Doublet Group distance statistics: 52608

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 8, 20, 12, 4, 4, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.013, 0.023, 0.032, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.019, 0.033, 0.047, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.019, 0.037, 0.056, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.037 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.018, 0.038, 0.057, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.038 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.020, 0.043, 0.065, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.043 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.023, 0.047, 0.071, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.047 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.036, 0.151, 0.266, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.151 std_dev=0.115
C2'	A	0, 0.059, 0.183, 0.307, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.183 std_dev=0.124
O2'	A	0, 0.101, 0.233, 0.365, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.233 std_dev=0.132
C4	B	0, 0.223, 0.393, 0.564, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.393 std_dev=0.170
N3	B	0, 0.256, 0.453, 0.649, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.453 std_dev=0.196
C4'	A	0, 0.064, 0.264, 0.465, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.264 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.229, 0.430, 0.630, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.430 std_dev=0.201
C2	B	0, 0.384, 0.586, 0.787, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.586 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.077, 0.289, 0.500, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.289 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.175, 0.400, 0.625, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.400 std_dev=0.225
C5	B	0, 0.256, 0.493, 0.730, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.493 std_dev=0.237
O4	B	0, 0.294, 0.537, 0.780, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.537 std_dev=0.243
C1'	B	0, 0.388, 0.672, 0.955, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.672 std_dev=0.283
O3'	A	0, 0.131, 0.423, 0.715, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.423 std_dev=0.292
O2	B	0, 0.608, 0.919, 1.229, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.919 std_dev=0.311
O4'	B	0, 0.360, 0.691, 1.022, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.691 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.128, 0.462, 0.796, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.462 std_dev=0.334
C2'	B	0, 0.572, 0.937, 1.301, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.937 std_dev=0.364
C5'	B	0, 0.545, 0.953, 1.360, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.953 std_dev=0.407
C4'	B	0, 0.489, 0.899, 1.310, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.899 std_dev=0.411
C3'	B	0, 0.610, 1.024, 1.438, 1.996 max_d=1.996 avg_d=1.024 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.108, 0.550, 0.992, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.550 std_dev=0.442
O2'	B	0, 0.683, 1.132, 1.581, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.132 std_dev=0.449
O3'	B	0, 0.765, 1.299, 1.832, 2.610 max_d=2.610 avg_d=1.299 std_dev=0.533
O5'	B	0, 0.468, 1.044, 1.620, 2.467 max_d=2.467 avg_d=1.044 std_dev=0.576
P	B	0, 0.460, 1.114, 1.769, 2.703 max_d=2.703 avg_d=1.114 std_dev=0.655
OP2	B	0, 0.456, 1.143, 1.829, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.143 std_dev=0.686
OP1	B	0, 0.518, 1.217, 1.916, 2.810 max_d=2.810 avg_d=1.217 std_dev=0.699
P	A	0, 0.019, 0.753, 1.487, 4.638 max_d=4.638 avg_d=0.753 std_dev=0.734
OP1	A	0, 0.133, 0.988, 1.842, 4.434 max_d=4.434 avg_d=0.988 std_dev=0.854
OP2	A	0, -0.089, 0.945, 1.978, 7.195 max_d=7.195 avg_d=0.945 std_dev=1.033

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.02	0.16	0.24	0.13
C2	0.03	0.00	0.13	0.18	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.22	0.03	0.34	0.02	0.42	0.49	0.36
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.07	0.22	0.25	0.14
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.02	0.15	0.10	0.17	0.21	0.16	0.10	0.07	0.02	0.01	0.02	0.25	0.15	0.27	0.24	0.19
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.36	0.01	0.39	0.47	0.37
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.09	0.10	0.08	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.26	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.02	0.44	0.01	0.51	0.64	0.50
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.14	0.16	0.13	0.11	0.17	0.10	0.08	0.04	0.02	0.01	0.19	0.18	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02	0.45	0.01	0.57	0.69	0.53
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.43	0.02	0.43	0.57	0.47
N1	0.03	0.01	0.10	0.17	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.21	0.03	0.40	0.01	0.51	0.60	0.46
N2	0.04	0.00	0.15	0.21	0.01	0.10	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.26	0.05	0.31	0.02	0.41	0.46	0.32
N3	0.03	0.01	0.12	0.16	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.19	0.03	0.30	0.01	0.35	0.41	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.48	0.02	0.55	0.72	0.57
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.33	0.02	0.31	0.40	0.31
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07	0.04	0.09	0.13	0.09	0.05	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.07	0.22	0.35	0.16
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.18	0.11	0.21	0.26	0.19	0.13	0.07	0.04	0.00	0.02	0.25	0.19	0.34	0.35	0.24
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.14	0.03	0.14	0.24	0.13
O5'	0.17	0.34	0.19	0.25	0.36	0.02	0.44	0.01	0.45	0.43	0.40	0.31	0.30	0.48	0.33	0.08	0.25	0.14	0.00	0.49	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.19	0.03	0.49	0.00	0.65	0.79	0.61
OP1	0.16	0.42	0.22	0.27	0.39	0.17	0.51	0.18	0.57	0.43	0.51	0.41	0.35	0.55	0.31	0.22	0.34	0.14	0.02	0.65	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.49	0.25	0.24	0.47	0.26	0.64	0.24	0.69	0.57	0.60	0.46	0.41	0.72	0.40	0.35	0.35	0.24	0.02	0.79	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.36	0.14	0.19	0.37	0.09	0.50	0.02	0.53	0.47	0.46	0.32	0.30	0.57	0.31	0.16	0.24	0.13	0.01	0.61	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.19	0.21	0.15	0.15	0.14	0.13	0.12	0.11	0.12	0.12	0.23	0.28	0.19	0.14	0.30	0.29	0.42	0.32
C2	0.14	0.13	0.18	0.20	0.18	0.14	0.16	0.14	0.14	0.13	0.16	0.13	0.21	0.26	0.21	0.14	0.29	0.28	0.38	0.30
C2'	0.17	0.13	0.25	0.26	0.17	0.19	0.16	0.16	0.15	0.14	0.15	0.14	0.29	0.34	0.22	0.16	0.25	0.24	0.36	0.26
C3'	0.21	0.19	0.30	0.30	0.21	0.23	0.20	0.20	0.19	0.19	0.19	0.21	0.33	0.37	0.25	0.19	0.27	0.25	0.36	0.27
C4	0.13	0.10	0.18	0.20	0.16	0.13	0.14	0.13	0.12	0.11	0.12	0.12	0.21	0.26	0.20	0.13	0.32	0.31	0.43	0.34
C4'	0.15	0.12	0.22	0.23	0.17	0.17	0.16	0.14	0.13	0.12	0.14	0.13	0.26	0.30	0.21	0.14	0.29	0.28	0.42	0.31
C5	0.12	0.10	0.19	0.21	0.15	0.13	0.14	0.14	0.12	0.10	0.12	0.13	0.21	0.26	0.20	0.12	0.36	0.36	0.47	0.39
C5'	0.21	0.20	0.25	0.26	0.25	0.21	0.24	0.21	0.22	0.20	0.23	0.21	0.28	0.31	0.29	0.20	0.36	0.36	0.50	0.39
C6	0.12	0.10	0.19	0.21	0.16	0.13	0.14	0.15	0.12	0.11	0.12	0.14	0.21	0.26	0.20	0.12	0.37	0.36	0.47	0.39
C8	0.12	0.10	0.19	0.21	0.15	0.13	0.15	0.14	0.12	0.11	0.12	0.13	0.21	0.27	0.20	0.12	0.36	0.36	0.49	0.40
N1	0.12	0.11	0.18	0.20	0.17	0.13	0.15	0.13	0.12	0.11	0.15	0.12	0.21	0.25	0.21	0.12	0.32	0.31	0.42	0.34
N2	0.17	0.17	0.20	0.21	0.20	0.17	0.18	0.16	0.17	0.16	0.19	0.17	0.22	0.27	0.22	0.17	0.27	0.25	0.35	0.27
N3	0.14	0.12	0.19	0.20	0.17	0.15	0.15	0.14	0.13	0.12	0.15	0.12	0.22	0.26	0.20	0.14	0.29	0.28	0.39	0.30
N7	0.12	0.11	0.19	0.22	0.16	0.13	0.15	0.16	0.12	0.11	0.12	0.14	0.20	0.28	0.20	0.12	0.38	0.39	0.51	0.42
N9	0.13	0.10	0.18	0.21	0.15	0.13	0.14	0.13	0.12	0.11	0.12	0.12	0.21	0.27	0.19	0.13	0.32	0.32	0.45	0.35
O2'	0.21	0.17	0.25	0.26	0.20	0.23	0.20	0.20	0.19	0.19	0.18	0.17	0.29	0.33	0.23	0.23	0.28	0.27	0.38	0.29
O3'	0.27	0.24	0.35	0.35	0.26	0.29	0.26	0.25	0.24	0.24	0.25	0.26	0.38	0.41	0.30	0.25	0.27	0.25	0.34	0.25
O4'	0.13	0.10	0.18	0.20	0.15	0.14	0.14	0.13	0.11	0.11	0.12	0.12	0.23	0.26	0.19	0.13	0.32	0.32	0.46	0.35
O5'	0.43	0.47	0.40	0.41	0.54	0.42	0.53	0.44	0.49	0.46	0.51	0.45	0.40	0.41	0.58	0.44	0.50	0.51	0.61	0.53
O6	0.14	0.13	0.21	0.23	0.16	0.15	0.15	0.18	0.13	0.12	0.12	0.17	0.21	0.27	0.20	0.13	0.41	0.41	0.51	0.44
OP1	0.60	0.64	0.55	0.57	0.75	0.59	0.74	0.63	0.69	0.64	0.69	0.59	0.53	0.55	0.81	0.63	0.73	0.75	0.85	0.78
OP2	0.68	0.74	0.63	0.65	0.90	0.67	0.88	0.72	0.81	0.74	0.82	0.67	0.60	0.62	0.98	0.71	0.81	0.83	0.95	0.86
P	0.50	0.56	0.47	0.49	0.69	0.50	0.68	0.54	0.61	0.56	0.63	0.51	0.45	0.48	0.76	0.53	0.61	0.64	0.76	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.15	0.18	0.13	0.13
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.03	0.34	0.32	0.35	0.33
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.06	0.13	0.00	0.03	0.06	0.01	0.21	0.23	0.17	0.18
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.11	0.15	0.02	0.01	0.10	0.01	0.29	0.29	0.17	0.24
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.00	0.04	0.50	0.51	0.57	0.53
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.06	0.06	0.03	0.08	0.00	0.02	0.16	0.19	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.01	0.05	0.53	0.52	0.55	0.55
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.15	0.01	0.16	0.00	0.13	0.09	0.13	0.09	0.06	0.05	0.17	0.01	0.01	0.13	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.01	0.04	0.46	0.41	0.38	0.43
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.33	0.30	0.28	0.30
N3	0.02	0.00	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.03	0.43	0.42	0.48	0.44
O2	0.04	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.17	0.01	0.05	0.26	0.25	0.30	0.26
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.06	0.10	0.00	0.12	0.06	0.05	0.07	0.19	0.13	0.10
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.14	0.03	0.16	0.05	0.15	0.07	0.13	0.17	0.12	0.00	0.16	0.02	0.26	0.31	0.23	0.25
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.05	0.53	0.57	0.65	0.59
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.05	0.00	0.07	0.15	0.18	0.10
O5'	0.15	0.34	0.21	0.29	0.50	0.02	0.53	0.01	0.46	0.33	0.43	0.26	0.07	0.26	0.53	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.32	0.23	0.29	0.51	0.16	0.52	0.13	0.41	0.30	0.42	0.25	0.19	0.31	0.57	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.35	0.17	0.17	0.57	0.19	0.55	0.29	0.38	0.28	0.48	0.30	0.13	0.23	0.65	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.33	0.18	0.24	0.53	0.06	0.55	0.02	0.43	0.30	0.44	0.26	0.10	0.25	0.59	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00