Doublet Group distance statistics: 52507

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.008, 0.028, 0.047, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.021, 0.072, 0.123, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.072 std_dev=0.051
N4	A	0, 0.023, 0.092, 0.161, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.092 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.074, 0.267, 0.460, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.267 std_dev=0.193
C2'	A	0, 0.104, 0.371, 0.639, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.371 std_dev=0.268
C4'	A	0, 0.118, 0.418, 0.719, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.418 std_dev=0.301
C3'	B	0, 0.129, 0.445, 0.761, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.445 std_dev=0.316
O2'	A	0, 0.147, 0.516, 0.884, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.516 std_dev=0.368
O5'	B	0, 0.155, 0.536, 0.917, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.536 std_dev=0.381
C3'	A	0, 0.152, 0.540, 0.929, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.540 std_dev=0.389
OP2	B	0, 0.169, 0.579, 0.988, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.579 std_dev=0.409
P	B	0, 0.198, 0.680, 1.161, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.680 std_dev=0.481
O3'	B	0, 0.197, 0.688, 1.179, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.688 std_dev=0.491
C5'	A	0, 0.210, 0.748, 1.285, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.748 std_dev=0.537
O5'	A	0, 0.222, 0.776, 1.330, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.776 std_dev=0.554
OP1	B	0, 0.240, 0.830, 1.420, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.830 std_dev=0.590
O3'	A	0, 0.235, 0.834, 1.433, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.834 std_dev=0.599
P	A	0, 0.306, 1.053, 1.800, 1.656 max_d=1.656 avg_d=1.053 std_dev=0.747
C4'	B	0, 0.323, 1.104, 1.885, 1.673 max_d=1.673 avg_d=1.104 std_dev=0.781
OP2	A	0, 0.341, 1.166, 1.990, 1.757 max_d=1.757 avg_d=1.166 std_dev=0.824
OP1	A	0, 0.343, 1.187, 2.031, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.187 std_dev=0.844
O4'	B	0, 0.449, 1.533, 2.616, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.533 std_dev=1.084
C2'	B	0, 0.493, 1.688, 2.883, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.688 std_dev=1.195
C5'	B	0, 0.516, 1.761, 3.006, 2.646 max_d=2.646 avg_d=1.761 std_dev=1.245
C1'	B	0, 0.521, 1.784, 3.046, 2.736 max_d=2.736 avg_d=1.784 std_dev=1.262
C6	B	0, 0.553, 1.889, 3.225, 2.877 max_d=2.877 avg_d=1.889 std_dev=1.336
N1	B	0, 0.586, 2.000, 3.415, 3.037 max_d=3.037 avg_d=2.000 std_dev=1.415
C5	B	0, 0.625, 2.134, 3.643, 3.206 max_d=3.206 avg_d=2.134 std_dev=1.509
C2	B	0, 0.732, 2.503, 4.274, 3.814 max_d=3.814 avg_d=2.503 std_dev=1.771
C4	B	0, 0.748, 2.558, 4.369, 3.926 max_d=3.926 avg_d=2.558 std_dev=1.811
O2'	B	0, 0.782, 2.678, 4.574, 4.132 max_d=4.132 avg_d=2.678 std_dev=1.896
N3	B	0, 0.798, 2.733, 4.668, 4.212 max_d=4.212 avg_d=2.733 std_dev=1.935
O2	B	0, 0.811, 2.776, 4.740, 4.272 max_d=4.272 avg_d=2.776 std_dev=1.965
O4	B	0, 0.847, 2.907, 4.966, 4.515 max_d=4.515 avg_d=2.907 std_dev=2.059

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.12	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.03	0.06	0.11	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.06
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.13	0.01	0.07	0.07	0.07	0.06
C5'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.12	0.00	0.06	0.05	0.04	0.04
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.04	0.06	0.06	0.05
O2	0.02	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.14	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.03	0.12	0.00	0.01	0.03	0.04	0.06	0.07	0.04
O3'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.00	0.13	0.02	0.12	0.03	0.02	0.09	0.14	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.14	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03
O5'	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.08	0.04	0.09	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.02	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.07	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.08	0.06	0.12	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.05	0.07	0.09	0.03	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.08	0.07	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.05	0.04	0.06	0.03	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.07	0.04	0.11	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.21	0.33	0.09	0.02	0.24	0.16	0.51	0.13	0.08	0.16	0.36	0.48	0.24	0.03	0.17	0.16	0.27	0.09	0.20
C2	0.10	0.13	0.37	0.12	0.11	0.20	0.23	0.47	0.17	0.02	0.06	0.26	0.49	0.21	0.12	0.21	0.14	0.23	0.13	0.19
C2'	0.04	0.05	0.19	0.05	0.15	0.37	0.29	0.64	0.26	0.08	0.00	0.19	0.28	0.33	0.15	0.32	0.22	0.32	0.15	0.26
C3'	0.14	0.06	0.07	0.13	0.25	0.47	0.38	0.74	0.36	0.18	0.10	0.08	0.12	0.39	0.24	0.40	0.29	0.39	0.22	0.34
C4	0.09	0.09	0.37	0.13	0.16	0.17	0.26	0.44	0.20	0.02	0.04	0.21	0.48	0.20	0.18	0.20	0.14	0.24	0.14	0.20
C4'	0.02	0.12	0.14	0.04	0.10	0.36	0.24	0.63	0.22	0.03	0.08	0.27	0.26	0.32	0.09	0.26	0.26	0.35	0.16	0.28
C5	0.12	0.14	0.36	0.12	0.10	0.20	0.22	0.47	0.16	0.03	0.07	0.27	0.48	0.21	0.11	0.17	0.16	0.28	0.10	0.21
C5'	0.03	0.09	0.05	0.09	0.15	0.39	0.28	0.66	0.26	0.08	0.07	0.23	0.15	0.35	0.14	0.27	0.30	0.38	0.19	0.32
C6	0.13	0.18	0.34	0.10	0.06	0.22	0.19	0.50	0.14	0.06	0.11	0.32	0.48	0.23	0.06	0.16	0.17	0.28	0.09	0.21
N1	0.12	0.17	0.35	0.10	0.06	0.22	0.19	0.49	0.15	0.05	0.11	0.31	0.49	0.23	0.07	0.18	0.16	0.26	0.10	0.20
N3	0.09	0.09	0.38	0.13	0.16	0.18	0.26	0.43	0.19	0.02	0.03	0.22	0.49	0.20	0.18	0.22	0.12	0.21	0.14	0.18
N4	0.06	0.02	0.37	0.13	0.23	0.15	0.31	0.39	0.24	0.06	0.08	0.12	0.45	0.20	0.26	0.22	0.11	0.21	0.16	0.19
O2	0.10	0.13	0.37	0.11	0.12	0.20	0.24	0.47	0.18	0.01	0.06	0.26	0.49	0.22	0.13	0.22	0.13	0.21	0.14	0.19
O2'	0.03	0.11	0.22	0.04	0.08	0.35	0.23	0.61	0.21	0.03	0.08	0.25	0.32	0.31	0.07	0.29	0.19	0.28	0.11	0.23
O3'	0.27	0.18	0.14	0.23	0.35	0.58	0.48	0.84	0.46	0.30	0.21	0.05	0.13	0.47	0.34	0.52	0.36	0.44	0.28	0.40
O4'	0.18	0.26	0.33	0.09	0.04	0.22	0.13	0.49	0.10	0.12	0.21	0.42	0.49	0.23	0.05	0.12	0.18	0.28	0.09	0.20
O5'	0.10	0.08	0.01	0.12	0.23	0.43	0.35	0.69	0.32	0.16	0.11	0.15	0.05	0.36	0.23	0.32	0.30	0.39	0.21	0.33
OP1	0.25	0.21	0.27	0.26	0.35	0.53	0.44	0.75	0.43	0.30	0.25	0.15	0.29	0.41	0.34	0.40	0.36	0.41	0.24	0.37
OP2	0.29	0.29	0.26	0.27	0.44	0.54	0.53	0.77	0.50	0.36	0.34	0.20	0.27	0.46	0.45	0.44	0.37	0.42	0.29	0.39
P	0.15	0.13	0.14	0.18	0.29	0.45	0.39	0.69	0.37	0.22	0.18	0.12	0.11	0.38	0.29	0.33	0.32	0.39	0.22	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.02	0.00	0.15	0.06	0.25	0.01
C2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.03	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.01	0.02	0.29	0.12	0.11	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.19	0.05	0.02	0.08	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.24	0.52	0.27
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.22	0.00	0.23	0.01	0.21	0.13	0.17	0.12	0.02	0.01	0.22	0.00	0.04	0.09	0.20	0.07
C4	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.18	0.06	0.00	0.03	0.42	0.27	0.13	0.28
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.19	0.01	0.05	0.00	0.02	0.11	0.19	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.23	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.02	0.02	0.01	0.17	0.14	0.01	0.05	0.45	0.31	0.17	0.31
C5'	0.10	0.12	0.19	0.01	0.14	0.01	0.15	0.00	0.14	0.13	0.14	0.11	0.01	0.17	0.15	0.00	0.01	0.23	0.23	0.01
C6	0.01	0.02	0.05	0.21	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.00	0.02	0.03	0.13	0.11	0.01	0.06	0.40	0.25	0.08	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.02	0.02	0.02	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.07	0.02	0.01	0.29	0.14	0.13	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.03	0.02	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.00	0.02	0.35	0.18	0.03	0.19
O2	0.02	0.01	0.16	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.25	0.01	0.04	0.23	0.07	0.17	0.07
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.18	0.19	0.17	0.01	0.13	0.10	0.17	0.12	0.00	0.03	0.21	0.12	0.02	0.22	0.58	0.25
O3'	0.22	0.14	0.01	0.01	0.06	0.01	0.14	0.17	0.11	0.07	0.07	0.25	0.03	0.00	0.08	0.20	0.15	0.28	0.14	0.18
O4	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.08	0.00	0.04	0.44	0.29	0.18	0.31
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.12	0.20	0.04	0.00	0.23	0.23	0.07	0.17
O5'	0.15	0.29	0.08	0.04	0.42	0.02	0.45	0.01	0.40	0.29	0.35	0.23	0.02	0.15	0.44	0.23	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.12	0.24	0.09	0.27	0.11	0.31	0.23	0.25	0.14	0.18	0.07	0.22	0.28	0.29	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.11	0.52	0.20	0.13	0.19	0.17	0.23	0.08	0.13	0.03	0.17	0.58	0.14	0.18	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.12	0.27	0.07	0.28	0.01	0.31	0.01	0.23	0.12	0.19	0.07	0.25	0.18	0.31	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00