Doublet Group distance statistics: 52552

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 10, 14, 19, 14, 1, 1, 2, 2, 1, 0, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.013, 0.024, 0.036, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.024 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.020, 0.037, 0.054, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.037 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.021, 0.040, 0.060, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.022, 0.048, 0.074, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.048 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.021, 0.053, 0.085, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.053 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.044, 0.205, 0.365, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.205 std_dev=0.160
C2'	A	0, 0.047, 0.209, 0.370, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.209 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.114, 0.290, 0.466, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.290 std_dev=0.176
C5	B	0, 0.166, 0.380, 0.594, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.380 std_dev=0.214
C6	B	0, 0.229, 0.460, 0.692, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.460 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.103, 0.342, 0.582, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.342 std_dev=0.239
N6	B	0, 0.303, 0.552, 0.800, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.552 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.109, 0.366, 0.623, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.366 std_dev=0.257
N7	B	0, 0.198, 0.455, 0.713, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.455 std_dev=0.257
C4	B	0, 0.105, 0.380, 0.655, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.380 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.240, 0.560, 0.881, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.560 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.153, 0.481, 0.808, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.481 std_dev=0.328
N3	B	0, 0.166, 0.497, 0.828, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.497 std_dev=0.331
N9	B	0, 0.087, 0.420, 0.754, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.420 std_dev=0.333
C2	B	0, 0.220, 0.573, 0.926, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.573 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.198, 0.581, 0.963, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.581 std_dev=0.382
O3'	A	0, 0.181, 0.586, 0.991, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.586 std_dev=0.405
C1'	B	0, 0.125, 0.540, 0.956, 2.515 max_d=2.515 avg_d=0.540 std_dev=0.416
C5'	A	0, 0.162, 0.589, 1.016, 2.217 max_d=2.217 avg_d=0.589 std_dev=0.427
P	A	0, 0.334, 0.826, 1.317, 2.542 max_d=2.542 avg_d=0.826 std_dev=0.491
OP2	A	0, 0.556, 1.079, 1.602, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.079 std_dev=0.523
O4'	B	0, 0.316, 0.874, 1.431, 3.383 max_d=3.383 avg_d=0.874 std_dev=0.557
O2'	B	0, 0.231, 0.822, 1.413, 3.295 max_d=3.295 avg_d=0.822 std_dev=0.591
C2'	B	0, 0.070, 0.683, 1.297, 3.091 max_d=3.091 avg_d=0.683 std_dev=0.614
OP1	A	0, 0.302, 0.948, 1.593, 3.657 max_d=3.657 avg_d=0.948 std_dev=0.645
C4'	B	0, 0.324, 1.083, 1.843, 4.214 max_d=4.214 avg_d=1.083 std_dev=0.759
C3'	B	0, 0.211, 1.001, 1.791, 4.116 max_d=4.116 avg_d=1.001 std_dev=0.790
O5'	B	0, 1.031, 1.977, 2.923, 5.212 max_d=5.212 avg_d=1.977 std_dev=0.946
C5'	B	0, 0.675, 1.641, 2.607, 5.122 max_d=5.122 avg_d=1.641 std_dev=0.966
O3'	B	0, 0.248, 1.237, 2.226, 5.507 max_d=5.507 avg_d=1.237 std_dev=0.989
P	B	0, 1.114, 2.141, 3.168, 5.776 max_d=5.776 avg_d=2.141 std_dev=1.027
OP2	B	0, 1.258, 2.337, 3.415, 5.572 max_d=5.572 avg_d=2.337 std_dev=1.078
OP1	B	0, 1.136, 2.397, 3.658, 7.432 max_d=7.432 avg_d=2.397 std_dev=1.261

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.17	0.10
C2	0.03	0.00	0.15	0.19	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.28	0.05	0.21	0.01	0.21	0.30	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.07	0.12	0.18	0.15	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.08	0.17	0.15	0.09
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.12	0.01	0.12	0.02	0.15	0.11	0.17	0.21	0.17	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.15	0.15	0.22	0.17	0.14
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.20	0.03	0.20	0.02	0.20	0.28	0.20
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.09	0.12	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.22	0.03	0.25	0.02	0.26	0.34	0.26
C5'	0.04	0.14	0.03	0.02	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.17	0.13	0.12	0.20	0.12	0.07	0.08	0.02	0.01	0.21	0.10	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.26	0.03	0.26	0.01	0.29	0.37	0.28
C8	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.05	0.24	0.02	0.23	0.28	0.23
N1	0.03	0.01	0.12	0.17	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.28	0.04	0.24	0.01	0.26	0.35	0.26
N2	0.04	0.00	0.18	0.21	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.31	0.06	0.20	0.02	0.20	0.30	0.20
N3	0.03	0.01	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.24	0.05	0.18	0.01	0.18	0.27	0.18
N7	0.01	0.02	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.04	0.27	0.02	0.29	0.35	0.29
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.02	0.17	0.02	0.17	0.23	0.17
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.10	0.17	0.12	0.05	0.02	0.00	0.09	0.06	0.08	0.07	0.17	0.13	0.08
O3'	0.04	0.28	0.02	0.01	0.20	0.02	0.22	0.08	0.26	0.17	0.28	0.31	0.24	0.21	0.13	0.09	0.00	0.04	0.14	0.28	0.31	0.25	0.19
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.06	0.04	0.00	0.09	0.04	0.10	0.19	0.13
O5'	0.09	0.21	0.10	0.15	0.20	0.02	0.25	0.01	0.26	0.24	0.24	0.20	0.18	0.27	0.17	0.08	0.14	0.09	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.02	0.09	0.02	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.28	0.04	0.28	0.00	0.33	0.41	0.32
OP1	0.10	0.21	0.17	0.22	0.20	0.12	0.26	0.10	0.29	0.23	0.26	0.20	0.18	0.29	0.17	0.17	0.31	0.10	0.02	0.33	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.30	0.15	0.17	0.28	0.10	0.34	0.12	0.37	0.28	0.35	0.30	0.27	0.35	0.23	0.13	0.25	0.19	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.21	0.09	0.14	0.20	0.03	0.26	0.02	0.28	0.23	0.26	0.20	0.18	0.29	0.17	0.08	0.19	0.13	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.35	0.17	0.20	0.21	0.20	0.19	0.33	0.27	0.18	0.37	0.27	0.28	0.18	0.17	0.21	0.23	0.18	0.51	0.66	0.87	0.63
C2	0.19	0.18	0.24	0.33	0.13	0.30	0.14	0.41	0.22	0.19	0.23	0.14	0.31	0.14	0.16	0.21	0.38	0.25	0.57	0.75	0.96	0.71
C2'	0.22	0.36	0.22	0.24	0.24	0.24	0.22	0.35	0.28	0.23	0.38	0.30	0.28	0.22	0.22	0.25	0.25	0.24	0.53	0.67	0.89	0.65
C3'	0.24	0.37	0.22	0.24	0.25	0.26	0.23	0.37	0.27	0.24	0.37	0.31	0.25	0.23	0.23	0.26	0.24	0.26	0.54	0.69	0.91	0.67
C4	0.16	0.25	0.18	0.27	0.15	0.26	0.16	0.39	0.25	0.19	0.30	0.19	0.31	0.16	0.15	0.17	0.31	0.22	0.55	0.75	0.94	0.69
C4'	0.17	0.36	0.19	0.20	0.20	0.18	0.18	0.32	0.24	0.17	0.36	0.29	0.22	0.17	0.16	0.24	0.24	0.17	0.51	0.67	0.87	0.63
C5	0.18	0.24	0.21	0.32	0.14	0.30	0.15	0.43	0.24	0.19	0.29	0.17	0.31	0.15	0.15	0.19	0.37	0.25	0.58	0.81	0.98	0.73
C5'	0.18	0.37	0.21	0.23	0.21	0.21	0.19	0.34	0.24	0.19	0.36	0.29	0.23	0.19	0.18	0.26	0.26	0.19	0.53	0.70	0.90	0.66
C6	0.21	0.20	0.26	0.38	0.13	0.35	0.14	0.47	0.23	0.20	0.26	0.14	0.31	0.14	0.17	0.24	0.45	0.28	0.60	0.85	1.01	0.76
C8	0.16	0.30	0.17	0.25	0.17	0.25	0.17	0.39	0.26	0.19	0.34	0.23	0.30	0.16	0.15	0.17	0.30	0.22	0.55	0.77	0.95	0.71
N1	0.22	0.18	0.28	0.39	0.13	0.35	0.14	0.46	0.22	0.20	0.23	0.13	0.31	0.14	0.17	0.26	0.46	0.29	0.60	0.83	1.01	0.75
N2	0.21	0.16	0.26	0.36	0.13	0.31	0.14	0.40	0.21	0.19	0.20	0.13	0.29	0.14	0.17	0.24	0.40	0.26	0.57	0.71	0.94	0.68
N3	0.16	0.23	0.18	0.26	0.14	0.25	0.15	0.37	0.24	0.19	0.27	0.17	0.32	0.15	0.15	0.17	0.30	0.22	0.54	0.70	0.92	0.67
N7	0.17	0.27	0.20	0.30	0.15	0.29	0.16	0.43	0.25	0.19	0.31	0.19	0.31	0.15	0.15	0.18	0.35	0.24	0.58	0.82	0.98	0.73
N9	0.16	0.30	0.17	0.23	0.18	0.23	0.18	0.37	0.26	0.18	0.34	0.23	0.30	0.17	0.16	0.18	0.27	0.20	0.54	0.73	0.92	0.68
O2'	0.22	0.37	0.24	0.24	0.23	0.22	0.21	0.31	0.25	0.21	0.37	0.30	0.24	0.22	0.21	0.29	0.26	0.22	0.50	0.63	0.84	0.61
O3'	0.32	0.42	0.30	0.30	0.31	0.33	0.29	0.43	0.31	0.32	0.40	0.37	0.28	0.30	0.31	0.35	0.30	0.35	0.59	0.73	0.94	0.71
O4'	0.21	0.39	0.23	0.25	0.24	0.23	0.22	0.35	0.29	0.21	0.40	0.32	0.29	0.21	0.20	0.26	0.28	0.21	0.52	0.68	0.88	0.64
O5'	0.19	0.38	0.20	0.22	0.24	0.21	0.22	0.35	0.29	0.20	0.38	0.31	0.28	0.20	0.20	0.24	0.25	0.20	0.55	0.69	0.93	0.67
O6	0.23	0.19	0.30	0.42	0.13	0.39	0.14	0.50	0.23	0.20	0.25	0.13	0.31	0.14	0.18	0.27	0.50	0.31	0.62	0.90	1.01	0.78
OP1	0.21	0.40	0.25	0.25	0.25	0.22	0.23	0.35	0.29	0.20	0.39	0.33	0.28	0.20	0.21	0.30	0.30	0.21	0.56	0.71	0.94	0.68
OP2	0.24	0.37	0.24	0.29	0.26	0.30	0.25	0.43	0.31	0.26	0.38	0.30	0.32	0.25	0.24	0.26	0.32	0.28	0.60	0.77	1.03	0.74
P	0.19	0.37	0.22	0.25	0.23	0.23	0.21	0.37	0.28	0.19	0.37	0.30	0.27	0.19	0.19	0.27	0.29	0.20	0.56	0.73	0.97	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.14	0.16	0.37	0.19
C2	0.03	0.00	0.18	0.21	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.25	0.06	0.33	0.33	0.51	0.34
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.10	0.14	0.18	0.08	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.23	0.22	0.14
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.02	0.16	0.15	0.19	0.19	0.16	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.27	0.34	0.15	0.19
C4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.04	0.34	0.32	0.49	0.33
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.11	0.09	0.07	0.11	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.31	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.03	0.43	0.42	0.60	0.42
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.21	0.20	0.18	0.12	0.24	0.23	0.12	0.05	0.04	0.01	0.01	0.16	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.04	0.45	0.45	0.64	0.45
C8	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.16	0.04	0.42	0.38	0.54	0.38
N1	0.03	0.01	0.14	0.19	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.22	0.05	0.40	0.41	0.59	0.41
N3	0.03	0.00	0.18	0.19	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.06	0.28	0.28	0.46	0.30
N6	0.03	0.01	0.08	0.16	0.02	0.11	0.02	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.19	0.05	0.49	0.52	0.72	0.51
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.48	0.46	0.64	0.47
N9	0.00	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.30	0.27	0.44	0.29
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.11	0.06	0.15	0.18	0.09	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.18	0.27	0.10
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.18	0.16	0.22	0.22	0.19	0.17	0.07	0.05	0.00	0.02	0.23	0.46	0.20	0.22
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.17	0.43	0.23
O5'	0.14	0.33	0.20	0.27	0.34	0.01	0.43	0.01	0.45	0.42	0.40	0.28	0.49	0.48	0.30	0.07	0.23	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.33	0.23	0.34	0.32	0.12	0.42	0.16	0.45	0.38	0.41	0.28	0.52	0.46	0.27	0.18	0.46	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.51	0.22	0.15	0.49	0.31	0.60	0.29	0.64	0.54	0.59	0.46	0.72	0.64	0.44	0.27	0.20	0.43	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.34	0.14	0.19	0.33	0.08	0.42	0.01	0.45	0.38	0.41	0.30	0.51	0.47	0.29	0.10	0.22	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00