Doublet Group distance statistics: 52585

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.010, 0.014, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.014, 0.022, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.014, 0.023, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.018, 0.032, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.027, 0.041, 0.056, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.041 std_dev=0.015
O4'	A	0, -0.031, 0.135, 0.301, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.135 std_dev=0.166
C2'	A	0, 0.009, 0.188, 0.367, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.188 std_dev=0.179
C4'	A	0, 0.013, 0.235, 0.457, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.235 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.004, 0.277, 0.551, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.277 std_dev=0.274
O2'	A	0, -0.040, 0.238, 0.515, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.238 std_dev=0.277
N9	B	0, 0.198, 0.485, 0.773, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.485 std_dev=0.287
O5'	A	0, 0.264, 0.551, 0.839, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.551 std_dev=0.288
O5'	B	0, 0.482, 0.812, 1.142, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.812 std_dev=0.330
P	B	0, 0.492, 0.833, 1.173, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.833 std_dev=0.340
C1'	B	0, 0.202, 0.553, 0.903, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.553 std_dev=0.351
C4	B	0, 0.062, 0.415, 0.767, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.415 std_dev=0.352
C5'	A	0, 0.025, 0.404, 0.782, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.404 std_dev=0.379
O3'	A	0, -0.029, 0.409, 0.848, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.409 std_dev=0.439
O2'	B	0, 0.202, 0.685, 1.169, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.685 std_dev=0.483
OP1	B	0, 0.462, 0.951, 1.439, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.951 std_dev=0.489
N1	B	0, -0.115, 0.422, 0.958, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.422 std_dev=0.536
O4'	B	0, 0.145, 0.681, 1.218, 2.104 max_d=2.104 avg_d=0.681 std_dev=0.537
P	A	0, 0.082, 0.621, 1.159, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.621 std_dev=0.539
OP1	A	0, 0.191, 0.757, 1.323, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.757 std_dev=0.566
C5	B	0, 0.002, 0.571, 1.140, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.571 std_dev=0.569
C2'	B	0, 0.151, 0.729, 1.306, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.729 std_dev=0.577
C5'	B	0, 0.318, 0.923, 1.529, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.923 std_dev=0.605
C8	B	0, 0.119, 0.728, 1.338, 2.418 max_d=2.418 avg_d=0.728 std_dev=0.610
N3	B	0, -0.146, 0.468, 1.082, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.468 std_dev=0.614
C6	B	0, -0.100, 0.558, 1.217, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.558 std_dev=0.658
C2	B	0, -0.213, 0.466, 1.145, 2.177 max_d=2.177 avg_d=0.466 std_dev=0.679
C4'	B	0, 0.118, 0.852, 1.585, 2.717 max_d=2.717 avg_d=0.852 std_dev=0.733
OP2	A	0, -0.057, 0.690, 1.437, 3.021 max_d=3.021 avg_d=0.690 std_dev=0.747
OP2	B	0, 0.316, 1.119, 1.921, 3.160 max_d=3.160 avg_d=1.119 std_dev=0.803
N7	B	0, -0.035, 0.815, 1.666, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.815 std_dev=0.851
C3'	B	0, 0.048, 0.900, 1.752, 3.128 max_d=3.128 avg_d=0.900 std_dev=0.852
O6	B	0, -0.245, 0.736, 1.717, 3.475 max_d=3.475 avg_d=0.736 std_dev=0.981
N2	B	0, -0.469, 0.618, 1.705, 3.545 max_d=3.545 avg_d=0.618 std_dev=1.087
O3'	B	0, -0.331, 1.095, 2.522, 5.009 max_d=5.009 avg_d=1.095 std_dev=1.427

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05
C2	0.02	0.00	0.16	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.18	0.07	0.07	0.01	0.08	0.17	0.11
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.19	0.16	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.07	0.05	0.03
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.08	0.14	0.10	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.09	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.08	0.04	0.06	0.01	0.06	0.14	0.09
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02	0.08	0.01	0.09	0.16	0.10
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.07	0.06	0.05	0.07	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.04	0.08	0.00	0.11	0.19	0.12
C8	0.00	0.01	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.05	0.07	0.01	0.08	0.10	0.09
N1	0.02	0.00	0.12	0.08	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.06	0.08	0.01	0.10	0.19	0.12
N2	0.03	0.00	0.19	0.14	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.23	0.09	0.06	0.01	0.07	0.18	0.12
N3	0.02	0.00	0.16	0.10	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.17	0.07	0.05	0.01	0.06	0.15	0.09
N7	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.08	0.01	0.10	0.14	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.09	0.07
O2'	0.02	0.21	0.00	0.01	0.10	0.03	0.06	0.02	0.09	0.06	0.16	0.26	0.20	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.02	0.07	0.08	0.04	0.02
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.08	0.01	0.06	0.04	0.07	0.14	0.13	0.23	0.17	0.12	0.04	0.05	0.00	0.01	0.10	0.07	0.18	0.12	0.13
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.09	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.08	0.07	0.07
O5'	0.04	0.07	0.03	0.04	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.07	0.08	0.06	0.05	0.08	0.05	0.02	0.10	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.09	0.00	0.13	0.20	0.13
OP1	0.05	0.08	0.07	0.09	0.06	0.06	0.09	0.06	0.11	0.08	0.10	0.07	0.06	0.10	0.05	0.08	0.18	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.17	0.05	0.07	0.14	0.02	0.16	0.01	0.19	0.10	0.19	0.18	0.15	0.14	0.09	0.04	0.12	0.07	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.03	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.12	0.09	0.12	0.12	0.09	0.10	0.07	0.02	0.13	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.18	0.23	0.12	0.22	0.15	0.46	0.10	0.58	0.40	0.38	0.43	0.14	0.54	0.21	0.11	0.37	0.18	0.11	0.80	0.09	0.31	0.23
C2	0.12	0.45	0.16	0.19	0.07	0.22	0.26	0.20	0.28	0.32	0.19	0.78	0.34	0.47	0.08	0.08	0.13	0.35	0.10	0.63	0.29	0.61	0.36
C2'	0.18	0.31	0.10	0.23	0.09	0.40	0.35	0.33	0.47	0.30	0.25	0.69	0.31	0.48	0.07	0.21	0.72	0.38	0.15	0.74	0.19	0.17	0.05
C3'	0.13	0.21	0.10	0.21	0.13	0.37	0.40	0.31	0.53	0.32	0.35	0.47	0.20	0.49	0.10	0.16	0.72	0.33	0.13	0.77	0.21	0.16	0.05
C4	0.07	0.25	0.20	0.17	0.10	0.18	0.36	0.15	0.44	0.36	0.12	0.60	0.20	0.51	0.14	0.06	0.22	0.27	0.10	0.74	0.20	0.49	0.31
C4'	0.10	0.29	0.27	0.09	0.29	0.13	0.49	0.09	0.62	0.39	0.52	0.30	0.18	0.53	0.24	0.13	0.45	0.13	0.10	0.79	0.09	0.21	0.15
C5	0.08	0.25	0.20	0.18	0.08	0.19	0.32	0.17	0.37	0.34	0.08	0.57	0.21	0.48	0.12	0.05	0.19	0.29	0.10	0.64	0.24	0.54	0.33
C5'	0.16	0.38	0.37	0.17	0.35	0.07	0.53	0.05	0.66	0.42	0.59	0.34	0.26	0.54	0.30	0.21	0.35	0.07	0.16	0.81	0.07	0.25	0.20
C6	0.10	0.34	0.18	0.20	0.06	0.22	0.25	0.20	0.27	0.31	0.11	0.64	0.27	0.44	0.09	0.06	0.13	0.33	0.10	0.54	0.30	0.62	0.36
C8	0.07	0.14	0.23	0.15	0.16	0.17	0.39	0.13	0.48	0.37	0.24	0.41	0.13	0.51	0.17	0.09	0.29	0.22	0.10	0.72	0.15	0.42	0.28
N1	0.12	0.42	0.16	0.21	0.08	0.23	0.22	0.22	0.21	0.30	0.20	0.72	0.33	0.43	0.08	0.08	0.12	0.36	0.10	0.50	0.32	0.65	0.37
N2	0.16	0.56	0.13	0.20	0.13	0.24	0.19	0.22	0.17	0.29	0.35	0.84	0.43	0.44	0.07	0.11	0.11	0.39	0.11	0.52	0.32	0.66	0.37
N3	0.09	0.35	0.18	0.17	0.07	0.19	0.35	0.16	0.43	0.36	0.07	0.74	0.27	0.52	0.12	0.06	0.19	0.30	0.10	0.79	0.22	0.52	0.32
N7	0.07	0.18	0.22	0.16	0.12	0.18	0.34	0.15	0.41	0.35	0.15	0.46	0.16	0.48	0.15	0.07	0.23	0.26	0.10	0.66	0.20	0.49	0.31
N9	0.07	0.16	0.23	0.15	0.16	0.16	0.41	0.12	0.51	0.38	0.26	0.47	0.14	0.53	0.18	0.08	0.29	0.22	0.10	0.77	0.15	0.41	0.28
O2'	0.26	0.41	0.18	0.37	0.10	0.49	0.28	0.40	0.40	0.24	0.21	0.83	0.42	0.42	0.05	0.32	0.88	0.43	0.23	0.65	0.32	0.16	0.10
O3'	0.28	0.27	0.19	0.46	0.07	0.58	0.29	0.50	0.44	0.21	0.28	0.56	0.31	0.40	0.06	0.30	1.02	0.49	0.31	0.69	0.45	0.19	0.19
O4'	0.20	0.33	0.40	0.26	0.36	0.10	0.55	0.11	0.67	0.46	0.57	0.26	0.24	0.58	0.33	0.21	0.23	0.09	0.23	0.82	0.15	0.34	0.30
O5'	0.13	0.28	0.34	0.17	0.30	0.11	0.49	0.08	0.61	0.40	0.50	0.23	0.19	0.53	0.26	0.18	0.35	0.13	0.13	0.79	0.08	0.29	0.22
O6	0.11	0.34	0.18	0.21	0.07	0.22	0.22	0.21	0.22	0.29	0.13	0.61	0.28	0.41	0.08	0.06	0.12	0.35	0.11	0.46	0.32	0.66	0.38
OP1	0.14	0.33	0.36	0.15	0.31	0.09	0.48	0.07	0.61	0.38	0.53	0.29	0.23	0.51	0.27	0.20	0.38	0.10	0.14	0.76	0.08	0.24	0.18
OP2	0.20	0.32	0.44	0.29	0.36	0.14	0.56	0.12	0.67	0.48	0.54	0.24	0.24	0.61	0.33	0.28	0.28	0.15	0.21	0.86	0.20	0.45	0.35
P	0.19	0.35	0.44	0.27	0.36	0.10	0.52	0.09	0.63	0.43	0.55	0.28	0.26	0.55	0.32	0.27	0.28	0.10	0.20	0.79	0.13	0.35	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.11	0.02	0.37	0.47	0.25
C2	0.02	0.00	0.33	0.23	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.05	0.27	0.18	0.01	0.22	0.19	0.13
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.16	0.01	0.07	0.12	0.14	0.20	0.25	0.40	0.32	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.10	0.67	0.82	0.56
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.20	0.00	0.23	0.03	0.25	0.16	0.25	0.22	0.20	0.20	0.14	0.01	0.00	0.01	0.10	0.27	0.44	0.39	0.23
C4	0.01	0.01	0.16	0.20	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.15	0.13	0.01	0.20	0.23	0.12
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.15	0.09	0.16	0.11	0.11	0.05	0.20	0.01	0.00	0.01	0.03	0.26	0.26	0.12
C5	0.01	0.01	0.07	0.23	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.06	0.08	0.11	0.01	0.12	0.15	0.07
C5'	0.04	0.21	0.12	0.03	0.11	0.01	0.08	0.00	0.12	0.14	0.18	0.25	0.18	0.11	0.05	0.08	0.18	0.01	0.01	0.11	0.10	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.25	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.14	0.13	0.01	0.12	0.13	0.09
C8	0.01	0.01	0.20	0.16	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.07	0.15	0.09	0.02	0.13	0.29	0.09
N1	0.02	0.00	0.25	0.25	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.04	0.22	0.16	0.01	0.16	0.14	0.10
N2	0.03	0.01	0.40	0.22	0.01	0.16	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.08	0.32	0.20	0.01	0.24	0.20	0.15
N3	0.02	0.00	0.32	0.20	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.08	0.26	0.17	0.01	0.25	0.24	0.15
N7	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.10	0.07	0.09	0.02	0.08	0.16	0.06
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.01	0.09	0.02	0.23	0.34	0.15
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.04	0.20	0.14	0.08	0.06	0.37	0.12	0.38	0.24	0.32	0.15	0.00	0.04	0.13	0.15	0.11	0.65	0.93	0.54
O3'	0.20	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.18	0.07	0.07	0.04	0.08	0.08	0.10	0.05	0.04	0.00	0.14	0.27	0.11	0.26	0.28	0.16
O4'	0.00	0.27	0.01	0.01	0.15	0.00	0.08	0.01	0.14	0.15	0.22	0.32	0.26	0.07	0.01	0.13	0.14	0.00	0.05	0.11	0.19	0.27	0.12
O5'	0.11	0.18	0.24	0.10	0.13	0.01	0.11	0.01	0.13	0.09	0.16	0.20	0.17	0.09	0.09	0.15	0.27	0.05	0.00	0.13	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.27	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.11	0.11	0.13	0.00	0.11	0.15	0.10
OP1	0.37	0.22	0.67	0.44	0.20	0.26	0.12	0.10	0.12	0.13	0.16	0.24	0.25	0.08	0.23	0.65	0.26	0.19	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.19	0.82	0.39	0.23	0.26	0.15	0.08	0.13	0.29	0.14	0.20	0.24	0.16	0.34	0.93	0.28	0.27	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.13	0.56	0.23	0.12	0.12	0.07	0.01	0.09	0.09	0.10	0.15	0.15	0.06	0.15	0.54	0.16	0.12	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00