Doublet Group distance statistics: 52594

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 2, 5, 0, 3, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.014, 0.028, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.030 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.039 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.019, 0.043, 0.068, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.043 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.051 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.008, 0.118, 0.228, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.118 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.011, 0.152, 0.292, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.152 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.044, 0.215, 0.386, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.215 std_dev=0.171
O2'	A	0, 0.050, 0.242, 0.435, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.242 std_dev=0.193
C3'	A	0, 0.051, 0.246, 0.441, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.246 std_dev=0.195
O5'	A	0, 0.040, 0.298, 0.556, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.298 std_dev=0.258
OP2	A	0, 0.148, 0.420, 0.693, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.420 std_dev=0.272
P	A	0, 0.055, 0.342, 0.630, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.342 std_dev=0.287
O3'	A	0, 0.056, 0.362, 0.667, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.362 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.021, 0.329, 0.636, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.329 std_dev=0.307
OP1	A	0, 0.109, 0.418, 0.726, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.418 std_dev=0.309
C2	B	0, 0.191, 0.535, 0.879, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.535 std_dev=0.344
N3	B	0, 0.265, 0.612, 0.960, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.612 std_dev=0.348
N1	B	0, 0.174, 0.543, 0.912, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.543 std_dev=0.369
C4	B	0, 0.297, 0.687, 1.077, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.687 std_dev=0.390
C6	B	0, 0.220, 0.641, 1.061, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.641 std_dev=0.421
N9	B	0, 0.375, 0.797, 1.220, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.797 std_dev=0.422
C1'	B	0, 0.415, 0.840, 1.266, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.840 std_dev=0.425
C5	B	0, 0.278, 0.707, 1.135, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.707 std_dev=0.429
O2'	B	0, 0.381, 0.823, 1.265, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.823 std_dev=0.442
C2'	B	0, 0.392, 0.839, 1.286, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.839 std_dev=0.447
N6	B	0, 0.229, 0.700, 1.172, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.700 std_dev=0.472
C8	B	0, 0.386, 0.859, 1.331, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.859 std_dev=0.473
N7	B	0, 0.340, 0.821, 1.302, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.821 std_dev=0.481
O4'	B	0, 0.517, 1.005, 1.493, 2.032 max_d=2.032 avg_d=1.005 std_dev=0.488
C3'	B	0, 0.484, 1.016, 1.549, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.016 std_dev=0.532
C4'	B	0, 0.543, 1.094, 1.645, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.094 std_dev=0.551
OP2	B	0, 0.555, 1.117, 1.679, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.117 std_dev=0.562
O3'	B	0, 0.529, 1.122, 1.715, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.122 std_dev=0.593
P	B	0, 0.565, 1.158, 1.751, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.158 std_dev=0.593
C5'	B	0, 0.633, 1.250, 1.867, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.250 std_dev=0.617
O5'	B	0, 0.540, 1.158, 1.776, 2.519 max_d=2.519 avg_d=1.158 std_dev=0.618
OP1	B	0, 0.669, 1.305, 1.941, 2.804 max_d=2.804 avg_d=1.305 std_dev=0.636

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.19	0.02	0.08	0.01	0.08	0.12	0.10
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.07	0.09	0.16	0.12	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.13	0.11	0.19	0.13	0.12	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.08	0.11	0.10	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.06	0.01	0.07	0.11	0.08
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.05	0.10	0.07	0.11	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.10	0.02	0.12	0.14	0.12
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.17	0.06	0.09	0.06	0.17	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.10	0.01	0.13	0.15	0.13
C8	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.12	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.14	0.03	0.13	0.11	0.11
N1	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.15	0.02	0.08	0.01	0.10	0.14	0.11
N2	0.03	0.00	0.16	0.19	0.02	0.10	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.26	0.03	0.10	0.02	0.09	0.13	0.11
N3	0.02	0.01	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.02	0.07	0.01	0.07	0.11	0.09
N7	0.02	0.02	0.05	0.12	0.01	0.11	0.00	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.15	0.03	0.16	0.16	0.16
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.09	0.07
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.12	0.19	0.14	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.09	0.06	0.06
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.04	0.10	0.14	0.15	0.26	0.17	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.15	0.10	0.19	0.17	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.04	0.10	0.15	0.13
O5'	0.05	0.08	0.05	0.10	0.06	0.02	0.10	0.01	0.10	0.14	0.08	0.10	0.07	0.15	0.06	0.05	0.15	0.11	0.00	0.12	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.10	0.04	0.12	0.00	0.16	0.18	0.16
OP1	0.05	0.08	0.08	0.11	0.07	0.05	0.12	0.06	0.13	0.13	0.10	0.09	0.07	0.16	0.06	0.09	0.19	0.10	0.03	0.16	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.12	0.07	0.10	0.11	0.04	0.14	0.02	0.15	0.11	0.14	0.13	0.11	0.16	0.09	0.06	0.17	0.15	0.03	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.05	0.09	0.08	0.02	0.12	0.02	0.13	0.11	0.11	0.11	0.09	0.16	0.07	0.06	0.16	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.14	0.16	0.18	0.14	0.16	0.14	0.17	0.16	0.14	0.16	0.15	0.19	0.14	0.15	0.15	0.19	0.17	0.17	0.18	0.18	0.17
C2	0.10	0.11	0.11	0.11	0.08	0.10	0.08	0.11	0.11	0.07	0.07	0.12	0.19	0.10	0.08	0.11	0.11	0.11	0.12	0.13	0.19	0.14
C2'	0.11	0.06	0.12	0.13	0.06	0.10	0.07	0.10	0.11	0.07	0.12	0.07	0.16	0.07	0.08	0.12	0.15	0.12	0.07	0.07	0.15	0.10
C3'	0.15	0.11	0.15	0.15	0.11	0.14	0.11	0.14	0.13	0.12	0.14	0.12	0.16	0.11	0.13	0.15	0.17	0.17	0.09	0.08	0.18	0.13
C4	0.12	0.10	0.12	0.13	0.10	0.12	0.10	0.13	0.12	0.09	0.10	0.12	0.17	0.10	0.10	0.12	0.14	0.13	0.14	0.15	0.18	0.15
C4'	0.14	0.06	0.12	0.13	0.08	0.12	0.08	0.11	0.11	0.09	0.11	0.08	0.15	0.08	0.10	0.13	0.15	0.16	0.07	0.07	0.13	0.10
C5	0.11	0.09	0.12	0.13	0.08	0.11	0.08	0.12	0.09	0.08	0.07	0.11	0.15	0.09	0.09	0.12	0.13	0.12	0.14	0.14	0.18	0.14
C5'	0.16	0.06	0.14	0.14	0.08	0.15	0.07	0.14	0.11	0.10	0.11	0.08	0.15	0.08	0.11	0.16	0.16	0.18	0.08	0.08	0.13	0.10
C6	0.11	0.11	0.12	0.12	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.08	0.12	0.16	0.10	0.09	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14	0.20	0.14
C8	0.14	0.12	0.15	0.17	0.12	0.14	0.11	0.15	0.12	0.11	0.11	0.13	0.16	0.11	0.13	0.14	0.18	0.15	0.16	0.16	0.17	0.16
N1	0.12	0.13	0.12	0.11	0.10	0.12	0.09	0.13	0.11	0.09	0.09	0.13	0.18	0.11	0.09	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14	0.20	0.14
N2	0.12	0.16	0.12	0.11	0.09	0.11	0.09	0.12	0.12	0.08	0.10	0.15	0.22	0.11	0.09	0.13	0.11	0.12	0.12	0.13	0.20	0.14
N3	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.11	0.09	0.12	0.12	0.09	0.10	0.11	0.19	0.10	0.09	0.10	0.12	0.12	0.13	0.14	0.18	0.14
N7	0.12	0.10	0.13	0.14	0.09	0.12	0.09	0.13	0.10	0.09	0.09	0.11	0.15	0.09	0.10	0.13	0.15	0.13	0.14	0.14	0.18	0.14
N9	0.14	0.13	0.15	0.16	0.12	0.14	0.12	0.15	0.14	0.12	0.13	0.14	0.18	0.13	0.13	0.13	0.17	0.15	0.16	0.16	0.18	0.16
O2'	0.11	0.14	0.09	0.10	0.10	0.08	0.12	0.08	0.17	0.09	0.18	0.10	0.20	0.11	0.09	0.09	0.13	0.13	0.06	0.06	0.12	0.09
O3'	0.25	0.21	0.24	0.23	0.22	0.25	0.21	0.24	0.21	0.23	0.21	0.22	0.21	0.21	0.23	0.24	0.24	0.27	0.20	0.18	0.27	0.23
O4'	0.16	0.14	0.17	0.19	0.14	0.16	0.15	0.17	0.17	0.15	0.17	0.15	0.21	0.16	0.15	0.15	0.20	0.17	0.17	0.18	0.18	0.17
O5'	0.14	0.04	0.10	0.11	0.06	0.13	0.05	0.12	0.09	0.06	0.09	0.07	0.15	0.05	0.09	0.13	0.13	0.18	0.08	0.08	0.12	0.07
O6	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.11	0.11	0.10	0.13	0.16	0.12	0.11	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.21	0.15
OP1	0.10	0.09	0.12	0.14	0.06	0.10	0.09	0.10	0.13	0.07	0.13	0.06	0.18	0.08	0.07	0.14	0.18	0.13	0.07	0.08	0.14	0.10
OP2	0.12	0.05	0.10	0.10	0.06	0.11	0.05	0.11	0.08	0.06	0.07	0.08	0.13	0.05	0.08	0.12	0.13	0.15	0.08	0.07	0.13	0.07
P	0.12	0.04	0.10	0.11	0.05	0.11	0.05	0.11	0.09	0.06	0.09	0.06	0.14	0.05	0.08	0.12	0.14	0.15	0.07	0.07	0.12	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.09	0.12	0.11
C2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.04	0.08	0.08	0.13	0.09
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.13	0.07	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.11	0.06	0.08	0.08	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.17	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02	0.08	0.08	0.13	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.09	0.04	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.08	0.08	0.14	0.09
C5'	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.05	0.04	0.09	0.09	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.09	0.09	0.15	0.10
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.08	0.08	0.13	0.08
N1	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.03	0.08	0.08	0.14	0.09
N3	0.03	0.01	0.10	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.03	0.08	0.09	0.13	0.09
N6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.10	0.04	0.10	0.12	0.17	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.09	0.09	0.14	0.09
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.08	0.13	0.09
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.04	0.11	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.05	0.13	0.06	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.07	0.11	0.08	0.10	0.10	0.11	0.03	0.05	0.00	0.02	0.10	0.22	0.14	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.12	0.17	0.16
O5'	0.08	0.08	0.06	0.08	0.08	0.02	0.08	0.01	0.09	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.08	0.05	0.10	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.09	0.08	0.13	0.17	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.08	0.13	0.22	0.12	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.13	0.07	0.10	0.13	0.04	0.14	0.03	0.15	0.13	0.14	0.13	0.17	0.14	0.13	0.06	0.14	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.09	0.05	0.08	0.09	0.05	0.09	0.02	0.10	0.08	0.09	0.09	0.12	0.09	0.09	0.05	0.11	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00