Doublet Group distance statistics: 52597

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.021, 0.034, 0.047, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.034 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.013, 0.026, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.018, 0.043, 0.067, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.043 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.043, 0.103, 0.163, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.103 std_dev=0.060
O4'	A	0, -0.010, 0.073, 0.155, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.073 std_dev=0.082
O2'	A	0, 0.050, 0.159, 0.267, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.159 std_dev=0.108
C3'	A	0, 0.039, 0.151, 0.264, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.151 std_dev=0.113
C4'	A	0, -0.008, 0.116, 0.241, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.116 std_dev=0.125
O3'	A	0, 0.053, 0.219, 0.384, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.219 std_dev=0.165
O5'	A	0, 0.079, 0.246, 0.412, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.246 std_dev=0.167
C5'	A	0, 0.006, 0.187, 0.368, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.187 std_dev=0.181
P	A	0, 0.145, 0.328, 0.511, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.328 std_dev=0.183
OP1	A	0, 0.160, 0.372, 0.584, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.372 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.152, 0.375, 0.597, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.375 std_dev=0.222
C2	B	0, 0.117, 0.347, 0.577, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.347 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.216, 0.454, 0.691, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.454 std_dev=0.237
N3	B	0, 0.203, 0.447, 0.690, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.447 std_dev=0.244
N6	B	0, 0.277, 0.532, 0.787, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.532 std_dev=0.255
C4	B	0, 0.257, 0.525, 0.793, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.525 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.245, 0.521, 0.797, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.521 std_dev=0.276
OP2	A	0, 0.235, 0.541, 0.847, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.541 std_dev=0.306
N9	B	0, 0.342, 0.672, 1.003, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.672 std_dev=0.330
N7	B	0, 0.315, 0.647, 0.978, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.647 std_dev=0.332
C8	B	0, 0.371, 0.729, 1.087, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.729 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.403, 0.789, 1.175, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.789 std_dev=0.386
C2'	B	0, 0.465, 0.900, 1.336, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.900 std_dev=0.436
O4'	B	0, 0.446, 0.900, 1.354, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.900 std_dev=0.454
O5'	B	0, 0.511, 0.988, 1.465, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.988 std_dev=0.477
C3'	B	0, 0.448, 0.958, 1.467, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.958 std_dev=0.510
C4'	B	0, 0.463, 0.978, 1.493, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.978 std_dev=0.515
P	B	0, 0.457, 1.007, 1.557, 1.870 max_d=1.870 avg_d=1.007 std_dev=0.550
OP1	B	0, 0.502, 1.082, 1.662, 2.152 max_d=2.152 avg_d=1.082 std_dev=0.580
O3'	B	0, 0.476, 1.061, 1.646, 2.208 max_d=2.208 avg_d=1.061 std_dev=0.585
C5'	B	0, 0.470, 1.096, 1.722, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.096 std_dev=0.626
OP2	B	0, 0.526, 1.156, 1.787, 2.219 max_d=2.219 avg_d=1.156 std_dev=0.630
O2'	B	0, 0.420, 1.082, 1.745, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.082 std_dev=0.663

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.16	0.06
C2	0.04	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.04	0.05	0.03	0.10	0.23	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.09	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.07	0.09	0.19	0.06
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.10	0.05	0.10	0.10	0.08	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.11	0.11	0.10	0.21	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.06	0.02	0.10	0.21	0.11
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.08	0.02	0.00	0.02	0.06	0.07	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.07	0.01	0.12	0.22	0.13
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.04	0.07	0.03	0.01	0.01	0.08	0.07	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.12	0.02	0.07	0.01	0.14	0.23	0.15
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.07	0.03	0.10	0.18	0.11
N1	0.04	0.01	0.08	0.10	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.13	0.04	0.06	0.02	0.13	0.24	0.14
N2	0.05	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.05	0.04	0.04	0.09	0.24	0.11
N3	0.03	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.11	0.04	0.05	0.03	0.09	0.22	0.10
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.03	0.12	0.20	0.13
N9	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.06	0.02	0.08	0.19	0.09
O2'	0.02	0.14	0.01	0.03	0.08	0.08	0.08	0.07	0.10	0.03	0.13	0.17	0.12	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.08	0.10	0.12	0.19	0.08
O3'	0.02	0.13	0.03	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.12	0.06	0.13	0.14	0.11	0.08	0.05	0.06	0.00	0.02	0.12	0.14	0.13	0.23	0.08
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.08	0.03	0.06	0.13	0.06
O5'	0.05	0.05	0.06	0.11	0.06	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.04	0.05	0.07	0.06	0.08	0.12	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.07	0.11	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.10	0.14	0.03	0.08	0.00	0.17	0.24	0.17
OP1	0.07	0.10	0.09	0.10	0.10	0.07	0.12	0.07	0.14	0.10	0.13	0.09	0.09	0.12	0.08	0.12	0.13	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.23	0.19	0.21	0.21	0.14	0.22	0.11	0.23	0.18	0.24	0.24	0.22	0.20	0.19	0.19	0.23	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.06	0.07	0.11	0.03	0.13	0.02	0.15	0.11	0.14	0.11	0.10	0.13	0.09	0.08	0.08	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.11	0.41	0.25	0.11	0.08	0.11	0.14	0.14	0.11	0.14	0.11	0.18	0.11	0.12	0.49	0.27	0.13	0.28	0.24	0.45	0.17
C2	0.10	0.12	0.21	0.17	0.09	0.11	0.10	0.21	0.12	0.10	0.10	0.12	0.18	0.11	0.09	0.23	0.16	0.16	0.22	0.29	0.28	0.09
C2'	0.18	0.12	0.38	0.21	0.10	0.06	0.12	0.17	0.17	0.11	0.18	0.08	0.22	0.12	0.11	0.51	0.23	0.13	0.28	0.25	0.44	0.17
C3'	0.20	0.13	0.42	0.22	0.10	0.05	0.13	0.16	0.18	0.12	0.19	0.09	0.24	0.13	0.13	0.59	0.25	0.11	0.30	0.24	0.45	0.16
C4	0.12	0.08	0.30	0.20	0.07	0.07	0.09	0.17	0.12	0.08	0.11	0.09	0.18	0.09	0.08	0.32	0.20	0.14	0.24	0.27	0.37	0.13
C4'	0.21	0.12	0.46	0.26	0.11	0.09	0.12	0.14	0.15	0.13	0.16	0.11	0.19	0.12	0.14	0.64	0.30	0.12	0.30	0.22	0.48	0.18
C5	0.11	0.08	0.28	0.20	0.07	0.08	0.09	0.18	0.12	0.08	0.09	0.09	0.18	0.10	0.07	0.30	0.20	0.15	0.25	0.27	0.36	0.12
C5'	0.22	0.12	0.47	0.27	0.12	0.09	0.13	0.14	0.16	0.13	0.16	0.12	0.20	0.13	0.14	0.66	0.31	0.12	0.30	0.22	0.49	0.19
C6	0.10	0.09	0.23	0.18	0.08	0.09	0.10	0.20	0.12	0.09	0.09	0.10	0.18	0.11	0.08	0.25	0.18	0.16	0.24	0.28	0.31	0.11
C8	0.15	0.08	0.37	0.23	0.08	0.07	0.09	0.15	0.12	0.09	0.11	0.10	0.18	0.09	0.10	0.42	0.25	0.13	0.27	0.24	0.43	0.16
N1	0.10	0.12	0.20	0.17	0.10	0.11	0.11	0.21	0.12	0.11	0.10	0.12	0.18	0.13	0.09	0.23	0.17	0.17	0.23	0.29	0.28	0.09
N2	0.14	0.18	0.18	0.17	0.14	0.15	0.13	0.24	0.13	0.13	0.15	0.17	0.17	0.14	0.13	0.22	0.15	0.20	0.19	0.33	0.22	0.08
N3	0.10	0.08	0.26	0.18	0.07	0.08	0.09	0.18	0.12	0.08	0.10	0.09	0.18	0.10	0.07	0.28	0.18	0.15	0.23	0.28	0.33	0.11
N7	0.13	0.07	0.32	0.22	0.07	0.07	0.08	0.17	0.12	0.07	0.10	0.09	0.18	0.09	0.08	0.36	0.23	0.14	0.26	0.25	0.39	0.14
N9	0.15	0.09	0.36	0.23	0.09	0.07	0.09	0.15	0.13	0.09	0.12	0.10	0.18	0.10	0.10	0.41	0.24	0.14	0.26	0.25	0.42	0.15
O2'	0.18	0.16	0.40	0.22	0.12	0.06	0.15	0.14	0.19	0.13	0.21	0.11	0.22	0.15	0.13	0.55	0.24	0.11	0.29	0.23	0.44	0.16
O3'	0.21	0.16	0.40	0.18	0.09	0.04	0.14	0.20	0.20	0.11	0.23	0.08	0.26	0.13	0.11	0.62	0.21	0.12	0.29	0.24	0.45	0.15
O4'	0.21	0.12	0.46	0.29	0.13	0.11	0.13	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.17	0.13	0.15	0.58	0.32	0.13	0.29	0.23	0.48	0.20
O5'	0.22	0.11	0.47	0.28	0.12	0.09	0.11	0.15	0.14	0.12	0.14	0.12	0.18	0.11	0.14	0.63	0.32	0.13	0.30	0.21	0.49	0.18
O6	0.10	0.10	0.22	0.18	0.09	0.10	0.11	0.21	0.12	0.10	0.09	0.10	0.18	0.13	0.08	0.24	0.18	0.16	0.25	0.28	0.31	0.11
OP1	0.28	0.16	0.52	0.31	0.18	0.13	0.18	0.14	0.19	0.20	0.19	0.17	0.23	0.18	0.21	0.70	0.33	0.14	0.33	0.26	0.56	0.25
OP2	0.32	0.26	0.52	0.37	0.27	0.23	0.28	0.22	0.30	0.28	0.29	0.25	0.34	0.29	0.28	0.63	0.39	0.21	0.45	0.35	0.60	0.36
P	0.22	0.14	0.46	0.28	0.14	0.11	0.15	0.15	0.18	0.15	0.18	0.13	0.23	0.16	0.16	0.61	0.33	0.12	0.33	0.23	0.50	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.12	0.00	0.21	0.26	0.32	0.14
C2	0.05	0.00	0.25	0.17	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.29	0.19	0.15	0.25	0.22	0.30	0.13
C2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.14	0.01	0.09	0.09	0.14	0.12	0.21	0.25	0.10	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.10	0.25	0.22	0.11
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.14	0.01	0.17	0.03	0.18	0.21	0.18	0.16	0.20	0.20	0.13	0.01	0.01	0.02	0.20	0.32	0.19	0.13
C4	0.03	0.01	0.14	0.14	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.08	0.08	0.24	0.23	0.28	0.12
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.07	0.16	0.05	0.07	0.10	0.15	0.07	0.16	0.02	0.01	0.02	0.31	0.30	0.10
C5	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.08	0.04	0.26	0.26	0.26	0.12
C5'	0.03	0.17	0.09	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.19	0.18	0.15	0.21	0.21	0.10	0.07	0.11	0.02	0.01	0.35	0.24	0.03
C6	0.03	0.01	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.11	0.07	0.25	0.27	0.26	0.12
C8	0.02	0.01	0.12	0.21	0.01	0.16	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.25	0.15	0.11	0.29	0.29	0.27	0.16
N1	0.04	0.00	0.21	0.18	0.01	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.15	0.11	0.25	0.24	0.28	0.13
N3	0.05	0.01	0.25	0.16	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.27	0.18	0.15	0.25	0.21	0.32	0.13
N6	0.03	0.02	0.10	0.20	0.02	0.10	0.02	0.21	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.23	0.12	0.06	0.26	0.30	0.24	0.14
N7	0.03	0.01	0.08	0.20	0.01	0.15	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.26	0.14	0.07	0.30	0.29	0.25	0.15
N9	0.01	0.02	0.03	0.13	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.02	0.02	0.24	0.25	0.29	0.13
O2'	0.02	0.29	0.00	0.01	0.16	0.16	0.19	0.07	0.21	0.25	0.24	0.27	0.23	0.26	0.12	0.00	0.08	0.13	0.12	0.38	0.40	0.20
O3'	0.12	0.19	0.03	0.01	0.08	0.02	0.08	0.11	0.11	0.15	0.15	0.18	0.12	0.14	0.02	0.08	0.00	0.07	0.39	0.38	0.28	0.26
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.11	0.11	0.15	0.06	0.07	0.02	0.13	0.07	0.00	0.32	0.29	0.38	0.22
O5'	0.21	0.25	0.10	0.20	0.24	0.02	0.26	0.01	0.25	0.29	0.25	0.25	0.26	0.30	0.24	0.12	0.39	0.32	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.26	0.22	0.25	0.32	0.23	0.31	0.26	0.35	0.27	0.29	0.24	0.21	0.30	0.29	0.25	0.38	0.38	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.30	0.22	0.19	0.28	0.30	0.26	0.24	0.26	0.27	0.28	0.32	0.24	0.25	0.29	0.40	0.28	0.38	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.13	0.11	0.13	0.12	0.10	0.12	0.03	0.12	0.16	0.13	0.13	0.14	0.15	0.13	0.20	0.26	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00