Doublet Group distance statistics: 52565

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 1, 3, 4, 7, 10, 10, 5, 4, 0, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.018, 0.037, 0.055, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.027 std_dev=0.022
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.041, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.019 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.043 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.009, 0.041, 0.074, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.041 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.033, 0.069, 0.106, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.069 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.040, 0.081, 0.122, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.081 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.034, 0.079, 0.124, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.079 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.187, 0.354, 0.521, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.354 std_dev=0.167
C2'	A	0, 0.204, 0.398, 0.592, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.398 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.282, 0.509, 0.736, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.509 std_dev=0.227
C4	B	0, 0.367, 0.614, 0.860, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.614 std_dev=0.247
O2'	A	0, 0.240, 0.488, 0.736, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.488 std_dev=0.248
N3	B	0, 0.317, 0.573, 0.829, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.573 std_dev=0.256
C3'	A	0, 0.322, 0.597, 0.871, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.597 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.302, 0.615, 0.928, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.615 std_dev=0.313
C2	B	0, 0.336, 0.654, 0.972, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.654 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.253, 0.582, 0.912, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.582 std_dev=0.329
N1	B	0, 0.288, 0.649, 1.010, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.649 std_dev=0.361
N9	B	0, 0.474, 0.839, 1.204, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.839 std_dev=0.365
O3'	A	0, 0.458, 0.837, 1.216, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.837 std_dev=0.379
O6	B	0, 0.253, 0.660, 1.067, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.660 std_dev=0.407
C5'	A	0, 0.504, 0.921, 1.338, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.921 std_dev=0.417
N7	B	0, 0.417, 0.838, 1.259, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.838 std_dev=0.421
O5'	A	0, 0.617, 1.042, 1.466, 1.905 max_d=1.905 avg_d=1.042 std_dev=0.424
C1'	B	0, 0.584, 1.022, 1.460, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.022 std_dev=0.438
C8	B	0, 0.533, 0.984, 1.435, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.984 std_dev=0.451
N2	B	0, 0.430, 0.883, 1.337, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.883 std_dev=0.454
O2'	B	0, 0.664, 1.182, 1.700, 3.019 max_d=3.019 avg_d=1.182 std_dev=0.518
P	A	0, 0.784, 1.373, 1.962, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.373 std_dev=0.589
C2'	B	0, 0.714, 1.308, 1.902, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.308 std_dev=0.594
OP2	A	0, 0.642, 1.239, 1.837, 2.348 max_d=2.348 avg_d=1.239 std_dev=0.597
O4'	B	0, 0.871, 1.530, 2.188, 3.081 max_d=3.081 avg_d=1.530 std_dev=0.659
OP1	A	0, 1.073, 1.859, 2.646, 2.846 max_d=2.846 avg_d=1.859 std_dev=0.787
C3'	B	0, 1.053, 1.904, 2.755, 3.589 max_d=3.589 avg_d=1.904 std_dev=0.851
C4'	B	0, 1.113, 1.985, 2.857, 3.759 max_d=3.759 avg_d=1.985 std_dev=0.872
OP2	B	0, 1.095, 2.071, 3.046, 3.576 max_d=3.576 avg_d=2.071 std_dev=0.975
O5'	B	0, 1.116, 2.131, 3.147, 3.794 max_d=3.794 avg_d=2.131 std_dev=1.016
O3'	B	0, 1.306, 2.379, 3.452, 4.250 max_d=4.250 avg_d=2.379 std_dev=1.073
C5'	B	0, 1.394, 2.486, 3.579, 4.268 max_d=4.268 avg_d=2.486 std_dev=1.093
P	B	0, 1.241, 2.432, 3.624, 4.215 max_d=4.215 avg_d=2.432 std_dev=1.191
OP1	B	0, 1.593, 3.149, 4.706, 5.423 max_d=5.423 avg_d=3.149 std_dev=1.557

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.16	0.11
C2	0.05	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.19	0.06	0.13	0.02	0.13	0.24	0.15
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.08	0.12	0.19	0.15	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.09	0.12	0.07
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.12	0.18	0.13	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.10	0.13	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.13	0.02	0.13	0.23	0.15
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.16	0.02	0.18	0.27	0.18
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.06	0.06	0.13	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.13	0.10	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.11	0.04	0.17	0.01	0.19	0.28	0.19
C8	0.02	0.02	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.06	0.16	0.04	0.17	0.24	0.18
N1	0.04	0.01	0.12	0.12	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.15	0.05	0.15	0.01	0.16	0.27	0.17
N2	0.06	0.01	0.19	0.18	0.02	0.07	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.21	0.24	0.08	0.13	0.02	0.12	0.23	0.14
N3	0.05	0.01	0.15	0.13	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.17	0.06	0.12	0.03	0.11	0.22	0.14
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.05	0.18	0.04	0.21	0.29	0.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.03	0.11	0.20	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.06	0.13	0.21	0.15	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.07	0.09	0.11	0.07
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.11	0.12	0.15	0.24	0.17	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.17	0.12	0.21	0.20	0.16
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.08	0.06	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.05	0.12	0.17	0.14
O5'	0.07	0.13	0.06	0.11	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.16	0.15	0.13	0.12	0.18	0.12	0.06	0.17	0.10	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.06	0.10	0.02	0.07	0.02	0.13	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.07	0.12	0.05	0.19	0.00	0.23	0.31	0.22
OP1	0.08	0.13	0.09	0.13	0.13	0.09	0.18	0.10	0.19	0.17	0.16	0.12	0.11	0.21	0.11	0.09	0.21	0.12	0.02	0.23	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.24	0.12	0.14	0.23	0.07	0.27	0.02	0.28	0.24	0.27	0.23	0.22	0.29	0.20	0.11	0.20	0.17	0.02	0.31	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.15	0.07	0.10	0.15	0.05	0.18	0.02	0.19	0.18	0.17	0.14	0.14	0.21	0.14	0.07	0.16	0.14	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.29	0.35	0.41	0.25	0.37	0.25	0.38	0.22	0.39	0.30	0.38	0.24	0.37	0.31	0.33	0.47	0.35	0.36	0.22	0.47	0.45	0.38
C2	0.31	0.21	0.28	0.32	0.18	0.37	0.17	0.38	0.26	0.34	0.28	0.24	0.16	0.25	0.28	0.27	0.32	0.39	0.30	0.38	0.37	0.38	0.31
C2'	0.42	0.40	0.50	0.53	0.39	0.45	0.39	0.43	0.36	0.47	0.39	0.46	0.38	0.46	0.42	0.48	0.60	0.43	0.42	0.35	0.48	0.49	0.41
C3'	0.43	0.41	0.49	0.52	0.39	0.45	0.39	0.43	0.36	0.47	0.40	0.47	0.39	0.46	0.43	0.48	0.58	0.44	0.41	0.36	0.47	0.47	0.40
C4	0.31	0.22	0.30	0.35	0.20	0.37	0.18	0.39	0.20	0.36	0.26	0.28	0.17	0.30	0.29	0.28	0.37	0.38	0.32	0.26	0.42	0.42	0.34
C4'	0.32	0.31	0.37	0.42	0.27	0.37	0.28	0.38	0.25	0.40	0.30	0.41	0.27	0.39	0.32	0.35	0.49	0.35	0.36	0.24	0.48	0.45	0.38
C5	0.31	0.20	0.28	0.33	0.18	0.37	0.16	0.40	0.21	0.34	0.26	0.26	0.16	0.26	0.28	0.28	0.34	0.40	0.33	0.28	0.41	0.41	0.35
C5'	0.31	0.30	0.34	0.39	0.25	0.36	0.26	0.38	0.23	0.39	0.29	0.40	0.25	0.37	0.31	0.32	0.45	0.36	0.35	0.22	0.48	0.45	0.37
C6	0.31	0.19	0.28	0.32	0.18	0.38	0.16	0.40	0.24	0.31	0.26	0.23	0.15	0.22	0.27	0.28	0.32	0.41	0.33	0.34	0.40	0.40	0.34
C8	0.31	0.24	0.31	0.36	0.21	0.37	0.19	0.39	0.19	0.36	0.26	0.31	0.19	0.31	0.30	0.29	0.39	0.38	0.33	0.22	0.45	0.43	0.36
N1	0.32	0.20	0.28	0.32	0.18	0.38	0.18	0.39	0.27	0.31	0.28	0.23	0.16	0.22	0.27	0.28	0.31	0.41	0.32	0.39	0.37	0.38	0.32
N2	0.31	0.22	0.27	0.31	0.18	0.36	0.19	0.37	0.31	0.33	0.30	0.24	0.17	0.23	0.27	0.27	0.30	0.39	0.28	0.45	0.34	0.36	0.30
N3	0.31	0.22	0.30	0.35	0.20	0.37	0.18	0.38	0.21	0.37	0.27	0.28	0.17	0.31	0.30	0.28	0.37	0.38	0.32	0.30	0.40	0.41	0.34
N7	0.31	0.21	0.29	0.34	0.19	0.38	0.17	0.40	0.19	0.35	0.25	0.28	0.17	0.27	0.29	0.28	0.35	0.40	0.33	0.25	0.43	0.42	0.36
N9	0.31	0.25	0.32	0.37	0.22	0.37	0.21	0.39	0.19	0.38	0.27	0.32	0.20	0.33	0.30	0.30	0.41	0.37	0.33	0.22	0.44	0.43	0.36
O2'	0.42	0.41	0.53	0.57	0.39	0.46	0.40	0.44	0.37	0.46	0.39	0.47	0.39	0.47	0.42	0.51	0.66	0.40	0.45	0.38	0.52	0.51	0.43
O3'	0.50	0.51	0.59	0.60	0.48	0.51	0.48	0.47	0.46	0.52	0.49	0.57	0.49	0.51	0.50	0.58	0.67	0.48	0.46	0.46	0.50	0.50	0.43
O4'	0.28	0.30	0.31	0.37	0.22	0.34	0.23	0.36	0.22	0.37	0.30	0.40	0.23	0.35	0.28	0.29	0.43	0.33	0.34	0.22	0.48	0.45	0.37
O5'	0.36	0.30	0.37	0.42	0.28	0.42	0.28	0.44	0.24	0.43	0.29	0.38	0.26	0.40	0.35	0.35	0.46	0.41	0.38	0.24	0.50	0.48	0.41
O6	0.32	0.19	0.29	0.33	0.18	0.40	0.17	0.42	0.25	0.30	0.26	0.22	0.16	0.21	0.27	0.29	0.33	0.42	0.36	0.36	0.42	0.41	0.37
OP1	0.34	0.26	0.35	0.40	0.27	0.40	0.27	0.43	0.22	0.42	0.26	0.35	0.24	0.39	0.34	0.33	0.43	0.41	0.38	0.22	0.49	0.47	0.40
OP2	0.43	0.37	0.42	0.47	0.36	0.48	0.35	0.50	0.34	0.47	0.38	0.43	0.35	0.43	0.42	0.40	0.50	0.49	0.45	0.34	0.53	0.51	0.46
P	0.36	0.30	0.36	0.41	0.28	0.42	0.29	0.44	0.25	0.42	0.30	0.38	0.26	0.39	0.35	0.33	0.45	0.42	0.40	0.26	0.51	0.47	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.07	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.04	0.12	0.13	0.08
C2	0.08	0.00	0.14	0.16	0.02	0.09	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.21	0.07	0.23	0.02	0.25	0.30	0.23
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.11	0.05	0.13	0.16	0.12	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.13	0.11	0.20	0.16	0.12
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.12	0.01	0.14	0.02	0.17	0.10	0.17	0.18	0.14	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.18	0.18	0.26	0.16	0.17
C4	0.03	0.02	0.08	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.27	0.02	0.28	0.28	0.25
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.12	0.08	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.10	0.16	0.03
C5	0.02	0.02	0.08	0.14	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.02	0.38	0.01	0.39	0.40	0.37
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.11	0.09	0.17	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.16	0.12	0.20	0.02
C6	0.04	0.01	0.11	0.17	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.11	0.23	0.03	0.39	0.01	0.42	0.45	0.39
C8	0.02	0.03	0.05	0.10	0.02	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.41	0.03	0.38	0.32	0.36
N1	0.07	0.01	0.13	0.17	0.02	0.08	0.02	0.11	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.15	0.23	0.05	0.31	0.02	0.34	0.39	0.31
N2	0.10	0.01	0.16	0.18	0.02	0.12	0.02	0.11	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.04	0.20	0.23	0.10	0.18	0.04	0.21	0.28	0.19
N3	0.07	0.01	0.12	0.14	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13	0.16	0.07	0.19	0.01	0.21	0.24	0.18
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.17	0.04	0.46	0.03	0.46	0.45	0.45
N9	0.00	0.03	0.04	0.08	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.09	0.01	0.26	0.03	0.25	0.21	0.21
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.07	0.06	0.08	0.06	0.11	0.04	0.15	0.20	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.11	0.14	0.14	0.06
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.14	0.02	0.18	0.04	0.23	0.11	0.23	0.23	0.16	0.17	0.09	0.04	0.00	0.01	0.16	0.25	0.31	0.22	0.20
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.10	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.03	0.08	0.20	0.11
O5'	0.11	0.23	0.13	0.18	0.27	0.02	0.38	0.01	0.39	0.41	0.31	0.18	0.19	0.46	0.26	0.04	0.16	0.09	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.11	0.18	0.02	0.09	0.01	0.16	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.11	0.25	0.03	0.45	0.00	0.50	0.54	0.47
OP1	0.12	0.25	0.20	0.26	0.28	0.10	0.39	0.12	0.42	0.38	0.34	0.21	0.21	0.46	0.25	0.14	0.31	0.08	0.02	0.50	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.30	0.16	0.16	0.28	0.16	0.40	0.20	0.45	0.32	0.39	0.28	0.24	0.45	0.21	0.14	0.22	0.20	0.02	0.54	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.23	0.12	0.17	0.25	0.03	0.37	0.02	0.39	0.36	0.31	0.19	0.18	0.45	0.21	0.06	0.20	0.11	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00