Doublet Group distance statistics: 52588

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.006, 0.024, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.005, 0.030, 0.054, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.012, 0.047, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.047 std_dev=0.034
O5'	A	0, 0.027, 0.094, 0.160, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.094 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.036, 0.124, 0.212, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.124 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.044, 0.157, 0.269, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.157 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.051, 0.190, 0.329, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.190 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.060, 0.207, 0.353, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.207 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.068, 0.232, 0.396, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.232 std_dev=0.164
O6	B	0, 0.078, 0.266, 0.455, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.266 std_dev=0.188
O3'	A	0, 0.090, 0.310, 0.530, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.310 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.098, 0.337, 0.575, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.337 std_dev=0.239
P	A	0, 0.106, 0.361, 0.616, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.361 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.106, 0.367, 0.627, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.367 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.129, 0.441, 0.753, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.441 std_dev=0.312
OP1	A	0, 0.141, 0.481, 0.822, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.481 std_dev=0.341
C5	B	0, 0.147, 0.504, 0.861, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.504 std_dev=0.357
C2	B	0, 0.151, 0.521, 0.891, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.521 std_dev=0.370
N2	B	0, 0.165, 0.568, 0.972, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.568 std_dev=0.404
N7	B	0, 0.168, 0.573, 0.979, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.573 std_dev=0.405
OP2	A	0, 0.181, 0.619, 1.057, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.619 std_dev=0.438
C4	B	0, 0.188, 0.645, 1.103, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.645 std_dev=0.457
N3	B	0, 0.193, 0.662, 1.131, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.662 std_dev=0.469
C8	B	0, 0.215, 0.734, 1.254, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.734 std_dev=0.520
N9	B	0, 0.230, 0.787, 1.344, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.787 std_dev=0.557
C1'	B	0, 0.272, 0.933, 1.594, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.933 std_dev=0.661
OP2	B	0, 0.291, 0.998, 1.704, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.998 std_dev=0.706
O4'	B	0, 0.296, 1.017, 1.738, 1.589 max_d=1.589 avg_d=1.017 std_dev=0.721
O2'	B	0, 0.305, 1.043, 1.781, 1.605 max_d=1.605 avg_d=1.043 std_dev=0.738
C2'	B	0, 0.307, 1.052, 1.797, 1.632 max_d=1.632 avg_d=1.052 std_dev=0.745
P	B	0, 0.332, 1.138, 1.943, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.138 std_dev=0.805
O5'	B	0, 0.341, 1.166, 1.991, 1.795 max_d=1.795 avg_d=1.166 std_dev=0.825
C4'	B	0, 0.342, 1.173, 2.004, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.173 std_dev=0.831
O3'	B	0, 0.345, 1.183, 2.022, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.183 std_dev=0.839
C3'	B	0, 0.346, 1.187, 2.028, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.187 std_dev=0.841
C5'	B	0, 0.363, 1.245, 2.128, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.245 std_dev=0.882
OP1	B	0, 0.375, 1.281, 2.187, 1.961 max_d=1.961 avg_d=1.281 std_dev=0.906

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.04
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.06	0.09	0.08	0.07	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.10	0.02	0.07	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03
C8	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04
N1	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03
N2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02
N7	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.07	0.05
N9	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
O3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.03
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01
O5'	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.07	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03
OP1	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.04	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01
C2	0.07	0.00	0.07	0.07	0.05	0.05	0.07	0.04	0.06	0.08	0.02	0.04	0.03	0.09	0.06	0.09	0.07	0.05	0.05	0.09	0.04	0.03	0.04
C2'	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01
C3'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01
C4	0.04	0.01	0.05	0.05	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.05	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.02
C4'	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.08	0.06	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.10	0.04	0.03	0.03
C5	0.05	0.01	0.07	0.07	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.05	0.10	0.07	0.03	0.04	0.09	0.04	0.03	0.03
C5'	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.01	0.03	0.08	0.06	0.04	0.03	0.02	0.06	0.06	0.04	0.14	0.03	0.02	0.02
C6	0.08	0.01	0.09	0.09	0.06	0.06	0.07	0.04	0.06	0.09	0.01	0.04	0.03	0.10	0.07	0.12	0.09	0.05	0.06	0.09	0.06	0.05	0.05
C8	0.04	0.02	0.06	0.05	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.03	0.08	0.05	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.02
N1	0.08	0.01	0.09	0.08	0.06	0.06	0.08	0.05	0.06	0.10	0.01	0.04	0.03	0.10	0.07	0.12	0.09	0.06	0.06	0.09	0.05	0.05	0.05
N2	0.08	0.02	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.05	0.07	0.09	0.03	0.01	0.04	0.10	0.07	0.09	0.08	0.07	0.05	0.10	0.05	0.04	0.05
N3	0.04	0.01	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.05	0.03	0.03	0.09	0.02	0.02	0.02
N7	0.05	0.02	0.07	0.06	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.10	0.07	0.02	0.04	0.09	0.03	0.03	0.03
N9	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.02	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02
O2'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01
O3'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.04	0.06	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01
O4'	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02
O5'	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00
O6	0.09	0.01	0.11	0.10	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.11	0.02	0.04	0.04	0.11	0.08	0.14	0.11	0.06	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07
OP1	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.07	0.03	0.09	0.05	0.07	0.02	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.14	0.04	0.03	0.04
OP2	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.07	0.03	0.04	0.03
P	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02
C4	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01
C6	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04
C8	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03
N2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01
N3	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01
N7	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00
O2'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03
O3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03
O5'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.08	0.09	0.08
OP1	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01
P	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00