Doublet Group distance statistics: 52543

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 6, 9, 5, 8, 2, 6, 3, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.014, 0.019, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.016, 0.029, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.019, 0.035, 0.050, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C2	A	0, -0.003, 0.015, 0.034, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.015 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.017, 0.038, 0.059, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.045, 0.067, 0.089, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.067 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.004, 0.026, 0.048, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.026 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.022, 0.047, 0.072, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.047 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.024, 0.054, 0.084, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.054 std_dev=0.030
C8	B	0, 0.214, 0.410, 0.606, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.410 std_dev=0.196
N9	B	0, 0.230, 0.434, 0.638, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.434 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.250, 0.455, 0.661, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.455 std_dev=0.206
N7	B	0, 0.206, 0.423, 0.639, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.423 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.334, 0.577, 0.821, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.577 std_dev=0.243
C1'	B	0, 0.333, 0.578, 0.822, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.578 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.202, 0.451, 0.701, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.451 std_dev=0.249
C3'	A	0, 0.046, 0.322, 0.599, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.322 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.334, 0.669, 1.005, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.669 std_dev=0.335
O4'	A	0, 0.035, 0.375, 0.716, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.375 std_dev=0.341
O3'	A	0, 0.035, 0.376, 0.718, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.376 std_dev=0.341
C2'	A	0, 0.047, 0.398, 0.748, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.398 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.396, 0.752, 1.107, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.752 std_dev=0.355
O4'	B	0, 0.227, 0.602, 0.977, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.602 std_dev=0.375
C6	B	0, 0.156, 0.560, 0.965, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.560 std_dev=0.404
O2'	B	0, 0.465, 0.885, 1.304, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.885 std_dev=0.419
O5'	B	0, 0.255, 0.676, 1.098, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.676 std_dev=0.422
N1	B	0, 0.221, 0.664, 1.107, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.664 std_dev=0.443
P	B	0, 0.453, 0.899, 1.345, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.899 std_dev=0.446
C3'	B	0, 0.360, 0.818, 1.277, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.818 std_dev=0.459
C4'	A	0, 0.027, 0.527, 1.026, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.527 std_dev=0.499
C4'	B	0, 0.235, 0.735, 1.235, 2.024 max_d=2.024 avg_d=0.735 std_dev=0.500
N6	B	0, 0.105, 0.637, 1.169, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.637 std_dev=0.532
C5'	B	0, 0.269, 0.834, 1.399, 2.130 max_d=2.130 avg_d=0.834 std_dev=0.565
OP2	B	0, 0.895, 1.506, 2.117, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.506 std_dev=0.611
O2'	A	0, 0.067, 0.692, 1.318, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.692 std_dev=0.626
OP1	B	0, 0.716, 1.358, 2.000, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.358 std_dev=0.642
O3'	B	0, 0.412, 1.061, 1.710, 2.387 max_d=2.387 avg_d=1.061 std_dev=0.649
C5'	A	0, 0.026, 1.000, 1.973, 3.029 max_d=3.029 avg_d=1.000 std_dev=0.974
O5'	A	0, 0.216, 1.251, 2.286, 3.375 max_d=3.375 avg_d=1.251 std_dev=1.035
P	A	0, 0.140, 1.725, 3.309, 4.973 max_d=4.973 avg_d=1.725 std_dev=1.585
OP2	A	0, 0.326, 2.083, 3.840, 5.625 max_d=5.625 avg_d=2.083 std_dev=1.757
OP1	A	0, 0.180, 1.950, 3.720, 5.717 max_d=5.717 avg_d=1.950 std_dev=1.770

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.21	0.16	0.34	0.22
C2	0.05	0.00	0.25	0.16	0.01	0.12	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.39	0.09	0.17	0.34	0.29	0.72	0.44
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.01	0.08	0.10	0.13	0.12	0.21	0.25	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.29	0.34	0.39	0.30
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.12	0.05	0.15	0.14	0.12	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.18	0.33	0.34	0.24
C4	0.02	0.01	0.14	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.05	0.09	0.38	0.35	0.67	0.47
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.14	0.08	0.12	0.04	0.11	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.14	0.21	0.07
C5	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.04	0.03	0.47	0.51	0.82	0.61
C5'	0.06	0.06	0.10	0.02	0.09	0.00	0.18	0.00	0.14	0.31	0.07	0.06	0.20	0.29	0.15	0.08	0.07	0.01	0.01	0.11	0.14	0.01
C6	0.03	0.00	0.13	0.12	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.19	0.05	0.07	0.47	0.52	0.88	0.63
C8	0.00	0.01	0.12	0.05	0.00	0.14	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.11	0.51	0.55	0.71	0.61
N1	0.04	0.00	0.21	0.15	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.30	0.08	0.13	0.41	0.41	0.83	0.55
N3	0.04	0.00	0.25	0.14	0.00	0.12	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.38	0.08	0.17	0.30	0.23	0.63	0.38
N6	0.03	0.01	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.05	0.04	0.51	0.63	0.97	0.72
N7	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.11	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.03	0.07	0.53	0.63	0.86	0.70
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.37	0.34	0.57	0.43
O2'	0.02	0.39	0.00	0.01	0.18	0.09	0.13	0.08	0.19	0.22	0.30	0.38	0.16	0.18	0.07	0.00	0.05	0.07	0.24	0.35	0.52	0.34
O3'	0.11	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.04	0.07	0.05	0.05	0.08	0.08	0.05	0.03	0.06	0.05	0.00	0.10	0.13	0.35	0.37	0.23
O4'	0.00	0.17	0.02	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.11	0.13	0.17	0.04	0.07	0.01	0.07	0.10	0.00	0.14	0.11	0.38	0.24
O5'	0.21	0.34	0.29	0.18	0.38	0.01	0.47	0.01	0.47	0.51	0.41	0.30	0.51	0.53	0.37	0.24	0.13	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.29	0.34	0.33	0.35	0.14	0.51	0.11	0.52	0.55	0.41	0.23	0.63	0.63	0.34	0.35	0.35	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.72	0.39	0.34	0.67	0.21	0.82	0.14	0.88	0.71	0.83	0.63	0.97	0.86	0.57	0.52	0.37	0.38	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.44	0.30	0.24	0.47	0.07	0.61	0.01	0.63	0.61	0.55	0.38	0.72	0.70	0.43	0.34	0.23	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.21	0.19	0.17	0.19	0.12	0.20	0.06	0.22	0.19	0.22	0.20	0.25	0.19	0.19	0.18	0.20	0.21	0.06	0.21	0.14	0.05
C2	0.20	0.17	0.22	0.23	0.17	0.17	0.17	0.16	0.15	0.22	0.17	0.17	0.15	0.22	0.20	0.22	0.29	0.22	0.19	0.24	0.27	0.13
C2'	0.27	0.25	0.20	0.17	0.26	0.20	0.27	0.16	0.26	0.30	0.25	0.25	0.26	0.29	0.27	0.21	0.18	0.29	0.15	0.24	0.19	0.10
C3'	0.20	0.16	0.14	0.12	0.17	0.11	0.17	0.05	0.16	0.21	0.16	0.16	0.16	0.19	0.19	0.13	0.16	0.23	0.05	0.13	0.20	0.01
C4	0.19	0.18	0.20	0.20	0.16	0.14	0.15	0.10	0.18	0.19	0.20	0.17	0.20	0.16	0.18	0.20	0.25	0.21	0.12	0.22	0.20	0.08
C4'	0.41	0.52	0.34	0.23	0.50	0.21	0.52	0.08	0.53	0.46	0.53	0.50	0.53	0.51	0.46	0.33	0.19	0.37	0.14	0.21	0.27	0.14
C5	0.19	0.18	0.21	0.22	0.16	0.14	0.15	0.10	0.17	0.19	0.19	0.17	0.19	0.16	0.18	0.20	0.28	0.21	0.12	0.21	0.22	0.08
C5'	0.51	0.58	0.38	0.26	0.56	0.28	0.56	0.15	0.57	0.53	0.57	0.57	0.55	0.55	0.54	0.40	0.20	0.49	0.20	0.17	0.39	0.14
C6	0.19	0.18	0.22	0.23	0.17	0.16	0.16	0.12	0.16	0.20	0.18	0.17	0.16	0.18	0.19	0.22	0.30	0.21	0.15	0.21	0.25	0.10
C8	0.20	0.20	0.20	0.20	0.18	0.13	0.18	0.07	0.20	0.18	0.21	0.18	0.23	0.17	0.18	0.19	0.25	0.22	0.08	0.20	0.21	0.07
N1	0.20	0.17	0.22	0.24	0.17	0.17	0.17	0.15	0.16	0.22	0.17	0.17	0.16	0.21	0.20	0.23	0.31	0.22	0.18	0.23	0.27	0.12
N3	0.19	0.18	0.20	0.20	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.20	0.19	0.17	0.18	0.19	0.18	0.20	0.25	0.21	0.16	0.24	0.24	0.11
N6	0.19	0.18	0.23	0.24	0.17	0.16	0.16	0.12	0.16	0.20	0.18	0.17	0.16	0.18	0.19	0.22	0.32	0.21	0.15	0.21	0.27	0.10
N7	0.19	0.19	0.21	0.22	0.17	0.13	0.16	0.08	0.18	0.18	0.20	0.17	0.21	0.16	0.18	0.20	0.27	0.21	0.09	0.20	0.22	0.08
N9	0.19	0.20	0.20	0.19	0.18	0.12	0.17	0.07	0.20	0.18	0.21	0.18	0.24	0.16	0.18	0.19	0.24	0.21	0.08	0.21	0.17	0.06
O2'	0.44	0.58	0.33	0.23	0.55	0.30	0.60	0.26	0.64	0.52	0.62	0.54	0.66	0.60	0.50	0.33	0.19	0.44	0.26	0.41	0.35	0.22
O3'	0.19	0.21	0.15	0.13	0.20	0.12	0.20	0.06	0.21	0.20	0.21	0.20	0.21	0.20	0.20	0.15	0.15	0.22	0.01	0.02	0.02	0.01
O4'	0.31	0.49	0.29	0.21	0.43	0.14	0.48	0.08	0.54	0.34	0.53	0.44	0.59	0.44	0.36	0.28	0.20	0.26	0.09	0.28	0.15	0.13
O5'	0.37	0.30	0.29	0.27	0.32	0.28	0.31	0.24	0.30	0.35	0.30	0.31	0.32	0.32	0.35	0.29	0.31	0.41	0.24	0.38	0.31	0.19
OP1	0.74	0.55	0.65	0.62	0.61	0.67	0.53	0.62	0.46	0.65	0.48	0.61	0.39	0.55	0.68	0.66	0.64	0.81	0.57	0.70	0.55	0.46
OP2	0.37	0.32	0.48	0.58	0.28	0.48	0.28	0.52	0.34	0.31	0.36	0.30	0.40	0.27	0.31	0.43	0.72	0.46	0.50	0.72	0.60	0.50
P	0.46	0.28	0.39	0.41	0.34	0.43	0.29	0.41	0.25	0.40	0.25	0.33	0.23	0.32	0.41	0.39	0.48	0.55	0.39	0.57	0.45	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.25	0.20	0.08
C2	0.01	0.00	0.14	0.23	0.01	0.13	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.29	0.02	0.17	0.20	0.34	0.15
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.11	0.14	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.29	0.07
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.14	0.00	0.11	0.02	0.15	0.06	0.21	0.22	0.13	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.32	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.01	0.15	0.21	0.27	0.11
C4'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.10	0.04	0.13	0.12	0.09	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.18	0.22	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.17	0.19	0.29	0.13
C5'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.15	0.09	0.17	0.14	0.16	0.11	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.15	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.18	0.19	0.34	0.15
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.15	0.21	0.19	0.09
N1	0.01	0.00	0.11	0.21	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.27	0.02	0.19	0.19	0.36	0.16
N3	0.01	0.00	0.14	0.22	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.26	0.02	0.15	0.21	0.30	0.13
N6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.17	0.02	0.19	0.19	0.35	0.16
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.16	0.20	0.24	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.22	0.21	0.09
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.19	0.28	0.05
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.16	0.02	0.13	0.03	0.19	0.06	0.27	0.26	0.17	0.06	0.05	0.04	0.00	0.02	0.16	0.15	0.39	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.28	0.17	0.11
O5'	0.07	0.17	0.06	0.12	0.15	0.01	0.17	0.01	0.18	0.15	0.19	0.15	0.19	0.16	0.12	0.04	0.16	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.20	0.17	0.14	0.21	0.18	0.19	0.15	0.19	0.21	0.19	0.21	0.19	0.20	0.22	0.19	0.15	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.34	0.29	0.32	0.27	0.22	0.29	0.20	0.34	0.19	0.36	0.30	0.35	0.24	0.21	0.28	0.39	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.07	0.10	0.11	0.03	0.13	0.01	0.15	0.09	0.16	0.13	0.16	0.12	0.09	0.05	0.14	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00