Doublet Group distance statistics: 52542

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 7, 6, 11, 20, 37, 18, 13, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.011, 0.024, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.016, 0.038, 0.060, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.048 std_dev=0.028
C4	B	0, 0.441, 0.632, 0.822, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.632 std_dev=0.190
C5	B	0, 0.379, 0.576, 0.773, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.576 std_dev=0.197
O4'	A	0, 0.100, 0.320, 0.539, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.320 std_dev=0.219
N9	B	0, 0.440, 0.662, 0.884, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.662 std_dev=0.222
N7	B	0, 0.349, 0.574, 0.799, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.574 std_dev=0.225
C8	B	0, 0.398, 0.628, 0.858, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.628 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.188, 0.421, 0.655, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.421 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.476, 0.713, 0.949, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.713 std_dev=0.237
C2'	A	0, 0.130, 0.377, 0.623, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.377 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.364, 0.617, 0.870, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.617 std_dev=0.253
C4'	A	0, 0.203, 0.458, 0.712, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.458 std_dev=0.254
O3'	A	0, 0.151, 0.413, 0.674, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.413 std_dev=0.262
C1'	B	0, 0.526, 0.809, 1.093, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.809 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.437, 0.727, 1.017, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.727 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.485, 0.783, 1.080, 2.502 max_d=2.502 avg_d=0.783 std_dev=0.297
N1	B	0, 0.390, 0.695, 0.999, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.695 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.435, 0.740, 1.046, 2.654 max_d=2.654 avg_d=0.740 std_dev=0.306
N6	B	0, 0.347, 0.655, 0.963, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.655 std_dev=0.308
P	B	0, 0.384, 0.707, 1.030, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.707 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.530, 0.858, 1.185, 2.687 max_d=2.687 avg_d=0.858 std_dev=0.327
O4'	B	0, 0.579, 0.917, 1.256, 2.299 max_d=2.299 avg_d=0.917 std_dev=0.339
C5'	B	0, 0.504, 0.844, 1.183, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.844 std_dev=0.340
O5'	B	0, 0.592, 0.948, 1.304, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.948 std_dev=0.356
OP2	B	0, 0.755, 1.133, 1.511, 1.924 max_d=1.924 avg_d=1.133 std_dev=0.378
O2'	B	0, 0.645, 1.055, 1.465, 3.206 max_d=3.206 avg_d=1.055 std_dev=0.410
O2'	A	0, 0.220, 0.643, 1.067, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.643 std_dev=0.423
O3'	B	0, 0.487, 0.929, 1.371, 3.469 max_d=3.469 avg_d=0.929 std_dev=0.442
OP1	B	0, 0.915, 1.369, 1.824, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.369 std_dev=0.455
C5'	A	0, 0.418, 0.892, 1.367, 2.422 max_d=2.422 avg_d=0.892 std_dev=0.474
O5'	A	0, 0.632, 1.161, 1.690, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.161 std_dev=0.529
P	A	0, 0.545, 1.111, 1.678, 3.664 max_d=3.664 avg_d=1.111 std_dev=0.566
OP1	A	0, 0.614, 1.208, 1.803, 3.522 max_d=3.522 avg_d=1.208 std_dev=0.595
OP2	A	0, 0.540, 1.168, 1.795, 4.257 max_d=4.257 avg_d=1.168 std_dev=0.627

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.01	0.26	0.21	0.30	0.19
C2	0.03	0.00	0.16	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.26	0.16	0.13	0.33	0.29	0.52	0.37
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.12	0.08	0.13	0.12	0.16	0.08	0.11	0.04	0.00	0.03	0.02	0.53	0.49	0.36	0.43
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.08	0.09	0.07	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.37	0.49	0.27	0.35
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.07	0.34	0.30	0.50	0.38
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.05	0.07	0.07	0.11	0.05	0.08	0.03	0.01	0.02	0.17	0.29	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.03	0.39	0.42	0.62	0.48
C5'	0.07	0.12	0.12	0.02	0.15	0.01	0.21	0.00	0.20	0.27	0.15	0.11	0.23	0.27	0.17	0.07	0.11	0.02	0.01	0.11	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.10	0.06	0.38	0.44	0.66	0.50
C8	0.02	0.02	0.13	0.08	0.01	0.12	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.21	0.08	0.10	0.42	0.41	0.56	0.46
N1	0.03	0.00	0.12	0.08	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.13	0.10	0.36	0.37	0.60	0.44
N3	0.03	0.00	0.16	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.15	0.13	0.31	0.25	0.46	0.32
N6	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.17	0.09	0.05	0.40	0.53	0.73	0.56
N7	0.01	0.02	0.11	0.07	0.01	0.11	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.20	0.07	0.07	0.42	0.50	0.68	0.54
N9	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.09	0.02	0.35	0.28	0.44	0.34
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.13	0.08	0.14	0.07	0.16	0.21	0.20	0.25	0.17	0.20	0.09	0.00	0.07	0.05	0.55	0.59	0.47	0.50
O3'	0.12	0.16	0.03	0.01	0.11	0.03	0.09	0.11	0.10	0.08	0.13	0.15	0.09	0.07	0.09	0.07	0.00	0.12	0.25	0.53	0.29	0.32
O4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.10	0.10	0.13	0.05	0.07	0.02	0.05	0.12	0.00	0.11	0.10	0.41	0.18
O5'	0.26	0.33	0.53	0.37	0.34	0.02	0.39	0.01	0.38	0.42	0.36	0.31	0.40	0.42	0.35	0.55	0.25	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.29	0.49	0.49	0.30	0.17	0.42	0.11	0.44	0.41	0.37	0.25	0.53	0.50	0.28	0.59	0.53	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.52	0.36	0.27	0.50	0.29	0.62	0.34	0.66	0.56	0.60	0.46	0.73	0.68	0.44	0.47	0.29	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.37	0.43	0.35	0.38	0.05	0.48	0.02	0.50	0.46	0.44	0.32	0.56	0.54	0.34	0.50	0.32	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.17	0.19	0.14	0.22	0.25	0.18	0.22	0.15	0.29	0.15	0.21	0.19	0.21	0.28	0.23	0.15	0.39	0.14	0.22	0.32	0.07
C2	0.27	0.20	0.17	0.14	0.24	0.21	0.25	0.22	0.20	0.29	0.19	0.22	0.19	0.29	0.27	0.19	0.19	0.32	0.19	0.21	0.47	0.13
C2'	0.26	0.27	0.21	0.23	0.24	0.23	0.25	0.25	0.29	0.25	0.29	0.25	0.32	0.23	0.25	0.21	0.30	0.34	0.19	0.12	0.43	0.16
C3'	0.27	0.15	0.15	0.15	0.17	0.22	0.16	0.21	0.18	0.21	0.17	0.17	0.23	0.16	0.21	0.17	0.21	0.37	0.08	0.14	0.18	0.03
C4	0.29	0.16	0.16	0.12	0.22	0.22	0.20	0.22	0.14	0.29	0.14	0.19	0.14	0.25	0.27	0.20	0.16	0.35	0.14	0.20	0.44	0.10
C4'	0.43	0.22	0.28	0.20	0.27	0.36	0.19	0.31	0.16	0.29	0.18	0.28	0.19	0.19	0.34	0.35	0.18	0.51	0.31	0.37	0.16	0.19
C5	0.29	0.16	0.16	0.12	0.21	0.23	0.19	0.22	0.15	0.29	0.15	0.19	0.15	0.25	0.27	0.20	0.17	0.36	0.14	0.20	0.47	0.11
C5'	0.49	0.26	0.33	0.25	0.30	0.43	0.21	0.39	0.18	0.31	0.20	0.32	0.20	0.20	0.37	0.42	0.24	0.58	0.37	0.43	0.29	0.25
C6	0.28	0.18	0.16	0.12	0.22	0.22	0.21	0.22	0.17	0.29	0.17	0.20	0.16	0.26	0.26	0.19	0.18	0.35	0.15	0.19	0.50	0.13
C8	0.32	0.16	0.19	0.14	0.21	0.25	0.18	0.24	0.14	0.28	0.15	0.20	0.17	0.22	0.27	0.23	0.17	0.39	0.14	0.21	0.43	0.12
N1	0.27	0.20	0.17	0.13	0.24	0.21	0.24	0.22	0.20	0.29	0.19	0.22	0.19	0.28	0.27	0.19	0.19	0.33	0.17	0.20	0.50	0.13
N3	0.28	0.17	0.16	0.12	0.23	0.21	0.23	0.21	0.16	0.30	0.15	0.20	0.13	0.28	0.27	0.19	0.17	0.33	0.17	0.21	0.43	0.12
N6	0.28	0.19	0.16	0.12	0.22	0.22	0.21	0.22	0.18	0.29	0.18	0.20	0.17	0.26	0.26	0.19	0.18	0.35	0.14	0.19	0.53	0.14
N7	0.31	0.15	0.18	0.13	0.21	0.24	0.18	0.23	0.14	0.29	0.15	0.19	0.16	0.23	0.27	0.22	0.17	0.38	0.13	0.21	0.47	0.12
N9	0.31	0.16	0.18	0.13	0.21	0.24	0.18	0.22	0.14	0.29	0.14	0.20	0.17	0.23	0.28	0.22	0.16	0.38	0.13	0.21	0.40	0.09
O2'	0.43	0.51	0.45	0.45	0.48	0.39	0.48	0.37	0.48	0.43	0.50	0.49	0.45	0.44	0.45	0.45	0.49	0.43	0.39	0.24	0.60	0.30
O3'	0.31	0.26	0.23	0.19	0.27	0.24	0.27	0.23	0.28	0.30	0.27	0.27	0.30	0.29	0.30	0.22	0.21	0.38	0.02	0.03	0.02	0.01
O4'	0.45	0.29	0.31	0.21	0.33	0.34	0.26	0.27	0.22	0.35	0.24	0.33	0.21	0.25	0.38	0.38	0.18	0.50	0.27	0.36	0.15	0.13
O5'	0.35	0.22	0.25	0.20	0.25	0.31	0.21	0.31	0.20	0.28	0.20	0.25	0.20	0.23	0.29	0.30	0.19	0.40	0.26	0.32	0.55	0.25
OP1	0.54	0.25	0.51	0.54	0.32	0.64	0.24	0.68	0.18	0.38	0.19	0.33	0.19	0.26	0.42	0.58	0.59	0.64	0.61	0.69	0.88	0.65
OP2	0.26	0.36	0.23	0.28	0.29	0.29	0.34	0.35	0.42	0.26	0.42	0.30	0.49	0.32	0.26	0.24	0.36	0.32	0.40	0.46	0.55	0.35
P	0.37	0.23	0.28	0.28	0.24	0.40	0.22	0.44	0.24	0.27	0.24	0.24	0.29	0.22	0.29	0.34	0.32	0.45	0.39	0.49	0.66	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.26	0.41	0.13
C2	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.23	0.03	0.15	0.26	0.39	0.17
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.11	0.15	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.56	0.15
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.13	0.15	0.16	0.17	0.13	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.62	0.18
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.02	0.16	0.26	0.38	0.16
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.08	0.08	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.22	0.46	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.03	0.19	0.28	0.37	0.18
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.12	0.10	0.14	0.14	0.07	0.03	0.03	0.02	0.01	0.22	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.16	0.03	0.19	0.29	0.37	0.18
C8	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.27	0.27	0.38	0.20
N1	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.20	0.03	0.17	0.28	0.38	0.18
N3	0.03	0.00	0.15	0.17	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.14	0.26	0.39	0.16
N6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.17	0.05	0.21	0.33	0.37	0.20
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.25	0.31	0.37	0.21
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.17	0.25	0.39	0.16
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.09	0.12	0.05	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.20	0.58	0.13
O3'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.12	0.01	0.13	0.03	0.16	0.17	0.20	0.21	0.17	0.18	0.07	0.04	0.00	0.01	0.24	0.13	0.74	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.19	0.32	0.34	0.12
O5'	0.12	0.15	0.07	0.15	0.16	0.01	0.19	0.01	0.19	0.27	0.17	0.14	0.21	0.25	0.17	0.05	0.24	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.26	0.15	0.10	0.26	0.22	0.28	0.22	0.29	0.27	0.28	0.26	0.33	0.31	0.25	0.20	0.13	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.39	0.56	0.62	0.38	0.46	0.37	0.36	0.37	0.38	0.38	0.39	0.37	0.37	0.39	0.58	0.74	0.34	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.17	0.15	0.18	0.16	0.06	0.18	0.01	0.18	0.20	0.18	0.16	0.20	0.21	0.16	0.13	0.22	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00