Doublet Group distance statistics: 52518

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
O2'	A	0, 0.000, 0.084, 0.168, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.084 std_dev=0.084
O4'	A	0, 0.000, 0.113, 0.226, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.113 std_dev=0.113
C2'	A	0, 0.000, 0.115, 0.231, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.115 std_dev=0.115
C5'	A	0, 0.000, 0.202, 0.404, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.202 std_dev=0.202
O5'	A	0, 0.000, 0.203, 0.407, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.203 std_dev=0.203
C4'	A	0, 0.000, 0.206, 0.412, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.206 std_dev=0.206
C3'	A	0, 0.000, 0.246, 0.492, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.246 std_dev=0.246
O3'	A	0, 0.000, 0.426, 0.851, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.426 std_dev=0.426
P	B	0, 0.000, 0.502, 1.004, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.502 std_dev=0.502
OP1	A	0, 0.000, 0.632, 1.264, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.632 std_dev=0.632
OP1	B	0, 0.000, 0.671, 1.341, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.671 std_dev=0.671
OP2	B	0, 0.000, 0.719, 1.438, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.719 std_dev=0.719
P	A	0, 0.000, 1.159, 2.317, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.159 std_dev=1.159
O5'	B	0, 0.000, 1.352, 2.704, 2.704 max_d=2.704 avg_d=1.352 std_dev=1.352
C5'	B	0, 0.000, 2.088, 4.176, 4.176 max_d=4.176 avg_d=2.088 std_dev=2.088
OP2	A	0, 0.000, 2.149, 4.299, 4.299 max_d=4.299 avg_d=2.149 std_dev=2.149
C4'	B	0, 0.000, 2.724, 5.448, 5.448 max_d=5.448 avg_d=2.724 std_dev=2.724
C3'	B	0, 0.000, 2.855, 5.709, 5.709 max_d=5.709 avg_d=2.855 std_dev=2.855
O4'	B	0, 0.000, 2.909, 5.818, 5.818 max_d=5.818 avg_d=2.909 std_dev=2.909
O3'	B	0, 0.000, 3.191, 6.382, 6.382 max_d=6.382 avg_d=3.191 std_dev=3.191
C2'	B	0, 0.000, 3.479, 6.958, 6.958 max_d=6.958 avg_d=3.479 std_dev=3.479
C1'	B	0, 0.000, 3.482, 6.964, 6.964 max_d=6.964 avg_d=3.482 std_dev=3.482
N1	B	0, 0.000, 3.626, 7.252, 7.252 max_d=7.252 avg_d=3.626 std_dev=3.626
C6	B	0, 0.000, 3.631, 7.263, 7.263 max_d=7.263 avg_d=3.631 std_dev=3.631
C5	B	0, 0.000, 4.086, 8.171, 8.171 max_d=8.171 avg_d=4.086 std_dev=4.086
C2	B	0, 0.000, 4.108, 8.216, 8.216 max_d=8.216 avg_d=4.108 std_dev=4.108
O2'	B	0, 0.000, 4.185, 8.369, 8.369 max_d=8.369 avg_d=4.185 std_dev=4.185
N3	B	0, 0.000, 4.247, 8.495, 8.495 max_d=8.495 avg_d=4.247 std_dev=4.247
C4	B	0, 0.000, 4.275, 8.551, 8.551 max_d=8.551 avg_d=4.275 std_dev=4.275
O2	B	0, 0.000, 4.600, 9.201, 9.201 max_d=9.201 avg_d=4.600 std_dev=4.600
O4	B	0, 0.000, 4.658, 9.315, 9.315 max_d=9.315 avg_d=4.658 std_dev=4.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.35	0.15
C2	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.09	0.13	0.19	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.06	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.12	0.20	0.77	0.37
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.03	0.07	0.06	0.10	0.12	0.07	0.00	0.01	0.01	0.10	0.21	0.87	0.41
C4	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.02	0.10	0.15	0.10	0.17
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.43	0.10
C5	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.01	0.09	0.15	0.18	0.15
C5'	0.04	0.04	0.03	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.24	0.00
C6	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.01	0.15
N1	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.12	0.19	0.17
N3	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.09	0.15	0.06	0.19
N4	0.00	0.00	0.06	0.12	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.16	0.02	0.10	0.16	0.20	0.16
O2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.12	0.30	0.19
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.03	0.06	0.12	0.77	0.28
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.14	0.01	0.13	0.02	0.09	0.06	0.12	0.16	0.06	0.04	0.00	0.00	0.06	0.20	1.05	0.43
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.04
O5'	0.07	0.09	0.12	0.10	0.10	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.13	0.20	0.21	0.15	0.04	0.15	0.02	0.13	0.12	0.15	0.16	0.12	0.12	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.19	0.77	0.87	0.10	0.43	0.18	0.24	0.01	0.19	0.06	0.20	0.30	0.77	1.05	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.18	0.37	0.41	0.17	0.10	0.15	0.00	0.15	0.17	0.19	0.16	0.19	0.28	0.43	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.22	1.49	1.38	1.50	0.57	1.48	0.10	1.37	0.29	0.99	1.21	2.11	1.58	1.78	0.42	1.20	0.59	0.39	0.18	0.21
C2	0.81	0.97	0.96	1.15	0.06	1.21	0.38	1.20	0.16	0.53	0.68	1.55	1.20	1.47	0.10	0.86	0.46	0.40	0.16	0.13
C2'	1.43	1.68	1.62	1.67	0.76	1.61	0.30	1.39	0.49	1.19	1.39	2.30	1.90	1.99	0.60	1.35	0.65	0.47	0.21	0.18
C3'	1.63	1.93	1.81	1.77	1.07	1.67	0.61	1.38	0.76	1.43	1.68	2.54	2.08	2.05	0.94	1.49	0.66	0.53	0.17	0.16
C4	0.59	0.73	0.66	0.85	0.04	1.00	0.44	1.06	0.27	0.34	0.49	1.21	0.87	1.09	0.17	0.67	0.41	0.38	0.17	0.11
C4'	1.60	2.00	1.74	1.74	1.15	1.64	0.66	1.42	0.79	1.45	1.76	2.62	1.91	1.91	1.03	1.48	0.67	0.41	0.19	0.24
C5	0.86	1.05	0.90	1.07	0.32	1.22	0.08	1.25	0.06	0.66	0.83	1.53	1.06	1.24	0.21	0.93	0.54	0.39	0.20	0.19
C5'	1.80	2.26	1.91	1.85	1.48	1.73	1.01	1.48	1.10	1.72	2.06	2.86	2.01	1.90	1.39	1.66	0.77	0.29	0.28	0.36
C6	1.09	1.32	1.17	1.34	0.52	1.40	0.09	1.35	0.25	0.88	1.07	1.86	1.34	1.55	0.39	1.12	0.59	0.39	0.20	0.22
N1	1.04	1.26	1.17	1.34	0.37	1.37	0.07	1.32	0.12	0.80	0.98	1.84	1.38	1.61	0.23	1.06	0.55	0.40	0.18	0.18
N3	0.60	0.73	0.73	0.93	0.13	1.04	0.55	1.07	0.34	0.32	0.45	1.26	0.97	1.24	0.29	0.67	0.39	0.38	0.15	0.09
N4	0.31	0.42	0.37	0.53	0.27	0.72	0.65	0.82	0.49	0.08	0.21	0.85	0.58	0.77	0.38	0.41	0.27	0.36	0.15	0.04
O2	0.80	0.95	0.98	1.18	0.02	1.21	0.46	1.18	0.21	0.50	0.64	1.56	1.24	1.53	0.20	0.84	0.44	0.40	0.14	0.11
O2'	1.41	1.67	1.62	1.66	0.71	1.60	0.24	1.39	0.45	1.16	1.38	2.31	1.90	1.98	0.55	1.33	0.64	0.46	0.21	0.19
O3'	1.73	2.05	1.92	1.80	1.21	1.68	0.74	1.32	0.88	1.54	1.81	2.66	2.24	2.07	1.09	1.53	0.64	0.62	0.14	0.10
O4'	1.32	1.68	1.44	1.54	0.81	1.50	0.32	1.39	0.48	1.15	1.43	2.30	1.57	1.72	0.68	1.28	0.60	0.36	0.17	0.25
O5'	1.73	2.09	1.82	1.82	1.33	1.72	0.91	1.47	1.01	1.61	1.86	2.64	1.91	1.89	1.22	1.62	0.77	0.27	0.29	0.37
OP1	2.14	2.48	2.22	1.88	1.84	1.80	1.49	1.40	1.57	2.07	2.27	2.94	2.35	1.73	1.74	1.90	0.88	0.10	0.37	0.48
OP2	0.80	0.92	0.89	0.79	0.25	0.84	0.04	0.55	0.08	0.59	0.69	1.39	1.23	1.06	0.15	0.72	0.00	0.85	0.32	0.33
P	1.71	1.88	1.80	1.73	1.18	1.69	0.86	1.37	0.99	1.52	1.63	2.36	1.99	1.86	1.05	1.61	0.76	0.17	0.30	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.01	0.23	0.07
C2	0.01	0.00	0.13	0.32	0.01	0.18	0.01	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.27	0.01	0.06	0.02	0.22	0.18	0.11
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.13	0.01	0.07	0.28	0.00	0.00	0.04	0.00	0.21	0.27	0.25	0.19
C3'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.19	0.04	0.25	0.55	0.01	0.00	0.07	0.01	0.27	0.47	0.14	0.23
C4	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.03	0.00	0.04	0.16	0.21	0.62	0.08
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.04	0.17	0.27	0.03	0.06	0.09	0.00	0.00	0.16	0.14	0.01
C5	0.01	0.01	0.12	0.13	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.15	0.01	0.00	0.33	0.07	0.90	0.31
C5'	0.01	0.31	0.01	0.00	0.16	0.00	0.04	0.00	0.11	0.08	0.30	0.44	0.02	0.04	0.19	0.00	0.00	0.30	0.28	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.19	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.01	0.03	0.36	0.01	0.83	0.34
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.15	0.08	0.42	0.10
N3	0.01	0.00	0.07	0.25	0.00	0.17	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.21	0.01	0.06	0.02	0.27	0.31	0.08
O2	0.03	0.00	0.28	0.55	0.01	0.27	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.50	0.01	0.08	0.16	0.27	0.10	0.26
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.09	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.11	0.13	0.00	0.00	0.11	0.05	0.03	0.13	0.02	0.03
O3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.03	0.06	0.15	0.04	0.18	0.03	0.21	0.50	0.00	0.00	0.03	0.03	0.16	0.55	0.06	0.17
O4	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.00	0.04	0.15	0.25	0.66	0.07
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.05	0.03	0.04	0.00	0.02	0.08	0.10	0.00
O5'	0.11	0.02	0.21	0.27	0.16	0.00	0.33	0.00	0.36	0.15	0.02	0.16	0.03	0.16	0.15	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.01	0.22	0.27	0.47	0.21	0.16	0.07	0.30	0.01	0.08	0.27	0.27	0.13	0.55	0.25	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.23	0.18	0.25	0.14	0.62	0.14	0.90	0.28	0.83	0.42	0.31	0.10	0.02	0.06	0.66	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.19	0.23	0.08	0.01	0.31	0.01	0.34	0.10	0.08	0.26	0.03	0.17	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00