Doublet Group distance statistics: 52550

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 9, 12, 14, 9, 8, 9, 15, 14, 8, 10, 8, 1, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.019, 0.032, 0.045, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.032 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.022, 0.039, 0.055, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.039 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.010, 0.027, 0.045, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.025, 0.052, 0.079, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.052 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.045, 0.072, 0.099, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.072 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.048 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.005, 0.033, 0.062, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.033 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.028, 0.061, 0.094, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.061 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.100, 0.257, 0.414, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.257 std_dev=0.157
O4'	A	0, 0.073, 0.235, 0.398, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.235 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.075, 0.262, 0.449, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.262 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.275, 0.523, 0.771, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.523 std_dev=0.248
C4'	A	0, 0.153, 0.405, 0.658, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.405 std_dev=0.253
C6	B	0, 0.238, 0.492, 0.747, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.492 std_dev=0.255
C3'	A	0, 0.207, 0.469, 0.731, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.469 std_dev=0.262
N7	B	0, 0.299, 0.568, 0.837, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.568 std_dev=0.269
N6	B	0, 0.148, 0.460, 0.773, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.460 std_dev=0.313
C4	B	0, 0.367, 0.702, 1.037, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.702 std_dev=0.335
N1	B	0, 0.307, 0.648, 0.988, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.648 std_dev=0.341
C8	B	0, 0.416, 0.778, 1.141, 2.276 max_d=2.276 avg_d=0.778 std_dev=0.362
O3'	A	0, 0.385, 0.758, 1.130, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.758 std_dev=0.372
C2	B	0, 0.386, 0.760, 1.135, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.760 std_dev=0.375
N3	B	0, 0.418, 0.806, 1.195, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.806 std_dev=0.388
N9	B	0, 0.448, 0.845, 1.242, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.845 std_dev=0.397
C5'	A	0, 0.155, 0.582, 1.008, 2.417 max_d=2.417 avg_d=0.582 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.611, 1.147, 1.683, 2.462 max_d=2.462 avg_d=1.147 std_dev=0.536
O4'	B	0, 0.717, 1.286, 1.855, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.286 std_dev=0.569
C2'	B	0, 0.678, 1.274, 1.870, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.274 std_dev=0.596
C3'	B	0, 0.636, 1.268, 1.901, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.268 std_dev=0.632
O5'	A	0, -0.009, 0.624, 1.257, 3.419 max_d=3.419 avg_d=0.624 std_dev=0.633
C4'	B	0, 0.701, 1.347, 1.993, 3.077 max_d=3.077 avg_d=1.347 std_dev=0.646
C5'	B	0, 0.677, 1.346, 2.014, 3.209 max_d=3.209 avg_d=1.346 std_dev=0.669
O5'	B	0, 0.650, 1.330, 2.011, 3.397 max_d=3.397 avg_d=1.330 std_dev=0.680
O2'	B	0, 0.803, 1.548, 2.292, 3.469 max_d=3.469 avg_d=1.548 std_dev=0.745
P	A	0, 0.090, 0.846, 1.602, 4.284 max_d=4.284 avg_d=0.846 std_dev=0.756
O3'	B	0, 0.743, 1.510, 2.277, 3.628 max_d=3.628 avg_d=1.510 std_dev=0.767
OP2	A	0, 0.357, 1.125, 1.893, 4.281 max_d=4.281 avg_d=1.125 std_dev=0.768
P	B	0, 0.608, 1.452, 2.295, 4.008 max_d=4.008 avg_d=1.452 std_dev=0.843
OP1	A	0, 0.146, 1.116, 2.086, 5.950 max_d=5.950 avg_d=1.116 std_dev=0.970
OP1	B	0, 0.720, 1.856, 2.993, 4.821 max_d=4.821 avg_d=1.856 std_dev=1.136
OP2	B	0, 0.267, 1.436, 2.605, 6.488 max_d=6.488 avg_d=1.436 std_dev=1.169

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.03	0.11	0.31	0.15
C2	0.04	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.22	0.08	0.26	0.02	0.20	0.32	0.21
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.09	0.14	0.19	0.16	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.18	0.10	0.22	0.21	0.10
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.15	0.14	0.17	0.20	0.16	0.14	0.08	0.02	0.01	0.02	0.24	0.16	0.33	0.16	0.16
C4	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.30	0.02	0.18	0.31	0.19
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.08	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.13	0.27	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.39	0.01	0.24	0.35	0.25
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.14	0.11	0.10	0.08	0.15	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.20	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.19	0.05	0.40	0.01	0.26	0.37	0.27
C8	0.02	0.01	0.09	0.14	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.06	0.44	0.03	0.27	0.31	0.25
N1	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.21	0.06	0.33	0.02	0.23	0.34	0.24
N2	0.05	0.00	0.19	0.20	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.26	0.10	0.23	0.02	0.21	0.31	0.21
N3	0.04	0.01	0.16	0.16	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.19	0.08	0.23	0.02	0.17	0.30	0.18
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.47	0.03	0.30	0.37	0.31
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.30	0.02	0.17	0.29	0.16
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.06	0.12	0.19	0.14	0.05	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.08	0.16	0.24	0.10
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.13	0.03	0.16	0.04	0.19	0.16	0.21	0.26	0.19	0.18	0.08	0.06	0.00	0.02	0.21	0.21	0.42	0.20	0.21
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.06	0.10	0.08	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.05	0.13	0.39	0.22
O5'	0.14	0.26	0.18	0.24	0.30	0.02	0.39	0.01	0.40	0.44	0.33	0.23	0.23	0.47	0.30	0.07	0.21	0.10	0.00	0.44	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.10	0.16	0.02	0.08	0.01	0.15	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.21	0.05	0.44	0.00	0.30	0.41	0.31
OP1	0.11	0.20	0.22	0.33	0.18	0.13	0.24	0.20	0.26	0.27	0.23	0.21	0.17	0.30	0.17	0.16	0.42	0.13	0.02	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.32	0.21	0.16	0.31	0.27	0.35	0.26	0.37	0.31	0.34	0.31	0.30	0.37	0.29	0.24	0.20	0.39	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.21	0.10	0.16	0.19	0.08	0.25	0.02	0.27	0.25	0.24	0.21	0.18	0.31	0.16	0.10	0.21	0.22	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.20	0.25	0.28	0.18	0.24	0.18	0.32	0.18	0.21	0.21	0.19	0.19	0.21	0.20	0.25	0.33	0.21	0.59	0.69	1.20	0.76
C2	0.21	0.17	0.22	0.27	0.17	0.27	0.16	0.37	0.18	0.22	0.19	0.17	0.21	0.19	0.20	0.21	0.30	0.25	0.61	0.80	1.27	0.82
C2'	0.25	0.29	0.26	0.28	0.24	0.26	0.23	0.33	0.26	0.25	0.30	0.26	0.27	0.24	0.24	0.27	0.31	0.26	0.52	0.65	1.06	0.67
C3'	0.28	0.32	0.29	0.30	0.27	0.28	0.25	0.35	0.26	0.26	0.32	0.30	0.25	0.25	0.27	0.30	0.33	0.29	0.50	0.64	1.04	0.65
C4	0.19	0.16	0.21	0.26	0.15	0.26	0.15	0.35	0.16	0.21	0.18	0.15	0.18	0.19	0.18	0.20	0.30	0.23	0.60	0.77	1.26	0.81
C4'	0.24	0.25	0.31	0.35	0.22	0.28	0.20	0.34	0.20	0.23	0.24	0.24	0.19	0.22	0.23	0.32	0.42	0.24	0.55	0.65	1.13	0.70
C5	0.20	0.16	0.21	0.27	0.16	0.27	0.15	0.37	0.16	0.21	0.18	0.15	0.18	0.19	0.19	0.20	0.31	0.25	0.61	0.83	1.29	0.83
C5'	0.26	0.25	0.36	0.40	0.23	0.31	0.21	0.37	0.19	0.25	0.24	0.25	0.18	0.23	0.24	0.36	0.48	0.26	0.57	0.67	1.16	0.71
C6	0.22	0.17	0.22	0.28	0.17	0.30	0.16	0.39	0.17	0.22	0.18	0.16	0.19	0.19	0.20	0.22	0.33	0.28	0.61	0.87	1.29	0.85
C8	0.19	0.18	0.22	0.27	0.16	0.25	0.16	0.35	0.16	0.21	0.19	0.16	0.17	0.19	0.18	0.22	0.32	0.23	0.60	0.78	1.27	0.81
N1	0.23	0.18	0.23	0.29	0.18	0.30	0.17	0.39	0.18	0.23	0.19	0.17	0.21	0.19	0.21	0.23	0.33	0.28	0.61	0.86	1.29	0.85
N2	0.22	0.19	0.23	0.28	0.19	0.28	0.19	0.37	0.20	0.22	0.21	0.19	0.23	0.20	0.21	0.23	0.31	0.26	0.61	0.78	1.25	0.81
N3	0.19	0.16	0.21	0.26	0.15	0.25	0.15	0.35	0.16	0.21	0.18	0.15	0.20	0.19	0.18	0.20	0.29	0.23	0.60	0.75	1.24	0.80
N7	0.20	0.17	0.21	0.27	0.16	0.27	0.15	0.36	0.16	0.21	0.18	0.15	0.17	0.19	0.18	0.21	0.32	0.24	0.61	0.82	1.29	0.83
N9	0.19	0.18	0.22	0.27	0.16	0.25	0.16	0.34	0.16	0.21	0.19	0.16	0.18	0.20	0.18	0.22	0.32	0.22	0.60	0.75	1.25	0.79
O2'	0.27	0.33	0.30	0.31	0.27	0.27	0.26	0.33	0.29	0.26	0.35	0.30	0.30	0.25	0.27	0.31	0.34	0.27	0.53	0.63	1.02	0.67
O3'	0.40	0.44	0.39	0.38	0.38	0.38	0.34	0.42	0.35	0.35	0.42	0.42	0.31	0.32	0.37	0.41	0.40	0.41	0.49	0.67	0.97	0.63
O4'	0.29	0.24	0.36	0.40	0.25	0.34	0.24	0.39	0.22	0.29	0.23	0.25	0.21	0.27	0.27	0.37	0.47	0.28	0.63	0.72	1.23	0.79
O5'	0.26	0.27	0.38	0.42	0.23	0.31	0.21	0.37	0.21	0.24	0.26	0.25	0.21	0.23	0.24	0.39	0.51	0.24	0.63	0.70	1.30	0.81
O6	0.24	0.17	0.23	0.30	0.18	0.32	0.17	0.41	0.17	0.23	0.18	0.17	0.19	0.20	0.21	0.23	0.34	0.30	0.60	0.90	1.28	0.85
OP1	0.38	0.33	0.52	0.59	0.32	0.47	0.30	0.53	0.28	0.37	0.31	0.33	0.27	0.34	0.36	0.53	0.70	0.36	0.68	0.80	1.36	0.88
OP2	0.43	0.43	0.50	0.55	0.42	0.49	0.41	0.55	0.41	0.43	0.42	0.42	0.41	0.42	0.43	0.49	0.62	0.44	0.73	0.85	1.37	0.90
P	0.39	0.36	0.50	0.56	0.35	0.47	0.34	0.53	0.33	0.38	0.35	0.36	0.32	0.36	0.38	0.50	0.65	0.38	0.70	0.82	1.37	0.89

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.23	0.30	0.21
C2	0.03	0.00	0.20	0.21	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.28	0.07	0.36	0.35	0.65	0.42
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.02	0.11	0.08	0.16	0.20	0.09	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.19	0.21	0.21	0.15
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.02	0.15	0.15	0.19	0.19	0.15	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.25	0.28	0.21	0.19
C4	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.04	0.37	0.34	0.64	0.42
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.07	0.06	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.19	0.23	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.03	0.46	0.47	0.84	0.54
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.19	0.22	0.16	0.10	0.23	0.24	0.13	0.05	0.05	0.02	0.01	0.20	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.15	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.04	0.47	0.50	0.90	0.58
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.05	0.47	0.44	0.75	0.51
N1	0.03	0.00	0.16	0.19	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.06	0.42	0.44	0.80	0.51
N3	0.03	0.00	0.20	0.19	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.25	0.07	0.32	0.30	0.55	0.36
N6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.02	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.18	0.04	0.52	0.59	1.02	0.66
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.51	0.54	0.93	0.61
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.35	0.30	0.54	0.37
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.11	0.06	0.16	0.18	0.09	0.04	0.03	0.00	0.06	0.06	0.07	0.28	0.22	0.13
O3'	0.02	0.28	0.03	0.01	0.15	0.02	0.14	0.05	0.18	0.16	0.24	0.25	0.18	0.15	0.07	0.06	0.00	0.02	0.25	0.40	0.27	0.22
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.19	0.29	0.28	0.22
O5'	0.20	0.36	0.19	0.25	0.37	0.02	0.46	0.01	0.47	0.47	0.42	0.32	0.52	0.51	0.35	0.07	0.25	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.35	0.21	0.28	0.34	0.19	0.47	0.20	0.50	0.44	0.44	0.30	0.59	0.54	0.30	0.28	0.40	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.65	0.21	0.21	0.64	0.23	0.84	0.30	0.90	0.75	0.80	0.55	1.02	0.93	0.54	0.22	0.27	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.42	0.15	0.19	0.42	0.07	0.54	0.02	0.58	0.51	0.51	0.36	0.66	0.61	0.37	0.13	0.22	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00