Doublet Group distance statistics: 52545

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.004, 0.023, 0.043, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.007, 0.034, 0.062, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.034 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.008, 0.040, 0.071, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.040 std_dev=0.032
N6	B	0, 0.086, 0.379, 0.672, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.379 std_dev=0.293
C6	B	0, 0.106, 0.460, 0.814, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.460 std_dev=0.354
C5	B	0, 0.067, 0.440, 0.814, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.440 std_dev=0.373
N7	B	0, 0.013, 0.408, 0.803, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.408 std_dev=0.395
C4'	B	0, 0.074, 0.532, 0.991, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.532 std_dev=0.459
C2'	A	0, -0.185, 0.289, 0.764, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.289 std_dev=0.475
O4'	A	0, -0.185, 0.291, 0.767, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.291 std_dev=0.476
N1	B	0, 0.141, 0.636, 1.130, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.636 std_dev=0.495
C4	B	0, 0.071, 0.572, 1.073, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.572 std_dev=0.501
C8	B	0, -0.005, 0.524, 1.052, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.524 std_dev=0.529
O4'	B	0, 0.050, 0.613, 1.176, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.613 std_dev=0.563
N9	B	0, 0.010, 0.589, 1.169, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.589 std_dev=0.579
C2	B	0, 0.147, 0.735, 1.323, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.735 std_dev=0.588
N3	B	0, 0.117, 0.715, 1.312, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.715 std_dev=0.598
O2'	A	0, -0.221, 0.476, 1.173, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.476 std_dev=0.697
C1'	B	0, -0.038, 0.713, 1.464, 2.315 max_d=2.315 avg_d=0.713 std_dev=0.751
C3'	A	0, -0.307, 0.451, 1.210, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.451 std_dev=0.759
C4'	A	0, -0.289, 0.474, 1.236, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.474 std_dev=0.762
C3'	B	0, -0.059, 0.868, 1.794, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.868 std_dev=0.927
C5'	A	0, -0.340, 0.672, 1.684, 3.116 max_d=3.116 avg_d=0.672 std_dev=1.012
O3'	A	0, -0.448, 0.611, 1.670, 3.000 max_d=3.000 avg_d=0.611 std_dev=1.059
C2'	B	0, -0.171, 0.987, 2.145, 3.535 max_d=3.535 avg_d=0.987 std_dev=1.158
C5'	B	0, -0.137, 1.114, 2.364, 3.665 max_d=3.665 avg_d=1.114 std_dev=1.251
O3'	B	0, -0.282, 1.142, 2.566, 4.283 max_d=4.283 avg_d=1.142 std_dev=1.424
O5'	A	0, -0.576, 1.098, 2.772, 4.943 max_d=4.943 avg_d=1.098 std_dev=1.674
O2'	B	0, -0.443, 1.263, 2.970, 5.127 max_d=5.127 avg_d=1.263 std_dev=1.706
O5'	B	0, -0.258, 1.451, 3.159, 5.231 max_d=5.231 avg_d=1.451 std_dev=1.708
P	A	0, -0.830, 1.492, 3.813, 6.766 max_d=6.766 avg_d=1.492 std_dev=2.322
OP1	A	0, -0.862, 1.549, 3.959, 7.008 max_d=7.008 avg_d=1.549 std_dev=2.410
P	B	0, -0.739, 1.990, 4.720, 8.128 max_d=8.128 avg_d=1.990 std_dev=2.730
OP2	A	0, -0.995, 1.864, 4.723, 8.273 max_d=8.273 avg_d=1.864 std_dev=2.859
OP2	B	0, -0.844, 2.164, 5.171, 8.880 max_d=8.880 avg_d=2.164 std_dev=3.007
OP1	B	0, -1.030, 2.300, 5.629, 9.813 max_d=9.813 avg_d=2.300 std_dev=3.329

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.26	0.01	0.17	0.23	0.31	0.12
C2	0.03	0.00	0.31	0.22	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.24	0.20	0.20	0.45	0.11
C2'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.17	0.01	0.10	0.17	0.16	0.13	0.25	0.29	0.13	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.13	0.37	0.25	0.10
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.23	0.00	0.31	0.01	0.32	0.27	0.28	0.17	0.36	0.33	0.20	0.01	0.01	0.02	0.30	0.38	0.35	0.18
C4	0.01	0.01	0.17	0.23	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.13	0.29	0.13	0.65	0.31
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.18	0.07	0.11	0.08	0.16	0.07	0.25	0.02	0.00	0.01	0.38	0.09	0.21
C5	0.01	0.01	0.10	0.31	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.09	0.07	0.45	0.36	1.00	0.60
C5'	0.06	0.15	0.17	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.16	0.11	0.14	0.11	0.15	0.04	0.07	0.17	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.32	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.16	0.10	0.12	0.41	0.32	0.97	0.54
C8	0.02	0.02	0.13	0.27	0.01	0.18	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.36	0.13	0.13	0.65	0.56	1.17	0.85
N1	0.02	0.00	0.25	0.28	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.09	0.20	0.29	0.12	0.71	0.30
N3	0.03	0.00	0.29	0.17	0.00	0.11	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.22	0.23	0.16	0.25	0.36	0.08
N6	0.02	0.01	0.13	0.36	0.01	0.08	0.02	0.11	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.22	0.16	0.10	0.49	0.50	1.19	0.72
N7	0.02	0.01	0.06	0.33	0.01	0.16	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.35	0.18	0.06	0.65	0.64	1.33	0.92
N9	0.00	0.01	0.02	0.20	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.07	0.01	0.37	0.18	0.70	0.41
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.10	0.25	0.21	0.07	0.16	0.36	0.09	0.15	0.22	0.35	0.17	0.00	0.04	0.16	0.25	0.33	0.31	0.17
O3'	0.26	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.17	0.10	0.13	0.09	0.22	0.16	0.18	0.07	0.04	0.00	0.18	0.34	0.41	0.37	0.23
O4'	0.01	0.24	0.02	0.02	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.13	0.20	0.23	0.10	0.06	0.01	0.16	0.18	0.00	0.11	0.19	0.14	0.08
O5'	0.17	0.20	0.13	0.30	0.29	0.01	0.45	0.01	0.41	0.65	0.29	0.16	0.49	0.65	0.37	0.25	0.34	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.23	0.20	0.37	0.38	0.13	0.38	0.36	0.06	0.32	0.56	0.12	0.25	0.50	0.64	0.18	0.33	0.41	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.45	0.25	0.35	0.65	0.09	1.00	0.04	0.97	1.17	0.71	0.36	1.19	1.33	0.70	0.31	0.37	0.14	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.12	0.11	0.10	0.18	0.31	0.21	0.60	0.01	0.54	0.85	0.30	0.08	0.72	0.92	0.41	0.17	0.23	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.37	0.20	0.25	0.14	0.28	0.12	0.25	0.18	0.17	0.36	0.16	0.25	0.13	0.31	0.33	0.39	0.13	0.19	0.12	0.16	0.57	0.45
C2	0.10	0.14	0.10	0.17	0.09	0.24	0.10	0.50	0.11	0.14	0.14	0.11	0.11	0.14	0.11	0.19	0.15	0.16	0.63	0.94	0.29	0.34
C2'	0.13	0.21	0.15	0.37	0.12	0.21	0.18	0.35	0.29	0.10	0.28	0.14	0.39	0.11	0.09	0.13	0.40	0.11	0.16	0.24	0.68	0.64
C3'	0.27	0.08	0.14	0.42	0.10	0.28	0.07	0.56	0.12	0.22	0.12	0.09	0.20	0.11	0.20	0.34	0.45	0.14	0.36	0.47	1.06	0.91
C4	0.22	0.16	0.09	0.10	0.18	0.19	0.18	0.31	0.17	0.23	0.16	0.16	0.17	0.22	0.21	0.12	0.09	0.23	0.49	0.71	0.10	0.13
C4'	0.20	0.07	0.16	0.48	0.12	0.43	0.09	0.78	0.06	0.18	0.06	0.11	0.08	0.13	0.17	0.35	0.49	0.25	0.65	0.83	1.49	1.28
C5	0.20	0.21	0.11	0.08	0.19	0.20	0.19	0.34	0.21	0.22	0.22	0.19	0.23	0.21	0.20	0.13	0.14	0.27	0.63	0.96	0.28	0.33
C5'	0.18	0.06	0.18	0.64	0.10	0.54	0.08	0.96	0.06	0.15	0.06	0.09	0.09	0.10	0.14	0.29	0.70	0.30	0.78	0.95	1.66	1.42
C6	0.13	0.21	0.17	0.07	0.15	0.22	0.16	0.46	0.20	0.17	0.23	0.17	0.22	0.17	0.14	0.24	0.12	0.26	0.76	1.19	0.49	0.53
C8	0.33	0.26	0.09	0.14	0.28	0.16	0.26	0.15	0.24	0.31	0.25	0.27	0.24	0.28	0.30	0.18	0.22	0.31	0.43	0.62	0.12	0.08
N1	0.10	0.18	0.15	0.10	0.11	0.24	0.12	0.53	0.15	0.13	0.19	0.15	0.16	0.14	0.11	0.27	0.07	0.20	0.75	1.18	0.48	0.53
N3	0.16	0.10	0.11	0.17	0.12	0.22	0.13	0.39	0.10	0.19	0.10	0.10	0.10	0.18	0.16	0.12	0.16	0.17	0.48	0.68	0.12	0.13
N6	0.14	0.25	0.24	0.11	0.17	0.24	0.18	0.50	0.22	0.17	0.26	0.20	0.24	0.17	0.15	0.32	0.19	0.29	0.86	1.39	0.66	0.70
N7	0.27	0.26	0.11	0.14	0.24	0.19	0.24	0.25	0.25	0.26	0.26	0.25	0.26	0.25	0.25	0.10	0.24	0.33	0.59	0.90	0.23	0.28
N9	0.31	0.20	0.13	0.11	0.25	0.15	0.23	0.18	0.19	0.30	0.19	0.23	0.18	0.27	0.28	0.22	0.13	0.25	0.34	0.47	0.21	0.12
O2'	0.24	0.08	0.12	0.15	0.11	0.08	0.07	0.17	0.12	0.16	0.09	0.11	0.22	0.08	0.18	0.25	0.16	0.12	0.11	0.19	0.51	0.51
O3'	0.30	0.21	0.18	0.48	0.24	0.38	0.22	0.74	0.19	0.30	0.19	0.23	0.17	0.25	0.28	0.41	0.50	0.19	0.56	0.65	1.33	1.11
O4'	0.31	0.22	0.23	0.24	0.26	0.18	0.25	0.44	0.21	0.30	0.20	0.25	0.19	0.27	0.29	0.42	0.25	0.10	0.29	0.43	1.08	0.89
O5'	0.12	0.20	0.32	0.82	0.17	0.69	0.18	1.07	0.20	0.13	0.22	0.19	0.21	0.15	0.15	0.10	0.90	0.43	0.87	0.95	1.71	1.46
OP1	0.69	0.50	0.48	0.42	0.54	0.48	0.50	0.86	0.44	0.59	0.44	0.54	0.38	0.53	0.60	0.91	0.49	0.45	0.73	0.85	1.68	1.32
OP2	0.24	0.37	0.38	0.89	0.27	0.76	0.27	1.14	0.35	0.17	0.39	0.32	0.37	0.19	0.21	0.31	0.99	0.50	0.93	0.95	1.76	1.47
P	0.34	0.18	0.17	0.54	0.21	0.49	0.17	0.90	0.14	0.27	0.15	0.20	0.12	0.20	0.26	0.52	0.61	0.31	0.75	0.84	1.66	1.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.16	0.23
C2	0.06	0.00	0.11	0.76	0.01	0.76	0.02	1.34	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.33	0.75	0.43	1.24	1.64	1.13	1.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.04	0.07	0.08	0.12	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.24	0.15	0.27	0.23
C3'	0.01	0.76	0.00	0.00	0.39	0.00	0.23	0.04	0.39	0.25	0.61	0.74	0.30	0.14	0.07	0.02	0.01	0.02	0.34	0.32	0.39	0.30
C4	0.03	0.01	0.06	0.39	0.00	0.38	0.00	0.67	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.35	0.23	0.66	0.73	0.40	0.39
C4'	0.01	0.76	0.01	0.00	0.38	0.00	0.23	0.01	0.39	0.25	0.62	0.72	0.31	0.11	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.18	0.19	0.08
C5	0.02	0.02	0.03	0.23	0.00	0.23	0.00	0.46	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.23	0.10	0.50	0.60	0.19	0.18
C5'	0.04	1.34	0.03	0.04	0.67	0.01	0.46	0.00	0.74	0.32	1.13	1.21	0.62	0.16	0.16	0.04	0.03	0.01	0.01	0.39	0.36	0.02
C6	0.03	0.02	0.04	0.39	0.01	0.39	0.01	0.74	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.38	0.20	0.75	1.01	0.48	0.50
C8	0.03	0.02	0.07	0.25	0.01	0.25	0.01	0.32	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.22	0.22	0.28	0.29	0.63	0.64
N1	0.06	0.00	0.08	0.61	0.02	0.62	0.00	1.13	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.28	0.61	0.34	1.08	1.48	0.93	0.96
N3	0.06	0.01	0.12	0.74	0.01	0.72	0.01	1.21	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.69	0.43	1.10	1.30	0.93	0.95
N6	0.02	0.02	0.03	0.30	0.01	0.31	0.01	0.62	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.15	0.31	0.14	0.64	0.90	0.33	0.37
N7	0.01	0.02	0.05	0.14	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.11	0.19	0.08	0.45	0.43
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.24	0.14	0.18	0.19
O2'	0.01	0.33	0.00	0.02	0.17	0.04	0.11	0.04	0.18	0.08	0.28	0.31	0.15	0.03	0.04	0.00	0.02	0.05	0.09	0.07	0.14	0.13
O3'	0.01	0.75	0.01	0.01	0.35	0.02	0.23	0.03	0.38	0.22	0.61	0.69	0.31	0.13	0.06	0.02	0.00	0.01	0.28	0.37	0.39	0.34
O4'	0.00	0.43	0.00	0.02	0.23	0.00	0.10	0.01	0.20	0.22	0.34	0.43	0.14	0.11	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.23	0.14	0.26
O5'	0.11	1.24	0.24	0.34	0.66	0.01	0.50	0.01	0.75	0.28	1.08	1.10	0.64	0.19	0.24	0.09	0.28	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.10	1.64	0.15	0.32	0.73	0.18	0.60	0.39	1.01	0.29	1.48	1.30	0.90	0.08	0.14	0.07	0.37	0.23	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	1.13	0.27	0.39	0.40	0.19	0.19	0.36	0.48	0.63	0.93	0.93	0.33	0.45	0.18	0.14	0.39	0.14	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.23	1.17	0.23	0.30	0.39	0.08	0.18	0.02	0.50	0.64	0.96	0.95	0.37	0.43	0.19	0.13	0.34	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00