Doublet Group distance statistics: 52596

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 1, 2, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.013, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.016, 0.025, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.016, 0.024, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N2	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.006, 0.036, 0.065, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.036 std_dev=0.030
O4'	A	0, -0.001, 0.164, 0.330, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.164 std_dev=0.166
C6	B	0, 0.141, 0.312, 0.483, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.312 std_dev=0.171
C2'	A	0, -0.006, 0.171, 0.347, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.171 std_dev=0.177
O2'	A	0, -0.024, 0.197, 0.417, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.197 std_dev=0.221
C4	B	0, 0.165, 0.432, 0.698, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.432 std_dev=0.266
C4'	A	0, -0.013, 0.255, 0.524, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.255 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.141, 0.415, 0.688, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.415 std_dev=0.273
C3'	A	0, -0.008, 0.274, 0.556, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.274 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.255, 0.537, 0.820, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.537 std_dev=0.282
O3'	B	0, 0.266, 0.560, 0.854, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.560 std_dev=0.294
N6	B	0, 0.106, 0.448, 0.791, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.448 std_dev=0.342
O5'	A	0, -0.007, 0.357, 0.720, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.357 std_dev=0.364
N1	B	0, 0.019, 0.391, 0.764, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.391 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.224, 0.607, 0.990, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.607 std_dev=0.383
N9	B	0, 0.175, 0.562, 0.949, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.562 std_dev=0.387
O3'	A	0, 0.008, 0.428, 0.849, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.428 std_dev=0.421
C5'	A	0, -0.012, 0.419, 0.850, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.419 std_dev=0.431
C4'	B	0, 0.280, 0.725, 1.170, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.725 std_dev=0.445
C1'	B	0, 0.188, 0.667, 1.146, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.667 std_dev=0.479
N3	B	0, 0.041, 0.563, 1.086, 2.308 max_d=2.308 avg_d=0.563 std_dev=0.522
C5'	B	0, 0.222, 0.810, 1.397, 2.422 max_d=2.422 avg_d=0.810 std_dev=0.588
C2	B	0, -0.025, 0.565, 1.155, 2.559 max_d=2.559 avg_d=0.565 std_dev=0.590
O4'	B	0, 0.179, 0.778, 1.377, 2.575 max_d=2.575 avg_d=0.778 std_dev=0.599
N7	B	0, 0.022, 0.659, 1.296, 2.615 max_d=2.615 avg_d=0.659 std_dev=0.637
C8	B	0, 0.059, 0.698, 1.336, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.698 std_dev=0.638
OP2	A	0, -0.086, 0.571, 1.228, 2.834 max_d=2.834 avg_d=0.571 std_dev=0.657
O5'	B	0, 0.179, 0.893, 1.606, 2.794 max_d=2.794 avg_d=0.893 std_dev=0.714
P	A	0, -0.166, 0.550, 1.267, 3.046 max_d=3.046 avg_d=0.550 std_dev=0.717
O2'	B	0, 0.073, 0.837, 1.601, 3.278 max_d=3.278 avg_d=0.837 std_dev=0.764
OP1	A	0, -0.289, 0.718, 1.725, 4.258 max_d=4.258 avg_d=0.718 std_dev=1.007
P	B	0, -0.169, 1.054, 2.278, 5.091 max_d=5.091 avg_d=1.054 std_dev=1.223
OP2	B	0, 0.131, 1.743, 3.356, 6.262 max_d=6.262 avg_d=1.743 std_dev=1.613
OP1	B	0, 0.041, 1.971, 3.901, 7.173 max_d=7.173 avg_d=1.971 std_dev=1.930

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.11	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.18	0.22	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.29	0.03	0.13	0.02	0.32	0.20	0.17
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.11	0.02	0.08	0.01	0.11	0.04	0.15	0.21	0.18	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.05	0.10	0.16	0.09	0.06
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.13	0.01	0.11	0.02	0.15	0.09	0.19	0.26	0.20	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.18	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.16	0.03	0.10	0.02	0.20	0.13	0.11
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.10	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.03	0.10	0.02	0.17	0.13	0.11
C5'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.11	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.15	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.19	0.03	0.13	0.00	0.23	0.18	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.10	0.03	0.10	0.14	0.13
N1	0.02	0.01	0.15	0.19	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.26	0.03	0.14	0.02	0.30	0.20	0.17
N2	0.03	0.01	0.21	0.26	0.01	0.12	0.02	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.36	0.03	0.15	0.04	0.38	0.23	0.20
N3	0.02	0.01	0.18	0.20	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.26	0.03	0.12	0.01	0.28	0.17	0.15
N7	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.10	0.04	0.11	0.14	0.12
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.07	0.03	0.12	0.09	0.07
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.10	0.05	0.08	0.04	0.11	0.02	0.15	0.21	0.16	0.02	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.10	0.18	0.07	0.06
O3'	0.01	0.29	0.02	0.01	0.16	0.02	0.13	0.03	0.19	0.09	0.26	0.36	0.26	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.10	0.18	0.26	0.12	0.13
O4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.05	0.10	0.07	0.08
O5'	0.06	0.13	0.05	0.06	0.10	0.01	0.10	0.01	0.13	0.10	0.14	0.15	0.12	0.10	0.07	0.03	0.10	0.08	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.14	0.02	0.09	0.02	0.12	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.10	0.18	0.05	0.15	0.00	0.23	0.19	0.15
OP1	0.11	0.32	0.16	0.18	0.20	0.10	0.17	0.07	0.23	0.10	0.30	0.38	0.28	0.11	0.12	0.18	0.26	0.10	0.02	0.23	0.00	0.02	0.00
OP2	0.07	0.20	0.09	0.08	0.13	0.03	0.13	0.02	0.18	0.14	0.20	0.23	0.17	0.14	0.09	0.07	0.12	0.07	0.02	0.19	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.06	0.07	0.11	0.02	0.11	0.02	0.14	0.13	0.17	0.20	0.15	0.12	0.07	0.06	0.13	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.21	0.21	0.10	0.19	0.14	0.16	0.18	0.17	0.17	0.18	0.21	0.21	0.16	0.19	0.41	0.11	0.19	0.22	0.75	1.00	0.25
C2	0.18	0.19	0.22	0.20	0.15	0.19	0.18	0.21	0.15	0.26	0.19	0.15	0.20	0.27	0.19	0.29	0.20	0.19	0.32	1.12	0.78	0.41
C2'	0.27	0.21	0.21	0.13	0.22	0.20	0.21	0.27	0.15	0.28	0.14	0.21	0.17	0.27	0.25	0.35	0.13	0.28	0.32	0.90	0.95	0.34
C3'	0.27	0.18	0.17	0.09	0.20	0.18	0.20	0.25	0.14	0.28	0.12	0.19	0.16	0.27	0.25	0.34	0.10	0.29	0.29	0.83	0.98	0.29
C4	0.15	0.23	0.21	0.14	0.15	0.13	0.15	0.15	0.15	0.17	0.20	0.19	0.20	0.19	0.14	0.37	0.14	0.13	0.22	0.88	0.93	0.29
C4'	0.27	0.16	0.19	0.12	0.20	0.17	0.19	0.22	0.17	0.23	0.16	0.19	0.22	0.22	0.23	0.40	0.15	0.27	0.26	0.69	1.04	0.28
C5	0.15	0.27	0.22	0.14	0.14	0.13	0.15	0.14	0.15	0.18	0.22	0.22	0.20	0.21	0.13	0.39	0.14	0.13	0.21	0.83	0.95	0.26
C5'	0.29	0.20	0.22	0.17	0.22	0.19	0.20	0.23	0.20	0.23	0.19	0.23	0.25	0.21	0.24	0.45	0.20	0.28	0.28	0.65	1.09	0.33
C6	0.15	0.26	0.22	0.17	0.14	0.17	0.16	0.18	0.14	0.24	0.23	0.20	0.18	0.26	0.15	0.36	0.17	0.17	0.25	0.93	0.87	0.30
C8	0.19	0.29	0.23	0.10	0.17	0.10	0.14	0.12	0.16	0.13	0.23	0.26	0.23	0.16	0.15	0.46	0.11	0.13	0.15	0.66	1.06	0.22
N1	0.17	0.22	0.22	0.20	0.14	0.20	0.18	0.21	0.14	0.27	0.21	0.16	0.17	0.29	0.19	0.32	0.20	0.21	0.31	1.06	0.80	0.37
N2	0.22	0.19	0.24	0.24	0.18	0.23	0.22	0.25	0.18	0.31	0.20	0.15	0.26	0.33	0.23	0.26	0.23	0.25	0.38	1.28	0.72	0.52
N3	0.16	0.19	0.21	0.17	0.15	0.16	0.17	0.19	0.15	0.20	0.18	0.16	0.20	0.22	0.16	0.31	0.17	0.15	0.28	1.03	0.84	0.37
N7	0.16	0.30	0.23	0.11	0.16	0.11	0.14	0.12	0.15	0.16	0.24	0.25	0.22	0.20	0.13	0.44	0.12	0.11	0.17	0.70	1.03	0.24
N9	0.18	0.25	0.22	0.11	0.17	0.12	0.15	0.14	0.16	0.14	0.21	0.23	0.22	0.16	0.15	0.41	0.12	0.14	0.19	0.76	1.00	0.24
O2'	0.29	0.26	0.21	0.16	0.22	0.25	0.25	0.33	0.16	0.35	0.18	0.22	0.23	0.35	0.29	0.32	0.16	0.32	0.39	0.95	0.94	0.41
O3'	0.31	0.25	0.17	0.12	0.23	0.24	0.26	0.32	0.17	0.38	0.18	0.23	0.21	0.37	0.31	0.29	0.13	0.36	0.37	0.92	0.96	0.38
O4'	0.26	0.27	0.24	0.18	0.23	0.18	0.21	0.22	0.23	0.19	0.24	0.27	0.29	0.20	0.22	0.47	0.19	0.23	0.26	0.66	1.08	0.32
O5'	0.26	0.19	0.20	0.13	0.19	0.15	0.17	0.18	0.17	0.19	0.16	0.22	0.24	0.19	0.21	0.45	0.15	0.23	0.22	0.63	1.13	0.31
O6	0.15	0.28	0.23	0.17	0.14	0.19	0.16	0.19	0.14	0.26	0.24	0.21	0.18	0.29	0.16	0.37	0.17	0.19	0.26	0.90	0.87	0.29
OP1	0.31	0.22	0.20	0.12	0.22	0.16	0.18	0.17	0.16	0.21	0.16	0.26	0.21	0.19	0.24	0.47	0.17	0.29	0.21	0.58	1.18	0.32
OP2	0.24	0.23	0.22	0.16	0.19	0.15	0.17	0.19	0.18	0.18	0.17	0.24	0.26	0.20	0.19	0.48	0.19	0.20	0.23	0.65	1.12	0.34
P	0.27	0.23	0.23	0.18	0.21	0.18	0.19	0.22	0.20	0.20	0.18	0.25	0.27	0.21	0.21	0.49	0.21	0.24	0.26	0.64	1.17	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.39	0.60	0.16
C2	0.03	0.00	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.17	0.03	0.27	0.64	0.93	0.29
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.06	0.08	0.06	0.12	0.15	0.07	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.18	0.32	0.73	0.19
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.09	0.16	0.10	0.12	0.10	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.16	0.45	0.71	0.27
C4	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.08	0.01	0.23	0.67	0.81	0.24
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.08	0.04	0.06	0.04	0.07	0.02	0.12	0.03	0.00	0.04	0.26	0.37	0.14
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.10	0.02	0.21	0.85	0.80	0.26
C5'	0.05	0.13	0.06	0.06	0.10	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.09	0.09	0.08	0.02	0.02	0.19	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.11	0.02	0.22	0.85	0.86	0.28
C8	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.03	0.18	0.88	0.64	0.25
N1	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.14	0.02	0.25	0.75	0.92	0.29
N3	0.03	0.00	0.15	0.12	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.16	0.03	0.26	0.58	0.88	0.27
N6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.02	0.20	0.96	0.84	0.29
N7	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.02	0.17	0.99	0.72	0.28
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.19	0.63	0.69	0.21
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.15	0.12	0.12	0.09	0.17	0.04	0.22	0.24	0.16	0.06	0.05	0.00	0.05	0.08	0.12	0.38	0.69	0.21
O3'	0.01	0.17	0.03	0.01	0.08	0.03	0.10	0.08	0.11	0.17	0.14	0.16	0.13	0.16	0.07	0.05	0.00	0.02	0.25	0.80	0.74	0.39
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.13	0.34	0.41	0.13
O5'	0.16	0.27	0.18	0.16	0.23	0.04	0.21	0.02	0.22	0.18	0.25	0.26	0.20	0.17	0.19	0.12	0.25	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.39	0.64	0.32	0.45	0.67	0.26	0.85	0.19	0.85	0.88	0.75	0.58	0.96	0.99	0.63	0.38	0.80	0.34	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.60	0.93	0.73	0.71	0.81	0.37	0.80	0.23	0.86	0.64	0.92	0.88	0.84	0.72	0.69	0.69	0.74	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.29	0.19	0.27	0.24	0.14	0.26	0.01	0.28	0.25	0.29	0.27	0.29	0.28	0.21	0.21	0.39	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00