Doublet Group distance statistics: 52592

back

Distances from reference structure (by RMSD)

6, 27, 13, 7, 2, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 3, 5, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.021, 0.040, 0.060, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.040 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.014, 0.040, 0.067, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.012, 0.042, 0.071, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.042 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.043, 0.080, 0.117, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.080 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.028, 0.069, 0.110, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.069 std_dev=0.041
O2'	A	0, 0.063, 0.123, 0.182, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.123 std_dev=0.060
C3'	A	0, 0.065, 0.134, 0.204, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.134 std_dev=0.069
C4'	A	0, 0.055, 0.127, 0.199, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.127 std_dev=0.072
C5'	A	0, 0.116, 0.213, 0.310, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.213 std_dev=0.097
O3'	A	0, 0.079, 0.182, 0.286, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.182 std_dev=0.104
C1'	B	0, 0.060, 0.425, 0.789, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.425 std_dev=0.364
C4	B	0, -0.003, 0.372, 0.747, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.372 std_dev=0.375
N1	B	0, -0.047, 0.352, 0.751, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.352 std_dev=0.399
C6	B	0, -0.057, 0.353, 0.764, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.353 std_dev=0.410
N9	B	0, -0.004, 0.427, 0.858, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.427 std_dev=0.431
N3	B	0, -0.050, 0.412, 0.873, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.412 std_dev=0.461
C5	B	0, -0.067, 0.402, 0.871, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.402 std_dev=0.469
C2	B	0, -0.093, 0.418, 0.929, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.418 std_dev=0.511
O4'	B	0, 0.005, 0.525, 1.045, 2.528 max_d=2.528 avg_d=0.525 std_dev=0.520
N6	B	0, -0.116, 0.410, 0.935, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.410 std_dev=0.525
C2'	B	0, -0.014, 0.531, 1.076, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.531 std_dev=0.545
C8	B	0, -0.119, 0.540, 1.200, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.540 std_dev=0.659
C3'	B	0, -0.059, 0.618, 1.295, 3.625 max_d=3.625 avg_d=0.618 std_dev=0.677
N7	B	0, -0.168, 0.540, 1.248, 2.403 max_d=2.403 avg_d=0.540 std_dev=0.708
O5'	B	0, -0.137, 0.588, 1.313, 5.204 max_d=5.204 avg_d=0.588 std_dev=0.725
C4'	B	0, -0.079, 0.646, 1.372, 3.785 max_d=3.785 avg_d=0.646 std_dev=0.726
O2'	B	0, -0.103, 0.625, 1.353, 2.380 max_d=2.380 avg_d=0.625 std_dev=0.728
O5'	A	0, -0.155, 0.650, 1.454, 2.645 max_d=2.645 avg_d=0.650 std_dev=0.804
OP1	B	0, -0.161, 0.698, 1.557, 3.730 max_d=3.730 avg_d=0.698 std_dev=0.859
C5'	B	0, -0.144, 0.760, 1.663, 4.990 max_d=4.990 avg_d=0.760 std_dev=0.903
P	B	0, -0.264, 0.692, 1.648, 6.084 max_d=6.084 avg_d=0.692 std_dev=0.956
P	A	0, -0.316, 0.735, 1.787, 3.235 max_d=3.235 avg_d=0.735 std_dev=1.052
O3'	B	0, -0.260, 0.812, 1.883, 4.290 max_d=4.290 avg_d=0.812 std_dev=1.071
OP2	A	0, -0.313, 0.817, 1.947, 3.504 max_d=3.504 avg_d=0.817 std_dev=1.130
OP1	A	0, -0.294, 0.862, 2.018, 3.595 max_d=3.595 avg_d=0.862 std_dev=1.156
OP2	B	0, -0.531, 1.047, 2.626, 8.473 max_d=8.473 avg_d=1.047 std_dev=1.578

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.24	0.02	0.24	0.11	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.48	0.01	0.45	0.33	0.35
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.06	0.39	0.13	0.19
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.09	0.05	0.09	0.09	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.30	0.10	0.52	0.15	0.29
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.52	0.01	0.44	0.28	0.35
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.22	0.25	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.64	0.01	0.54	0.41	0.49
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.09	0.31	0.36	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.66	0.00	0.58	0.49	0.53
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.64	0.03	0.50	0.27	0.44
N1	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.58	0.01	0.53	0.43	0.45
N2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.43	0.02	0.41	0.31	0.31
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.43	0.01	0.39	0.25	0.28
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.71	0.03	0.58	0.43	0.55
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.48	0.02	0.40	0.18	0.29
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.05	0.20	0.11	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.04	0.10	0.06	0.11	0.11	0.08	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.15	0.12	0.54	0.17	0.26
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.11	0.03	0.11	0.31	0.11
O5'	0.24	0.48	0.25	0.30	0.52	0.01	0.64	0.01	0.66	0.64	0.58	0.43	0.43	0.71	0.48	0.04	0.15	0.11	0.00	0.71	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.12	0.03	0.71	0.00	0.63	0.57	0.60
OP1	0.24	0.45	0.39	0.52	0.44	0.22	0.54	0.31	0.58	0.50	0.53	0.41	0.39	0.58	0.40	0.20	0.54	0.11	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.33	0.13	0.15	0.28	0.25	0.41	0.36	0.49	0.27	0.43	0.31	0.25	0.43	0.18	0.11	0.17	0.31	0.02	0.57	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.35	0.19	0.29	0.35	0.04	0.49	0.01	0.53	0.44	0.45	0.31	0.28	0.55	0.29	0.05	0.26	0.11	0.00	0.60	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.22	0.24	0.35	0.21	0.17	0.19	0.17	0.18	0.20	0.20	0.22	0.16	0.19	0.21	0.25	0.14	0.38	0.22	0.28	0.67	0.32
C2	0.30	0.44	0.15	0.25	0.32	0.20	0.27	0.19	0.32	0.20	0.42	0.40	0.25	0.18	0.27	0.39	0.11	0.42	0.17	0.43	0.59	0.21
C2'	0.20	0.25	0.24	0.25	0.17	0.22	0.12	0.21	0.11	0.12	0.18	0.24	0.14	0.11	0.16	0.21	0.17	0.41	0.15	0.33	0.49	0.20
C3'	0.16	0.17	0.30	0.26	0.12	0.21	0.10	0.20	0.10	0.10	0.11	0.17	0.15	0.11	0.12	0.19	0.17	0.39	0.15	0.30	0.48	0.20
C4	0.27	0.34	0.15	0.31	0.28	0.18	0.26	0.17	0.28	0.22	0.33	0.32	0.25	0.21	0.26	0.34	0.12	0.41	0.19	0.35	0.65	0.27
C4'	0.15	0.13	0.35	0.35	0.12	0.15	0.11	0.15	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.18	0.14	0.34	0.22	0.23	0.62	0.31
C5	0.28	0.35	0.15	0.31	0.29	0.18	0.27	0.18	0.29	0.24	0.34	0.33	0.27	0.23	0.27	0.36	0.14	0.41	0.19	0.37	0.66	0.28
C5'	0.15	0.13	0.38	0.38	0.12	0.15	0.11	0.16	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.13	0.13	0.18	0.15	0.33	0.24	0.23	0.65	0.34
C6	0.29	0.39	0.14	0.29	0.31	0.19	0.28	0.18	0.31	0.23	0.38	0.37	0.28	0.22	0.28	0.39	0.14	0.41	0.18	0.40	0.63	0.25
C8	0.26	0.25	0.20	0.36	0.25	0.18	0.24	0.18	0.24	0.24	0.24	0.25	0.24	0.24	0.25	0.30	0.16	0.39	0.23	0.31	0.70	0.33
N1	0.30	0.44	0.15	0.26	0.33	0.20	0.28	0.19	0.32	0.21	0.41	0.40	0.27	0.20	0.28	0.41	0.12	0.42	0.17	0.43	0.60	0.22
N2	0.30	0.48	0.17	0.21	0.34	0.22	0.26	0.21	0.32	0.17	0.45	0.44	0.21	0.15	0.27	0.42	0.10	0.42	0.16	0.47	0.55	0.17
N3	0.28	0.40	0.14	0.28	0.30	0.19	0.26	0.18	0.30	0.20	0.39	0.36	0.24	0.18	0.26	0.36	0.11	0.41	0.18	0.38	0.62	0.24
N7	0.27	0.29	0.18	0.34	0.27	0.18	0.26	0.18	0.27	0.25	0.29	0.29	0.27	0.25	0.26	0.33	0.16	0.40	0.22	0.34	0.69	0.32
N9	0.25	0.27	0.19	0.34	0.25	0.18	0.23	0.17	0.24	0.22	0.26	0.27	0.22	0.22	0.24	0.30	0.14	0.39	0.22	0.31	0.68	0.31
O2'	0.17	0.20	0.26	0.24	0.12	0.21	0.10	0.19	0.13	0.10	0.10	0.20	0.24	0.13	0.12	0.20	0.18	0.39	0.16	0.28	0.50	0.20
O3'	0.13	0.14	0.33	0.20	0.11	0.26	0.13	0.26	0.15	0.13	0.10	0.15	0.23	0.16	0.11	0.22	0.27	0.40	0.15	0.31	0.40	0.15
O4'	0.21	0.16	0.31	0.41	0.18	0.17	0.18	0.18	0.16	0.21	0.15	0.17	0.16	0.20	0.20	0.22	0.18	0.34	0.27	0.25	0.74	0.39
O5'	0.39	0.20	0.16	0.15	0.26	0.34	0.19	0.27	0.13	0.26	0.13	0.28	0.17	0.20	0.30	0.44	0.39	0.54	0.18	0.29	0.63	0.27
O6	0.30	0.40	0.15	0.29	0.32	0.19	0.29	0.18	0.32	0.24	0.38	0.37	0.29	0.23	0.28	0.40	0.15	0.41	0.19	0.41	0.63	0.26
OP1	0.29	0.13	0.15	0.15	0.15	0.27	0.13	0.22	0.13	0.23	0.17	0.13	0.18	0.18	0.22	0.36	0.38	0.43	0.18	0.26	0.63	0.26
OP2	0.43	0.26	0.17	0.15	0.32	0.38	0.28	0.32	0.21	0.35	0.20	0.32	0.18	0.30	0.37	0.52	0.43	0.56	0.21	0.39	0.57	0.23
P	0.46	0.21	0.18	0.16	0.32	0.40	0.28	0.33	0.19	0.39	0.15	0.30	0.16	0.32	0.39	0.54	0.46	0.59	0.21	0.38	0.54	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.28	0.00	0.15	0.27	0.19	0.16
C2	0.02	0.00	0.42	0.30	0.01	0.15	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.07	0.35	0.16	0.28	0.26	0.07
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.23	0.01	0.12	0.18	0.21	0.20	0.34	0.41	0.16	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01	0.37	0.40	0.20	0.36
C3'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.28	0.00	0.34	0.01	0.37	0.24	0.36	0.25	0.40	0.32	0.20	0.02	0.01	0.01	0.06	0.28	0.19	0.08
C4	0.01	0.01	0.23	0.28	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.18	0.12	0.32	0.30	0.08
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.06	0.24	0.08	0.15	0.10	0.21	0.08	0.23	0.02	0.00	0.01	0.26	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.12	0.34	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.09	0.08	0.18	0.36	0.49	0.18
C5'	0.06	0.21	0.18	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.26	0.14	0.21	0.12	0.24	0.06	0.06	0.17	0.01	0.01	0.33	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.21	0.37	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.16	0.19	0.34	0.51	0.19
C8	0.01	0.01	0.20	0.24	0.01	0.24	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.44	0.08	0.20	0.22	0.42	0.50	0.21
N1	0.02	0.01	0.34	0.36	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.28	0.16	0.30	0.38	0.12
N3	0.03	0.00	0.41	0.25	0.00	0.15	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.11	0.35	0.17	0.27	0.21	0.09
N6	0.02	0.01	0.16	0.40	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.18	0.11	0.25	0.35	0.66	0.28
N7	0.01	0.01	0.09	0.32	0.01	0.21	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.40	0.14	0.10	0.27	0.42	0.64	0.28
N9	0.01	0.01	0.02	0.20	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.07	0.01	0.09	0.34	0.28	0.09
O2'	0.01	0.29	0.00	0.02	0.07	0.23	0.19	0.06	0.12	0.44	0.15	0.30	0.20	0.40	0.18	0.00	0.05	0.17	0.27	0.37	0.17	0.31
O3'	0.28	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.09	0.17	0.12	0.08	0.07	0.11	0.18	0.14	0.07	0.05	0.00	0.20	0.22	0.72	0.40	0.36
O4'	0.00	0.35	0.01	0.01	0.18	0.00	0.08	0.01	0.16	0.20	0.28	0.35	0.11	0.10	0.01	0.17	0.20	0.00	0.08	0.14	0.25	0.09
O5'	0.15	0.16	0.37	0.06	0.12	0.01	0.18	0.01	0.19	0.22	0.16	0.17	0.25	0.27	0.09	0.27	0.22	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.28	0.40	0.28	0.32	0.26	0.36	0.33	0.34	0.42	0.30	0.27	0.35	0.42	0.34	0.37	0.72	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.26	0.20	0.19	0.30	0.17	0.49	0.29	0.51	0.50	0.38	0.21	0.66	0.64	0.28	0.17	0.40	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.07	0.36	0.08	0.08	0.03	0.18	0.01	0.19	0.21	0.12	0.09	0.28	0.28	0.09	0.31	0.36	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00