Doublet Group distance statistics: 52560

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.019, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.005, 0.028, 0.052, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.007, 0.040, 0.072, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.032
P	A	0, 0.089, 0.318, 0.548, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.318 std_dev=0.229
O2'	A	0, 0.006, 0.258, 0.509, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.258 std_dev=0.251
C2'	A	0, -0.057, 0.244, 0.546, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.244 std_dev=0.302
OP1	A	0, 0.121, 0.426, 0.730, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.426 std_dev=0.305
O4'	A	0, -0.041, 0.279, 0.599, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.279 std_dev=0.320
OP2	A	0, 0.104, 0.446, 0.788, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.446 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.098, 0.441, 0.784, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.441 std_dev=0.343
C4'	A	0, -0.042, 0.473, 0.987, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.473 std_dev=0.514
C3'	A	0, -0.064, 0.455, 0.973, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.455 std_dev=0.519
N1	B	0, 0.160, 0.694, 1.228, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.694 std_dev=0.534
C2	B	0, 0.216, 0.756, 1.295, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.756 std_dev=0.539
C4	B	0, 0.194, 0.777, 1.360, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.777 std_dev=0.583
C5	B	0, 0.031, 0.619, 1.206, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.619 std_dev=0.588
O4'	B	0, 0.242, 0.850, 1.458, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.850 std_dev=0.608
N3	B	0, 0.263, 0.898, 1.533, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.898 std_dev=0.635
C6	B	0, -0.021, 0.647, 1.316, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.647 std_dev=0.669
O3'	A	0, -0.065, 0.607, 1.278, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.607 std_dev=0.671
N7	B	0, -0.106, 0.594, 1.294, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.594 std_dev=0.700
C8	B	0, 0.004, 0.708, 1.412, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.708 std_dev=0.704
N9	B	0, 0.168, 0.893, 1.618, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.893 std_dev=0.725
C5'	A	0, -0.009, 0.845, 1.699, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.845 std_dev=0.854
C1'	B	0, 0.279, 1.277, 2.276, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.277 std_dev=0.998
N6	B	0, -0.212, 0.794, 1.801, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.794 std_dev=1.007
C4'	B	0, -0.097, 1.079, 2.254, 2.714 max_d=2.714 avg_d=1.079 std_dev=1.176
C2'	B	0, 0.238, 2.128, 4.018, 4.593 max_d=4.593 avg_d=2.128 std_dev=1.890
C3'	B	0, -0.003, 1.929, 3.862, 4.570 max_d=4.570 avg_d=1.929 std_dev=1.932
C5'	B	0, 0.039, 2.129, 4.219, 4.970 max_d=4.970 avg_d=2.129 std_dev=2.090
O2'	B	0, 0.452, 2.958, 5.464, 6.127 max_d=6.127 avg_d=2.958 std_dev=2.506
O3'	B	0, -0.079, 2.521, 5.121, 6.100 max_d=6.100 avg_d=2.521 std_dev=2.600
O5'	B	0, -0.190, 2.514, 5.219, 6.267 max_d=6.267 avg_d=2.514 std_dev=2.704
P	B	0, -0.563, 3.467, 7.496, 9.117 max_d=9.117 avg_d=3.467 std_dev=4.029
OP2	B	0, -0.628, 3.581, 7.790, 9.490 max_d=9.490 avg_d=3.581 std_dev=4.209
OP1	B	0, -0.668, 4.237, 9.143, 11.113 max_d=11.113 avg_d=4.237 std_dev=4.906

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.12	0.01	0.09	0.38	0.07
C2	0.04	0.00	0.18	0.25	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.31	0.06	0.31	0.00	0.11	0.24	0.07
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.04	0.01	0.09	0.08	0.15	0.22	0.18	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.08	0.34	0.14	0.15
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.00	0.09	0.01	0.15	0.12	0.22	0.29	0.22	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.40	0.14	0.47	0.04	0.29
C4	0.02	0.01	0.10	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.33	0.02	0.13	0.25	0.07
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.09	0.06	0.10	0.09	0.07	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.13	0.37	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.41	0.03	0.13	0.19	0.12
C5'	0.03	0.16	0.01	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.18	0.12	0.18	0.16	0.13	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.12	0.39	0.02
C6	0.01	0.00	0.09	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.17	0.00	0.40	0.01	0.11	0.18	0.12
C8	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.06	0.43	0.04	0.15	0.23	0.12
N1	0.02	0.00	0.15	0.22	0.01	0.10	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.27	0.03	0.36	0.00	0.10	0.21	0.09
N2	0.05	0.00	0.22	0.29	0.00	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.38	0.08	0.28	0.01	0.10	0.25	0.05
N3	0.05	0.00	0.18	0.22	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.27	0.07	0.28	0.01	0.12	0.26	0.05
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.04	0.46	0.05	0.15	0.17	0.16
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.31	0.03	0.13	0.29	0.05
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.24	0.25	0.02
O3'	0.00	0.31	0.01	0.01	0.15	0.00	0.09	0.01	0.17	0.13	0.27	0.38	0.27	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.37	0.16	0.61	0.08	0.37
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.08	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.03	0.08	0.55	0.24
O5'	0.12	0.31	0.29	0.40	0.33	0.02	0.41	0.02	0.40	0.43	0.36	0.28	0.28	0.46	0.31	0.08	0.37	0.11	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.11	0.03	0.19	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.16	0.03	0.41	0.00	0.08	0.14	0.13
OP1	0.09	0.11	0.34	0.47	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.10	0.10	0.12	0.15	0.13	0.24	0.61	0.08	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01
OP2	0.38	0.24	0.14	0.04	0.25	0.37	0.19	0.39	0.18	0.23	0.21	0.25	0.26	0.17	0.29	0.25	0.08	0.55	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.07	0.15	0.29	0.07	0.06	0.12	0.02	0.12	0.12	0.09	0.05	0.05	0.16	0.05	0.02	0.37	0.24	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.62	0.18	0.53	0.03	0.42	0.18	0.41	0.39	0.21	0.69	0.11	0.31	0.12	0.62	0.57	0.90	0.03	0.45	1.20	1.51	1.54	1.27
C2	0.72	0.04	0.84	0.13	0.26	0.12	0.03	0.84	0.26	0.52	0.22	0.21	0.54	0.16	0.52	1.44	0.20	0.28	1.85	2.59	2.77	2.32
C2'	0.92	0.44	0.93	0.54	0.74	0.60	0.75	0.42	0.51	1.01	0.35	0.61	0.40	0.97	0.90	1.21	0.53	0.78	0.68	0.87	0.92	0.71
C3'	1.05	0.64	1.11	0.72	0.89	0.74	0.88	0.53	0.69	1.09	0.56	0.78	0.60	1.04	1.02	1.38	0.72	0.89	0.56	0.80	0.80	0.62
C4	0.73	0.11	0.78	0.11	0.37	0.08	0.24	0.65	0.04	0.66	0.09	0.29	0.27	0.45	0.60	1.30	0.16	0.35	1.63	2.30	2.37	1.99
C4'	0.77	0.46	0.71	0.29	0.65	0.42	0.67	0.31	0.54	0.84	0.43	0.56	0.53	0.82	0.75	1.00	0.24	0.65	0.84	1.08	1.04	0.86
C5	0.74	0.09	0.86	0.13	0.33	0.11	0.17	0.85	0.11	0.60	0.14	0.27	0.34	0.35	0.57	1.47	0.19	0.29	1.86	2.75	2.77	2.38
C5'	0.85	0.54	0.82	0.37	0.72	0.46	0.71	0.31	0.59	0.88	0.49	0.64	0.55	0.84	0.81	1.14	0.32	0.69	0.89	1.23	1.16	0.97
C6	0.73	0.07	0.92	0.14	0.26	0.21	0.05	1.07	0.23	0.49	0.22	0.22	0.48	0.18	0.50	1.60	0.23	0.24	2.10	3.18	3.19	2.77
C8	0.72	0.15	0.76	0.10	0.41	0.09	0.32	0.62	0.08	0.68	0.06	0.32	0.10	0.52	0.61	1.28	0.14	0.37	1.59	2.29	2.28	1.95
N1	0.72	0.07	0.91	0.15	0.21	0.22	0.04	1.08	0.30	0.43	0.26	0.19	0.56	0.08	0.47	1.60	0.24	0.24	2.11	3.13	3.23	2.77
N2	0.71	0.05	0.84	0.15	0.18	0.13	0.12	0.86	0.37	0.41	0.28	0.16	0.63	0.07	0.47	1.44	0.21	0.26	1.87	2.50	2.75	2.29
N3	0.73	0.09	0.76	0.12	0.36	0.08	0.20	0.60	0.10	0.66	0.11	0.28	0.36	0.41	0.59	1.26	0.16	0.36	1.56	2.12	2.24	1.86
N7	0.74	0.12	0.84	0.12	0.36	0.10	0.23	0.80	0.04	0.63	0.11	0.29	0.24	0.42	0.59	1.44	0.18	0.31	1.81	2.69	2.67	2.30
N9	0.70	0.16	0.70	0.09	0.42	0.12	0.34	0.52	0.10	0.70	0.05	0.32	0.08	0.56	0.61	1.17	0.11	0.40	1.45	2.01	2.04	1.71
O2'	0.74	0.35	0.67	0.40	0.63	0.57	0.70	0.52	0.53	0.89	0.32	0.48	0.55	0.90	0.75	0.85	0.35	0.74	0.48	0.45	0.49	0.33
O3'	1.17	0.84	1.29	1.02	1.06	1.02	1.05	0.87	0.91	1.21	0.78	0.96	0.84	1.17	1.16	1.46	1.02	1.09	0.22	0.25	0.26	0.14
O4'	0.56	0.24	0.43	0.07	0.42	0.14	0.44	0.41	0.30	0.63	0.20	0.33	0.28	0.60	0.53	0.79	0.14	0.42	1.22	1.54	1.50	1.27
O5'	0.54	0.25	0.52	0.00	0.41	0.12	0.40	0.44	0.28	0.58	0.20	0.34	0.24	0.53	0.51	0.88	0.03	0.34	1.33	1.75	1.70	1.47
O6	0.71	0.09	0.94	0.15	0.22	0.30	0.03	1.24	0.26	0.42	0.25	0.20	0.51	0.12	0.47	1.68	0.25	0.24	2.26	3.54	3.44	3.04
OP1	0.61	0.20	0.65	0.15	0.42	0.18	0.40	0.37	0.24	0.64	0.14	0.32	0.19	0.57	0.56	1.03	0.14	0.39	1.27	1.73	1.66	1.45
OP2	1.03	0.53	1.10	0.47	0.78	0.41	0.73	0.33	0.53	1.01	0.43	0.68	0.42	0.90	0.94	1.57	0.49	0.68	1.21	1.91	1.81	1.55
P	0.73	0.33	0.73	0.17	0.53	0.20	0.51	0.40	0.36	0.74	0.26	0.45	0.30	0.67	0.67	1.15	0.15	0.47	1.30	1.84	1.76	1.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.31	0.21	0.26	0.18
C2	0.01	0.00	0.27	0.60	0.02	0.67	0.01	1.09	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.23	0.57	0.48	0.59	1.13	1.41	1.08
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.12	0.02	0.03	0.07	0.09	0.17	0.19	0.28	0.06	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.33	0.33	0.17	0.09
C3'	0.02	0.60	0.00	0.00	0.18	0.00	0.11	0.01	0.09	0.62	0.37	0.60	0.08	0.51	0.15	0.01	0.00	0.01	0.34	0.48	0.18	0.19
C4	0.02	0.02	0.12	0.18	0.00	0.25	0.01	0.42	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.17	0.23	0.25	0.11	0.35	0.16
C4'	0.01	0.67	0.02	0.00	0.25	0.00	0.08	0.01	0.16	0.53	0.45	0.67	0.08	0.43	0.10	0.10	0.01	0.01	0.01	0.13	0.42	0.15
C5	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.08	0.00	0.28	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.12	0.05	0.77	0.48	0.37	0.45
C5'	0.09	1.09	0.07	0.01	0.42	0.01	0.28	0.00	0.35	0.83	0.75	1.05	0.29	0.72	0.24	0.06	0.09	0.01	0.01	0.27	0.43	0.03
C6	0.02	0.02	0.09	0.09	0.01	0.16	0.01	0.35	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.09	0.15	0.52	0.14	0.06	0.16
C8	0.03	0.04	0.17	0.62	0.01	0.53	0.03	0.83	0.04	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.21	0.55	0.29	1.53	1.36	1.19	1.25
N1	0.01	0.01	0.19	0.37	0.01	0.45	0.02	0.75	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.15	0.35	0.34	0.20	0.62	0.78	0.56
N3	0.02	0.00	0.28	0.60	0.00	0.67	0.02	1.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.22	0.56	0.50	0.57	0.99	1.33	1.01
N6	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.08	0.03	0.29	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.11	0.09	0.08	0.80	0.54	0.54	0.54
N7	0.05	0.01	0.12	0.51	0.02	0.43	0.01	0.72	0.04	0.01	0.03	0.02	0.08	0.00	0.04	0.16	0.49	0.21	1.48	1.35	1.30	1.26
N9	0.01	0.02	0.01	0.15	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.12	0.02	0.70	0.47	0.23	0.37
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.08	0.10	0.07	0.06	0.08	0.21	0.15	0.22	0.11	0.16	0.07	0.00	0.07	0.09	0.18	0.24	0.22	0.04
O3'	0.05	0.57	0.03	0.00	0.17	0.01	0.12	0.09	0.09	0.55	0.35	0.56	0.09	0.49	0.12	0.07	0.00	0.06	0.20	0.52	0.19	0.18
O4'	0.01	0.48	0.00	0.01	0.23	0.01	0.05	0.01	0.15	0.29	0.34	0.50	0.08	0.21	0.02	0.09	0.06	0.00	0.21	0.27	0.56	0.37
O5'	0.31	0.59	0.33	0.34	0.25	0.01	0.77	0.01	0.52	1.53	0.20	0.57	0.80	1.48	0.70	0.18	0.20	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.21	1.13	0.33	0.48	0.11	0.13	0.48	0.27	0.14	1.36	0.62	0.99	0.54	1.35	0.47	0.24	0.52	0.27	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.26	1.41	0.17	0.18	0.35	0.42	0.37	0.43	0.06	1.19	0.78	1.33	0.54	1.30	0.23	0.22	0.19	0.56	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.18	1.08	0.09	0.19	0.16	0.15	0.45	0.03	0.16	1.25	0.56	1.01	0.54	1.26	0.37	0.04	0.18	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00