Doublet Group distance statistics: 52610

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 17, 8, 7, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.021, 0.042, 0.062, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.042 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.017, 0.039, 0.060, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.013, 0.037, 0.061, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.020, 0.050, 0.080, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.050 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.015, 0.047, 0.078, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.047 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.018, 0.058, 0.097, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.058 std_dev=0.039
C2	B	0, 0.181, 0.296, 0.410, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.296 std_dev=0.114
N1	B	0, 0.147, 0.289, 0.431, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.289 std_dev=0.142
C2'	A	0, 0.071, 0.232, 0.394, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.232 std_dev=0.161
O4'	A	0, 0.031, 0.196, 0.361, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.196 std_dev=0.165
C6	B	0, 0.150, 0.339, 0.528, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.339 std_dev=0.189
O2'	A	0, 0.125, 0.318, 0.511, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.318 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.167, 0.366, 0.565, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.366 std_dev=0.199
O2	B	0, 0.196, 0.404, 0.612, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.404 std_dev=0.208
C1'	B	0, 0.256, 0.494, 0.732, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.494 std_dev=0.238
C4'	A	0, 0.073, 0.318, 0.564, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.318 std_dev=0.245
C3'	A	0, 0.092, 0.353, 0.615, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.353 std_dev=0.262
C4	B	0, 0.203, 0.480, 0.756, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.480 std_dev=0.277
C5	B	0, 0.154, 0.435, 0.715, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.435 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.340, 0.658, 0.976, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.658 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.339, 0.681, 1.024, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.681 std_dev=0.342
O3'	A	0, 0.151, 0.525, 0.899, 2.226 max_d=2.226 avg_d=0.525 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.336, 0.722, 1.109, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.722 std_dev=0.387
O4	B	0, 0.275, 0.677, 1.079, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.677 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.416, 0.858, 1.301, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.858 std_dev=0.443
C5'	A	0, 0.118, 0.561, 1.004, 2.631 max_d=2.631 avg_d=0.561 std_dev=0.443
C4'	B	0, 0.409, 0.862, 1.315, 1.930 max_d=1.930 avg_d=0.862 std_dev=0.453
O2'	B	0, 0.408, 0.861, 1.314, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.861 std_dev=0.453
P	B	0, 0.403, 0.864, 1.326, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.864 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.466, 0.962, 1.458, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.962 std_dev=0.496
OP2	B	0, 0.294, 0.831, 1.367, 3.452 max_d=3.452 avg_d=0.831 std_dev=0.536
OP1	B	0, 0.500, 1.049, 1.598, 2.517 max_d=2.517 avg_d=1.049 std_dev=0.549
O3'	B	0, 0.565, 1.209, 1.852, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.209 std_dev=0.643
O5'	A	0, 0.111, 0.767, 1.424, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.767 std_dev=0.656
P	A	0, 0.337, 1.057, 1.777, 2.933 max_d=2.933 avg_d=1.057 std_dev=0.720
OP2	A	0, 0.360, 1.244, 2.128, 3.543 max_d=3.543 avg_d=1.244 std_dev=0.884
OP1	A	0, 0.440, 1.385, 2.331, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.385 std_dev=0.946

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.22	0.02	0.49	0.26	0.22
C2	0.03	0.00	0.16	0.22	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.26	0.03	0.44	0.02	0.75	0.54	0.45
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.08	0.12	0.20	0.16	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.07	0.43	0.22	0.19
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.12	0.00	0.10	0.02	0.13	0.14	0.18	0.26	0.20	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.33	0.13	0.42	0.23	0.25
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.46	0.01	0.73	0.50	0.44
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.10	0.13	0.10	0.09	0.05	0.07	0.03	0.00	0.03	0.09	0.31	0.26	0.10
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.57	0.01	0.84	0.64	0.56
C5'	0.04	0.19	0.02	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.21	0.18	0.20	0.20	0.17	0.20	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.22	0.25	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.59	0.00	0.89	0.71	0.61
C8	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.16	0.04	0.57	0.02	0.76	0.51	0.50
N1	0.03	0.01	0.12	0.18	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.22	0.03	0.52	0.02	0.84	0.65	0.55
N2	0.04	0.01	0.20	0.26	0.01	0.13	0.01	0.20	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.33	0.04	0.40	0.03	0.73	0.52	0.42
N3	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.23	0.03	0.39	0.01	0.69	0.46	0.39
N7	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.04	0.63	0.02	0.87	0.68	0.61
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.43	0.01	0.66	0.40	0.38
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.07	0.06	0.07	0.09	0.05	0.13	0.19	0.14	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.10	0.08	0.35	0.19	0.09
O3'	0.03	0.26	0.02	0.01	0.13	0.03	0.13	0.05	0.17	0.16	0.22	0.33	0.23	0.16	0.07	0.05	0.00	0.03	0.29	0.17	0.45	0.32	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.15	0.03	0.45	0.34	0.24
O5'	0.22	0.44	0.26	0.33	0.46	0.03	0.57	0.01	0.59	0.57	0.52	0.40	0.39	0.63	0.43	0.10	0.29	0.15	0.00	0.64	0.04	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.17	0.03	0.64	0.00	0.95	0.80	0.67
OP1	0.49	0.75	0.43	0.42	0.73	0.31	0.84	0.25	0.89	0.76	0.84	0.73	0.69	0.87	0.66	0.35	0.45	0.45	0.04	0.95	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.54	0.22	0.23	0.50	0.26	0.64	0.35	0.71	0.51	0.65	0.52	0.46	0.68	0.40	0.19	0.32	0.34	0.02	0.80	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.45	0.19	0.25	0.44	0.10	0.56	0.02	0.61	0.50	0.55	0.42	0.39	0.61	0.38	0.09	0.28	0.24	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.14	0.32	0.32	0.20	0.23	0.18	0.19	0.15	0.15	0.16	0.17	0.37	0.42	0.26	0.17	0.20	0.23	0.36	0.24
C2	0.21	0.17	0.31	0.32	0.21	0.24	0.18	0.21	0.16	0.16	0.19	0.18	0.36	0.39	0.25	0.20	0.21	0.22	0.32	0.23
C2'	0.26	0.19	0.38	0.38	0.19	0.29	0.18	0.26	0.18	0.20	0.17	0.24	0.44	0.48	0.23	0.24	0.25	0.26	0.36	0.25
C3'	0.30	0.23	0.41	0.40	0.20	0.32	0.20	0.28	0.21	0.24	0.19	0.30	0.48	0.49	0.23	0.27	0.27	0.27	0.37	0.26
C4	0.19	0.15	0.30	0.31	0.21	0.22	0.18	0.18	0.15	0.15	0.17	0.18	0.35	0.39	0.26	0.16	0.20	0.22	0.36	0.24
C4'	0.24	0.19	0.35	0.34	0.20	0.26	0.20	0.22	0.17	0.19	0.17	0.23	0.40	0.43	0.25	0.21	0.22	0.24	0.37	0.25
C5	0.17	0.14	0.29	0.29	0.20	0.19	0.19	0.17	0.15	0.14	0.16	0.18	0.32	0.37	0.26	0.14	0.20	0.23	0.39	0.26
C5'	0.31	0.28	0.38	0.37	0.29	0.32	0.29	0.29	0.27	0.28	0.27	0.32	0.42	0.44	0.33	0.30	0.30	0.31	0.42	0.32
C6	0.17	0.14	0.28	0.28	0.21	0.19	0.18	0.16	0.15	0.14	0.17	0.18	0.30	0.34	0.26	0.14	0.20	0.23	0.38	0.25
C8	0.17	0.14	0.29	0.30	0.20	0.19	0.19	0.16	0.15	0.14	0.15	0.18	0.33	0.39	0.26	0.14	0.20	0.24	0.41	0.27
N1	0.19	0.15	0.29	0.29	0.21	0.21	0.18	0.18	0.15	0.15	0.19	0.18	0.32	0.35	0.25	0.17	0.20	0.21	0.34	0.23
N2	0.23	0.18	0.33	0.34	0.21	0.28	0.19	0.26	0.18	0.18	0.21	0.20	0.38	0.42	0.24	0.24	0.23	0.25	0.30	0.24
N3	0.20	0.16	0.32	0.32	0.21	0.24	0.18	0.21	0.16	0.16	0.19	0.18	0.37	0.41	0.26	0.19	0.21	0.22	0.33	0.23
N7	0.16	0.14	0.28	0.29	0.20	0.18	0.19	0.16	0.15	0.14	0.15	0.18	0.31	0.37	0.26	0.13	0.21	0.25	0.42	0.28
N9	0.18	0.15	0.31	0.31	0.21	0.21	0.19	0.18	0.15	0.15	0.17	0.18	0.35	0.40	0.26	0.16	0.20	0.23	0.38	0.25
O2'	0.28	0.20	0.40	0.40	0.20	0.32	0.19	0.29	0.19	0.21	0.19	0.24	0.46	0.51	0.24	0.27	0.28	0.29	0.37	0.28
O3'	0.36	0.28	0.47	0.46	0.23	0.38	0.24	0.34	0.26	0.29	0.22	0.34	0.54	0.54	0.25	0.33	0.32	0.30	0.37	0.29
O4'	0.19	0.15	0.31	0.32	0.22	0.22	0.20	0.19	0.16	0.15	0.17	0.18	0.37	0.42	0.28	0.17	0.20	0.23	0.38	0.25
O5'	0.57	0.57	0.56	0.57	0.63	0.57	0.64	0.58	0.61	0.58	0.60	0.56	0.55	0.59	0.67	0.58	0.62	0.63	0.76	0.68
O6	0.16	0.14	0.26	0.27	0.20	0.17	0.19	0.16	0.15	0.14	0.15	0.19	0.28	0.32	0.26	0.13	0.21	0.25	0.41	0.28
OP1	0.94	0.94	0.95	0.95	0.97	0.94	0.98	0.96	0.96	0.95	0.95	0.94	0.94	0.97	0.98	0.95	0.99	1.01	1.11	1.03
OP2	0.80	0.81	0.75	0.78	0.92	0.81	0.93	0.86	0.89	0.84	0.86	0.77	0.73	0.76	0.96	0.85	0.91	0.94	1.10	0.99
P	0.65	0.66	0.63	0.65	0.73	0.65	0.73	0.68	0.70	0.67	0.68	0.64	0.62	0.66	0.76	0.67	0.72	0.75	0.89	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.08	0.15	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.04	0.14	0.15	0.28	0.18
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.04	0.08	0.15	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.13	0.12	0.08
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.13	0.01	0.14	0.02	0.14	0.07	0.12	0.14	0.02	0.01	0.15	0.02	0.08	0.16	0.12	0.10
C4	0.04	0.02	0.07	0.13	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.17	0.01	0.06	0.19	0.24	0.41	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.09	0.00	0.02	0.08	0.05	0.03
C5	0.03	0.02	0.08	0.14	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.18	0.02	0.07	0.20	0.24	0.41	0.27
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.06	0.07	0.05	0.14	0.02	0.01	0.08	0.05	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.02	0.07	0.18	0.18	0.31	0.21
N1	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.03	0.13	0.13	0.25	0.16
N3	0.03	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.01	0.05	0.16	0.19	0.35	0.22
O2	0.03	0.01	0.15	0.14	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.18	0.03	0.06	0.12	0.12	0.25	0.16
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.03	0.08	0.15	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.13	0.09	0.06
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.17	0.03	0.18	0.05	0.16	0.08	0.15	0.18	0.06	0.00	0.19	0.03	0.12	0.23	0.22	0.15
O4	0.04	0.02	0.08	0.15	0.01	0.09	0.02	0.14	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.19	0.00	0.07	0.20	0.27	0.45	0.29
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.07	0.00	0.08	0.09	0.13	0.10
O5'	0.08	0.14	0.07	0.08	0.19	0.02	0.20	0.01	0.18	0.13	0.16	0.12	0.06	0.12	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.15	0.13	0.16	0.24	0.08	0.24	0.08	0.18	0.13	0.19	0.12	0.13	0.23	0.27	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.28	0.12	0.12	0.41	0.05	0.41	0.05	0.31	0.25	0.35	0.25	0.09	0.22	0.45	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.08	0.10	0.26	0.03	0.27	0.02	0.21	0.16	0.22	0.16	0.06	0.15	0.29	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00