Doublet Group distance statistics: 52591

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 7, 20, 12, 8, 9, 4, 6, 1, 3, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.001, 0.015, 0.032, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.003, 0.021, 0.040, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.017, 0.040, 0.063, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.040 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.008, 0.042, 0.075, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.042 std_dev=0.033
N2	A	0, 0.001, 0.037, 0.072, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.037 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.016, 0.091, 0.166, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.091 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.021, 0.120, 0.219, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.120 std_dev=0.099
C4'	A	0, 0.027, 0.139, 0.251, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.139 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.033, 0.171, 0.310, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.171 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.030, 0.173, 0.316, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.173 std_dev=0.143
O5'	A	0, 0.054, 0.223, 0.392, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.223 std_dev=0.169
P	A	0, 0.055, 0.246, 0.437, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.246 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.069, 0.262, 0.456, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.262 std_dev=0.194
C5'	A	0, 0.024, 0.247, 0.470, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.247 std_dev=0.223
OP2	A	0, 0.049, 0.280, 0.511, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.280 std_dev=0.231
N1	B	0, 0.081, 0.317, 0.553, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.317 std_dev=0.236
OP1	A	0, 0.072, 0.311, 0.550, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.311 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.153, 0.401, 0.650, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.401 std_dev=0.249
N6	B	0, 0.152, 0.430, 0.709, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.430 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.034, 0.327, 0.620, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.327 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.195, 0.498, 0.801, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.498 std_dev=0.303
C4	B	0, 0.147, 0.488, 0.829, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.488 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.053, 0.408, 0.762, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.408 std_dev=0.355
N7	B	0, 0.242, 0.625, 1.008, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.625 std_dev=0.383
O4'	B	0, 0.149, 0.537, 0.924, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.537 std_dev=0.387
N9	B	0, 0.170, 0.596, 1.021, 2.242 max_d=2.242 avg_d=0.596 std_dev=0.426
C8	B	0, 0.230, 0.672, 1.113, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.672 std_dev=0.442
C4'	B	0, 0.021, 0.530, 1.039, 3.031 max_d=3.031 avg_d=0.530 std_dev=0.509
C1'	B	0, 0.116, 0.627, 1.137, 2.882 max_d=2.882 avg_d=0.627 std_dev=0.510
C5'	B	0, -0.252, 0.473, 1.198, 4.697 max_d=4.697 avg_d=0.473 std_dev=0.725
C3'	B	0, -0.139, 0.660, 1.460, 5.108 max_d=5.108 avg_d=0.660 std_dev=0.799
C2'	B	0, -0.106, 0.706, 1.518, 5.123 max_d=5.123 avg_d=0.706 std_dev=0.812
O3'	B	0, -0.105, 0.768, 1.641, 5.563 max_d=5.563 avg_d=0.768 std_dev=0.873
O5'	B	0, -0.517, 0.485, 1.488, 6.655 max_d=6.655 avg_d=0.485 std_dev=1.003
O2'	B	0, -0.232, 0.878, 1.989, 6.914 max_d=6.914 avg_d=0.878 std_dev=1.111
P	B	0, -0.945, 0.500, 1.945, 9.435 max_d=9.435 avg_d=0.500 std_dev=1.445
OP1	B	0, -1.007, 0.581, 2.170, 10.318 max_d=10.318 avg_d=0.581 std_dev=1.588
OP2	B	0, -1.038, 0.561, 2.159, 10.386 max_d=10.386 avg_d=0.561 std_dev=1.598

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.14	0.09
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.03	0.14	0.02	0.15	0.20	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.13	0.10	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.05	0.13	0.09	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.08	0.13	0.10	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.14	0.06	0.17	0.12	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.14	0.02	0.14	0.20	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.07	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.17	0.02	0.17	0.22	0.17
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.09	0.10	0.08	0.08	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.10	0.07	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.03	0.17	0.01	0.18	0.22	0.17
C8	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.17	0.03	0.16	0.21	0.16
N1	0.03	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.03	0.16	0.02	0.16	0.21	0.16
N2	0.05	0.01	0.13	0.13	0.02	0.08	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.15	0.17	0.05	0.14	0.03	0.15	0.20	0.15
N3	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.12	0.03	0.13	0.02	0.13	0.19	0.14
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.18	0.04	0.18	0.23	0.18
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.13	0.03	0.13	0.18	0.14
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.15	0.11	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.06	0.06	0.12	0.08	0.06
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.09	0.09	0.17	0.12	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.15	0.07	0.24	0.21	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.05	0.08	0.17	0.11
O5'	0.08	0.14	0.10	0.14	0.14	0.02	0.17	0.01	0.17	0.17	0.16	0.14	0.13	0.18	0.13	0.06	0.15	0.08	0.00	0.18	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.05	0.18	0.00	0.19	0.23	0.19
OP1	0.08	0.15	0.13	0.17	0.14	0.07	0.17	0.07	0.18	0.16	0.16	0.15	0.13	0.18	0.13	0.12	0.24	0.08	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.20	0.09	0.12	0.20	0.10	0.22	0.13	0.22	0.21	0.21	0.20	0.19	0.23	0.18	0.08	0.21	0.17	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.08	0.13	0.15	0.02	0.17	0.02	0.17	0.16	0.16	0.15	0.14	0.18	0.14	0.06	0.18	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.14	0.42	0.39	0.15	0.35	0.16	0.69	0.15	0.18	0.14	0.14	0.17	0.18	0.17	0.32	0.20	0.22	0.74	1.05	1.26	1.13
C2	0.11	0.12	0.36	0.33	0.11	0.21	0.13	0.45	0.15	0.12	0.13	0.12	0.19	0.13	0.11	0.40	0.21	0.12	0.38	0.66	0.90	0.70
C2'	0.15	0.13	0.42	0.40	0.13	0.36	0.13	0.70	0.13	0.16	0.13	0.12	0.14	0.15	0.15	0.32	0.21	0.22	0.75	0.99	1.24	1.11
C3'	0.16	0.15	0.42	0.43	0.15	0.37	0.15	0.70	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.15	0.16	0.32	0.24	0.24	0.88	1.20	1.39	1.29
C4	0.15	0.15	0.44	0.39	0.14	0.29	0.15	0.58	0.15	0.14	0.15	0.15	0.17	0.15	0.14	0.42	0.24	0.16	0.59	0.92	1.18	0.97
C4'	0.15	0.13	0.38	0.40	0.13	0.38	0.14	0.72	0.13	0.17	0.12	0.12	0.14	0.16	0.15	0.25	0.20	0.25	0.90	1.27	1.38	1.31
C5	0.17	0.17	0.50	0.45	0.16	0.31	0.15	0.57	0.15	0.15	0.16	0.18	0.18	0.15	0.16	0.51	0.31	0.16	0.61	0.99	1.25	1.01
C5'	0.18	0.14	0.40	0.44	0.15	0.41	0.15	0.72	0.13	0.18	0.13	0.15	0.13	0.16	0.17	0.29	0.27	0.28	0.97	1.43	1.48	1.40
C6	0.17	0.17	0.49	0.45	0.16	0.28	0.15	0.52	0.16	0.15	0.16	0.18	0.20	0.15	0.16	0.55	0.34	0.15	0.51	0.89	1.13	0.89
C8	0.20	0.17	0.52	0.48	0.17	0.37	0.16	0.67	0.16	0.18	0.16	0.18	0.17	0.16	0.18	0.48	0.31	0.21	0.77	1.20	1.42	1.21
N1	0.14	0.15	0.43	0.39	0.13	0.24	0.14	0.46	0.16	0.13	0.15	0.16	0.21	0.15	0.13	0.49	0.29	0.13	0.41	0.73	0.97	0.75
N2	0.11	0.11	0.29	0.27	0.10	0.17	0.13	0.37	0.14	0.12	0.12	0.11	0.20	0.14	0.11	0.34	0.19	0.13	0.26	0.49	0.71	0.53
N3	0.11	0.12	0.36	0.32	0.12	0.23	0.13	0.51	0.14	0.13	0.13	0.11	0.17	0.14	0.12	0.36	0.18	0.14	0.47	0.74	1.00	0.81
N7	0.20	0.18	0.54	0.50	0.18	0.35	0.16	0.63	0.16	0.17	0.16	0.20	0.17	0.15	0.18	0.54	0.35	0.19	0.71	1.15	1.38	1.15
N9	0.17	0.15	0.46	0.42	0.16	0.34	0.16	0.65	0.16	0.17	0.15	0.16	0.17	0.16	0.17	0.41	0.24	0.20	0.71	1.06	1.31	1.12
O2'	0.20	0.18	0.40	0.38	0.18	0.41	0.19	0.74	0.18	0.22	0.17	0.17	0.19	0.21	0.20	0.27	0.26	0.29	0.72	0.85	1.07	0.99
O3'	0.18	0.19	0.40	0.43	0.18	0.38	0.18	0.69	0.17	0.19	0.18	0.19	0.17	0.18	0.18	0.30	0.25	0.26	0.92	1.19	1.31	1.30
O4'	0.14	0.13	0.39	0.38	0.14	0.37	0.15	0.71	0.15	0.18	0.14	0.12	0.17	0.17	0.15	0.27	0.18	0.24	0.83	1.20	1.35	1.24
O5'	0.19	0.14	0.52	0.54	0.15	0.43	0.15	0.72	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.16	0.17	0.43	0.36	0.23	0.96	1.48	1.55	1.43
O6	0.20	0.19	0.53	0.48	0.17	0.29	0.16	0.51	0.17	0.17	0.17	0.21	0.22	0.17	0.18	0.61	0.39	0.16	0.51	0.92	1.15	0.90
OP1	0.30	0.18	0.60	0.64	0.22	0.53	0.20	0.78	0.18	0.26	0.17	0.21	0.17	0.23	0.26	0.52	0.48	0.34	1.09	1.67	1.63	1.53
OP2	0.28	0.16	0.62	0.66	0.19	0.50	0.15	0.76	0.14	0.20	0.14	0.20	0.15	0.16	0.23	0.59	0.50	0.30	1.03	1.63	1.66	1.50
P	0.23	0.13	0.56	0.59	0.16	0.48	0.14	0.75	0.13	0.18	0.13	0.16	0.13	0.15	0.19	0.49	0.42	0.27	1.03	1.60	1.62	1.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.15	0.23	0.22	0.15
C2	0.03	0.00	0.27	0.22	0.01	0.16	0.02	0.39	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.27	0.09	0.09	0.27	0.38	0.62	0.47
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.14	0.02	0.08	0.11	0.13	0.12	0.21	0.27	0.10	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.19	0.33	0.36	0.26
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.09	0.18	0.20	0.11	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.13	0.28	0.23	0.18
C4	0.01	0.01	0.14	0.11	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.08	0.05	0.09	0.10	0.27	0.14
C4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.00	0.06	0.01	0.09	0.04	0.13	0.15	0.08	0.03	0.02	0.08	0.04	0.00	0.02	0.16	0.11	0.05
C5	0.01	0.02	0.08	0.08	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.09	0.03	0.13	0.12	0.24	0.11
C5'	0.05	0.39	0.11	0.02	0.22	0.01	0.18	0.00	0.25	0.07	0.34	0.36	0.23	0.09	0.09	0.06	0.10	0.01	0.01	0.16	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01	0.09	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.04	0.10	0.14	0.31	0.19
C8	0.01	0.02	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.17	0.05	0.31	0.36	0.41	0.32
N1	0.02	0.00	0.21	0.18	0.01	0.13	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.06	0.07	0.18	0.30	0.50	0.37
N3	0.03	0.00	0.27	0.20	0.01	0.15	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.08	0.10	0.23	0.28	0.52	0.38
N6	0.02	0.02	0.10	0.11	0.01	0.08	0.01	0.23	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.17	0.06	0.05	0.11	0.13	0.27	0.15
N7	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.11	0.14	0.05	0.26	0.28	0.34	0.25
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.14	0.01	0.18	0.21	0.24	0.15
O2'	0.02	0.27	0.00	0.02	0.16	0.08	0.14	0.06	0.18	0.12	0.24	0.24	0.17	0.11	0.07	0.00	0.06	0.05	0.14	0.33	0.38	0.24
O3'	0.19	0.09	0.04	0.02	0.08	0.04	0.09	0.10	0.06	0.17	0.06	0.08	0.06	0.14	0.14	0.06	0.00	0.15	0.14	0.26	0.27	0.19
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.07	0.10	0.05	0.05	0.01	0.05	0.15	0.00	0.19	0.23	0.17	0.17
O5'	0.15	0.27	0.19	0.13	0.09	0.02	0.13	0.01	0.10	0.31	0.18	0.23	0.11	0.26	0.18	0.14	0.14	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.38	0.33	0.28	0.10	0.16	0.12	0.16	0.14	0.36	0.30	0.28	0.13	0.28	0.21	0.33	0.26	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.62	0.36	0.23	0.27	0.11	0.24	0.13	0.31	0.41	0.50	0.52	0.27	0.34	0.24	0.38	0.27	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.47	0.26	0.18	0.14	0.05	0.11	0.01	0.19	0.32	0.37	0.38	0.15	0.25	0.15	0.24	0.19	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00