Doublet Group distance statistics: 52527

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, -0.001, 0.010, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.012, 0.032, 0.053, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.129, 0.250, 0.372, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.250 std_dev=0.121
C2'	A	0, 0.131, 0.277, 0.424, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.277 std_dev=0.146
O2'	A	0, 0.127, 0.303, 0.478, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.303 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.200, 0.387, 0.574, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.387 std_dev=0.187
C3'	A	0, 0.216, 0.431, 0.647, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.431 std_dev=0.215
O3'	A	0, 0.323, 0.623, 0.923, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.623 std_dev=0.300
O2'	B	0, 0.266, 0.602, 0.938, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.602 std_dev=0.336
C5'	A	0, 0.346, 0.685, 1.023, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.685 std_dev=0.338
O3'	B	0, 0.215, 0.557, 0.899, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.557 std_dev=0.342
C2'	B	0, 0.275, 0.706, 1.137, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.706 std_dev=0.431
C3'	B	0, 0.259, 0.699, 1.138, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.699 std_dev=0.439
O5'	A	0, 0.270, 0.781, 1.292, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.781 std_dev=0.511
C4'	B	0, 0.309, 0.824, 1.339, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.824 std_dev=0.515
C1'	B	0, 0.363, 0.899, 1.435, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.899 std_dev=0.536
O4'	B	0, 0.392, 0.954, 1.516, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.954 std_dev=0.562
C5'	B	0, 0.421, 0.988, 1.556, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.988 std_dev=0.568
O5'	B	0, 0.415, 0.993, 1.571, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.993 std_dev=0.578
P	A	0, 0.413, 0.993, 1.574, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.993 std_dev=0.581
OP1	A	0, 0.521, 1.131, 1.740, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.131 std_dev=0.610
N9	B	0, 0.416, 1.041, 1.666, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.041 std_dev=0.625
N3	B	0, 0.535, 1.170, 1.805, 1.899 max_d=1.899 avg_d=1.170 std_dev=0.635
C4	B	0, 0.469, 1.136, 1.803, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.136 std_dev=0.667
OP2	A	0, 0.634, 1.332, 2.029, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.332 std_dev=0.698
C8	B	0, 0.422, 1.124, 1.827, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.124 std_dev=0.702
C2	B	0, 0.629, 1.333, 2.037, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.333 std_dev=0.704
N2	B	0, 0.712, 1.427, 2.141, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.427 std_dev=0.715
P	B	0, 0.478, 1.220, 1.962, 2.198 max_d=2.198 avg_d=1.220 std_dev=0.742
C5	B	0, 0.484, 1.244, 2.005, 2.127 max_d=2.127 avg_d=1.244 std_dev=0.761
OP1	B	0, 0.475, 1.238, 2.000, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.238 std_dev=0.762
N1	B	0, 0.667, 1.448, 2.229, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.448 std_dev=0.781
OP2	B	0, 0.525, 1.320, 2.116, 2.286 max_d=2.286 avg_d=1.320 std_dev=0.795
N7	B	0, 0.412, 1.215, 2.018, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.215 std_dev=0.803
C6	B	0, 0.606, 1.413, 2.220, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.413 std_dev=0.807
O6	B	0, 0.677, 1.552, 2.427, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.552 std_dev=0.875

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.23	0.45	0.32	0.22
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.25	0.44	0.35	0.20
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.09	0.33	0.25	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.06	0.02	0.04	0.06	0.08	0.02	0.01	0.01	0.23	0.24	0.30	0.12
C4	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.32	0.41	0.42	0.21
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.29	0.27	0.07
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.37	0.41	0.46	0.25
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.24	0.36	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.37	0.43	0.44	0.26
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.29	0.44	0.37	0.23
N3	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.28	0.43	0.38	0.19
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.08	0.01	0.32	0.39	0.44	0.20
O2	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.20	0.44	0.31	0.18
O2'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.08	0.36	0.21	0.07
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.04	0.07	0.03	0.06	0.08	0.10	0.02	0.00	0.02	0.47	0.20	0.45	0.32
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.34	0.46	0.39	0.30
O5'	0.23	0.25	0.09	0.23	0.32	0.01	0.37	0.01	0.37	0.29	0.28	0.32	0.20	0.08	0.47	0.34	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.45	0.44	0.33	0.24	0.41	0.29	0.41	0.24	0.43	0.44	0.43	0.39	0.44	0.36	0.20	0.46	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.32	0.35	0.25	0.30	0.42	0.27	0.46	0.36	0.44	0.37	0.38	0.44	0.31	0.21	0.45	0.39	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.20	0.03	0.12	0.21	0.07	0.25	0.02	0.26	0.23	0.19	0.20	0.18	0.07	0.32	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.27	0.22	0.22	0.20	0.22	0.18	0.24	0.20	0.19	0.25	0.34	0.24	0.18	0.19	0.23	0.23	0.21	0.23	0.20	0.27	0.23	0.21
C2	0.11	0.20	0.14	0.16	0.12	0.14	0.14	0.17	0.16	0.14	0.19	0.27	0.16	0.14	0.12	0.12	0.19	0.13	0.17	0.17	0.25	0.21	0.18
C2'	0.24	0.25	0.24	0.23	0.22	0.26	0.22	0.29	0.21	0.25	0.24	0.31	0.23	0.24	0.24	0.23	0.23	0.27	0.28	0.21	0.34	0.28	0.26
C3'	0.32	0.29	0.30	0.29	0.29	0.33	0.29	0.36	0.27	0.33	0.28	0.32	0.29	0.31	0.32	0.29	0.27	0.35	0.34	0.27	0.38	0.32	0.31
C4	0.09	0.13	0.10	0.13	0.08	0.11	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.18	0.10	0.13	0.09	0.09	0.18	0.10	0.15	0.14	0.22	0.20	0.15
C4'	0.33	0.32	0.32	0.30	0.30	0.33	0.28	0.35	0.27	0.31	0.29	0.35	0.32	0.29	0.32	0.31	0.28	0.35	0.32	0.26	0.35	0.29	0.29
C5	0.13	0.17	0.18	0.20	0.13	0.16	0.15	0.19	0.16	0.15	0.17	0.20	0.14	0.16	0.14	0.17	0.25	0.12	0.19	0.17	0.22	0.21	0.18
C5'	0.38	0.36	0.36	0.33	0.36	0.36	0.34	0.38	0.33	0.36	0.34	0.38	0.38	0.34	0.38	0.34	0.30	0.39	0.34	0.32	0.36	0.30	0.31
C6	0.18	0.22	0.22	0.23	0.18	0.20	0.18	0.22	0.19	0.18	0.21	0.27	0.20	0.17	0.18	0.23	0.26	0.17	0.21	0.19	0.24	0.22	0.20
N1	0.15	0.23	0.19	0.20	0.16	0.18	0.16	0.20	0.18	0.17	0.22	0.29	0.20	0.16	0.16	0.19	0.22	0.16	0.20	0.19	0.25	0.21	0.19
N3	0.08	0.16	0.09	0.13	0.09	0.11	0.11	0.14	0.13	0.12	0.15	0.22	0.12	0.13	0.09	0.08	0.17	0.11	0.15	0.15	0.24	0.21	0.16
N4	0.13	0.11	0.10	0.12	0.09	0.12	0.10	0.13	0.11	0.13	0.10	0.16	0.11	0.13	0.10	0.16	0.16	0.14	0.13	0.13	0.22	0.20	0.14
O2	0.11	0.22	0.13	0.15	0.13	0.14	0.14	0.17	0.17	0.14	0.21	0.29	0.17	0.15	0.12	0.12	0.18	0.13	0.18	0.18	0.26	0.22	0.19
O2'	0.22	0.27	0.23	0.22	0.21	0.25	0.20	0.29	0.21	0.23	0.24	0.34	0.24	0.21	0.22	0.22	0.22	0.26	0.28	0.20	0.35	0.28	0.26
O3'	0.35	0.31	0.32	0.31	0.32	0.36	0.33	0.41	0.31	0.38	0.30	0.33	0.31	0.36	0.36	0.30	0.27	0.40	0.39	0.31	0.43	0.37	0.36
O4'	0.25	0.29	0.27	0.26	0.24	0.26	0.22	0.28	0.23	0.22	0.27	0.35	0.28	0.21	0.24	0.28	0.26	0.25	0.25	0.22	0.29	0.24	0.24
O5'	0.18	0.28	0.13	0.08	0.23	0.11	0.25	0.20	0.27	0.25	0.28	0.33	0.24	0.26	0.21	0.17	0.07	0.19	0.16	0.28	0.23	0.10	0.13
OP1	0.53	0.57	0.56	0.54	0.50	0.55	0.45	0.59	0.45	0.46	0.51	0.65	0.57	0.43	0.50	0.60	0.54	0.54	0.54	0.42	0.57	0.51	0.53
OP2	0.26	0.37	0.25	0.24	0.30	0.24	0.35	0.30	0.37	0.37	0.37	0.45	0.31	0.39	0.29	0.30	0.25	0.28	0.30	0.40	0.29	0.27	0.26
P	0.09	0.21	0.11	0.13	0.06	0.20	0.08	0.33	0.11	0.16	0.17	0.32	0.15	0.14	0.09	0.19	0.13	0.20	0.27	0.12	0.35	0.21	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.09	0.09
C2	0.06	0.00	0.09	0.07	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.05	0.05	0.01	0.06	0.10	0.06
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.07	0.13	0.10	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.09	0.06	0.02
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.09	0.11	0.07	0.11	0.08	0.13	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.14	0.13	0.07
C4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.06	0.01	0.07	0.09	0.06
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.10	0.07	0.09	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.13	0.13	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.04	0.07	0.04	0.13	0.03	0.04	0.05	0.01	0.01	0.12	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.13	0.00	0.15	0.17	0.13
C8	0.02	0.00	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.12	0.04	0.11	0.02	0.10	0.09	0.07
N1	0.05	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.03	0.09	0.00	0.11	0.14	0.09
N2	0.08	0.01	0.13	0.11	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.13	0.07	0.04	0.02	0.05	0.09	0.06
N3	0.06	0.00	0.10	0.08	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.05	0.04	0.01	0.05	0.09	0.07
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.16	0.02	0.15	0.15	0.13
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.09	0.06
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.10	0.18	0.13	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.09	0.06	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.02	0.11	0.05	0.12	0.12	0.09	0.13	0.09	0.15	0.05	0.03	0.00	0.02	0.07	0.15	0.19	0.19	0.11
O4'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.14	0.14
O5'	0.04	0.05	0.02	0.05	0.06	0.01	0.12	0.01	0.13	0.11	0.09	0.04	0.04	0.16	0.05	0.03	0.07	0.06	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.15	0.02	0.17	0.00	0.20	0.23	0.18
OP1	0.04	0.06	0.09	0.14	0.07	0.05	0.13	0.05	0.15	0.10	0.11	0.05	0.05	0.15	0.05	0.09	0.19	0.07	0.02	0.20	0.00	0.00	0.01
OP2	0.09	0.10	0.06	0.13	0.09	0.03	0.13	0.02	0.17	0.09	0.14	0.09	0.09	0.15	0.09	0.06	0.19	0.14	0.02	0.23	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.06	0.02	0.07	0.06	0.03	0.10	0.01	0.13	0.07	0.09	0.06	0.07	0.13	0.06	0.04	0.11	0.14	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00