Doublet Group distance statistics: 52568

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 1, 0, 2, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.002, 0.030, 0.059, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.030 std_dev=0.028
C2'	A	0, -0.025, 0.313, 0.651, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.313 std_dev=0.338
C5	B	0, 0.306, 0.654, 1.002, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.654 std_dev=0.348
O4'	A	0, -0.040, 0.310, 0.660, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.310 std_dev=0.350
C4	B	0, 0.271, 0.678, 1.085, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.678 std_dev=0.407
N7	B	0, 0.162, 0.586, 1.010, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.586 std_dev=0.424
C8	B	0, 0.244, 0.712, 1.180, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.712 std_dev=0.468
C6	B	0, 0.284, 0.757, 1.229, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.757 std_dev=0.472
N3	B	0, 0.285, 0.775, 1.265, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.775 std_dev=0.490
N9	B	0, 0.163, 0.671, 1.179, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.671 std_dev=0.508
O6	B	0, 0.240, 0.778, 1.317, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.778 std_dev=0.538
C1'	B	0, 0.240, 0.822, 1.404, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.822 std_dev=0.582
C2'	B	0, 0.315, 0.901, 1.488, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.901 std_dev=0.587
P	B	0, 0.440, 1.051, 1.663, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.051 std_dev=0.612
O2'	A	0, -0.039, 0.586, 1.211, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.586 std_dev=0.625
O4'	B	0, 0.360, 0.987, 1.613, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.987 std_dev=0.627
C3'	B	0, 0.354, 0.995, 1.637, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.995 std_dev=0.642
O2'	B	0, 0.382, 1.031, 1.681, 1.804 max_d=1.804 avg_d=1.031 std_dev=0.649
O5'	A	0, -0.046, 0.608, 1.262, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.608 std_dev=0.654
C2	B	0, 0.209, 0.866, 1.523, 2.248 max_d=2.248 avg_d=0.866 std_dev=0.657
C4'	A	0, -0.126, 0.542, 1.209, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.542 std_dev=0.668
N1	B	0, 0.179, 0.863, 1.548, 2.285 max_d=2.285 avg_d=0.863 std_dev=0.685
C4'	B	0, 0.421, 1.109, 1.796, 2.017 max_d=2.017 avg_d=1.109 std_dev=0.688
O5'	B	0, 0.557, 1.247, 1.937, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.247 std_dev=0.690
OP2	A	0, 0.103, 0.797, 1.490, 2.199 max_d=2.199 avg_d=0.797 std_dev=0.694
P	A	0, 0.056, 0.751, 1.445, 2.018 max_d=2.018 avg_d=0.751 std_dev=0.695
C5'	A	0, -0.061, 0.676, 1.414, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.676 std_dev=0.738
C5'	B	0, 0.495, 1.242, 1.990, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.242 std_dev=0.747
C3'	A	0, -0.144, 0.607, 1.358, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.607 std_dev=0.751
OP1	A	0, 0.098, 0.854, 1.610, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.854 std_dev=0.756
O3'	B	0, 0.365, 1.154, 1.943, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.154 std_dev=0.789
OP2	B	0, 0.639, 1.468, 2.296, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.468 std_dev=0.828
N2	B	0, 0.075, 0.981, 1.888, 2.974 max_d=2.974 avg_d=0.981 std_dev=0.906
OP1	B	0, 0.595, 1.541, 2.486, 2.944 max_d=2.944 avg_d=1.541 std_dev=0.945
O3'	A	0, -0.282, 0.967, 2.216, 3.179 max_d=3.179 avg_d=0.967 std_dev=1.249

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.32	0.00	0.15	0.03	0.15	0.41	0.22
C2	0.03	0.00	0.23	0.20	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.30	0.15	0.17	0.02	0.09	0.21	0.09
C2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.12	0.01	0.06	0.20	0.10	0.11	0.18	0.28	0.22	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.37	0.08	0.38	0.61	0.46
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.26	0.01	0.37	0.01	0.37	0.39	0.29	0.16	0.16	0.44	0.25	0.03	0.01	0.02	0.11	0.42	0.15	0.23	0.13
C4	0.02	0.01	0.12	0.26	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.13	0.08	0.19	0.02	0.09	0.24	0.09
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.11	0.25	0.04	0.11	0.07	0.24	0.11	0.31	0.02	0.00	0.01	0.15	0.14	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.37	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.34	0.09	0.04	0.31	0.02	0.14	0.16	0.13
C5'	0.06	0.05	0.20	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.17	0.26	0.09	0.08	0.06	0.28	0.10	0.10	0.20	0.01	0.00	0.22	0.16	0.08	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.37	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.35	0.08	0.07	0.32	0.01	0.17	0.16	0.16
C8	0.02	0.01	0.11	0.39	0.00	0.25	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.23	0.11	0.32	0.02	0.11	0.23	0.10
N1	0.03	0.00	0.18	0.29	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.14	0.12	0.25	0.02	0.13	0.17	0.11
N2	0.04	0.00	0.28	0.16	0.01	0.11	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.43	0.18	0.15	0.03	0.10	0.22	0.11
N3	0.03	0.00	0.22	0.16	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.35	0.15	0.14	0.02	0.10	0.27	0.12
N7	0.02	0.02	0.06	0.44	0.00	0.24	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.39	0.27	0.07	0.39	0.02	0.18	0.14	0.19
N9	0.01	0.01	0.02	0.25	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.06	0.02	0.17	0.02	0.09	0.31	0.11
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.23	0.31	0.34	0.10	0.35	0.34	0.27	0.14	0.14	0.39	0.22	0.00	0.03	0.24	0.25	0.40	0.24	0.65	0.36
O3'	0.32	0.30	0.03	0.01	0.13	0.02	0.09	0.20	0.08	0.23	0.14	0.43	0.35	0.27	0.06	0.03	0.00	0.22	0.29	0.16	0.57	0.44	0.39
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.12	0.18	0.15	0.07	0.02	0.24	0.22	0.00	0.09	0.05	0.06	0.33	0.15
O5'	0.15	0.17	0.37	0.11	0.19	0.01	0.31	0.00	0.32	0.32	0.25	0.15	0.14	0.39	0.17	0.25	0.29	0.09	0.00	0.38	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.42	0.02	0.15	0.02	0.22	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.40	0.16	0.05	0.38	0.00	0.23	0.20	0.23
OP1	0.15	0.09	0.38	0.15	0.09	0.14	0.14	0.16	0.17	0.11	0.13	0.10	0.10	0.18	0.09	0.24	0.57	0.06	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.21	0.61	0.23	0.24	0.17	0.16	0.08	0.16	0.23	0.17	0.22	0.27	0.14	0.31	0.65	0.44	0.33	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.09	0.46	0.13	0.09	0.05	0.13	0.01	0.16	0.10	0.11	0.11	0.12	0.19	0.11	0.36	0.39	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.19	0.14	0.13	0.19	0.18	0.19	0.27	0.20	0.19	0.20	0.20	0.18	0.20	0.19	0.18	0.16	0.23	0.31	0.21	0.96	1.06	0.20
C2	0.23	0.18	0.16	0.23	0.20	0.31	0.20	0.41	0.18	0.23	0.18	0.19	0.19	0.23	0.22	0.15	0.20	0.30	0.45	0.17	0.93	1.21	0.32
C2'	0.22	0.31	0.31	0.29	0.25	0.22	0.26	0.23	0.30	0.21	0.33	0.32	0.28	0.23	0.22	0.33	0.34	0.20	0.22	0.33	1.21	0.84	0.24
C3'	0.42	0.45	0.30	0.26	0.40	0.38	0.34	0.42	0.33	0.33	0.40	0.51	0.44	0.30	0.39	0.33	0.19	0.44	0.44	0.26	0.93	1.08	0.26
C4	0.19	0.19	0.11	0.14	0.18	0.23	0.19	0.33	0.19	0.19	0.20	0.20	0.18	0.20	0.19	0.12	0.13	0.25	0.36	0.21	0.96	1.16	0.27
C4'	0.47	0.56	0.35	0.33	0.49	0.43	0.46	0.48	0.49	0.42	0.56	0.61	0.53	0.42	0.47	0.37	0.25	0.50	0.51	0.47	0.76	1.24	0.34
C5	0.19	0.21	0.11	0.15	0.19	0.24	0.19	0.34	0.21	0.19	0.21	0.22	0.19	0.20	0.19	0.12	0.12	0.25	0.37	0.22	0.94	1.22	0.29
C5'	0.45	0.59	0.34	0.30	0.49	0.40	0.46	0.43	0.50	0.39	0.58	0.66	0.54	0.40	0.45	0.36	0.24	0.46	0.47	0.48	0.79	1.22	0.29
C6	0.21	0.21	0.13	0.18	0.20	0.28	0.20	0.39	0.21	0.21	0.22	0.23	0.20	0.21	0.20	0.13	0.15	0.28	0.41	0.22	0.90	1.27	0.34
C8	0.17	0.20	0.13	0.13	0.18	0.19	0.19	0.28	0.20	0.17	0.21	0.22	0.18	0.19	0.17	0.15	0.15	0.22	0.31	0.22	0.97	1.16	0.24
N1	0.23	0.20	0.17	0.23	0.20	0.32	0.20	0.42	0.20	0.23	0.20	0.21	0.20	0.22	0.22	0.16	0.21	0.30	0.46	0.20	0.90	1.27	0.36
N2	0.27	0.17	0.22	0.30	0.21	0.36	0.20	0.46	0.15	0.27	0.15	0.17	0.19	0.25	0.25	0.21	0.29	0.33	0.51	0.13	0.92	1.21	0.36
N3	0.20	0.18	0.13	0.17	0.19	0.26	0.19	0.35	0.18	0.21	0.18	0.18	0.18	0.21	0.20	0.12	0.15	0.27	0.39	0.18	0.96	1.14	0.27
N7	0.18	0.21	0.12	0.13	0.19	0.21	0.19	0.31	0.21	0.18	0.22	0.23	0.19	0.19	0.18	0.13	0.12	0.24	0.34	0.23	0.95	1.21	0.28
N9	0.17	0.19	0.13	0.13	0.18	0.19	0.18	0.28	0.19	0.18	0.20	0.20	0.17	0.19	0.18	0.15	0.14	0.23	0.32	0.21	0.97	1.12	0.23
O2'	0.27	0.61	0.42	0.35	0.37	0.24	0.33	0.26	0.45	0.21	0.62	0.73	0.49	0.22	0.27	0.47	0.43	0.22	0.28	0.45	1.02	0.95	0.22
O3'	1.13	1.09	1.02	0.98	1.07	1.08	0.99	1.10	0.94	1.00	1.02	1.12	1.11	0.94	1.08	1.06	0.92	1.14	1.11	0.82	0.36	1.65	0.84
O4'	0.37	0.46	0.26	0.23	0.41	0.34	0.42	0.40	0.47	0.37	0.49	0.49	0.42	0.39	0.38	0.28	0.17	0.41	0.46	0.49	0.76	1.25	0.31
O5'	0.36	0.50	0.26	0.22	0.39	0.30	0.37	0.34	0.41	0.30	0.49	0.57	0.44	0.31	0.35	0.29	0.18	0.36	0.37	0.40	0.93	1.14	0.25
O6	0.21	0.23	0.14	0.19	0.21	0.29	0.21	0.40	0.22	0.21	0.24	0.25	0.21	0.21	0.21	0.14	0.16	0.28	0.42	0.23	0.85	1.31	0.36
OP1	0.38	0.51	0.29	0.24	0.42	0.32	0.39	0.36	0.44	0.33	0.51	0.58	0.46	0.34	0.38	0.32	0.19	0.39	0.40	0.43	0.87	1.19	0.25
OP2	0.47	0.61	0.36	0.33	0.52	0.43	0.50	0.47	0.56	0.43	0.62	0.68	0.56	0.45	0.48	0.37	0.27	0.49	0.48	0.55	0.82	1.28	0.32
P	0.40	0.57	0.28	0.23	0.45	0.34	0.43	0.38	0.49	0.35	0.57	0.64	0.51	0.36	0.40	0.31	0.17	0.41	0.40	0.49	0.84	1.22	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.03	0.51	0.10	0.11
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.21	0.03	0.22	0.02	0.73	0.59	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.11	0.17	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.25	0.19	0.05
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.01	0.12	0.08	0.15	0.20	0.16	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.17	0.22	0.08
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.20	0.02	0.76	0.50	0.11
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.09	0.23	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03	0.23	0.02	0.87	0.69	0.11
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.14	0.11	0.12	0.10	0.09	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.00	0.17	0.19	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.03	0.26	0.01	0.88	0.80	0.12
C8	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.05	0.18	0.04	0.86	0.49	0.11
N1	0.03	0.00	0.11	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.18	0.02	0.25	0.01	0.82	0.73	0.12
N2	0.05	0.01	0.17	0.20	0.02	0.09	0.02	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.26	0.05	0.21	0.02	0.69	0.56	0.13
N3	0.04	0.00	0.14	0.16	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.03	0.19	0.01	0.69	0.46	0.12
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.22	0.04	0.94	0.70	0.10
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.15	0.03	0.72	0.35	0.12
O2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.09	0.15	0.11	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.05	0.16	0.12	0.06
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.11	0.02	0.09	0.02	0.13	0.08	0.18	0.26	0.19	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.22	0.13	0.44	0.30	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.15	0.05	0.49	0.17	0.16
O5'	0.09	0.22	0.07	0.15	0.20	0.01	0.23	0.00	0.26	0.18	0.25	0.21	0.19	0.22	0.15	0.03	0.22	0.15	0.00	0.28	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.06	0.12	0.02	0.10	0.02	0.17	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.13	0.05	0.28	0.00	0.92	0.91	0.12
OP1	0.51	0.73	0.25	0.17	0.76	0.09	0.87	0.19	0.88	0.86	0.82	0.69	0.69	0.94	0.72	0.16	0.44	0.49	0.02	0.92	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.59	0.19	0.22	0.50	0.23	0.69	0.40	0.80	0.49	0.73	0.56	0.46	0.70	0.35	0.12	0.30	0.17	0.02	0.91	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.05	0.08	0.11	0.04	0.11	0.01	0.12	0.11	0.12	0.13	0.12	0.10	0.12	0.06	0.17	0.16	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00