Doublet Group distance statistics: 52549

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O5'	A	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
O4'	A	0, 0.000, 0.394, 0.788, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.394 std_dev=0.394
O4'	B	0, 0.000, 0.440, 0.881, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.440 std_dev=0.440
O3'	A	0, 0.000, 0.454, 0.908, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.454 std_dev=0.454
C2'	A	0, 0.000, 0.479, 0.958, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.479 std_dev=0.479
C8	B	0, 0.000, 0.490, 0.981, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.490 std_dev=0.490
N7	B	0, 0.000, 0.493, 0.986, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.493 std_dev=0.493
C4'	B	0, 0.000, 0.533, 1.066, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.533 std_dev=0.533
N9	B	0, 0.000, 0.548, 1.097, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.548 std_dev=0.548
C1'	B	0, 0.000, 0.552, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.552 std_dev=0.552
C5	B	0, 0.000, 0.559, 1.117, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.559 std_dev=0.559
N6	B	0, 0.000, 0.564, 1.129, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.564 std_dev=0.564
C3'	A	0, 0.000, 0.578, 1.156, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.578 std_dev=0.578
C6	B	0, 0.000, 0.592, 1.184, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.592 std_dev=0.592
C4	B	0, 0.000, 0.597, 1.195, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.597 std_dev=0.597
O3'	B	0, 0.000, 0.608, 1.215, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.608 std_dev=0.608
N1	B	0, 0.000, 0.663, 1.326, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.663 std_dev=0.663
N3	B	0, 0.000, 0.670, 1.341, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.670 std_dev=0.670
C4'	A	0, 0.000, 0.693, 1.386, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.693 std_dev=0.693
C3'	B	0, 0.000, 0.699, 1.398, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.699 std_dev=0.699
C2	B	0, 0.000, 0.700, 1.401, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.700 std_dev=0.700
O2'	A	0, 0.000, 0.757, 1.513, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.757 std_dev=0.757
C5'	B	0, 0.000, 0.770, 1.540, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.770 std_dev=0.770
O5'	B	0, 0.000, 0.775, 1.550, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.775 std_dev=0.775
P	A	0, 0.000, 0.797, 1.594, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.797 std_dev=0.797
C2'	B	0, 0.000, 0.815, 1.630, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.815 std_dev=0.815
O2'	B	0, 0.000, 0.993, 1.986, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.993 std_dev=0.993
P	B	0, 0.000, 0.998, 1.996, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.998 std_dev=0.998
OP2	A	0, 0.000, 1.066, 2.132, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.066 std_dev=1.066
OP2	B	0, 0.000, 1.113, 2.227, 2.227 max_d=2.227 avg_d=1.113 std_dev=1.113
OP1	A	0, 0.000, 1.192, 2.384, 2.384 max_d=2.384 avg_d=1.192 std_dev=1.192
C5'	A	0, 0.000, 1.222, 2.445, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.222 std_dev=1.222
OP1	B	0, 0.000, 1.253, 2.505, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.253 std_dev=1.253

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.17	0.37	0.03	0.18
C2	0.04	0.00	0.14	0.05	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.03	0.13	0.16	0.62	0.19	0.32
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.05	0.12	0.13	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.42	0.50	0.17	0.36
C3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.14	0.08	0.04	0.11	0.14	0.07	0.01	0.00	0.00	0.36	0.37	0.07	0.23
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.07	0.16	0.52	0.12	0.26
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.22	0.02	0.10	0.08	0.19	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.20	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.13	0.48	0.09	0.23
C5'	0.05	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.21	0.00	0.17	0.41	0.04	0.08	0.23	0.39	0.17	0.03	0.01	0.01	0.00	0.28	0.04	0.00
C6	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.13	0.53	0.13	0.26
C8	0.00	0.01	0.05	0.14	0.01	0.22	0.00	0.41	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.07	0.11	0.09	0.32	0.03	0.12
N1	0.04	0.00	0.12	0.08	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.05	0.09	0.15	0.60	0.17	0.30
N3	0.04	0.00	0.13	0.04	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.02	0.14	0.17	0.59	0.17	0.30
N6	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.06	0.02	0.12	0.50	0.13	0.24
N7	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.08	0.08	0.08	0.35	0.00	0.14
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.14	0.42	0.05	0.19
O2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.01	0.22	0.12	0.20	0.06	0.18	0.06	0.00	0.03	0.03	0.37	0.44	0.13	0.32
O3'	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.02	0.06	0.08	0.02	0.03	0.00	0.01	0.22	0.20	0.09	0.09
O4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.09	0.14	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.28	0.08	0.05
O5'	0.17	0.16	0.42	0.36	0.16	0.01	0.13	0.00	0.13	0.09	0.15	0.17	0.12	0.08	0.14	0.37	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.37	0.62	0.50	0.37	0.52	0.20	0.48	0.28	0.53	0.32	0.60	0.59	0.50	0.35	0.42	0.44	0.20	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.19	0.17	0.07	0.12	0.14	0.09	0.04	0.13	0.03	0.17	0.17	0.13	0.00	0.05	0.13	0.09	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.32	0.36	0.23	0.26	0.02	0.23	0.00	0.26	0.12	0.30	0.30	0.24	0.14	0.19	0.32	0.09	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.20	0.11	0.06	0.16	0.03	0.18	0.06	0.20	0.11	0.20	0.18	0.21	0.15	0.12	0.14	0.00	0.03	0.00	0.00	0.08	0.01
C2	0.01	0.12	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.13	0.10	0.03	0.14	0.08	0.13	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.12	0.12	0.10	0.12
C2'	0.18	0.36	0.19	0.14	0.30	0.13	0.30	0.17	0.34	0.19	0.36	0.33	0.34	0.24	0.23	0.19	0.07	0.15	0.12	0.12	0.04	0.10
C3'	0.02	0.15	0.01	0.07	0.09	0.08	0.11	0.05	0.16	0.01	0.16	0.11	0.18	0.07	0.03	0.00	0.13	0.05	0.08	0.08	0.13	0.09
C4	0.02	0.13	0.04	0.02	0.08	0.01	0.09	0.07	0.13	0.02	0.15	0.10	0.16	0.04	0.04	0.03	0.05	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03
C4'	0.18	0.07	0.16	0.21	0.10	0.23	0.08	0.19	0.04	0.15	0.05	0.10	0.00	0.09	0.15	0.14	0.26	0.21	0.22	0.21	0.25	0.22
C5	0.02	0.11	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.06	0.11	0.03	0.12	0.09	0.13	0.05	0.04	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00
C5'	0.32	0.15	0.32	0.38	0.20	0.36	0.14	0.30	0.09	0.24	0.11	0.19	0.02	0.16	0.26	0.32	0.46	0.32	0.31	0.30	0.31	0.30
C6	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.07	0.08	0.00	0.10	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03
C8	0.07	0.14	0.10	0.05	0.12	0.01	0.12	0.03	0.14	0.09	0.14	0.12	0.16	0.11	0.09	0.14	0.01	0.01	0.03	0.05	0.13	0.06
N1	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.11	0.08	0.02	0.10	0.06	0.09	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.10	0.09	0.06	0.09
N3	0.00	0.15	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.12	0.14	0.01	0.17	0.11	0.18	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.10	0.10	0.07	0.10
N6	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.07	0.01	0.09	0.06	0.08	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01
N7	0.05	0.11	0.08	0.04	0.09	0.01	0.10	0.03	0.12	0.06	0.12	0.10	0.13	0.08	0.07	0.11	0.00	0.00	0.02	0.05	0.12	0.05
N9	0.05	0.15	0.08	0.04	0.12	0.01	0.13	0.05	0.16	0.07	0.16	0.13	0.18	0.10	0.08	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02
O2'	0.41	0.58	0.42	0.37	0.52	0.35	0.50	0.38	0.52	0.39	0.56	0.56	0.47	0.41	0.45	0.42	0.30	0.37	0.32	0.30	0.19	0.28
O3'	0.02	0.12	0.02	0.08	0.07	0.11	0.08	0.09	0.12	0.00	0.13	0.09	0.13	0.04	0.02	0.01	0.12	0.07	0.14	0.13	0.19	0.14
O4'	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.09	0.07	0.08	0.07	0.14	0.08
O5'	0.08	0.10	0.15	0.07	0.10	0.02	0.09	0.01	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.24	0.04	0.01	0.11	0.07	0.21	0.11
OP1	0.09	0.22	0.02	0.05	0.18	0.12	0.22	0.12	0.26	0.16	0.26	0.18	0.29	0.21	0.14	0.05	0.06	0.14	0.18	0.13	0.24	0.16
OP2	0.16	0.14	0.20	0.15	0.15	0.11	0.13	0.12	0.12	0.14	0.12	0.16	0.10	0.13	0.16	0.24	0.12	0.12	0.06	0.10	0.01	0.08
P	0.06	0.02	0.11	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.18	0.03	0.00	0.07	0.03	0.14	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.02	0.08	0.23	0.18	0.24	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07
C4	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.11	0.08	0.10	0.11
C4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.10	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.06
C5	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.08	0.05	0.06	0.07
C5'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.16	0.18	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.03	0.12	0.08	0.11	0.11
C8	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01
N1	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.03	0.06	0.19	0.14	0.19	0.18
N3	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.09	0.21	0.16	0.21	0.20
N6	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.10	0.06	0.07	0.09
N7	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04
O2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.03	0.11	0.12	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05
O3'	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.09
O4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.09	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04
O5'	0.01	0.23	0.02	0.02	0.11	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.19	0.21	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.18	0.05	0.08	0.08	0.06	0.05	0.02	0.08	0.01	0.14	0.16	0.06	0.00	0.03	0.06	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.24	0.04	0.06	0.10	0.05	0.06	0.02	0.11	0.05	0.19	0.21	0.07	0.03	0.02	0.04	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.22	0.05	0.07	0.11	0.06	0.07	0.02	0.11	0.01	0.18	0.20	0.09	0.00	0.04	0.05	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00