Doublet Group distance statistics: 52573

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 17, 14, 12, 8, 4, 4, 3, 1, 4, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.033 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.039 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.028, 0.057, 0.086, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.057 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.032, 0.066, 0.099, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.066 std_dev=0.033
O2'	A	0, 0.078, 0.177, 0.277, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.177 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.029, 0.130, 0.230, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.130 std_dev=0.101
O4'	A	0, -0.025, 0.092, 0.209, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.092 std_dev=0.117
C4	B	0, 0.090, 0.272, 0.454, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.272 std_dev=0.182
C5	B	0, 0.118, 0.306, 0.493, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.306 std_dev=0.187
C4'	A	0, -0.022, 0.166, 0.354, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.166 std_dev=0.188
C3'	A	0, -0.014, 0.181, 0.376, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.181 std_dev=0.195
N3	B	0, 0.133, 0.347, 0.561, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.347 std_dev=0.214
O4	B	0, 0.073, 0.323, 0.572, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.323 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.151, 0.402, 0.652, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.402 std_dev=0.251
C6	B	0, 0.094, 0.381, 0.667, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.381 std_dev=0.287
C5'	A	0, -0.044, 0.243, 0.531, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.243 std_dev=0.287
O3'	A	0, -0.035, 0.269, 0.572, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.269 std_dev=0.304
N1	B	0, 0.096, 0.400, 0.705, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.400 std_dev=0.304
O2	B	0, 0.207, 0.514, 0.821, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.514 std_dev=0.307
OP2	A	0, 0.035, 0.458, 0.880, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.458 std_dev=0.423
C2'	B	0, 0.082, 0.506, 0.930, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.506 std_dev=0.424
O5'	A	0, -0.089, 0.335, 0.760, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.335 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.077, 0.505, 0.933, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.505 std_dev=0.428
O2'	B	0, 0.123, 0.560, 0.997, 2.330 max_d=2.330 avg_d=0.560 std_dev=0.437
P	A	0, -0.048, 0.407, 0.861, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.407 std_dev=0.454
OP1	A	0, -0.024, 0.510, 1.044, 2.916 max_d=2.916 avg_d=0.510 std_dev=0.534
C3'	B	0, -0.003, 0.649, 1.301, 2.162 max_d=2.162 avg_d=0.649 std_dev=0.652
O4'	B	0, -0.018, 0.640, 1.297, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.640 std_dev=0.657
C4'	B	0, -0.041, 0.731, 1.504, 2.628 max_d=2.628 avg_d=0.731 std_dev=0.773
O3'	B	0, -0.024, 0.776, 1.576, 2.661 max_d=2.661 avg_d=0.776 std_dev=0.800
O5'	B	0, -0.093, 0.774, 1.642, 2.827 max_d=2.827 avg_d=0.774 std_dev=0.868
C5'	B	0, -0.140, 0.866, 1.872, 3.218 max_d=3.218 avg_d=0.866 std_dev=1.006
OP2	B	0, -0.184, 0.893, 1.970, 3.933 max_d=3.933 avg_d=0.893 std_dev=1.077
P	B	0, -0.207, 0.927, 2.061, 3.765 max_d=3.765 avg_d=0.927 std_dev=1.134
OP1	B	0, -0.269, 1.121, 2.511, 4.615 max_d=4.615 avg_d=1.121 std_dev=1.390

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.08	0.19	0.06
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.04	0.19	0.01	0.14	0.16	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.12	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.16	0.13	0.07
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.10	0.06	0.12	0.14	0.11	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.11	0.22	0.10	0.11
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.20	0.01	0.13	0.16	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.25	0.01	0.16	0.16	0.16
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.10	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.25	0.01	0.17	0.18	0.17
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.25	0.01	0.14	0.15	0.14
N1	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.23	0.01	0.16	0.17	0.15
N2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.05	0.18	0.01	0.14	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.04	0.17	0.01	0.12	0.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.27	0.01	0.17	0.17	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.19	0.01	0.12	0.16	0.10
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.07	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.05	0.13	0.15	0.05
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.13	0.07	0.15	0.17	0.12	0.09	0.05	0.04	0.00	0.01	0.14	0.14	0.28	0.12	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.06	0.25	0.11
O5'	0.10	0.19	0.13	0.17	0.20	0.01	0.25	0.01	0.25	0.25	0.23	0.18	0.17	0.27	0.19	0.06	0.14	0.05	0.00	0.27	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.27	0.00	0.19	0.19	0.19
OP1	0.08	0.14	0.16	0.22	0.13	0.08	0.16	0.10	0.17	0.14	0.16	0.14	0.12	0.17	0.12	0.13	0.28	0.06	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.16	0.13	0.10	0.16	0.19	0.16	0.19	0.18	0.15	0.17	0.16	0.16	0.17	0.16	0.15	0.12	0.25	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.07	0.11	0.12	0.04	0.16	0.01	0.17	0.14	0.15	0.11	0.10	0.18	0.10	0.05	0.14	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.20	0.11	0.16	0.14	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.21	0.26	0.12	0.23	0.16	0.11	0.23	0.24	0.38	0.23
C2	0.09	0.10	0.11	0.14	0.10	0.13	0.10	0.14	0.11	0.09	0.13	0.12	0.10	0.17	0.14	0.12	0.23	0.22	0.39	0.24
C2'	0.24	0.29	0.15	0.12	0.20	0.16	0.15	0.14	0.17	0.23	0.28	0.35	0.19	0.14	0.18	0.24	0.17	0.18	0.34	0.22
C3'	0.26	0.31	0.16	0.12	0.21	0.17	0.16	0.16	0.18	0.25	0.29	0.38	0.20	0.15	0.18	0.27	0.17	0.18	0.35	0.22
C4	0.09	0.13	0.10	0.15	0.11	0.12	0.10	0.14	0.11	0.09	0.15	0.17	0.10	0.19	0.13	0.10	0.24	0.24	0.39	0.25
C4'	0.17	0.25	0.12	0.17	0.16	0.10	0.12	0.10	0.12	0.17	0.25	0.33	0.14	0.25	0.16	0.16	0.21	0.23	0.37	0.22
C5	0.09	0.11	0.11	0.16	0.10	0.14	0.11	0.16	0.11	0.09	0.14	0.15	0.10	0.19	0.13	0.12	0.25	0.26	0.41	0.27
C5'	0.16	0.24	0.13	0.19	0.16	0.11	0.11	0.12	0.11	0.16	0.25	0.32	0.14	0.28	0.16	0.14	0.23	0.25	0.38	0.23
C6	0.11	0.10	0.12	0.17	0.10	0.16	0.11	0.17	0.12	0.10	0.12	0.12	0.12	0.19	0.13	0.14	0.26	0.27	0.42	0.28
C8	0.09	0.15	0.10	0.16	0.11	0.13	0.11	0.15	0.11	0.09	0.17	0.19	0.10	0.22	0.13	0.10	0.25	0.26	0.40	0.26
N1	0.11	0.10	0.13	0.16	0.10	0.16	0.11	0.16	0.13	0.10	0.12	0.12	0.12	0.18	0.14	0.14	0.25	0.25	0.41	0.26
N2	0.10	0.10	0.11	0.14	0.11	0.13	0.10	0.13	0.11	0.09	0.12	0.11	0.11	0.16	0.16	0.12	0.22	0.21	0.37	0.23
N3	0.09	0.13	0.10	0.14	0.11	0.12	0.10	0.13	0.11	0.09	0.15	0.16	0.09	0.18	0.14	0.10	0.23	0.22	0.37	0.23
N7	0.09	0.12	0.11	0.16	0.10	0.14	0.11	0.17	0.11	0.09	0.14	0.16	0.10	0.20	0.13	0.11	0.26	0.27	0.41	0.27
N9	0.10	0.16	0.10	0.16	0.12	0.12	0.11	0.14	0.10	0.10	0.18	0.20	0.10	0.21	0.14	0.10	0.24	0.25	0.39	0.24
O2'	0.24	0.29	0.15	0.14	0.19	0.16	0.16	0.14	0.17	0.23	0.27	0.35	0.19	0.18	0.18	0.25	0.19	0.19	0.34	0.22
O3'	0.32	0.35	0.20	0.16	0.23	0.25	0.20	0.25	0.24	0.30	0.32	0.43	0.25	0.16	0.19	0.36	0.22	0.24	0.37	0.29
O4'	0.13	0.20	0.15	0.23	0.15	0.16	0.13	0.20	0.12	0.13	0.22	0.27	0.15	0.32	0.16	0.12	0.30	0.34	0.43	0.30
O5'	0.16	0.22	0.12	0.18	0.17	0.14	0.17	0.17	0.16	0.16	0.23	0.29	0.12	0.26	0.17	0.17	0.33	0.37	0.52	0.37
O6	0.12	0.11	0.14	0.18	0.11	0.18	0.11	0.19	0.13	0.11	0.12	0.12	0.13	0.20	0.14	0.16	0.27	0.29	0.43	0.29
OP1	0.20	0.28	0.13	0.17	0.19	0.13	0.16	0.15	0.16	0.20	0.27	0.35	0.15	0.25	0.19	0.21	0.31	0.34	0.48	0.33
OP2	0.17	0.23	0.20	0.24	0.18	0.18	0.16	0.20	0.16	0.17	0.24	0.29	0.20	0.30	0.19	0.15	0.30	0.33	0.45	0.31
P	0.11	0.20	0.14	0.22	0.13	0.14	0.12	0.17	0.11	0.12	0.20	0.27	0.14	0.31	0.14	0.11	0.32	0.36	0.48	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.13	0.12	0.22	0.14
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.07	0.19	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.13	0.12	0.09
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.08	0.16	0.01	0.01	0.06	0.01	0.12	0.18	0.09	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.20	0.19	0.33	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.04	0.22	0.20	0.33	0.22
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.05	0.04	0.04	0.08	0.01	0.01	0.12	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.04	0.18	0.15	0.26	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.13	0.11	0.20	0.13
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.03	0.17	0.15	0.28	0.18
O2	0.02	0.00	0.19	0.16	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.21	0.01	0.06	0.10	0.10	0.19	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.06	0.17	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.11	0.09	0.05
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.11	0.04	0.11	0.04	0.11	0.21	0.03	0.00	0.09	0.01	0.12	0.23	0.10	0.11
O4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.22	0.22	0.37	0.24
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.07	0.10	0.07
O5'	0.06	0.13	0.09	0.12	0.20	0.01	0.22	0.01	0.18	0.13	0.17	0.10	0.04	0.12	0.22	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.12	0.13	0.18	0.19	0.09	0.20	0.12	0.15	0.11	0.15	0.10	0.11	0.23	0.22	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.22	0.12	0.09	0.33	0.07	0.33	0.11	0.26	0.20	0.28	0.19	0.09	0.10	0.37	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.09	0.10	0.22	0.02	0.22	0.01	0.17	0.13	0.18	0.12	0.05	0.11	0.24	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00