Doublet Group distance statistics: 52516

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
OP1	B	0, 0.000, 0.310, 0.619, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.310 std_dev=0.310
P	B	0, 0.000, 0.588, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O4'	A	0, 0.000, 0.626, 1.251, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.626 std_dev=0.626
OP2	B	0, 0.000, 0.662, 1.324, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.662 std_dev=0.662
C2'	A	0, 0.000, 0.691, 1.382, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.691 std_dev=0.691
O2'	A	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C4'	A	0, 0.000, 0.907, 1.813, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.907 std_dev=0.907
C3'	A	0, 0.000, 1.043, 2.087, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.043 std_dev=1.043
O5'	B	0, 0.000, 1.324, 2.647, 2.647 max_d=2.647 avg_d=1.324 std_dev=1.324
O4	B	0, 0.000, 1.358, 2.715, 2.715 max_d=2.715 avg_d=1.358 std_dev=1.358
O3'	A	0, 0.000, 1.399, 2.799, 2.799 max_d=2.799 avg_d=1.399 std_dev=1.399
C4	B	0, 0.000, 1.443, 2.885, 2.885 max_d=2.885 avg_d=1.443 std_dev=1.443
N3	B	0, 0.000, 1.489, 2.979, 2.979 max_d=2.979 avg_d=1.489 std_dev=1.489
C5	B	0, 0.000, 1.534, 3.067, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.534 std_dev=1.534
C5'	A	0, 0.000, 1.612, 3.223, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.612 std_dev=1.612
C2	B	0, 0.000, 1.636, 3.272, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.636 std_dev=1.636
C6	B	0, 0.000, 1.673, 3.346, 3.346 max_d=3.346 avg_d=1.673 std_dev=1.673
O2	B	0, 0.000, 1.687, 3.375, 3.375 max_d=3.375 avg_d=1.687 std_dev=1.687
O4'	B	0, 0.000, 1.696, 3.391, 3.391 max_d=3.391 avg_d=1.696 std_dev=1.696
N1	B	0, 0.000, 1.737, 3.474, 3.474 max_d=3.474 avg_d=1.737 std_dev=1.737
OP2	A	0, 0.000, 1.759, 3.517, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.759 std_dev=1.759
P	A	0, 0.000, 1.833, 3.665, 3.665 max_d=3.665 avg_d=1.833 std_dev=1.833
C5'	B	0, 0.000, 1.893, 3.785, 3.785 max_d=3.785 avg_d=1.893 std_dev=1.893
C1'	B	0, 0.000, 1.936, 3.872, 3.872 max_d=3.872 avg_d=1.936 std_dev=1.936
O5'	A	0, 0.000, 1.945, 3.890, 3.890 max_d=3.890 avg_d=1.945 std_dev=1.945
OP1	A	0, 0.000, 2.008, 4.015, 4.015 max_d=4.015 avg_d=2.008 std_dev=2.008
C4'	B	0, 0.000, 2.010, 4.020, 4.020 max_d=4.020 avg_d=2.010 std_dev=2.010
C2'	B	0, 0.000, 2.342, 4.684, 4.684 max_d=4.684 avg_d=2.342 std_dev=2.342
C3'	B	0, 0.000, 2.344, 4.689, 4.689 max_d=4.689 avg_d=2.344 std_dev=2.344
O2'	B	0, 0.000, 2.584, 5.169, 5.169 max_d=5.169 avg_d=2.584 std_dev=2.584
O3'	B	0, 0.000, 2.761, 5.523, 5.523 max_d=5.523 avg_d=2.761 std_dev=2.761

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.20	0.70	0.36
C2	0.01	0.00	0.14	0.03	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.06	0.15	0.47	0.02	0.36	0.02
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.01	0.17	0.00	0.10	0.02	0.27	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.56	0.27
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.39	0.16
C4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.34	0.23	0.37	0.12
C4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.11	0.08	0.14	0.03	0.06	0.00	0.01	0.04	0.46	0.22
C5	0.00	0.00	0.13	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.18	0.11	0.09	0.44	0.62	0.36
C5'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.25	0.18	0.30	0.03	0.08	0.01	0.00	0.18	0.14	0.01
C6	0.00	0.00	0.17	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.17	0.15	0.00	0.46	0.79	0.47
N1	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.22	0.22	0.63	0.28
N3	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.11	0.49	0.05	0.27	0.03
N4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.01	0.37	0.23	0.25	0.05
O2	0.02	0.00	0.27	0.10	0.00	0.14	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.36	0.18	0.25	0.59	0.15	0.25	0.12
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.03	0.15	0.02	0.15	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.63	0.35
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.06	0.18	0.08	0.17	0.03	0.01	0.11	0.18	0.01	0.00	0.04	0.12	0.17	0.34	0.16
O4'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.00	0.11	0.01	0.25	0.01	0.04	0.00	0.08	0.21	0.72	0.39
O5'	0.11	0.47	0.05	0.02	0.34	0.01	0.09	0.00	0.00	0.22	0.49	0.37	0.59	0.03	0.12	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.02	0.04	0.10	0.23	0.04	0.44	0.18	0.46	0.22	0.05	0.23	0.15	0.06	0.17	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.70	0.36	0.56	0.39	0.37	0.46	0.62	0.14	0.79	0.63	0.27	0.25	0.25	0.63	0.34	0.72	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.36	0.02	0.27	0.16	0.12	0.22	0.36	0.01	0.47	0.28	0.03	0.05	0.12	0.35	0.16	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.04	0.11	0.14	0.14	0.14	0.23	0.27	0.23	0.13	0.06	0.04	0.04	0.06	0.14	0.13	0.16	0.10	0.02	0.02
C2	0.22	0.13	0.25	0.33	0.25	0.31	0.36	0.49	0.36	0.24	0.15	0.03	0.15	0.28	0.24	0.24	0.33	0.09	0.06	0.11
C2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.10	0.04	0.03	0.11	0.16	0.06	0.05	0.06	0.02	0.00	0.24	0.16	0.14
C3'	0.09	0.19	0.07	0.02	0.11	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.18	0.26	0.12	0.08	0.11	0.09	0.06	0.29	0.17	0.18
C4	0.15	0.07	0.17	0.26	0.22	0.24	0.34	0.44	0.33	0.19	0.11	0.04	0.06	0.19	0.23	0.18	0.30	0.09	0.06	0.10
C4'	0.04	0.06	0.04	0.08	0.06	0.07	0.18	0.19	0.17	0.05	0.04	0.15	0.03	0.01	0.06	0.05	0.07	0.16	0.00	0.04
C5	0.03	0.03	0.02	0.06	0.12	0.04	0.22	0.19	0.21	0.07	0.01	0.12	0.08	0.04	0.13	0.04	0.11	0.10	0.00	0.01
C5'	0.04	0.15	0.03	0.03	0.02	0.00	0.15	0.13	0.14	0.02	0.12	0.27	0.12	0.04	0.02	0.03	0.02	0.21	0.02	0.08
C6	0.03	0.03	0.01	0.04	0.10	0.03	0.19	0.16	0.18	0.06	0.00	0.12	0.07	0.06	0.11	0.04	0.09	0.10	0.01	0.01
N1	0.12	0.05	0.12	0.17	0.16	0.16	0.26	0.31	0.26	0.14	0.07	0.04	0.03	0.09	0.17	0.14	0.19	0.10	0.02	0.04
N3	0.24	0.15	0.28	0.39	0.28	0.37	0.40	0.57	0.40	0.26	0.17	0.04	0.17	0.35	0.27	0.27	0.39	0.08	0.08	0.14
N4	0.19	0.10	0.21	0.32	0.26	0.30	0.39	0.54	0.39	0.23	0.13	0.03	0.08	0.26	0.26	0.22	0.38	0.08	0.11	0.16
O2	0.28	0.18	0.33	0.42	0.29	0.40	0.40	0.58	0.40	0.29	0.19	0.08	0.23	0.40	0.28	0.30	0.39	0.08	0.08	0.14
O2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01	0.09	0.11	0.03	0.05	0.06	0.01	0.01	0.23	0.16	0.14
O3'	0.20	0.31	0.17	0.14	0.26	0.17	0.17	0.10	0.15	0.22	0.32	0.36	0.21	0.19	0.28	0.20	0.20	0.39	0.28	0.31
O4'	0.18	0.09	0.16	0.20	0.23	0.20	0.34	0.34	0.33	0.20	0.12	0.01	0.07	0.11	0.24	0.19	0.22	0.03	0.13	0.10
O5'	0.13	0.23	0.14	0.08	0.02	0.09	0.13	0.06	0.10	0.09	0.18	0.37	0.24	0.16	0.00	0.11	0.05	0.29	0.07	0.15
OP1	0.55	0.42	0.53	0.56	0.59	0.55	0.75	0.65	0.74	0.57	0.44	0.28	0.45	0.47	0.59	0.55	0.50	0.30	0.60	0.43
OP2	0.31	0.11	0.36	0.45	0.25	0.43	0.44	0.57	0.47	0.29	0.10	0.03	0.28	0.43	0.22	0.34	0.36	0.03	0.41	0.22
P	0.27	0.11	0.28	0.34	0.28	0.33	0.45	0.46	0.45	0.28	0.13	0.03	0.19	0.29	0.28	0.29	0.29	0.01	0.34	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.06	0.06	0.05
C2	0.00	0.00	0.10	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.13	0.00	0.06	0.11	0.06	0.05	0.08
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.08	0.17	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.09	0.00	0.05	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.05	0.11	0.03
C4	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.08	0.27	0.13	0.10
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.09	0.15	0.08
C5	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.01	0.02	0.48	0.24	0.23
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.15	0.00	0.15	0.00	0.13	0.09	0.12	0.07	0.00	0.03	0.16	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.03	0.00	0.39	0.20	0.20
N1	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.02
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.11	0.04	0.01	0.03
O2	0.01	0.00	0.17	0.13	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.22	0.00	0.08	0.13	0.22	0.15	0.17
O2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.08	0.17	0.00	0.07	0.03	0.02	0.01	0.14	0.20	0.10
O3'	0.03	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.10	0.02	0.10	0.22	0.07	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.23	0.04
O4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.08	0.30	0.16	0.11
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.12	0.07	0.08
O5'	0.04	0.11	0.03	0.09	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.11	0.13	0.01	0.06	0.08	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.06	0.00	0.05	0.27	0.09	0.48	0.01	0.39	0.08	0.04	0.22	0.14	0.01	0.30	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.05	0.11	0.11	0.13	0.15	0.24	0.04	0.20	0.03	0.01	0.15	0.20	0.23	0.16	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.01	0.03	0.10	0.08	0.23	0.01	0.20	0.02	0.03	0.17	0.10	0.04	0.11	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00