Doublet Group distance statistics: 52567

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 6, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.010, 0.032, 0.055, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.005, 0.029, 0.052, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.029 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.011, 0.035, 0.058, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.035 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.008, 0.036, 0.063, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.036 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.044 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.014, 0.050, 0.086, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.050 std_dev=0.036
N2	A	0, 0.001, 0.043, 0.086, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.043 std_dev=0.042
O4'	A	0, -0.022, 0.162, 0.345, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.162 std_dev=0.184
C3'	A	0, 0.003, 0.190, 0.377, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.190 std_dev=0.187
C2'	A	0, -0.038, 0.183, 0.405, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.183 std_dev=0.221
C4'	A	0, -0.045, 0.198, 0.442, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.198 std_dev=0.244
N3	B	0, 0.359, 0.619, 0.880, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.619 std_dev=0.260
C4	B	0, 0.312, 0.608, 0.904, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.608 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.295, 0.638, 0.981, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.638 std_dev=0.343
O3'	A	0, -0.100, 0.284, 0.667, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.284 std_dev=0.383
N9	B	0, 0.279, 0.678, 1.078, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.678 std_dev=0.399
C5	B	0, 0.212, 0.612, 1.011, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.612 std_dev=0.400
N2	B	0, 0.266, 0.720, 1.173, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.720 std_dev=0.453
O5'	A	0, 0.099, 0.556, 1.012, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.556 std_dev=0.457
N1	B	0, 0.174, 0.632, 1.090, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.632 std_dev=0.458
O2'	A	0, -0.138, 0.324, 0.786, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.324 std_dev=0.462
C5'	A	0, -0.094, 0.388, 0.870, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.388 std_dev=0.482
C6	B	0, 0.139, 0.624, 1.109, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.624 std_dev=0.485
C1'	B	0, 0.287, 0.785, 1.282, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.785 std_dev=0.497
N7	B	0, 0.147, 0.673, 1.200, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.673 std_dev=0.526
C8	B	0, 0.177, 0.705, 1.233, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.705 std_dev=0.528
C2'	B	0, 0.265, 0.795, 1.325, 2.191 max_d=2.191 avg_d=0.795 std_dev=0.530
P	A	0, -0.043, 0.536, 1.116, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.536 std_dev=0.579
O6	B	0, 0.045, 0.683, 1.322, 2.377 max_d=2.377 avg_d=0.683 std_dev=0.638
OP1	A	0, -0.021, 0.625, 1.270, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.625 std_dev=0.645
C3'	B	0, 0.153, 0.809, 1.464, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.809 std_dev=0.656
OP2	A	0, -0.113, 0.576, 1.266, 2.361 max_d=2.361 avg_d=0.576 std_dev=0.689
O4'	B	0, 0.188, 0.881, 1.574, 2.722 max_d=2.722 avg_d=0.881 std_dev=0.693
O2'	B	0, 0.238, 0.938, 1.639, 2.807 max_d=2.807 avg_d=0.938 std_dev=0.701
O3'	B	0, 0.104, 0.932, 1.760, 3.302 max_d=3.302 avg_d=0.932 std_dev=0.828
C4'	B	0, 0.062, 0.898, 1.734, 3.246 max_d=3.246 avg_d=0.898 std_dev=0.836
O5'	B	0, -0.056, 0.823, 1.703, 3.449 max_d=3.449 avg_d=0.823 std_dev=0.879
P	B	0, -0.094, 0.888, 1.870, 3.774 max_d=3.774 avg_d=0.888 std_dev=0.982
OP2	B	0, -0.001, 1.033, 2.068, 3.894 max_d=3.894 avg_d=1.033 std_dev=1.035
C5'	B	0, -0.126, 0.921, 1.969, 3.872 max_d=3.872 avg_d=0.921 std_dev=1.047
OP1	B	0, -0.071, 1.056, 2.183, 4.555 max_d=4.555 avg_d=1.056 std_dev=1.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.00	0.02	0.20	0.01	0.15	0.03	0.08	0.25	0.06
C2	0.05	0.00	0.10	0.04	0.01	0.13	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.28	0.17	0.22	0.01	0.15	0.27	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.13	0.07	0.10	0.08	0.13	0.10	0.08	0.04	0.00	0.04	0.03	0.22	0.08	0.27	0.29	0.21
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.04	0.14	0.23	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.22	0.08	0.25	0.01	0.11	0.21	0.09
C4'	0.02	0.13	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.18	0.12	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.22	0.08
C5	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.18	0.04	0.31	0.01	0.13	0.16	0.12
C5'	0.05	0.18	0.13	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.15	0.20	0.16	0.23	0.15	0.19	0.12	0.05	0.13	0.03	0.01	0.16	0.17	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.21	0.07	0.31	0.00	0.14	0.17	0.14
C8	0.01	0.01	0.10	0.07	0.00	0.07	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.11	0.09	0.37	0.02	0.16	0.10	0.16
N1	0.04	0.01	0.08	0.03	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.20	0.26	0.13	0.27	0.01	0.15	0.23	0.15
N2	0.07	0.00	0.13	0.05	0.01	0.18	0.01	0.23	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.28	0.30	0.21	0.20	0.03	0.18	0.31	0.21
N3	0.05	0.01	0.10	0.03	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.21	0.28	0.15	0.20	0.01	0.12	0.27	0.14
N7	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.12	0.05	0.37	0.02	0.15	0.10	0.18
N9	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.10	0.17	0.01	0.26	0.02	0.10	0.19	0.06
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.13	0.11	0.16	0.05	0.18	0.22	0.20	0.28	0.21	0.22	0.10	0.00	0.06	0.07	0.20	0.20	0.31	0.33	0.23
O3'	0.20	0.28	0.04	0.01	0.22	0.01	0.18	0.13	0.21	0.11	0.26	0.30	0.28	0.12	0.17	0.06	0.00	0.14	0.15	0.20	0.17	0.25	0.16
O4'	0.01	0.17	0.03	0.00	0.08	0.01	0.04	0.03	0.07	0.09	0.13	0.21	0.15	0.05	0.01	0.07	0.14	0.00	0.11	0.06	0.10	0.34	0.16
O5'	0.15	0.22	0.22	0.09	0.25	0.01	0.31	0.01	0.31	0.37	0.27	0.20	0.20	0.37	0.26	0.20	0.15	0.11	0.00	0.33	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.08	0.04	0.01	0.05	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.20	0.20	0.06	0.33	0.00	0.14	0.15	0.16
OP1	0.08	0.15	0.27	0.14	0.11	0.12	0.13	0.17	0.14	0.16	0.15	0.18	0.12	0.15	0.10	0.31	0.17	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.27	0.29	0.23	0.21	0.22	0.16	0.10	0.17	0.10	0.23	0.31	0.27	0.10	0.19	0.33	0.25	0.34	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.21	0.11	0.09	0.08	0.12	0.02	0.14	0.16	0.15	0.21	0.14	0.18	0.06	0.23	0.16	0.16	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.47	0.26	0.35	0.50	0.27	0.71	0.32	0.95	0.16	0.63	0.29	0.44	0.17	0.59	0.46	0.31	0.45	0.67	0.92	0.17	1.19	1.27	1.12
C2	0.41	0.31	0.37	0.55	0.15	0.72	0.14	0.97	0.35	0.46	0.43	0.39	0.15	0.30	0.33	0.36	0.55	0.61	0.92	0.54	1.22	1.24	1.14
C2'	0.49	0.34	0.39	0.52	0.34	0.70	0.38	0.93	0.29	0.63	0.35	0.48	0.28	0.59	0.48	0.36	0.47	0.67	0.90	0.30	1.13	1.18	1.05
C3'	0.39	0.22	0.27	0.41	0.24	0.60	0.33	0.84	0.17	0.59	0.19	0.43	0.12	0.58	0.40	0.21	0.34	0.57	0.82	0.23	1.09	1.21	1.03
C4	0.44	0.30	0.35	0.52	0.17	0.73	0.17	0.98	0.24	0.53	0.39	0.44	0.14	0.42	0.38	0.33	0.50	0.65	0.92	0.35	1.23	1.25	1.14
C4'	0.57	0.16	0.43	0.57	0.44	0.75	0.54	0.99	0.38	0.77	0.16	0.27	0.25	0.77	0.59	0.36	0.49	0.73	0.99	0.45	1.29	1.39	1.22
C5	0.43	0.31	0.36	0.54	0.16	0.75	0.14	1.01	0.27	0.49	0.40	0.43	0.14	0.35	0.35	0.35	0.53	0.65	0.93	0.40	1.26	1.22	1.15
C5'	0.62	0.23	0.50	0.64	0.51	0.81	0.62	1.05	0.48	0.82	0.26	0.21	0.34	0.83	0.65	0.42	0.56	0.78	1.06	0.56	1.39	1.49	1.30
C6	0.42	0.31	0.38	0.56	0.15	0.76	0.14	1.01	0.34	0.42	0.43	0.41	0.15	0.27	0.32	0.38	0.58	0.63	0.92	0.49	1.28	1.17	1.14
C8	0.45	0.29	0.35	0.51	0.20	0.74	0.20	1.00	0.18	0.56	0.35	0.45	0.14	0.46	0.40	0.32	0.48	0.67	0.93	0.24	1.24	1.24	1.14
N1	0.41	0.31	0.38	0.57	0.14	0.75	0.16	1.00	0.38	0.40	0.43	0.39	0.16	0.23	0.30	0.39	0.59	0.61	0.92	0.55	1.27	1.20	1.15
N2	0.40	0.29	0.39	0.56	0.14	0.70	0.16	0.93	0.40	0.42	0.42	0.34	0.15	0.24	0.31	0.38	0.57	0.57	0.90	0.61	1.17	1.24	1.11
N3	0.43	0.30	0.35	0.52	0.17	0.71	0.16	0.95	0.27	0.53	0.41	0.42	0.14	0.42	0.37	0.33	0.50	0.63	0.91	0.42	1.19	1.25	1.12
N7	0.44	0.30	0.35	0.53	0.17	0.75	0.16	1.02	0.23	0.51	0.38	0.45	0.14	0.39	0.37	0.34	0.51	0.66	0.93	0.33	1.26	1.21	1.14
N9	0.45	0.29	0.35	0.51	0.21	0.72	0.23	0.98	0.17	0.58	0.34	0.45	0.14	0.50	0.41	0.31	0.47	0.66	0.92	0.23	1.22	1.26	1.13
O2'	0.59	0.61	0.54	0.61	0.54	0.72	0.55	0.89	0.56	0.65	0.63	0.70	0.54	0.62	0.58	0.54	0.58	0.70	0.87	0.57	1.03	1.04	0.94
O3'	0.28	0.41	0.23	0.26	0.19	0.42	0.20	0.63	0.14	0.42	0.36	0.62	0.28	0.41	0.28	0.25	0.23	0.42	0.57	0.14	0.83	1.00	0.80
O4'	0.59	0.24	0.47	0.60	0.44	0.80	0.51	1.04	0.32	0.77	0.22	0.36	0.29	0.76	0.60	0.41	0.53	0.77	1.03	0.34	1.34	1.44	1.26
O5'	0.52	0.22	0.41	0.54	0.40	0.71	0.47	0.95	0.33	0.68	0.21	0.30	0.27	0.66	0.53	0.35	0.48	0.67	0.95	0.36	1.26	1.37	1.18
O6	0.41	0.32	0.38	0.57	0.15	0.76	0.16	1.02	0.36	0.38	0.43	0.40	0.16	0.23	0.30	0.40	0.60	0.62	0.90	0.51	1.28	1.10	1.11
OP1	0.54	0.24	0.44	0.59	0.43	0.76	0.51	1.02	0.38	0.72	0.23	0.31	0.29	0.71	0.56	0.37	0.53	0.71	1.02	0.43	1.41	1.47	1.29
OP2	0.69	0.20	0.61	0.77	0.51	0.94	0.57	1.19	0.39	0.84	0.20	0.15	0.34	0.80	0.68	0.54	0.73	0.87	1.16	0.41	1.53	1.54	1.41
P	0.60	0.18	0.50	0.66	0.46	0.83	0.54	1.07	0.39	0.77	0.20	0.19	0.29	0.76	0.61	0.43	0.60	0.77	1.07	0.43	1.44	1.49	1.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.02	0.24	0.20	0.11
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02	0.13	0.01	0.38	0.43	0.26
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08	0.12	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.06	0.37	0.24	0.18
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.09	0.07	0.12	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.40	0.23	0.18
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.15	0.01	0.34	0.39	0.24
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.19	0.15	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.20	0.01	0.37	0.48	0.29
C5'	0.04	0.08	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.18	0.11	0.08	0.07	0.19	0.10	0.04	0.02	0.02	0.01	0.18	0.12	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.20	0.01	0.40	0.53	0.32
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.02	0.22	0.02	0.29	0.36	0.24
N1	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.02	0.17	0.01	0.40	0.50	0.30
N2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.17	0.03	0.12	0.02	0.39	0.43	0.26
N3	0.03	0.00	0.10	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.02	0.12	0.01	0.35	0.38	0.23
N7	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.23	0.02	0.35	0.48	0.30
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.02	0.28	0.31	0.19
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.02	0.11	0.16	0.12	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.35	0.23	0.15
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.10	0.11	0.17	0.12	0.10	0.04	0.04	0.00	0.01	0.12	0.10	0.47	0.29	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.03	0.16	0.10	0.06
O5'	0.09	0.13	0.08	0.09	0.15	0.02	0.20	0.01	0.20	0.22	0.17	0.12	0.12	0.23	0.15	0.06	0.12	0.09	0.00	0.22	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.10	0.03	0.22	0.00	0.43	0.59	0.36
OP1	0.24	0.38	0.37	0.40	0.34	0.19	0.37	0.12	0.40	0.29	0.40	0.39	0.35	0.35	0.28	0.35	0.47	0.16	0.02	0.43	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.43	0.24	0.23	0.39	0.15	0.48	0.16	0.53	0.36	0.50	0.43	0.38	0.48	0.31	0.23	0.29	0.10	0.02	0.59	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.26	0.18	0.18	0.24	0.06	0.29	0.01	0.32	0.24	0.30	0.26	0.23	0.30	0.19	0.15	0.21	0.06	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00