Doublet Group distance statistics: 52512

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.044 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.013, 0.046, 0.078, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.046 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.017, 0.058, 0.099, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.058 std_dev=0.041
OP2	B	0, 0.068, 0.232, 0.396, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.232 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.070, 0.240, 0.411, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.240 std_dev=0.170
OP1	B	0, 0.101, 0.348, 0.594, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.348 std_dev=0.246
P	B	0, 0.123, 0.422, 0.722, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.422 std_dev=0.299
C2'	B	0, 0.199, 0.682, 1.165, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.682 std_dev=0.483
O5'	B	0, 0.206, 0.705, 1.204, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.705 std_dev=0.499
C4'	A	0, 0.220, 0.750, 1.280, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.750 std_dev=0.530
O2'	B	0, 0.227, 0.777, 1.327, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.777 std_dev=0.550
O2'	A	0, 0.242, 0.826, 1.411, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.826 std_dev=0.584
C3'	A	0, 0.277, 0.945, 1.613, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.945 std_dev=0.668
C1'	B	0, 0.312, 1.067, 1.822, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.067 std_dev=0.755
C5'	A	0, 0.324, 1.107, 1.890, 1.669 max_d=1.669 avg_d=1.107 std_dev=0.783
C3'	B	0, 0.339, 1.159, 1.979, 1.770 max_d=1.770 avg_d=1.159 std_dev=0.820
O4'	B	0, 0.358, 1.224, 2.089, 1.858 max_d=1.858 avg_d=1.224 std_dev=0.865
O5'	A	0, 0.371, 1.268, 2.165, 1.905 max_d=1.905 avg_d=1.268 std_dev=0.897
C4'	B	0, 0.373, 1.276, 2.178, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.276 std_dev=0.902
P	A	0, 0.415, 1.416, 2.417, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.416 std_dev=1.001
OP2	A	0, 0.464, 1.585, 2.705, 2.395 max_d=2.395 avg_d=1.585 std_dev=1.121
O3'	B	0, 0.470, 1.607, 2.743, 2.439 max_d=2.439 avg_d=1.607 std_dev=1.136
O3'	A	0, 0.492, 1.679, 2.867, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.679 std_dev=1.188
C5'	B	0, 0.497, 1.699, 2.900, 2.563 max_d=2.563 avg_d=1.699 std_dev=1.201
N1	B	0, 0.546, 1.866, 3.185, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.866 std_dev=1.319
OP1	A	0, 0.659, 2.251, 3.842, 3.407 max_d=3.407 avg_d=2.251 std_dev=1.592
C2	B	0, 0.677, 2.310, 3.944, 3.478 max_d=3.478 avg_d=2.310 std_dev=1.634
O2	B	0, 0.683, 2.331, 3.980, 3.509 max_d=3.509 avg_d=2.331 std_dev=1.648
C6	B	0, 0.727, 2.481, 4.236, 3.734 max_d=3.734 avg_d=2.481 std_dev=1.755
N3	B	0, 0.896, 3.060, 5.224, 4.604 max_d=4.604 avg_d=3.060 std_dev=2.164
C5	B	0, 0.946, 3.231, 5.515, 4.858 max_d=4.858 avg_d=3.231 std_dev=2.284
C4	B	0, 1.020, 3.484, 5.947, 5.238 max_d=5.238 avg_d=3.484 std_dev=2.463
O4	B	0, 1.225, 4.183, 7.141, 6.286 max_d=6.286 avg_d=4.183 std_dev=2.958

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.03	0.10
C2	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.01	0.01	0.23	0.15	0.21	0.07
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.20	0.06	0.01
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.22	0.00	0.26	0.02	0.23	0.14	0.15	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.33	0.18	0.14
C4	0.01	0.01	0.02	0.22	0.00	0.13	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.19	0.01	0.40	0.27	0.39	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.16	0.07	0.07	0.14	0.04	0.11	0.03	0.00	0.02	0.08	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.26	0.00	0.17	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.27	0.01	0.43	0.26	0.36	0.23
C5'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.26	0.01	0.31	0.00	0.26	0.14	0.18	0.29	0.03	0.10	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.23	0.00	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.23	0.01	0.35	0.17	0.20	0.11
N1	0.01	0.00	0.02	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.22	0.11	0.13	0.03
N3	0.01	0.00	0.00	0.15	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.01	0.32	0.22	0.32	0.16
N4	0.01	0.01	0.03	0.24	0.00	0.14	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.22	0.01	0.44	0.32	0.47	0.28
O2	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.14	0.01	0.14	0.10	0.16	0.01
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.14	0.11	0.06	0.10	0.02	0.07	0.19	0.15	0.28	0.00	0.08	0.10	0.08	0.28	0.09	0.07
O3'	0.04	0.01	0.03	0.01	0.19	0.03	0.27	0.08	0.23	0.08	0.08	0.22	0.14	0.08	0.00	0.00	0.12	0.58	0.35	0.32
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.00	0.02	0.14	0.15	0.21
O5'	0.05	0.23	0.01	0.04	0.40	0.02	0.43	0.01	0.35	0.22	0.32	0.44	0.14	0.08	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.01	0.15	0.20	0.33	0.27	0.08	0.26	0.02	0.17	0.11	0.22	0.32	0.10	0.28	0.58	0.14	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.21	0.06	0.18	0.39	0.02	0.36	0.02	0.20	0.13	0.32	0.47	0.16	0.09	0.35	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.07	0.01	0.14	0.22	0.02	0.23	0.01	0.11	0.03	0.16	0.28	0.01	0.07	0.32	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.16	0.12	0.30	0.49	0.49	0.68	0.68	0.63	0.34	0.26	0.07	0.13	0.51	0.50	0.40	0.19	0.11	0.08	0.11
C2	0.26	0.33	0.07	0.23	0.74	0.46	0.90	0.68	0.78	0.47	0.49	0.10	0.15	0.44	0.79	0.44	0.18	0.10	0.09	0.12
C2'	0.08	0.01	0.06	0.18	0.35	0.38	0.55	0.58	0.50	0.21	0.11	0.23	0.13	0.37	0.36	0.28	0.08	0.04	0.02	0.03
C3'	0.13	0.22	0.07	0.02	0.06	0.13	0.25	0.30	0.22	0.03	0.14	0.43	0.19	0.15	0.06	0.03	0.19	0.22	0.25	0.23
C4	0.27	0.42	0.01	0.12	0.85	0.37	0.97	0.62	0.82	0.52	0.60	0.20	0.15	0.28	0.93	0.43	0.15	0.09	0.08	0.11
C4'	0.08	0.19	0.02	0.08	0.07	0.21	0.26	0.35	0.25	0.01	0.13	0.40	0.22	0.26	0.06	0.08	0.08	0.12	0.16	0.14
C5	0.24	0.36	0.01	0.11	0.73	0.39	0.86	0.66	0.75	0.46	0.51	0.15	0.13	0.26	0.79	0.43	0.16	0.10	0.07	0.10
C5'	0.25	0.37	0.13	0.11	0.17	0.01	0.01	0.10	0.01	0.20	0.33	0.54	0.24	0.04	0.19	0.12	0.28	0.30	0.35	0.34
C6	0.23	0.27	0.04	0.19	0.60	0.46	0.76	0.69	0.69	0.41	0.39	0.05	0.12	0.37	0.64	0.42	0.18	0.10	0.07	0.10
N1	0.24	0.26	0.08	0.25	0.62	0.48	0.79	0.70	0.71	0.42	0.39	0.03	0.14	0.46	0.65	0.43	0.19	0.11	0.08	0.11
N3	0.27	0.41	0.03	0.18	0.84	0.41	0.98	0.65	0.83	0.52	0.59	0.18	0.16	0.36	0.92	0.44	0.16	0.09	0.08	0.12
N4	0.27	0.49	0.04	0.06	0.95	0.30	1.04	0.53	0.85	0.55	0.70	0.28	0.15	0.20	1.06	0.42	0.12	0.07	0.08	0.10
O2	0.26	0.32	0.09	0.27	0.73	0.47	0.90	0.69	0.78	0.47	0.47	0.08	0.16	0.48	0.78	0.44	0.18	0.10	0.09	0.12
O2'	0.00	0.09	0.01	0.14	0.28	0.34	0.51	0.59	0.46	0.14	0.02	0.36	0.27	0.30	0.29	0.22	0.11	0.11	0.11	0.10
O3'	0.31	0.41	0.19	0.16	0.11	0.04	0.10	0.16	0.07	0.20	0.33	0.64	0.30	0.04	0.11	0.16	0.32	0.32	0.32	0.32
O4'	0.17	0.08	0.13	0.31	0.35	0.47	0.54	0.62	0.52	0.27	0.15	0.13	0.14	0.55	0.34	0.36	0.17	0.10	0.05	0.08
O5'	0.21	0.29	0.14	0.19	0.13	0.02	0.02	0.02	0.01	0.16	0.25	0.41	0.10	0.01	0.14	0.09	0.38	0.41	0.48	0.46
OP1	0.16	0.11	0.45	0.14	0.20	0.10	0.27	0.10	0.27	0.19	0.13	0.02	0.68	0.02	0.19	0.10	0.20	0.19	0.32	0.24
OP2	0.17	0.14	0.22	0.03	0.22	0.11	0.26	0.04	0.25	0.19	0.17	0.08	0.52	0.01	0.23	0.19	0.37	0.38	0.51	0.44
P	0.02	0.03	0.18	0.01	0.09	0.06	0.17	0.08	0.17	0.06	0.01	0.13	0.35	0.00	0.09	0.04	0.28	0.28	0.36	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.23	0.02	0.00	0.26	0.28	0.22	0.23
C2	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.23	0.01	0.01	0.49	0.65	0.48	0.55
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.12	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.11	0.15	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.18	0.00	0.23	0.01	0.22	0.11	0.11	0.03	0.02	0.00	0.18	0.00	0.12	0.13	0.12	0.14
C4	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.03	0.00	0.04	0.73	0.96	0.86	0.89
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.14	0.07	0.08	0.02	0.19	0.01	0.14	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.23	0.00	0.15	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.09	0.01	0.03	0.74	0.88	0.90	0.90
C5'	0.01	0.08	0.12	0.01	0.20	0.00	0.23	0.00	0.18	0.09	0.14	0.02	0.04	0.13	0.23	0.01	0.00	0.15	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.22	0.01	0.14	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.08	0.01	0.02	0.64	0.66	0.71	0.70
N1	0.00	0.00	0.02	0.11	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.11	0.01	0.01	0.48	0.54	0.48	0.51
N3	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.16	0.01	0.03	0.62	0.84	0.67	0.73
O2	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.37	0.01	0.02	0.37	0.55	0.32	0.41
O2'	0.03	0.21	0.00	0.02	0.26	0.19	0.21	0.04	0.14	0.14	0.27	0.19	0.00	0.03	0.29	0.18	0.07	0.01	0.11	0.08
O3'	0.23	0.23	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.13	0.08	0.11	0.16	0.37	0.03	0.00	0.02	0.15	0.11	0.10	0.03	0.08
O4	0.02	0.01	0.06	0.18	0.00	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.02	0.00	0.06	0.80	1.11	0.97	1.00
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.18	0.15	0.06	0.00	0.33	0.29	0.32	0.29
O5'	0.26	0.49	0.06	0.12	0.73	0.01	0.74	0.00	0.64	0.48	0.62	0.37	0.07	0.11	0.80	0.33	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.28	0.65	0.11	0.13	0.96	0.04	0.88	0.15	0.66	0.54	0.84	0.55	0.01	0.10	1.11	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.48	0.15	0.12	0.86	0.10	0.90	0.23	0.71	0.48	0.67	0.32	0.11	0.03	0.97	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.55	0.15	0.14	0.89	0.01	0.90	0.01	0.70	0.51	0.73	0.41	0.08	0.08	1.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00