Doublet Group distance statistics: 52571

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.037 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.011, 0.038, 0.066, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.038 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.011, 0.040, 0.068, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.040 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.009, 0.042, 0.075, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.042 std_dev=0.033
C2	A	0, -0.004, 0.029, 0.063, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.029 std_dev=0.033
C1'	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.016, 0.055, 0.094, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.055 std_dev=0.039
N2	A	0, 0.005, 0.063, 0.121, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.063 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.026, 0.197, 0.367, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.197 std_dev=0.171
C5	B	0, 0.028, 0.201, 0.373, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.201 std_dev=0.172
C2	B	0, 0.075, 0.266, 0.458, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.266 std_dev=0.191
O2'	A	0, 0.079, 0.283, 0.487, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.283 std_dev=0.204
N7	B	0, -0.013, 0.203, 0.419, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.203 std_dev=0.216
C8	B	0, 0.057, 0.284, 0.510, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.284 std_dev=0.227
C4	B	0, 0.090, 0.343, 0.595, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.343 std_dev=0.253
N2	B	0, 0.107, 0.365, 0.623, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.365 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.025, 0.292, 0.560, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.292 std_dev=0.267
O4'	A	0, -0.058, 0.211, 0.481, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.211 std_dev=0.270
C3'	A	0, 0.056, 0.358, 0.661, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.358 std_dev=0.303
C4'	A	0, 0.033, 0.348, 0.663, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.348 std_dev=0.315
O3'	A	0, 0.111, 0.463, 0.816, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.463 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.118, 0.492, 0.867, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.492 std_dev=0.374
N9	B	0, 0.071, 0.471, 0.871, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.471 std_dev=0.400
C6	B	0, -0.071, 0.374, 0.818, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.374 std_dev=0.444
C5'	A	0, 0.005, 0.630, 1.254, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.630 std_dev=0.625
OP2	A	0, 0.050, 0.713, 1.377, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.713 std_dev=0.663
P	A	0, -0.051, 0.621, 1.293, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.621 std_dev=0.672
O5'	A	0, -0.029, 0.645, 1.319, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.645 std_dev=0.674
C1'	B	0, -0.014, 0.756, 1.526, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.756 std_dev=0.770
O6	B	0, -0.103, 0.686, 1.475, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.686 std_dev=0.789
OP1	A	0, -0.211, 0.651, 1.513, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.651 std_dev=0.862
O2'	B	0, -0.110, 0.907, 1.924, 2.328 max_d=2.328 avg_d=0.907 std_dev=1.017
C2'	B	0, -0.111, 0.999, 2.109, 2.547 max_d=2.547 avg_d=0.999 std_dev=1.110
OP2	B	0, -0.137, 1.017, 2.171, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.017 std_dev=1.154
O4'	B	0, -0.240, 1.087, 2.413, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.087 std_dev=1.326
O5'	B	0, -0.336, 1.103, 2.542, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.103 std_dev=1.439
P	B	0, -0.298, 1.183, 2.665, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.183 std_dev=1.482
C3'	B	0, -0.344, 1.410, 3.164, 3.882 max_d=3.882 avg_d=1.410 std_dev=1.754
C4'	B	0, -0.448, 1.442, 3.333, 4.113 max_d=4.113 avg_d=1.442 std_dev=1.890
OP1	B	0, -0.389, 1.514, 3.417, 4.197 max_d=4.197 avg_d=1.514 std_dev=1.903
C5'	B	0, -0.628, 1.671, 3.970, 4.922 max_d=4.922 avg_d=1.671 std_dev=2.299
O3'	B	0, -0.539, 1.907, 4.353, 5.360 max_d=5.360 avg_d=1.907 std_dev=2.446

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.09	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.01	0.11	0.47	0.08
C2	0.07	0.00	0.09	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.13	0.09	0.43	0.01	0.18	0.25	0.15
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.08	0.05	0.10	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.02	0.17	0.41	0.04
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.16	0.08	0.13	0.10	0.12	0.04	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.21	0.37	0.03
C4	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.46	0.01	0.19	0.27	0.14
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.02	0.01	0.00	0.07	0.04	0.04	0.07	0.01	0.03	0.03	0.13	0.47	0.10
C5	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.56	0.01	0.22	0.15	0.21
C5'	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.01	0.06	0.00	0.05	0.14	0.03	0.02	0.01	0.12	0.06	0.02	0.14	0.01	0.02	0.05	0.18	0.39	0.03
C6	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.02	0.55	0.00	0.20	0.12	0.21
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.09	0.00	0.14	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.04	0.60	0.03	0.25	0.21	0.20
N1	0.05	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.08	0.06	0.50	0.01	0.19	0.18	0.19
N2	0.09	0.00	0.10	0.13	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.12	0.18	0.13	0.40	0.02	0.18	0.27	0.14
N3	0.07	0.00	0.10	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.13	0.09	0.39	0.02	0.18	0.31	0.12
N7	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.03	0.63	0.03	0.25	0.08	0.26
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.44	0.01	0.19	0.32	0.12
O2'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.12	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.05	0.17	0.43	0.05
O3'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.14	0.03	0.17	0.08	0.18	0.13	0.14	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.19	0.35	0.03
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.13	0.09	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.58	0.18
O5'	0.19	0.43	0.19	0.18	0.46	0.03	0.56	0.02	0.55	0.60	0.50	0.40	0.39	0.63	0.44	0.07	0.02	0.03	0.00	0.58	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.58	0.00	0.19	0.06	0.24
OP1	0.11	0.18	0.17	0.21	0.19	0.13	0.22	0.18	0.20	0.25	0.19	0.18	0.18	0.25	0.19	0.17	0.19	0.04	0.02	0.19	0.00	0.03	0.02
OP2	0.47	0.25	0.41	0.37	0.27	0.47	0.15	0.39	0.12	0.21	0.18	0.27	0.31	0.08	0.32	0.43	0.35	0.58	0.02	0.06	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.04	0.03	0.14	0.10	0.21	0.03	0.21	0.20	0.19	0.14	0.12	0.26	0.12	0.05	0.03	0.18	0.00	0.24	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.10	0.35	0.59	0.07	0.19	0.06	0.28	0.10	0.04	0.11	0.10	0.09	0.02	0.05	0.18	0.83	0.17	0.24	0.14	0.11	0.23	0.04
C2	0.13	0.06	0.12	0.36	0.08	0.11	0.07	0.23	0.03	0.12	0.04	0.07	0.07	0.10	0.11	0.05	0.55	0.19	0.29	0.01	0.11	0.20	0.04
C2'	0.26	0.17	0.12	0.30	0.18	0.13	0.12	0.05	0.05	0.20	0.09	0.21	0.21	0.14	0.22	0.10	0.51	0.44	0.48	0.08	0.16	0.04	0.26
C3'	0.41	0.29	0.09	0.15	0.31	0.34	0.21	0.27	0.12	0.31	0.18	0.35	0.35	0.22	0.35	0.24	0.34	0.64	0.65	0.07	0.34	0.13	0.44
C4	0.14	0.07	0.15	0.36	0.07	0.06	0.04	0.16	0.02	0.12	0.04	0.09	0.08	0.07	0.11	0.05	0.57	0.26	0.35	0.06	0.04	0.10	0.13
C4'	0.23	0.14	0.20	0.41	0.15	0.08	0.09	0.03	0.02	0.17	0.05	0.18	0.17	0.11	0.19	0.06	0.65	0.42	0.45	0.09	0.13	0.06	0.25
C5	0.20	0.07	0.06	0.22	0.09	0.06	0.05	0.05	0.02	0.14	0.03	0.09	0.10	0.08	0.15	0.09	0.41	0.31	0.43	0.07	0.06	0.04	0.22
C5'	0.34	0.22	0.11	0.29	0.23	0.21	0.15	0.13	0.07	0.24	0.12	0.27	0.27	0.16	0.28	0.13	0.54	0.56	0.57	0.07	0.24	0.08	0.37
C6	0.21	0.07	0.08	0.14	0.10	0.08	0.06	0.04	0.01	0.15	0.03	0.09	0.10	0.08	0.15	0.13	0.30	0.30	0.44	0.06	0.06	0.07	0.22
C8	0.17	0.07	0.12	0.31	0.08	0.04	0.04	0.06	0.05	0.13	0.05	0.09	0.09	0.07	0.13	0.06	0.53	0.32	0.43	0.11	0.08	0.03	0.23
N1	0.18	0.06	0.06	0.20	0.09	0.03	0.06	0.13	0.02	0.14	0.03	0.07	0.08	0.09	0.14	0.10	0.36	0.24	0.37	0.02	0.05	0.07	0.13
N2	0.09	0.05	0.16	0.43	0.06	0.19	0.08	0.34	0.07	0.11	0.05	0.06	0.05	0.13	0.09	0.05	0.61	0.12	0.20	0.09	0.18	0.32	0.08
N3	0.11	0.06	0.19	0.44	0.07	0.12	0.05	0.24	0.02	0.11	0.04	0.08	0.07	0.08	0.10	0.06	0.65	0.20	0.28	0.02	0.10	0.21	0.05
N7	0.21	0.07	0.06	0.20	0.09	0.09	0.05	0.02	0.03	0.15	0.04	0.09	0.10	0.08	0.15	0.10	0.40	0.35	0.48	0.10	0.11	0.10	0.28
N9	0.13	0.07	0.20	0.41	0.07	0.07	0.03	0.16	0.04	0.10	0.05	0.09	0.08	0.06	0.10	0.07	0.64	0.26	0.35	0.09	0.03	0.10	0.14
O2'	0.16	0.11	0.22	0.43	0.12	0.02	0.10	0.09	0.07	0.16	0.06	0.15	0.14	0.14	0.16	0.01	0.66	0.34	0.38	0.11	0.08	0.14	0.16
O3'	0.49	0.39	0.13	0.06	0.38	0.46	0.26	0.40	0.18	0.35	0.25	0.46	0.44	0.25	0.42	0.33	0.21	0.74	0.73	0.11	0.44	0.17	0.52
O4'	0.05	0.11	0.39	0.63	0.08	0.20	0.08	0.29	0.12	0.04	0.13	0.11	0.10	0.03	0.05	0.22	0.91	0.18	0.24	0.16	0.11	0.22	0.05
O5'	0.13	0.11	0.48	0.73	0.18	0.30	0.24	0.42	0.25	0.23	0.17	0.07	0.13	0.27	0.17	0.29	0.98	0.06	0.03	0.33	0.37	0.48	0.20
O6	0.24	0.07	0.15	0.06	0.10	0.15	0.05	0.07	0.01	0.15	0.03	0.09	0.11	0.08	0.17	0.18	0.16	0.32	0.50	0.06	0.12	0.19	0.30
OP1	0.16	0.08	0.24	0.43	0.07	0.07	0.07	0.02	0.14	0.05	0.09	0.12	0.11	0.05	0.09	0.08	0.67	0.39	0.42	0.25	0.09	0.04	0.24
OP2	0.56	0.49	0.25	0.04	0.46	0.43	0.39	0.33	0.35	0.44	0.41	0.55	0.51	0.38	0.49	0.41	0.20	0.74	0.75	0.28	0.34	0.28	0.53
P	0.16	0.09	0.20	0.43	0.07	0.00	0.02	0.10	0.05	0.06	0.02	0.16	0.12	0.03	0.10	0.03	0.68	0.34	0.36	0.14	0.03	0.11	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.13	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.28	0.06
C2	0.09	0.00	0.46	0.56	0.02	0.21	0.01	0.27	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.64	0.03	0.03	0.00	0.11	0.46	0.17
C2'	0.00	0.46	0.00	0.01	0.26	0.02	0.19	0.01	0.27	0.06	0.38	0.54	0.43	0.07	0.06	0.00	0.00	0.02	0.25	0.24	0.31	0.12	0.13
C3'	0.02	0.56	0.01	0.00	0.39	0.00	0.38	0.01	0.46	0.12	0.54	0.62	0.50	0.24	0.19	0.03	0.01	0.00	0.36	0.44	0.43	0.11	0.23
C4	0.03	0.02	0.26	0.39	0.00	0.16	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.41	0.02	0.06	0.00	0.09	0.43	0.15
C4'	0.01	0.21	0.02	0.00	0.16	0.00	0.17	0.00	0.19	0.13	0.21	0.24	0.19	0.16	0.11	0.11	0.04	0.00	0.01	0.19	0.15	0.32	0.03
C5	0.01	0.01	0.19	0.38	0.01	0.17	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.44	0.03	0.10	0.01	0.12	0.41	0.15
C5'	0.02	0.27	0.01	0.01	0.23	0.00	0.27	0.00	0.29	0.23	0.28	0.28	0.24	0.28	0.17	0.10	0.04	0.01	0.01	0.29	0.17	0.37	0.01
C6	0.02	0.00	0.27	0.46	0.00	0.19	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.56	0.05	0.10	0.00	0.12	0.41	0.14
C8	0.02	0.03	0.06	0.12	0.02	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.07	0.14	0.04	0.11	0.03	0.10	0.39	0.16
N1	0.06	0.01	0.38	0.54	0.01	0.21	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.65	0.05	0.07	0.00	0.11	0.43	0.15
N2	0.13	0.00	0.54	0.62	0.03	0.24	0.01	0.28	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.28	0.73	0.04	0.06	0.02	0.12	0.47	0.19
N3	0.09	0.01	0.43	0.50	0.01	0.19	0.01	0.24	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.16	0.53	0.02	0.03	0.00	0.09	0.45	0.17
N7	0.01	0.01	0.07	0.24	0.02	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.30	0.01	0.12	0.03	0.14	0.40	0.16
N9	0.00	0.04	0.06	0.19	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04	0.00	0.00	0.03	0.18	0.01	0.08	0.01	0.05	0.38	0.13
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.04	0.11	0.03	0.10	0.06	0.07	0.12	0.28	0.16	0.06	0.03	0.00	0.04	0.12	0.01	0.06	0.13	0.25	0.06
O3'	0.02	0.64	0.00	0.01	0.41	0.04	0.44	0.04	0.56	0.14	0.65	0.73	0.53	0.30	0.18	0.04	0.00	0.03	0.32	0.57	0.51	0.11	0.26
O4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.00	0.09	0.06	0.05	0.36	0.15
O5'	0.08	0.03	0.25	0.36	0.06	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.07	0.06	0.03	0.12	0.08	0.01	0.32	0.09	0.00	0.14	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.24	0.44	0.00	0.19	0.01	0.29	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.57	0.06	0.14	0.00	0.13	0.37	0.12
OP1	0.10	0.11	0.31	0.43	0.09	0.15	0.12	0.17	0.12	0.10	0.11	0.12	0.09	0.14	0.05	0.13	0.51	0.05	0.02	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.46	0.12	0.11	0.43	0.32	0.41	0.37	0.41	0.39	0.43	0.47	0.45	0.40	0.38	0.25	0.11	0.36	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.13	0.23	0.15	0.03	0.15	0.01	0.14	0.16	0.15	0.19	0.17	0.16	0.13	0.06	0.26	0.15	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00