Doublet Group distance statistics: 52556

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 2, 9, 6, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.023, 0.046, 0.069, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.046 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.007, 0.031, 0.054, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.020, 0.047, 0.075, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.047 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.023, 0.053, 0.083, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.053 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.044, 0.086, 0.128, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.086 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.047, 0.093, 0.140, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.093 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.046, 0.102, 0.158, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.102 std_dev=0.056
C2'	A	0, 0.105, 0.233, 0.361, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.233 std_dev=0.128
O2'	A	0, 0.158, 0.299, 0.440, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.299 std_dev=0.141
O4'	A	0, 0.029, 0.170, 0.312, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.170 std_dev=0.141
C4	B	0, 0.271, 0.412, 0.554, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.412 std_dev=0.141
N3	B	0, 0.227, 0.376, 0.525, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.376 std_dev=0.149
C5	B	0, 0.225, 0.382, 0.539, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.382 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.152, 0.350, 0.547, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.350 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.199, 0.401, 0.602, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.401 std_dev=0.202
C4'	A	0, 0.062, 0.285, 0.507, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.285 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.130, 0.353, 0.576, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.353 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.196, 0.428, 0.660, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.428 std_dev=0.232
N7	B	0, 0.320, 0.567, 0.814, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.567 std_dev=0.247
N9	B	0, 0.380, 0.636, 0.893, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.636 std_dev=0.256
N6	B	0, 0.171, 0.441, 0.711, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.441 std_dev=0.270
O5'	A	0, 0.269, 0.559, 0.849, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.559 std_dev=0.290
C8	B	0, 0.391, 0.709, 1.028, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.709 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.523, 0.852, 1.182, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.852 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.204, 0.542, 0.880, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.542 std_dev=0.338
C5'	A	0, 0.106, 0.456, 0.807, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.456 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.674, 1.080, 1.487, 1.652 max_d=1.652 avg_d=1.080 std_dev=0.407
O4'	B	0, 0.485, 0.915, 1.346, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.915 std_dev=0.431
C3'	B	0, 0.724, 1.188, 1.651, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.188 std_dev=0.463
P	A	0, 0.480, 0.966, 1.453, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.966 std_dev=0.487
O2'	B	0, 0.769, 1.297, 1.824, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.297 std_dev=0.528
OP1	A	0, 0.544, 1.081, 1.619, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.081 std_dev=0.538
C4'	B	0, 0.561, 1.110, 1.658, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.110 std_dev=0.549
O3'	B	0, 0.889, 1.457, 2.025, 2.615 max_d=2.615 avg_d=1.457 std_dev=0.568
C5'	B	0, 0.668, 1.281, 1.894, 2.806 max_d=2.806 avg_d=1.281 std_dev=0.613
O5'	B	0, 0.765, 1.383, 2.002, 2.905 max_d=2.905 avg_d=1.383 std_dev=0.619
OP2	A	0, 0.542, 1.214, 1.887, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.214 std_dev=0.672
P	B	0, 0.789, 1.559, 2.329, 3.744 max_d=3.744 avg_d=1.559 std_dev=0.770
OP1	B	0, 1.093, 2.001, 2.909, 4.374 max_d=4.374 avg_d=2.001 std_dev=0.908
OP2	B	0, 0.688, 1.764, 2.839, 5.465 max_d=5.465 avg_d=1.764 std_dev=1.075

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.03	0.16	0.10	0.14
C2	0.03	0.00	0.15	0.18	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.24	0.06	0.14	0.01	0.16	0.18	0.16
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.13	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.13	0.13	0.07
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.15	0.08	0.18	0.20	0.16	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.17	0.18	0.12
C4	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.14	0.02	0.16	0.17	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.16	0.02	0.18	0.20	0.19
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.11	0.08	0.08	0.13	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.19	0.04	0.16	0.00	0.19	0.22	0.19
C8	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.16	0.03	0.17	0.17	0.18
N1	0.02	0.01	0.13	0.18	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.23	0.05	0.15	0.01	0.18	0.21	0.18
N2	0.04	0.00	0.18	0.20	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.28	0.07	0.13	0.02	0.16	0.18	0.16
N3	0.03	0.01	0.15	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.20	0.06	0.13	0.01	0.15	0.16	0.16
N7	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.17	0.03	0.19	0.21	0.20
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.13	0.03	0.16	0.14	0.16
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.11	0.16	0.11	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.05	0.07	0.14	0.08	0.08
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.03	0.19	0.09	0.23	0.28	0.20	0.11	0.06	0.05	0.00	0.01	0.14	0.20	0.26	0.26	0.19
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.05	0.21	0.14	0.18
O5'	0.08	0.14	0.06	0.10	0.14	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.15	0.13	0.13	0.17	0.13	0.05	0.14	0.10	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.15	0.02	0.07	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.20	0.05	0.17	0.00	0.21	0.25	0.21
OP1	0.16	0.16	0.13	0.17	0.16	0.11	0.18	0.06	0.19	0.17	0.18	0.16	0.15	0.19	0.16	0.14	0.26	0.21	0.02	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.18	0.13	0.18	0.17	0.03	0.20	0.02	0.22	0.17	0.21	0.18	0.16	0.21	0.14	0.08	0.26	0.14	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.16	0.07	0.12	0.17	0.05	0.19	0.02	0.19	0.18	0.18	0.16	0.16	0.20	0.16	0.08	0.19	0.18	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.19	0.28	0.31	0.16	0.26	0.15	0.37	0.14	0.20	0.18	0.18	0.13	0.20	0.18	0.28	0.36	0.19	0.60	0.81	1.18	0.81
C2	0.22	0.14	0.25	0.30	0.15	0.28	0.13	0.38	0.13	0.22	0.15	0.14	0.18	0.18	0.20	0.23	0.33	0.26	0.64	0.87	1.27	0.87
C2'	0.18	0.24	0.23	0.24	0.19	0.19	0.20	0.28	0.21	0.21	0.24	0.21	0.23	0.22	0.19	0.24	0.29	0.18	0.61	0.76	1.18	0.81
C3'	0.18	0.24	0.24	0.26	0.19	0.19	0.19	0.28	0.20	0.20	0.23	0.21	0.21	0.21	0.18	0.24	0.32	0.17	0.60	0.76	1.18	0.80
C4	0.21	0.16	0.27	0.31	0.16	0.28	0.15	0.39	0.14	0.22	0.17	0.15	0.15	0.20	0.19	0.25	0.35	0.24	0.63	0.89	1.24	0.86
C4'	0.19	0.20	0.31	0.36	0.16	0.26	0.15	0.36	0.14	0.18	0.18	0.19	0.14	0.18	0.17	0.32	0.44	0.18	0.58	0.78	1.15	0.78
C5	0.22	0.16	0.28	0.33	0.15	0.30	0.14	0.40	0.14	0.23	0.17	0.15	0.15	0.19	0.20	0.26	0.37	0.25	0.64	0.94	1.26	0.89
C5'	0.22	0.21	0.36	0.41	0.18	0.31	0.15	0.40	0.14	0.20	0.18	0.21	0.14	0.19	0.19	0.37	0.51	0.21	0.58	0.81	1.15	0.77
C6	0.23	0.15	0.28	0.34	0.15	0.31	0.13	0.41	0.14	0.22	0.16	0.14	0.17	0.17	0.20	0.26	0.38	0.28	0.65	0.96	1.28	0.90
C8	0.21	0.18	0.29	0.33	0.16	0.29	0.15	0.40	0.14	0.22	0.18	0.17	0.14	0.20	0.19	0.28	0.38	0.23	0.63	0.92	1.23	0.87
N1	0.23	0.14	0.27	0.33	0.15	0.31	0.13	0.41	0.14	0.22	0.15	0.14	0.18	0.17	0.20	0.25	0.37	0.28	0.65	0.93	1.29	0.90
N2	0.23	0.13	0.25	0.31	0.15	0.29	0.13	0.38	0.14	0.23	0.14	0.14	0.19	0.17	0.20	0.23	0.33	0.27	0.64	0.82	1.26	0.85
N3	0.20	0.15	0.25	0.29	0.15	0.27	0.14	0.37	0.13	0.22	0.16	0.15	0.16	0.20	0.19	0.24	0.32	0.23	0.62	0.84	1.23	0.84
N7	0.21	0.17	0.29	0.33	0.16	0.30	0.15	0.41	0.14	0.23	0.18	0.16	0.14	0.20	0.20	0.27	0.38	0.25	0.64	0.95	1.25	0.89
N9	0.20	0.18	0.28	0.32	0.16	0.28	0.15	0.39	0.14	0.22	0.18	0.17	0.14	0.20	0.19	0.27	0.36	0.22	0.62	0.88	1.22	0.85
O2'	0.17	0.23	0.22	0.24	0.18	0.17	0.19	0.25	0.20	0.19	0.23	0.21	0.24	0.21	0.18	0.24	0.28	0.17	0.59	0.71	1.13	0.78
O3'	0.24	0.30	0.25	0.26	0.25	0.22	0.24	0.28	0.25	0.25	0.29	0.28	0.26	0.26	0.24	0.27	0.31	0.25	0.62	0.74	1.18	0.81
O4'	0.26	0.22	0.36	0.41	0.21	0.35	0.19	0.45	0.15	0.25	0.19	0.22	0.16	0.23	0.23	0.37	0.48	0.26	0.60	0.84	1.16	0.80
O5'	0.23	0.23	0.37	0.42	0.19	0.31	0.17	0.40	0.16	0.21	0.20	0.22	0.16	0.20	0.21	0.37	0.51	0.22	0.59	0.82	1.17	0.78
O6	0.24	0.14	0.29	0.36	0.15	0.32	0.13	0.43	0.14	0.22	0.16	0.14	0.17	0.17	0.20	0.27	0.41	0.29	0.66	0.98	1.27	0.91
OP1	0.29	0.30	0.44	0.48	0.26	0.36	0.23	0.42	0.22	0.26	0.27	0.30	0.19	0.24	0.27	0.46	0.58	0.26	0.63	0.85	1.19	0.80
OP2	0.26	0.23	0.40	0.45	0.22	0.34	0.20	0.42	0.19	0.25	0.22	0.23	0.18	0.24	0.24	0.40	0.55	0.25	0.63	0.91	1.20	0.83
P	0.29	0.27	0.45	0.49	0.25	0.37	0.23	0.45	0.21	0.27	0.24	0.27	0.19	0.25	0.27	0.46	0.59	0.27	0.65	0.90	1.21	0.83

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.19	0.16	0.44	0.24
C2	0.05	0.00	0.20	0.25	0.01	0.10	0.02	0.17	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.32	0.06	0.37	0.35	0.76	0.46
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.09	0.01	0.04	0.03	0.08	0.12	0.15	0.21	0.06	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.23	0.35	0.19
C3'	0.01	0.25	0.01	0.00	0.13	0.00	0.08	0.02	0.12	0.16	0.20	0.24	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.01	0.31	0.35	0.28	0.23
C4	0.03	0.01	0.09	0.13	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.38	0.35	0.74	0.46
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.11	0.09	0.09	0.09	0.10	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.17	0.29	0.07
C5	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.47	0.48	0.90	0.59
C5'	0.04	0.17	0.03	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.21	0.21	0.19	0.14	0.23	0.22	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.23	0.30	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.48	0.52	0.95	0.61
C8	0.01	0.03	0.12	0.16	0.02	0.11	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.07	0.18	0.04	0.49	0.46	0.82	0.56
N1	0.05	0.00	0.15	0.20	0.02	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.26	0.05	0.43	0.45	0.88	0.55
N3	0.04	0.01	0.21	0.24	0.01	0.09	0.02	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.29	0.06	0.32	0.29	0.67	0.40
N6	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.12	0.03	0.52	0.62	1.05	0.69
N7	0.01	0.02	0.09	0.12	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.53	0.56	0.97	0.65
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.36	0.30	0.65	0.41
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.11	0.07	0.16	0.18	0.09	0.07	0.03	0.00	0.05	0.06	0.06	0.23	0.31	0.10
O3'	0.02	0.32	0.02	0.01	0.14	0.02	0.09	0.04	0.15	0.18	0.26	0.29	0.12	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.29	0.47	0.28	0.24
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.17	0.22	0.39	0.24
O5'	0.19	0.37	0.22	0.31	0.38	0.02	0.47	0.01	0.48	0.49	0.43	0.32	0.52	0.53	0.36	0.06	0.29	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.35	0.23	0.35	0.35	0.17	0.48	0.23	0.52	0.46	0.45	0.29	0.62	0.56	0.30	0.23	0.47	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.44	0.76	0.35	0.28	0.74	0.29	0.90	0.30	0.95	0.82	0.88	0.67	1.05	0.97	0.65	0.31	0.28	0.39	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.46	0.19	0.23	0.46	0.07	0.59	0.02	0.61	0.56	0.55	0.40	0.69	0.65	0.41	0.10	0.24	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00