Doublet Group distance statistics: 52575

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 2, 1, 8, 4, 6, 7, 4, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.019, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.016, 0.035, 0.053, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.005, 0.025, 0.046, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.017, 0.041, 0.065, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.041 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.027, 0.060, 0.094, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.060 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.028, 0.067, 0.106, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.067 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.032, 0.077, 0.121, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.077 std_dev=0.045
C5	B	0, 0.170, 0.332, 0.494, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.332 std_dev=0.162
C6	B	0, 0.215, 0.424, 0.633, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.424 std_dev=0.209
O4	B	0, 0.231, 0.449, 0.667, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.449 std_dev=0.218
C4	B	0, 0.198, 0.417, 0.636, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.417 std_dev=0.219
N1	B	0, 0.236, 0.550, 0.863, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.550 std_dev=0.313
N3	B	0, 0.254, 0.596, 0.937, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.596 std_dev=0.342
C3'	B	0, 0.119, 0.475, 0.830, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.475 std_dev=0.356
O3'	B	0, 0.077, 0.438, 0.799, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.438 std_dev=0.361
C2	B	0, 0.278, 0.658, 1.038, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.658 std_dev=0.380
C4'	B	0, 0.222, 0.603, 0.984, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.603 std_dev=0.381
C1'	B	0, 0.271, 0.652, 1.033, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.652 std_dev=0.381
O4'	B	0, 0.293, 0.675, 1.057, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.675 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.205, 0.592, 0.978, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.592 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.254, 0.661, 1.068, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.661 std_dev=0.407
O2'	B	0, 0.280, 0.727, 1.174, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.727 std_dev=0.447
O4'	A	0, 0.316, 0.782, 1.248, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.782 std_dev=0.466
O2	B	0, 0.373, 0.847, 1.321, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.847 std_dev=0.474
C2'	A	0, 0.358, 0.857, 1.356, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.857 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.122, 0.643, 1.164, 3.119 max_d=3.119 avg_d=0.643 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.579, 1.308, 2.036, 2.110 max_d=2.110 avg_d=1.308 std_dev=0.729
P	B	0, 0.055, 0.812, 1.568, 4.837 max_d=4.837 avg_d=0.812 std_dev=0.757
C4'	A	0, 0.472, 1.235, 1.998, 1.884 max_d=1.884 avg_d=1.235 std_dev=0.763
C3'	A	0, 0.462, 1.232, 2.002, 1.859 max_d=1.859 avg_d=1.232 std_dev=0.770
O5'	A	0, 0.512, 1.289, 2.067, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.289 std_dev=0.777
O2'	A	0, 0.622, 1.445, 2.269, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.445 std_dev=0.823
P	A	0, 0.618, 1.490, 2.363, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.490 std_dev=0.873
OP1	B	0, 0.446, 1.389, 2.332, 4.908 max_d=4.908 avg_d=1.389 std_dev=0.943
C5'	A	0, 0.655, 1.650, 2.645, 2.555 max_d=2.555 avg_d=1.650 std_dev=0.995
OP2	B	0, -0.145, 0.861, 1.866, 6.134 max_d=6.134 avg_d=0.861 std_dev=1.006
O3'	A	0, 0.647, 1.731, 2.815, 2.686 max_d=2.686 avg_d=1.731 std_dev=1.084
OP1	A	0, 0.814, 1.919, 3.024, 3.032 max_d=3.032 avg_d=1.919 std_dev=1.105

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.28	0.00	0.13	0.02	0.12	0.20	0.14
C2	0.02	0.00	0.33	0.25	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.22	0.08	0.01	0.09	0.17	0.10
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.16	0.01	0.06	0.20	0.13	0.19	0.24	0.40	0.32	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.46	0.08	0.49	0.56	0.50
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.26	0.00	0.34	0.01	0.36	0.30	0.32	0.21	0.20	0.36	0.23	0.01	0.01	0.02	0.10	0.39	0.13	0.07	0.07
C4	0.01	0.01	0.16	0.26	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.11	0.09	0.01	0.09	0.17	0.11
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.08	0.20	0.03	0.12	0.08	0.18	0.08	0.30	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.34	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.11	0.04	0.17	0.01	0.19	0.23	0.17
C5'	0.07	0.13	0.20	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.15	0.07	0.18	0.14	0.15	0.04	0.09	0.21	0.01	0.01	0.10	0.08	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.36	0.01	0.08	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.11	0.08	0.19	0.00	0.22	0.26	0.19
C8	0.01	0.01	0.19	0.30	0.00	0.20	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.17	0.15	0.20	0.02	0.17	0.18	0.17
N1	0.02	0.00	0.24	0.32	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.16	0.13	0.01	0.15	0.22	0.14
N2	0.03	0.00	0.40	0.21	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.23	0.27	0.08	0.02	0.08	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.32	0.20	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.20	0.22	0.08	0.01	0.07	0.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.11	0.36	0.00	0.18	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.45	0.21	0.09	0.25	0.02	0.25	0.26	0.23
N9	0.00	0.01	0.01	0.23	0.00	0.08	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.15	0.10
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.12	0.30	0.30	0.09	0.26	0.43	0.10	0.25	0.15	0.45	0.21	0.00	0.03	0.21	0.35	0.34	0.41	0.63	0.42
O3'	0.28	0.15	0.02	0.01	0.07	0.01	0.11	0.21	0.11	0.17	0.07	0.23	0.20	0.21	0.06	0.03	0.00	0.19	0.19	0.18	0.31	0.24	0.22
O4'	0.00	0.22	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.15	0.16	0.27	0.22	0.09	0.01	0.21	0.19	0.00	0.09	0.05	0.10	0.16	0.11
O5'	0.13	0.08	0.46	0.10	0.09	0.01	0.17	0.01	0.19	0.20	0.13	0.08	0.08	0.25	0.08	0.35	0.19	0.09	0.00	0.24	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.39	0.01	0.11	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.34	0.18	0.05	0.24	0.00	0.29	0.32	0.25
OP1	0.12	0.09	0.49	0.13	0.09	0.05	0.19	0.08	0.22	0.17	0.15	0.08	0.07	0.25	0.08	0.41	0.31	0.10	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.17	0.56	0.07	0.17	0.09	0.23	0.07	0.26	0.18	0.22	0.17	0.16	0.26	0.15	0.63	0.24	0.16	0.02	0.32	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.10	0.50	0.07	0.11	0.02	0.17	0.01	0.19	0.17	0.14	0.11	0.10	0.23	0.10	0.42	0.22	0.11	0.00	0.25	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.28	0.22	0.16	0.20	0.19	0.15	0.21	0.18	0.24	0.27	0.33	0.26	0.13	0.19	0.22	0.40	0.62	0.92	0.64
C2	0.19	0.23	0.19	0.15	0.23	0.16	0.17	0.19	0.17	0.20	0.25	0.25	0.20	0.15	0.27	0.17	0.40	0.67	0.99	0.69
C2'	0.35	0.34	0.35	0.39	0.37	0.37	0.39	0.35	0.37	0.35	0.34	0.32	0.33	0.41	0.36	0.36	0.45	0.38	0.96	0.50
C3'	0.31	0.37	0.34	0.23	0.20	0.23	0.13	0.19	0.17	0.28	0.34	0.46	0.41	0.23	0.18	0.24	0.33	0.49	0.84	0.51
C4	0.21	0.27	0.21	0.15	0.24	0.17	0.17	0.19	0.17	0.22	0.28	0.30	0.23	0.13	0.26	0.18	0.40	0.65	0.97	0.67
C4'	0.55	0.60	0.59	0.51	0.43	0.49	0.36	0.47	0.41	0.52	0.56	0.68	0.64	0.51	0.39	0.48	0.57	0.73	0.91	0.75
C5	0.20	0.26	0.20	0.15	0.24	0.16	0.17	0.18	0.17	0.21	0.28	0.29	0.22	0.14	0.27	0.17	0.39	0.67	1.00	0.68
C5'	0.59	0.64	0.65	0.58	0.48	0.54	0.40	0.51	0.45	0.56	0.61	0.73	0.71	0.59	0.45	0.51	0.61	0.77	0.96	0.79
C6	0.18	0.24	0.19	0.16	0.23	0.16	0.17	0.18	0.17	0.19	0.26	0.26	0.20	0.15	0.27	0.16	0.39	0.69	1.02	0.70
C8	0.23	0.28	0.22	0.16	0.23	0.18	0.17	0.19	0.18	0.23	0.29	0.32	0.25	0.13	0.25	0.19	0.40	0.65	0.98	0.67
N1	0.18	0.22	0.19	0.16	0.22	0.16	0.17	0.19	0.17	0.19	0.25	0.24	0.19	0.16	0.26	0.16	0.40	0.69	1.02	0.70
N2	0.18	0.21	0.19	0.16	0.22	0.16	0.17	0.19	0.17	0.19	0.23	0.22	0.19	0.15	0.24	0.16	0.40	0.66	0.97	0.69
N3	0.21	0.26	0.20	0.15	0.24	0.17	0.17	0.19	0.17	0.22	0.28	0.29	0.23	0.13	0.27	0.18	0.40	0.64	0.95	0.67
N7	0.21	0.27	0.21	0.15	0.24	0.16	0.17	0.18	0.17	0.21	0.29	0.30	0.23	0.14	0.26	0.17	0.39	0.67	1.00	0.68
N9	0.23	0.28	0.22	0.16	0.23	0.18	0.17	0.19	0.18	0.23	0.29	0.32	0.25	0.13	0.24	0.20	0.40	0.64	0.95	0.66
O2'	0.55	0.63	0.63	0.62	0.55	0.51	0.46	0.42	0.48	0.55	0.65	0.68	0.63	0.67	0.54	0.48	0.46	0.36	0.85	0.42
O3'	0.81	0.86	0.86	0.76	0.67	0.73	0.59	0.68	0.66	0.77	0.82	0.94	0.93	0.76	0.62	0.73	0.68	0.88	0.80	0.79
O4'	0.60	0.65	0.61	0.54	0.53	0.55	0.46	0.55	0.50	0.59	0.63	0.70	0.65	0.52	0.50	0.56	0.66	0.85	1.01	0.87
O5'	0.44	0.52	0.49	0.39	0.37	0.37	0.27	0.33	0.31	0.42	0.50	0.61	0.55	0.39	0.35	0.36	0.49	0.68	0.97	0.71
O6	0.18	0.23	0.19	0.17	0.23	0.17	0.18	0.19	0.17	0.19	0.25	0.25	0.20	0.17	0.27	0.16	0.39	0.70	1.02	0.69
OP1	0.47	0.55	0.53	0.43	0.37	0.38	0.27	0.34	0.32	0.44	0.52	0.65	0.60	0.44	0.35	0.37	0.47	0.65	0.94	0.67
OP2	0.38	0.46	0.41	0.31	0.35	0.29	0.26	0.24	0.28	0.37	0.46	0.54	0.46	0.29	0.35	0.31	0.35	0.59	0.88	0.58
P	0.45	0.53	0.50	0.40	0.38	0.37	0.28	0.33	0.32	0.43	0.51	0.62	0.56	0.40	0.37	0.37	0.47	0.66	0.94	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.19	0.22	0.16
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.25	0.29	0.48	0.34
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.14	0.13	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.06	0.09	0.01	0.01	0.09	0.01	0.07	0.10	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.02	0.36	0.49	0.75	0.54
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.14	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.04	0.37	0.52	0.75	0.56
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.13	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.32	0.42	0.59	0.45
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.24	0.28	0.44	0.32
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.31	0.38	0.63	0.44
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.12	0.02	0.06	0.20	0.24	0.38	0.26
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.08	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.27	0.06	0.12
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.08	0.12	0.02	0.00	0.12	0.01	0.12	0.26	0.16	0.15
O4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.03	0.38	0.54	0.83	0.59
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.12	0.20	0.18	0.11
O5'	0.14	0.25	0.08	0.07	0.36	0.01	0.37	0.01	0.32	0.24	0.31	0.20	0.04	0.12	0.38	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.29	0.14	0.10	0.49	0.14	0.52	0.13	0.42	0.28	0.38	0.24	0.27	0.26	0.54	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.48	0.13	0.08	0.75	0.07	0.75	0.13	0.59	0.44	0.63	0.38	0.06	0.16	0.83	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.34	0.10	0.07	0.54	0.05	0.56	0.01	0.45	0.32	0.44	0.26	0.12	0.15	0.59	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00