Doublet Group distance statistics: 52600

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.009
O6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C2'	A	0, 0.031, 0.073, 0.116, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.073 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.043, 0.133, 0.224, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.133 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.056, 0.166, 0.276, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.166 std_dev=0.110
C3'	A	0, 0.107, 0.263, 0.419, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.263 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.072, 0.258, 0.444, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.258 std_dev=0.186
C4'	A	0, 0.151, 0.383, 0.615, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.383 std_dev=0.232
C5	B	0, 0.186, 0.440, 0.694, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.440 std_dev=0.254
C6	B	0, 0.077, 0.384, 0.690, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.384 std_dev=0.306
N6	B	0, 0.196, 0.511, 0.825, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.511 std_dev=0.315
N3	B	0, 0.249, 0.607, 0.966, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.607 std_dev=0.358
C4	B	0, 0.241, 0.602, 0.964, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.602 std_dev=0.361
N7	B	0, 0.100, 0.505, 0.909, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.505 std_dev=0.404
N1	B	0, 0.032, 0.452, 0.871, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.452 std_dev=0.419
C5'	A	0, 0.289, 0.712, 1.136, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.712 std_dev=0.424
C2	B	0, 0.003, 0.433, 0.862, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.433 std_dev=0.429
O5'	A	0, 0.364, 0.867, 1.369, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.867 std_dev=0.503
N9	B	0, 0.186, 0.805, 1.424, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.805 std_dev=0.619
C8	B	0, 0.111, 0.738, 1.365, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.738 std_dev=0.627
P	B	0, 0.286, 0.944, 1.603, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.944 std_dev=0.659
O5'	B	0, 0.266, 1.002, 1.737, 1.724 max_d=1.724 avg_d=1.002 std_dev=0.735
P	A	0, 0.534, 1.293, 2.052, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.293 std_dev=0.759
OP2	B	0, 0.381, 1.213, 2.046, 1.992 max_d=1.992 avg_d=1.213 std_dev=0.833
OP1	A	0, 0.608, 1.469, 2.330, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.469 std_dev=0.861
C1'	B	0, 0.330, 1.210, 2.090, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.210 std_dev=0.880
OP2	A	0, 0.620, 1.503, 2.386, 2.174 max_d=2.174 avg_d=1.503 std_dev=0.883
O4'	B	0, 0.427, 1.383, 2.339, 2.297 max_d=2.297 avg_d=1.383 std_dev=0.956
C5'	B	0, 0.441, 1.453, 2.465, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.453 std_dev=1.012
OP1	B	0, 0.305, 1.338, 2.371, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.338 std_dev=1.033
C3'	B	0, 0.621, 1.700, 2.778, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.700 std_dev=1.078
C2'	B	0, 0.540, 1.620, 2.700, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.620 std_dev=1.080
C4'	B	0, 0.551, 1.632, 2.713, 2.629 max_d=2.629 avg_d=1.632 std_dev=1.081
O2'	B	0, 0.777, 2.046, 3.315, 3.160 max_d=3.160 avg_d=2.046 std_dev=1.269
O3'	B	0, 1.075, 2.646, 4.217, 3.837 max_d=3.837 avg_d=2.646 std_dev=1.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.02	0.08	0.11	0.07
C2	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.15	0.01	0.17	0.23	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.07	0.03
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.08	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02
C4	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.15	0.01	0.17	0.21	0.16
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.03	0.02	0.02	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.19	0.02	0.23	0.27	0.22
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.09	0.05	0.05	0.14	0.08	0.03	0.04	0.02	0.01	0.13	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.19	0.00	0.24	0.29	0.23
C8	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.19	0.03	0.21	0.23	0.20
N1	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.17	0.01	0.21	0.27	0.20
N2	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.13	0.01	0.16	0.22	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.13	0.01	0.15	0.20	0.14
N7	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.21	0.03	0.25	0.29	0.24
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.14	0.02	0.15	0.18	0.14
O2'	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.03	0.00	0.08	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02
O3'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.09	0.05	0.09	0.06	0.08	0.04	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02
O4'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.07	0.03	0.06	0.10	0.07
O5'	0.07	0.15	0.03	0.02	0.15	0.02	0.19	0.01	0.19	0.19	0.17	0.13	0.13	0.21	0.14	0.03	0.04	0.07	0.00	0.21	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.21	0.00	0.27	0.32	0.26
OP1	0.08	0.17	0.07	0.06	0.17	0.04	0.23	0.03	0.24	0.21	0.21	0.16	0.15	0.25	0.15	0.04	0.04	0.06	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.23	0.07	0.05	0.21	0.03	0.27	0.01	0.29	0.23	0.27	0.22	0.20	0.29	0.18	0.05	0.04	0.10	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.03	0.02	0.16	0.01	0.22	0.01	0.23	0.20	0.20	0.15	0.14	0.24	0.14	0.02	0.02	0.07	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.18	0.17	0.20	0.16	0.14	0.13	0.13	0.15	0.14	0.17	0.18	0.11	0.12	0.15	0.18	0.23	0.17	0.14	0.28	0.12	0.09
C2	0.21	0.19	0.28	0.32	0.21	0.17	0.21	0.13	0.21	0.21	0.19	0.20	0.22	0.21	0.21	0.25	0.43	0.15	0.16	0.15	0.25	0.09
C2'	0.14	0.12	0.12	0.15	0.12	0.15	0.10	0.14	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.12	0.16	0.17	0.19	0.12	0.31	0.11	0.11
C3'	0.17	0.12	0.13	0.14	0.12	0.19	0.10	0.17	0.12	0.12	0.11	0.13	0.11	0.10	0.13	0.20	0.15	0.23	0.10	0.33	0.11	0.11
C4	0.19	0.19	0.23	0.26	0.19	0.12	0.18	0.09	0.20	0.18	0.19	0.19	0.19	0.18	0.19	0.21	0.34	0.15	0.12	0.25	0.15	0.09
C4'	0.19	0.16	0.14	0.14	0.14	0.21	0.10	0.19	0.10	0.11	0.13	0.17	0.06	0.09	0.14	0.23	0.14	0.24	0.09	0.33	0.12	0.12
C5	0.19	0.18	0.24	0.27	0.19	0.11	0.18	0.06	0.20	0.19	0.18	0.18	0.20	0.19	0.19	0.22	0.37	0.14	0.11	0.28	0.14	0.11
C5'	0.19	0.17	0.14	0.13	0.14	0.21	0.10	0.19	0.10	0.10	0.13	0.17	0.07	0.08	0.14	0.24	0.13	0.25	0.09	0.35	0.10	0.13
C6	0.20	0.18	0.27	0.30	0.20	0.12	0.20	0.06	0.20	0.21	0.18	0.19	0.21	0.21	0.20	0.25	0.43	0.13	0.10	0.24	0.17	0.10
C8	0.18	0.18	0.20	0.22	0.17	0.10	0.16	0.08	0.18	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.20	0.29	0.15	0.11	0.35	0.11	0.15
N1	0.21	0.18	0.29	0.33	0.20	0.15	0.20	0.09	0.20	0.21	0.18	0.19	0.21	0.22	0.21	0.26	0.46	0.14	0.12	0.18	0.22	0.09
N2	0.23	0.19	0.30	0.37	0.22	0.21	0.22	0.18	0.21	0.23	0.18	0.20	0.20	0.23	0.23	0.27	0.49	0.17	0.21	0.12	0.33	0.16
N3	0.20	0.20	0.24	0.28	0.20	0.15	0.19	0.12	0.21	0.19	0.20	0.20	0.21	0.18	0.20	0.21	0.36	0.16	0.16	0.18	0.20	0.07
N7	0.18	0.17	0.22	0.24	0.18	0.09	0.17	0.06	0.18	0.18	0.17	0.17	0.18	0.18	0.18	0.21	0.33	0.14	0.10	0.34	0.13	0.15
N9	0.18	0.19	0.20	0.23	0.18	0.12	0.16	0.09	0.18	0.16	0.18	0.18	0.16	0.16	0.17	0.19	0.29	0.16	0.13	0.29	0.12	0.11
O2'	0.17	0.10	0.13	0.14	0.11	0.19	0.08	0.19	0.06	0.10	0.08	0.12	0.02	0.07	0.12	0.20	0.14	0.23	0.12	0.27	0.14	0.10
O3'	0.22	0.13	0.18	0.17	0.15	0.25	0.12	0.24	0.12	0.15	0.12	0.15	0.12	0.13	0.16	0.27	0.17	0.28	0.10	0.33	0.13	0.12
O4'	0.17	0.19	0.16	0.18	0.16	0.16	0.12	0.15	0.13	0.12	0.16	0.18	0.07	0.10	0.15	0.19	0.20	0.19	0.14	0.28	0.12	0.09
O5'	0.13	0.13	0.12	0.16	0.11	0.14	0.10	0.13	0.12	0.11	0.11	0.13	0.14	0.12	0.11	0.16	0.18	0.19	0.14	0.32	0.06	0.10
O6	0.20	0.18	0.28	0.31	0.20	0.11	0.20	0.03	0.20	0.21	0.18	0.18	0.21	0.21	0.20	0.26	0.45	0.12	0.09	0.26	0.16	0.11
OP1	0.16	0.15	0.13	0.15	0.12	0.17	0.11	0.15	0.13	0.12	0.12	0.15	0.15	0.13	0.12	0.21	0.17	0.22	0.16	0.29	0.05	0.07
OP2	0.09	0.10	0.15	0.22	0.10	0.05	0.13	0.03	0.14	0.16	0.10	0.09	0.18	0.18	0.11	0.10	0.28	0.11	0.22	0.29	0.06	0.12
P	0.13	0.14	0.11	0.15	0.11	0.14	0.10	0.12	0.11	0.11	0.11	0.14	0.13	0.12	0.10	0.17	0.18	0.19	0.15	0.31	0.05	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.07	0.15	0.07
C2	0.03	0.00	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.07	0.05	0.27	0.31	0.13	0.17
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.06	0.12	0.03	0.03	0.09	0.11	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.23	0.09
C3'	0.03	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.17	0.18	0.13	0.07	0.20	0.19	0.11	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.29	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.05	0.18	0.17	0.12	0.06
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.02	0.02	0.05	0.05	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.05	0.15	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.05	0.17	0.14	0.15	0.02
C5'	0.03	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.03	0.07	0.06	0.07	0.03	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.07	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.17	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.22	0.06	0.22	0.20	0.12	0.08
C8	0.02	0.01	0.12	0.18	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.26	0.03	0.04	0.10	0.25	0.13
N1	0.03	0.00	0.03	0.13	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.15	0.06	0.26	0.28	0.12	0.15
N3	0.04	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.04	0.04	0.23	0.26	0.12	0.13
N6	0.01	0.02	0.09	0.20	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.28	0.06	0.21	0.17	0.15	0.06
N7	0.01	0.01	0.11	0.19	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.29	0.05	0.08	0.09	0.24	0.09
N9	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.03	0.08	0.08	0.17	0.05
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.06	0.03	0.09	0.08	0.13	0.02	0.07	0.01	0.00	0.04	0.05	0.05	0.09	0.26	0.11
O3'	0.03	0.07	0.02	0.00	0.12	0.04	0.22	0.02	0.22	0.26	0.15	0.04	0.28	0.29	0.13	0.04	0.00	0.03	0.06	0.22	0.43	0.22
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.06	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.04	0.11	0.05	0.07
O5'	0.04	0.27	0.04	0.06	0.18	0.01	0.17	0.01	0.22	0.04	0.26	0.23	0.21	0.08	0.08	0.05	0.06	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.31	0.07	0.13	0.17	0.05	0.14	0.07	0.20	0.10	0.28	0.26	0.17	0.09	0.08	0.09	0.22	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.13	0.23	0.29	0.12	0.15	0.15	0.15	0.12	0.25	0.12	0.12	0.15	0.24	0.17	0.26	0.43	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.09	0.14	0.06	0.04	0.02	0.01	0.08	0.13	0.15	0.13	0.06	0.09	0.05	0.11	0.22	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00