Doublet Group distance statistics: 52584

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 17, 13, 10, 2, 1, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.004, 0.025, 0.046, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.025 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.055, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.029 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.003, 0.033, 0.064, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.033 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.008, 0.065, 0.122, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.065 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.012, 0.094, 0.176, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.094 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.022, 0.128, 0.233, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.128 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.018, 0.144, 0.271, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.144 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.021, 0.167, 0.312, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.167 std_dev=0.145
C5'	A	0, 0.041, 0.232, 0.423, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.232 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.024, 0.217, 0.409, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.217 std_dev=0.192
O5'	A	0, 0.064, 0.287, 0.510, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.287 std_dev=0.223
N3	B	0, 0.106, 0.406, 0.706, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.406 std_dev=0.300
C4	B	0, 0.120, 0.424, 0.727, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.424 std_dev=0.303
P	A	0, 0.057, 0.390, 0.722, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.390 std_dev=0.333
OP2	A	0, 0.129, 0.467, 0.806, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.467 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.116, 0.472, 0.827, 2.185 max_d=2.185 avg_d=0.472 std_dev=0.355
C2	B	0, 0.023, 0.385, 0.746, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.385 std_dev=0.362
C1'	B	0, 0.139, 0.503, 0.868, 2.258 max_d=2.258 avg_d=0.503 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.057, 0.424, 0.790, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.424 std_dev=0.367
N1	B	0, -0.016, 0.365, 0.746, 2.232 max_d=2.232 avg_d=0.365 std_dev=0.381
C6	B	0, -0.004, 0.382, 0.767, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.382 std_dev=0.386
O6	B	0, -0.066, 0.391, 0.848, 2.660 max_d=2.660 avg_d=0.391 std_dev=0.457
OP1	A	0, 0.028, 0.496, 0.963, 2.596 max_d=2.596 avg_d=0.496 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.035, 0.510, 0.985, 3.255 max_d=3.255 avg_d=0.510 std_dev=0.475
N7	B	0, 0.004, 0.488, 0.971, 3.026 max_d=3.026 avg_d=0.488 std_dev=0.484
N2	B	0, -0.088, 0.404, 0.896, 2.566 max_d=2.566 avg_d=0.404 std_dev=0.492
C2'	B	0, 0.026, 0.570, 1.113, 3.085 max_d=3.085 avg_d=0.570 std_dev=0.543
O3'	B	0, 0.044, 0.625, 1.206, 3.243 max_d=3.243 avg_d=0.625 std_dev=0.581
C3'	B	0, -0.022, 0.599, 1.220, 3.278 max_d=3.278 avg_d=0.599 std_dev=0.621
O4'	B	0, -0.075, 0.592, 1.258, 4.387 max_d=4.387 avg_d=0.592 std_dev=0.666
C4'	B	0, -0.091, 0.641, 1.373, 4.527 max_d=4.527 avg_d=0.641 std_dev=0.732
O2'	B	0, -0.143, 0.686, 1.515, 4.906 max_d=4.906 avg_d=0.686 std_dev=0.829
C5'	B	0, -0.512, 0.769, 2.051, 7.105 max_d=7.105 avg_d=0.769 std_dev=1.281
O5'	B	0, -0.774, 0.775, 2.323, 7.572 max_d=7.572 avg_d=0.775 std_dev=1.549
P	B	0, -1.252, 0.930, 3.112, 10.499 max_d=10.499 avg_d=0.930 std_dev=2.182
OP1	B	0, -1.428, 0.999, 3.427, 12.131 max_d=12.131 avg_d=0.999 std_dev=2.427
OP2	B	0, -1.398, 1.037, 3.472, 11.971 max_d=11.971 avg_d=1.037 std_dev=2.435

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.15	0.08	0.06
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.07	0.02	0.10	0.01	0.21	0.20	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.07	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.23	0.08	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.10	0.05	0.07	0.05	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.25	0.09	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.10	0.01	0.16	0.18	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.13	0.01	0.16	0.24	0.17
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.11	0.06	0.04	0.04	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.14	0.00	0.18	0.26	0.18
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.13	0.02	0.12	0.19	0.16
N1	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.02	0.12	0.01	0.20	0.24	0.16
N2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.10	0.01	0.23	0.19	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.09	0.01	0.20	0.17	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.16	0.02	0.15	0.26	0.21
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.13	0.14	0.10
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.05	0.07	0.03	0.09	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.08	0.22	0.07	0.07
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.08	0.10	0.06	0.10	0.07	0.11	0.05	0.03	0.00	0.01	0.09	0.10	0.30	0.13	0.14
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.10	0.08	0.06
O5'	0.04	0.10	0.05	0.07	0.10	0.01	0.13	0.01	0.14	0.13	0.12	0.10	0.09	0.16	0.08	0.05	0.09	0.05	0.00	0.15	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.10	0.02	0.15	0.00	0.19	0.29	0.21
OP1	0.15	0.21	0.23	0.25	0.16	0.12	0.16	0.04	0.18	0.12	0.20	0.23	0.20	0.15	0.13	0.22	0.30	0.10	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.20	0.08	0.09	0.18	0.03	0.24	0.01	0.26	0.19	0.24	0.19	0.17	0.26	0.14	0.07	0.13	0.08	0.01	0.29	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.08	0.10	0.12	0.04	0.17	0.01	0.18	0.16	0.16	0.12	0.11	0.21	0.10	0.07	0.14	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.10	0.14	0.19	0.13	0.19	0.17	0.30	0.22	0.17	0.17	0.16	0.14	0.20	0.17	0.51	0.07	0.22	0.53	0.31	0.73	0.67	0.77
C2	0.23	0.28	0.21	0.10	0.18	0.13	0.12	0.16	0.12	0.13	0.19	0.40	0.25	0.14	0.17	0.47	0.17	0.16	0.15	0.18	0.17	0.23	0.23
C2'	0.29	0.10	0.12	0.20	0.18	0.22	0.19	0.30	0.21	0.22	0.16	0.14	0.16	0.22	0.23	0.45	0.07	0.28	0.50	0.27	0.67	0.62	0.72
C3'	0.37	0.11	0.15	0.22	0.23	0.32	0.23	0.39	0.21	0.31	0.16	0.13	0.19	0.28	0.30	0.44	0.12	0.40	0.56	0.26	0.76	0.69	0.78
C4	0.23	0.18	0.16	0.11	0.15	0.14	0.13	0.16	0.14	0.16	0.09	0.29	0.19	0.17	0.17	0.48	0.10	0.20	0.30	0.23	0.40	0.30	0.45
C4'	0.32	0.10	0.14	0.20	0.18	0.27	0.19	0.39	0.22	0.25	0.18	0.12	0.15	0.23	0.24	0.51	0.08	0.33	0.63	0.29	0.89	0.86	0.92
C5	0.23	0.20	0.16	0.10	0.16	0.15	0.13	0.18	0.11	0.16	0.11	0.30	0.20	0.16	0.18	0.45	0.10	0.21	0.27	0.17	0.36	0.27	0.40
C5'	0.36	0.11	0.15	0.20	0.21	0.32	0.22	0.43	0.22	0.30	0.18	0.13	0.16	0.27	0.28	0.51	0.11	0.39	0.66	0.28	0.94	0.89	0.95
C6	0.23	0.25	0.17	0.08	0.18	0.15	0.13	0.20	0.12	0.15	0.17	0.35	0.23	0.15	0.18	0.43	0.13	0.20	0.21	0.13	0.27	0.28	0.30
C8	0.24	0.13	0.13	0.16	0.15	0.18	0.15	0.24	0.15	0.18	0.09	0.21	0.16	0.19	0.18	0.47	0.07	0.24	0.42	0.23	0.58	0.48	0.62
N1	0.23	0.28	0.20	0.09	0.19	0.15	0.14	0.21	0.13	0.14	0.21	0.39	0.25	0.14	0.18	0.44	0.16	0.18	0.18	0.13	0.21	0.32	0.25
N2	0.22	0.33	0.24	0.13	0.20	0.14	0.13	0.20	0.13	0.12	0.26	0.44	0.28	0.13	0.17	0.47	0.21	0.14	0.13	0.17	0.14	0.30	0.17
N3	0.23	0.22	0.19	0.10	0.16	0.12	0.13	0.13	0.14	0.14	0.11	0.35	0.22	0.16	0.17	0.50	0.14	0.17	0.24	0.25	0.31	0.23	0.36
N7	0.24	0.16	0.14	0.13	0.16	0.17	0.14	0.21	0.12	0.18	0.09	0.25	0.18	0.18	0.18	0.45	0.08	0.23	0.34	0.18	0.47	0.35	0.50
N9	0.24	0.12	0.14	0.15	0.14	0.17	0.15	0.23	0.17	0.17	0.11	0.22	0.16	0.19	0.18	0.48	0.07	0.22	0.42	0.26	0.58	0.48	0.62
O2'	0.27	0.10	0.14	0.21	0.15	0.18	0.16	0.32	0.21	0.17	0.20	0.12	0.14	0.17	0.19	0.51	0.07	0.22	0.57	0.27	0.76	0.76	0.82
O3'	0.43	0.13	0.18	0.26	0.27	0.39	0.26	0.44	0.22	0.38	0.18	0.15	0.21	0.33	0.36	0.42	0.17	0.49	0.60	0.25	0.80	0.72	0.80
O4'	0.25	0.10	0.14	0.20	0.14	0.22	0.18	0.37	0.23	0.19	0.19	0.13	0.13	0.21	0.19	0.52	0.07	0.26	0.62	0.31	0.87	0.82	0.90
O5'	0.32	0.13	0.15	0.24	0.20	0.32	0.22	0.42	0.23	0.28	0.19	0.15	0.16	0.27	0.26	0.45	0.12	0.37	0.63	0.30	0.88	0.80	0.89
O6	0.23	0.26	0.17	0.09	0.19	0.17	0.14	0.23	0.13	0.16	0.20	0.35	0.24	0.15	0.19	0.41	0.14	0.20	0.23	0.13	0.30	0.35	0.32
OP1	0.57	0.27	0.31	0.10	0.38	0.35	0.30	0.30	0.20	0.45	0.19	0.30	0.36	0.36	0.47	0.66	0.24	0.52	0.40	0.14	0.68	0.52	0.62
OP2	0.33	0.15	0.17	0.22	0.21	0.29	0.20	0.37	0.20	0.28	0.17	0.19	0.19	0.26	0.27	0.44	0.11	0.36	0.53	0.25	0.78	0.63	0.75
P	0.39	0.14	0.19	0.15	0.22	0.29	0.19	0.35	0.15	0.30	0.13	0.18	0.21	0.24	0.30	0.52	0.12	0.39	0.52	0.21	0.80	0.67	0.77

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02	0.05	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.12	0.00	0.10	0.03	0.14	0.16	0.12
C2	0.06	0.00	0.12	0.33	0.02	0.22	0.01	0.27	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.27	0.16	0.15	0.43	0.01	0.45	0.41	0.51
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.13	0.05	0.11	0.08	0.16	0.12	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.17	0.14	0.08
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.16	0.00	0.08	0.02	0.14	0.14	0.25	0.42	0.31	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.10	0.10	0.33	0.17
C4	0.02	0.02	0.05	0.16	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.04	0.08	0.06	0.02	0.12	0.16	0.07
C4'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.21	0.14	0.32	0.22	0.16	0.05	0.12	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.10	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.20	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.05	0.04	0.20	0.02	0.29	0.46	0.26
C5'	0.09	0.27	0.13	0.02	0.06	0.00	0.20	0.00	0.12	0.49	0.13	0.44	0.24	0.43	0.21	0.03	0.12	0.01	0.01	0.18	0.07	0.13	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.06	0.07	0.09	0.01	0.17	0.32	0.12
C8	0.02	0.03	0.11	0.14	0.01	0.21	0.02	0.49	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.17	0.10	0.61	0.03	0.67	0.87	0.71
N1	0.05	0.00	0.08	0.25	0.03	0.14	0.02	0.13	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.24	0.12	0.11	0.24	0.01	0.26	0.17	0.29
N2	0.06	0.01	0.16	0.42	0.02	0.32	0.01	0.44	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.31	0.25	0.19	0.66	0.01	0.73	0.76	0.83
N3	0.06	0.01	0.12	0.31	0.01	0.22	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.23	0.13	0.14	0.38	0.01	0.37	0.34	0.42
N7	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.16	0.00	0.43	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.05	0.52	0.02	0.65	0.89	0.66
N9	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.21	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.23	0.03	0.28	0.39	0.27
O2'	0.02	0.27	0.00	0.01	0.13	0.12	0.12	0.03	0.17	0.08	0.24	0.31	0.23	0.08	0.05	0.00	0.03	0.06	0.06	0.17	0.13	0.18	0.06
O3'	0.12	0.16	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.12	0.06	0.17	0.12	0.25	0.13	0.12	0.09	0.03	0.00	0.12	0.23	0.05	0.19	0.52	0.29
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.11	0.19	0.14	0.05	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.06	0.08	0.12	0.08
O5'	0.10	0.43	0.05	0.17	0.06	0.01	0.20	0.01	0.09	0.61	0.24	0.66	0.38	0.52	0.23	0.06	0.23	0.07	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.05	0.10	0.02	0.04	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.05	0.06	0.16	0.00	0.27	0.48	0.23
OP1	0.14	0.45	0.17	0.10	0.12	0.05	0.29	0.07	0.17	0.67	0.26	0.73	0.37	0.65	0.28	0.13	0.19	0.08	0.02	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.41	0.14	0.33	0.16	0.10	0.46	0.13	0.32	0.87	0.17	0.76	0.34	0.89	0.39	0.18	0.52	0.12	0.02	0.48	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.51	0.08	0.17	0.07	0.03	0.26	0.01	0.12	0.71	0.29	0.83	0.42	0.66	0.27	0.06	0.29	0.08	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00