Doublet Group distance statistics: 52564

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 1, 9, 17, 20, 12, 16, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.024, 0.039, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.019, 0.035, 0.050, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.035 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.021, 0.037, 0.054, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.038 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.038, 0.176, 0.314, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.176 std_dev=0.138
C2'	A	0, 0.039, 0.185, 0.330, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.185 std_dev=0.145
C6	B	0, 0.341, 0.503, 0.665, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.503 std_dev=0.162
C5	B	0, 0.326, 0.489, 0.651, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.489 std_dev=0.163
C4	B	0, 0.391, 0.577, 0.763, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.577 std_dev=0.186
O6	B	0, 0.292, 0.480, 0.667, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.480 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.048, 0.242, 0.436, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.242 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.066, 0.264, 0.463, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.264 std_dev=0.199
N9	B	0, 0.377, 0.585, 0.793, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.585 std_dev=0.208
N7	B	0, 0.294, 0.502, 0.711, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.502 std_dev=0.209
C8	B	0, 0.328, 0.550, 0.773, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.550 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.405, 0.633, 0.861, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.633 std_dev=0.228
C3'	A	0, 0.054, 0.294, 0.534, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.294 std_dev=0.240
N3	B	0, 0.439, 0.714, 0.988, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.714 std_dev=0.274
C1'	B	0, 0.435, 0.720, 1.006, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.720 std_dev=0.286
C2	B	0, 0.430, 0.736, 1.042, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.736 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.137, 0.479, 0.820, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.479 std_dev=0.342
O3'	A	0, 0.101, 0.446, 0.790, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.446 std_dev=0.344
O4'	B	0, 0.476, 0.832, 1.187, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.832 std_dev=0.356
O5'	A	0, 0.126, 0.533, 0.941, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.533 std_dev=0.408
C3'	B	0, 0.633, 1.045, 1.458, 1.956 max_d=1.956 avg_d=1.045 std_dev=0.413
C2'	B	0, 0.574, 0.988, 1.401, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.988 std_dev=0.413
N2	B	0, 0.482, 0.913, 1.343, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.913 std_dev=0.430
C4'	B	0, 0.574, 1.034, 1.494, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.034 std_dev=0.460
OP2	A	0, 0.134, 0.676, 1.218, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.676 std_dev=0.542
P	A	0, 0.073, 0.632, 1.191, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.632 std_dev=0.559
O3'	B	0, 0.745, 1.329, 1.913, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.329 std_dev=0.584
C5'	B	0, 0.513, 1.142, 1.771, 3.241 max_d=3.241 avg_d=1.142 std_dev=0.629
OP1	A	0, 0.103, 0.826, 1.549, 2.805 max_d=2.805 avg_d=0.826 std_dev=0.723
O2'	B	0, 0.550, 1.282, 2.015, 3.265 max_d=3.265 avg_d=1.282 std_dev=0.732
O5'	B	0, 0.195, 1.198, 2.200, 4.339 max_d=4.339 avg_d=1.198 std_dev=1.002
P	B	0, 0.157, 1.381, 2.605, 4.894 max_d=4.894 avg_d=1.381 std_dev=1.224
OP2	B	0, -0.163, 1.468, 3.099, 6.257 max_d=6.257 avg_d=1.468 std_dev=1.631
OP1	B	0, 0.134, 1.820, 3.505, 6.547 max_d=6.547 avg_d=1.820 std_dev=1.686

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.07	0.25	0.10
C2	0.03	0.00	0.15	0.14	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.19	0.07	0.16	0.01	0.13	0.28	0.16
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.06	0.10	0.22	0.09
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.13	0.12	0.17	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.16	0.09	0.15	0.18	0.12
C4	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.18	0.01	0.13	0.27	0.15
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.05	0.09	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.23	0.01	0.19	0.29	0.20
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.06	0.05	0.11	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.10	0.12	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.24	0.00	0.20	0.30	0.21
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.05	0.24	0.02	0.17	0.27	0.19
N1	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.16	0.05	0.20	0.01	0.17	0.29	0.19
N2	0.03	0.00	0.18	0.17	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.24	0.08	0.14	0.01	0.12	0.28	0.15
N3	0.03	0.01	0.15	0.13	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.17	0.06	0.14	0.01	0.11	0.27	0.14
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.27	0.02	0.22	0.30	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.17	0.01	0.11	0.26	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.09	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.14	0.20	0.16	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.08	0.10	0.22	0.08
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.12	0.14	0.16	0.24	0.17	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.18	0.12	0.20	0.19	0.15
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.03	0.11	0.27	0.13
O5'	0.08	0.16	0.11	0.16	0.18	0.02	0.23	0.01	0.24	0.24	0.20	0.14	0.14	0.27	0.17	0.07	0.18	0.10	0.00	0.26	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.03	0.26	0.00	0.24	0.32	0.24
OP1	0.07	0.13	0.10	0.15	0.13	0.09	0.19	0.12	0.20	0.17	0.17	0.12	0.11	0.22	0.11	0.10	0.20	0.11	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.28	0.22	0.18	0.27	0.20	0.29	0.15	0.30	0.27	0.29	0.28	0.27	0.30	0.26	0.22	0.19	0.27	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.09	0.12	0.15	0.06	0.20	0.02	0.21	0.19	0.19	0.15	0.14	0.23	0.14	0.08	0.15	0.13	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.24	0.28	0.50	0.21	0.31	0.22	0.33	0.21	0.27	0.24	0.29	0.21	0.27	0.23	0.41	0.48	0.26	0.91	0.21	1.05	1.64	1.08
C2	0.23	0.16	0.27	0.41	0.16	0.30	0.15	0.32	0.16	0.26	0.19	0.19	0.15	0.22	0.21	0.48	0.40	0.27	0.89	0.21	1.00	1.62	1.06
C2'	0.38	0.40	0.40	0.50	0.37	0.38	0.37	0.37	0.36	0.39	0.38	0.43	0.38	0.39	0.38	0.49	0.49	0.41	0.75	0.35	0.80	1.45	0.90
C3'	0.39	0.41	0.40	0.48	0.38	0.38	0.37	0.37	0.36	0.39	0.39	0.46	0.40	0.39	0.38	0.49	0.47	0.43	0.73	0.34	0.79	1.46	0.88
C4	0.23	0.19	0.26	0.46	0.18	0.31	0.18	0.34	0.17	0.27	0.20	0.23	0.17	0.24	0.22	0.46	0.45	0.27	0.92	0.18	1.06	1.68	1.11
C4'	0.25	0.28	0.29	0.49	0.24	0.29	0.24	0.30	0.24	0.28	0.27	0.34	0.25	0.28	0.25	0.39	0.46	0.28	0.85	0.23	1.00	1.61	1.04
C5	0.23	0.18	0.27	0.43	0.17	0.32	0.16	0.35	0.16	0.26	0.20	0.21	0.15	0.22	0.22	0.50	0.44	0.28	0.93	0.18	1.09	1.72	1.13
C5'	0.23	0.27	0.28	0.51	0.22	0.29	0.23	0.32	0.22	0.27	0.26	0.34	0.24	0.27	0.23	0.38	0.48	0.27	0.91	0.22	1.09	1.69	1.10
C6	0.24	0.16	0.30	0.40	0.15	0.32	0.14	0.36	0.16	0.25	0.19	0.19	0.14	0.19	0.21	0.53	0.42	0.29	0.91	0.20	1.08	1.71	1.12
C8	0.23	0.21	0.26	0.47	0.18	0.32	0.19	0.35	0.18	0.27	0.22	0.25	0.18	0.24	0.22	0.47	0.48	0.27	0.94	0.19	1.11	1.73	1.14
N1	0.23	0.16	0.30	0.39	0.15	0.31	0.14	0.34	0.17	0.25	0.19	0.18	0.14	0.19	0.21	0.52	0.40	0.28	0.90	0.22	1.04	1.67	1.09
N2	0.23	0.15	0.27	0.39	0.16	0.29	0.15	0.30	0.17	0.26	0.19	0.17	0.14	0.22	0.22	0.47	0.37	0.27	0.87	0.24	0.94	1.53	1.01
N3	0.23	0.18	0.26	0.45	0.18	0.30	0.18	0.32	0.17	0.27	0.20	0.21	0.17	0.25	0.22	0.45	0.43	0.27	0.90	0.19	1.01	1.62	1.06
N7	0.23	0.19	0.27	0.45	0.17	0.32	0.17	0.36	0.17	0.26	0.20	0.23	0.16	0.23	0.22	0.50	0.46	0.28	0.94	0.18	1.12	1.74	1.15
N9	0.23	0.21	0.26	0.48	0.19	0.31	0.20	0.34	0.19	0.27	0.22	0.26	0.19	0.25	0.23	0.45	0.47	0.27	0.92	0.19	1.08	1.69	1.11
O2'	0.40	0.43	0.44	0.54	0.40	0.41	0.40	0.40	0.39	0.40	0.42	0.47	0.41	0.41	0.40	0.49	0.53	0.43	0.73	0.39	0.77	1.38	0.87
O3'	0.49	0.53	0.50	0.53	0.48	0.48	0.46	0.46	0.45	0.47	0.50	0.59	0.51	0.46	0.48	0.55	0.53	0.54	0.66	0.42	0.67	1.35	0.79
O4'	0.21	0.24	0.28	0.55	0.20	0.33	0.21	0.36	0.20	0.25	0.24	0.30	0.21	0.25	0.22	0.39	0.52	0.24	0.98	0.20	1.17	1.73	1.17
O5'	0.25	0.26	0.27	0.51	0.22	0.32	0.23	0.36	0.22	0.30	0.25	0.33	0.23	0.29	0.25	0.40	0.48	0.29	0.93	0.22	1.10	1.74	1.13
O6	0.24	0.16	0.33	0.39	0.15	0.33	0.14	0.37	0.17	0.24	0.19	0.18	0.14	0.18	0.21	0.56	0.43	0.30	0.91	0.21	1.09	1.71	1.13
OP1	0.23	0.25	0.27	0.53	0.21	0.33	0.22	0.38	0.21	0.28	0.24	0.32	0.22	0.28	0.24	0.38	0.51	0.28	0.97	0.21	1.18	1.81	1.19
OP2	0.38	0.42	0.40	0.66	0.37	0.48	0.36	0.51	0.38	0.39	0.41	0.47	0.39	0.38	0.37	0.46	0.67	0.40	1.11	0.38	1.32	1.94	1.33
P	0.28	0.30	0.32	0.59	0.26	0.40	0.26	0.44	0.26	0.32	0.29	0.36	0.27	0.31	0.28	0.41	0.59	0.32	1.04	0.26	1.26	1.87	1.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.25	0.00	0.26	0.02	0.27	0.24	0.23
C2	0.03	0.00	0.27	0.26	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.10	0.53	0.01	0.56	0.79	0.57
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.15	0.01	0.11	0.17	0.16	0.10	0.23	0.30	0.25	0.08	0.04	0.00	0.02	0.02	0.11	0.15	0.22	0.28	0.14
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.25	0.00	0.34	0.02	0.36	0.29	0.33	0.22	0.21	0.35	0.20	0.02	0.01	0.01	0.15	0.40	0.29	0.24	0.14
C4	0.02	0.01	0.15	0.25	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.06	0.58	0.01	0.57	0.80	0.60
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.05	0.04	0.15	0.08	0.24	0.02	0.00	0.02	0.14	0.14	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.11	0.34	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.18	0.04	0.74	0.01	0.75	1.11	0.80
C5'	0.06	0.07	0.17	0.02	0.07	0.00	0.12	0.00	0.13	0.13	0.10	0.06	0.06	0.15	0.07	0.08	0.17	0.01	0.01	0.15	0.23	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.16	0.36	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.21	0.06	0.76	0.01	0.80	1.21	0.85
C8	0.01	0.01	0.10	0.29	0.01	0.14	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.17	0.06	0.76	0.02	0.70	1.00	0.77
N1	0.03	0.00	0.23	0.33	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.17	0.08	0.66	0.01	0.70	1.04	0.74
N2	0.04	0.01	0.30	0.22	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.24	0.12	0.45	0.02	0.50	0.69	0.50
N3	0.03	0.01	0.25	0.21	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.10	0.45	0.01	0.48	0.64	0.48
N7	0.01	0.01	0.08	0.35	0.01	0.15	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.24	0.04	0.84	0.02	0.83	1.26	0.91
N9	0.01	0.02	0.04	0.20	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.09	0.02	0.54	0.02	0.51	0.67	0.53
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.15	0.24	0.22	0.08	0.21	0.24	0.16	0.12	0.10	0.26	0.16	0.00	0.04	0.16	0.13	0.25	0.27	0.33	0.08
O3'	0.25	0.18	0.02	0.01	0.12	0.02	0.18	0.17	0.21	0.17	0.17	0.24	0.20	0.24	0.09	0.04	0.00	0.18	0.16	0.27	0.44	0.22	0.20
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.08	0.12	0.10	0.04	0.02	0.16	0.18	0.00	0.26	0.05	0.25	0.26	0.25
O5'	0.26	0.53	0.11	0.15	0.58	0.02	0.74	0.01	0.76	0.76	0.66	0.45	0.45	0.84	0.54	0.13	0.16	0.26	0.00	0.84	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.40	0.01	0.14	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.25	0.27	0.05	0.84	0.00	0.90	1.40	0.97
OP1	0.27	0.56	0.22	0.29	0.57	0.14	0.75	0.23	0.80	0.70	0.70	0.50	0.48	0.83	0.51	0.27	0.44	0.25	0.02	0.90	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.79	0.28	0.24	0.80	0.17	1.11	0.18	1.21	1.00	1.04	0.69	0.64	1.26	0.67	0.33	0.22	0.26	0.02	1.40	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.57	0.14	0.14	0.60	0.03	0.80	0.02	0.85	0.77	0.74	0.50	0.48	0.91	0.53	0.08	0.20	0.25	0.00	0.97	0.01	0.01	0.00