, 0.031, 0.097, 0.164, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.097 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.084, 0.292, 0.500, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.292 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.085, 0.303, 0.521, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.303 std_dev=0.218
C3'	A	0, 0.134, 0.387, 0.641, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.387 std_dev=0.253
C5'	A	0, 0.211, 0.499, 0.786, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.499 std_dev=0.288
C2'	A	0, 0.203, 0.508, 0.813, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.508 std_dev=0.305
OP1	B	0, 0.106, 0.420, 0.735, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.420 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.231, 0.549, 0.867, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.549 std_dev=0.318
OP2	A	0, 0.247, 0.611, 0.975, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.611 std_dev=0.364
P	A	0, 0.250, 0.625, 1.000, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.625 std_dev=0.375
C5'	B	0, 0.019, 0.426, 0.833, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.426 std_dev=0.407
O3'	B	0, 0.035, 0.459, 0.883, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.459 std_dev=0.424
P	B	0, 0.006, 0.446, 0.886, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.446 std_dev=0.440
O5'	B	0, -0.076, 0.379, 0.833, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.379 std_dev=0.455
C3'	B	0, 0.039, 0.499, 0.960, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.499 std_dev=0.460
C4'	B	0, 0.019, 0.481, 0.942, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.481 std_dev=0.461
O4'	B	0, 0.096, 0.559, 1.022, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.559 std_dev=0.463
OP1	A	0, 0.229, 0.720, 1.211, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.720 std_dev=0.491
O2'	B	0, 0.162, 0.675, 1.188, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.675 std_dev=0.513
OP2	B	0, 0.016, 0.530, 1.044, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.530 std_dev=0.514
C2'	B	0, 0.112, 0.627, 1.141, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.627 std_dev=0.515
C1'	B	0, 0.095, 0.641, 1.187, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.641 std_dev=0.546
O2'	A	0, 0.439, 1.064, 1.688, 1.527 max_d=1.527 avg_d=1.064 std_dev=0.625
N1	B	0, 0.045, 0.671, 1.297, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.671 std_dev=0.626
O3'	A	0, 0.467, 1.110, 1.753, 1.546 max_d=1.546 avg_d=1.110 std_dev=0.643
C6	B	0, -0.065, 0.587, 1.238, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.587 std_dev=0.652
C2	B	0, 0.106, 0.808, 1.510, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.808 std_dev=0.702
O2	B	0, 0.195, 0.913, 1.630, 2.004 max_d=2.004 avg_d=0.913 std_dev=0.717
C5	B	0, -0.077, 0.657, 1.391, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.657 std_dev=0.734
N3	B	0, 0.040, 0.834, 1.627, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.834 std_dev=0.793
C4	B	0, -0.073, 0.756, 1.585, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.756 std_dev=0.829
O4	B	0, -0.092, 0.832, 1.756, 2.367 max_d=2.367 avg_d=0.832 std_dev=0.924

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.00	0.03	0.02	0.17	0.05
C2	0.00	0.00	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.15	0.03	0.05	0.07	0.12	0.04
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.02	0.05	0.05	0.11	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.21	0.10
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.25	0.10
C4	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.07	0.10	0.11	0.06
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.09
C5	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.06	0.03	0.10	0.12	0.15	0.10
C5'	0.04	0.06	0.09	0.02	0.11	0.00	0.14	0.00	0.13	0.08	0.08	0.12	0.04	0.03	0.12	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.04	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.06	0.04	0.10	0.10	0.17	0.11
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00	0.04	0.03	0.15	0.05
N3	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.06	0.10	0.10	0.05
N4	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.01	0.08	0.13	0.10	0.07
O2	0.01	0.00	0.11	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.20	0.05	0.07	0.11	0.14	0.07
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.12	0.07	0.16	0.03	0.15	0.07	0.08	0.13	0.12	0.00	0.06	0.03	0.04	0.07	0.24	0.10
O3'	0.15	0.15	0.03	0.00	0.10	0.01	0.06	0.12	0.06	0.12	0.14	0.10	0.20	0.06	0.00	0.10	0.07	0.12	0.26	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.10	0.00	0.04	0.03	0.15	0.04
O5'	0.03	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.04	0.06	0.08	0.07	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.07	0.05	0.07	0.10	0.06	0.12	0.03	0.10	0.03	0.10	0.13	0.11	0.07	0.12	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.12	0.21	0.25	0.11	0.20	0.15	0.07	0.17	0.15	0.10	0.10	0.14	0.24	0.26	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.04	0.10	0.10	0.06	0.09	0.10	0.01	0.11	0.05	0.05	0.07	0.07	0.10	0.12	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.10	0.08	0.06	0.03	0.06	0.09	0.07	0.08	0.04	0.07	0.18	0.14	0.06	0.03	0.06	0.04	0.10	0.07	0.06
C2	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.14	0.13	0.14	0.12	0.11	0.17	0.12	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12
C2'	0.06	0.10	0.07	0.06	0.06	0.07	0.13	0.09	0.12	0.05	0.07	0.18	0.14	0.06	0.06	0.07	0.09	0.12	0.11	0.10
C3'	0.06	0.10	0.07	0.05	0.12	0.06	0.17	0.06	0.14	0.07	0.10	0.18	0.14	0.06	0.13	0.04	0.06	0.12	0.12	0.10
C4	0.06	0.08	0.06	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.08	0.05	0.06	0.13	0.12	0.06	0.05	0.06	0.08	0.14	0.13	0.12
C4'	0.05	0.09	0.07	0.04	0.07	0.05	0.13	0.05	0.10	0.02	0.06	0.17	0.14	0.06	0.08	0.04	0.03	0.09	0.08	0.06
C5	0.14	0.15	0.17	0.15	0.10	0.13	0.09	0.08	0.09	0.12	0.13	0.21	0.22	0.18	0.10	0.12	0.07	0.09	0.08	0.07
C5'	0.08	0.09	0.08	0.08	0.07	0.10	0.15	0.13	0.13	0.06	0.04	0.17	0.13	0.08	0.06	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09
C6	0.14	0.17	0.17	0.15	0.11	0.12	0.11	0.07	0.10	0.12	0.15	0.23	0.23	0.18	0.12	0.11	0.07	0.09	0.08	0.07
N1	0.07	0.10	0.08	0.05	0.01	0.06	0.07	0.06	0.06	0.04	0.07	0.17	0.15	0.07	0.02	0.06	0.04	0.10	0.08	0.07
N3	0.14	0.15	0.13	0.14	0.15	0.15	0.17	0.16	0.17	0.15	0.14	0.17	0.12	0.14	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15
N4	0.07	0.09	0.06	0.06	0.11	0.07	0.13	0.10	0.12	0.08	0.09	0.11	0.09	0.05	0.11	0.08	0.14	0.19	0.18	0.17
O2	0.18	0.19	0.18	0.19	0.18	0.18	0.20	0.18	0.20	0.19	0.18	0.23	0.18	0.19	0.17	0.18	0.16	0.14	0.14	0.14
O2'	0.27	0.30	0.27	0.28	0.28	0.25	0.30	0.26	0.30	0.28	0.29	0.34	0.25	0.26	0.28	0.26	0.27	0.21	0.25	0.24
O3'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.12	0.07	0.18	0.09	0.14	0.03	0.07	0.15	0.11	0.04	0.15	0.06	0.05	0.12	0.11	0.09
O4'	0.06	0.10	0.08	0.05	0.07	0.05	0.11	0.04	0.08	0.03	0.08	0.17	0.15	0.07	0.09	0.04	0.01	0.10	0.09	0.07
O5'	0.10	0.12	0.12	0.10	0.01	0.11	0.08	0.11	0.06	0.06	0.08	0.21	0.18	0.12	0.03	0.10	0.08	0.02	0.01	0.03
OP1	0.18	0.22	0.19	0.18	0.14	0.19	0.09	0.19	0.09	0.16	0.20	0.28	0.22	0.18	0.16	0.18	0.20	0.17	0.20	0.18
OP2	0.12	0.10	0.11	0.12	0.15	0.13	0.21	0.14	0.20	0.13	0.09	0.11	0.08	0.12	0.14	0.13	0.11	0.08	0.07	0.08
P	0.09	0.11	0.10	0.09	0.02	0.11	0.07	0.11	0.06	0.06	0.08	0.19	0.14	0.09	0.03	0.10	0.09	0.04	0.05	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03
C4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04
O2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.10	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03
O4	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05
O5'	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00