Doublet Group distance statistics: 52614

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 2, 4, 5, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.017, 0.024, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.022, 0.035, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.031 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.019, 0.040, 0.060, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.040 std_dev=0.020
C5	B	0, 0.279, 0.454, 0.629, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.454 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.248, 0.424, 0.601, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.424 std_dev=0.177
N3	B	0, 0.396, 0.593, 0.791, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.593 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.258, 0.464, 0.670, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.464 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.360, 0.570, 0.780, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.570 std_dev=0.210
O2	B	0, 0.352, 0.583, 0.815, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.583 std_dev=0.232
C6	B	0, 0.244, 0.505, 0.765, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.505 std_dev=0.261
O4	B	0, 0.550, 0.865, 1.180, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.865 std_dev=0.315
C2'	A	0, 0.075, 0.402, 0.728, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.402 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.464, 0.792, 1.120, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.792 std_dev=0.328
O4'	A	0, 0.052, 0.389, 0.727, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.389 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.360, 0.714, 1.068, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.714 std_dev=0.354
O2'	A	0, 0.000, 0.407, 0.813, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.407 std_dev=0.407
C4'	B	0, 0.439, 0.853, 1.266, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.853 std_dev=0.414
C3'	B	0, 0.593, 1.018, 1.444, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.018 std_dev=0.425
O5'	B	0, 0.409, 0.845, 1.282, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.845 std_dev=0.437
OP2	B	0, 0.371, 0.869, 1.367, 2.409 max_d=2.409 avg_d=0.869 std_dev=0.498
P	B	0, 0.408, 0.911, 1.415, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.911 std_dev=0.504
C3'	A	0, 0.120, 0.644, 1.168, 2.522 max_d=2.522 avg_d=0.644 std_dev=0.524
C4'	A	0, 0.093, 0.622, 1.151, 2.538 max_d=2.538 avg_d=0.622 std_dev=0.529
O5'	A	0, 0.240, 0.804, 1.369, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.804 std_dev=0.565
O3'	B	0, 0.581, 1.198, 1.815, 2.759 max_d=2.759 avg_d=1.198 std_dev=0.617
OP1	B	0, 0.479, 1.146, 1.813, 3.376 max_d=3.376 avg_d=1.146 std_dev=0.667
C2'	B	0, 0.678, 1.347, 2.016, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.347 std_dev=0.669
C5'	B	0, 0.544, 1.215, 1.885, 3.015 max_d=3.015 avg_d=1.215 std_dev=0.671
O3'	A	0, 0.305, 0.977, 1.649, 3.337 max_d=3.337 avg_d=0.977 std_dev=0.672
C5'	A	0, 0.347, 1.055, 1.764, 3.490 max_d=3.490 avg_d=1.055 std_dev=0.709
P	A	0, 0.471, 1.336, 2.201, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.336 std_dev=0.865
OP2	A	0, 0.714, 1.659, 2.604, 3.431 max_d=3.431 avg_d=1.659 std_dev=0.945
OP1	A	0, 0.649, 1.623, 2.598, 4.551 max_d=4.551 avg_d=1.623 std_dev=0.975
O2'	B	0, 0.877, 2.115, 3.353, 3.726 max_d=3.726 avg_d=2.115 std_dev=1.238

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.16	0.03	0.15	0.18	0.13
C2	0.02	0.00	0.24	0.28	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.24	0.10	0.35	0.01	0.36	0.42	0.37
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.10	0.12	0.10	0.19	0.29	0.24	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.11	0.24	0.28	0.23
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.20	0.00	0.21	0.02	0.25	0.17	0.27	0.30	0.25	0.19	0.12	0.02	0.01	0.02	0.17	0.26	0.22	0.14	0.11
C4	0.01	0.01	0.13	0.20	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.05	0.33	0.02	0.29	0.30	0.30
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.10	0.10	0.11	0.12	0.09	0.10	0.06	0.16	0.02	0.00	0.01	0.12	0.11	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.21	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.11	0.03	0.38	0.01	0.34	0.35	0.36
C5'	0.05	0.19	0.10	0.02	0.15	0.00	0.18	0.00	0.20	0.14	0.20	0.20	0.16	0.17	0.11	0.07	0.11	0.01	0.01	0.21	0.14	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.25	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.04	0.41	0.01	0.38	0.44	0.41
C8	0.01	0.01	0.10	0.17	0.00	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.13	0.07	0.32	0.02	0.25	0.21	0.25
N1	0.02	0.00	0.19	0.27	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.20	0.07	0.39	0.01	0.39	0.47	0.41
N2	0.03	0.01	0.29	0.30	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.31	0.13	0.35	0.01	0.37	0.45	0.37
N3	0.02	0.00	0.24	0.25	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.22	0.10	0.31	0.01	0.31	0.35	0.31
N7	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.14	0.05	0.37	0.02	0.32	0.29	0.34
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.27	0.02	0.22	0.20	0.21
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.16	0.11	0.07	0.10	0.17	0.10	0.18	0.12	0.17	0.09	0.00	0.05	0.12	0.14	0.12	0.17	0.29	0.16
O3'	0.14	0.24	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.11	0.15	0.13	0.20	0.31	0.22	0.14	0.03	0.05	0.00	0.11	0.19	0.17	0.34	0.22	0.20
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.07	0.13	0.10	0.05	0.01	0.12	0.11	0.00	0.07	0.03	0.09	0.23	0.09
O5'	0.16	0.35	0.24	0.17	0.33	0.01	0.38	0.01	0.41	0.32	0.39	0.35	0.31	0.37	0.27	0.14	0.19	0.07	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.11	0.26	0.02	0.12	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.17	0.03	0.42	0.00	0.41	0.47	0.45
OP1	0.15	0.36	0.24	0.22	0.29	0.11	0.34	0.14	0.38	0.25	0.39	0.37	0.31	0.32	0.22	0.17	0.34	0.09	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.42	0.28	0.14	0.30	0.18	0.35	0.21	0.44	0.21	0.47	0.45	0.35	0.29	0.20	0.29	0.22	0.23	0.01	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.37	0.23	0.11	0.30	0.03	0.36	0.01	0.41	0.25	0.41	0.37	0.31	0.34	0.21	0.16	0.20	0.09	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.18	0.64	0.48	0.19	0.22	0.19	0.26	0.20	0.20	0.17	0.18	0.38	0.34	0.21	0.15	0.25	0.26	0.34	0.24
C2	0.23	0.16	0.64	0.40	0.14	0.16	0.16	0.18	0.18	0.19	0.13	0.16	0.48	0.37	0.14	0.15	0.22	0.21	0.27	0.20
C2'	0.33	0.23	0.60	0.35	0.19	0.24	0.20	0.24	0.23	0.26	0.19	0.26	0.48	0.40	0.20	0.33	0.34	0.29	0.25	0.26
C3'	0.34	0.27	0.55	0.36	0.23	0.27	0.24	0.29	0.27	0.29	0.24	0.30	0.43	0.45	0.22	0.40	0.35	0.30	0.27	0.30
C4	0.21	0.17	0.59	0.45	0.18	0.20	0.18	0.23	0.18	0.19	0.17	0.17	0.32	0.30	0.19	0.14	0.25	0.25	0.32	0.24
C4'	0.22	0.17	0.63	0.53	0.17	0.26	0.17	0.34	0.17	0.18	0.16	0.19	0.39	0.46	0.19	0.21	0.20	0.22	0.34	0.22
C5	0.19	0.17	0.52	0.46	0.19	0.20	0.18	0.25	0.18	0.18	0.18	0.18	0.20	0.25	0.21	0.14	0.28	0.27	0.34	0.26
C5'	0.24	0.22	0.59	0.56	0.23	0.33	0.23	0.43	0.22	0.22	0.22	0.23	0.34	0.52	0.26	0.29	0.21	0.26	0.38	0.26
C6	0.19	0.17	0.49	0.44	0.17	0.19	0.17	0.24	0.18	0.18	0.17	0.17	0.18	0.23	0.18	0.14	0.28	0.26	0.32	0.26
C8	0.19	0.17	0.53	0.49	0.20	0.22	0.19	0.27	0.18	0.18	0.18	0.17	0.18	0.26	0.23	0.14	0.29	0.29	0.37	0.28
N1	0.21	0.16	0.57	0.41	0.14	0.17	0.16	0.20	0.18	0.19	0.14	0.17	0.33	0.30	0.14	0.14	0.25	0.23	0.28	0.22
N2	0.25	0.14	0.69	0.36	0.12	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.11	0.14	0.65	0.46	0.11	0.18	0.20	0.20	0.23	0.17
N3	0.23	0.16	0.65	0.43	0.16	0.18	0.17	0.21	0.19	0.19	0.15	0.16	0.45	0.36	0.17	0.15	0.23	0.22	0.29	0.21
N7	0.18	0.17	0.48	0.48	0.20	0.22	0.19	0.27	0.18	0.18	0.18	0.17	0.13	0.24	0.23	0.14	0.30	0.29	0.37	0.29
N9	0.21	0.17	0.59	0.48	0.19	0.21	0.19	0.25	0.19	0.19	0.17	0.18	0.29	0.30	0.21	0.14	0.26	0.26	0.34	0.25
O2'	0.33	0.25	0.71	0.42	0.26	0.25	0.26	0.26	0.27	0.28	0.24	0.25	0.59	0.39	0.30	0.26	0.27	0.26	0.27	0.21
O3'	0.34	0.26	0.64	0.48	0.21	0.35	0.22	0.39	0.25	0.28	0.21	0.29	0.58	0.63	0.21	0.39	0.28	0.26	0.26	0.25
O4'	0.26	0.23	0.70	0.64	0.22	0.36	0.23	0.43	0.24	0.24	0.22	0.24	0.41	0.49	0.23	0.19	0.28	0.33	0.44	0.32
O5'	0.30	0.31	0.54	0.57	0.35	0.40	0.34	0.45	0.32	0.31	0.33	0.30	0.38	0.64	0.37	0.40	0.52	0.55	0.63	0.56
O6	0.17	0.17	0.39	0.43	0.18	0.21	0.18	0.26	0.18	0.18	0.18	0.16	0.14	0.19	0.19	0.15	0.30	0.28	0.34	0.28
OP1	0.34	0.35	0.56	0.63	0.39	0.48	0.40	0.57	0.38	0.35	0.36	0.33	0.40	0.70	0.41	0.46	0.52	0.57	0.63	0.57
OP2	0.42	0.41	0.46	0.52	0.42	0.48	0.43	0.53	0.43	0.42	0.41	0.41	0.40	0.60	0.42	0.56	0.57	0.56	0.58	0.58
P	0.36	0.38	0.54	0.61	0.42	0.48	0.43	0.56	0.40	0.38	0.40	0.36	0.40	0.66	0.45	0.49	0.51	0.56	0.63	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.35	0.02	0.00	0.31	0.30	0.34	0.27
C2	0.02	0.00	0.20	0.25	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.21	0.01	0.11	0.37	0.33	0.33	0.32
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.04	0.01	0.14	0.22	0.18	0.02	0.14	0.35	0.00	0.04	0.05	0.01	0.57	0.62	0.67	0.59
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.39	0.00	0.42	0.01	0.38	0.23	0.32	0.23	0.02	0.01	0.42	0.03	0.18	0.30	0.09	0.14
C4	0.01	0.01	0.04	0.39	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.15	0.00	0.03	0.48	0.42	0.41	0.42
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.20	0.08	0.08	0.08	0.32	0.02	0.15	0.00	0.01	0.13	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.14	0.42	0.00	0.20	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.42	0.30	0.01	0.08	0.52	0.44	0.42	0.44
C5'	0.09	0.12	0.22	0.01	0.17	0.01	0.20	0.00	0.18	0.10	0.14	0.14	0.10	0.24	0.18	0.02	0.01	0.21	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.38	0.01	0.20	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.36	0.25	0.01	0.11	0.48	0.39	0.35	0.38
N1	0.01	0.01	0.02	0.23	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.11	0.01	0.02	0.38	0.33	0.33	0.31
N3	0.02	0.00	0.14	0.32	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.09	0.01	0.08	0.42	0.37	0.37	0.37
O2	0.03	0.01	0.35	0.23	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.43	0.01	0.17	0.32	0.30	0.32	0.29
O2'	0.03	0.17	0.00	0.02	0.37	0.32	0.42	0.10	0.36	0.20	0.26	0.21	0.00	0.07	0.40	0.22	0.38	0.45	0.71	0.45
O3'	0.35	0.21	0.04	0.01	0.15	0.02	0.30	0.24	0.25	0.11	0.09	0.43	0.07	0.00	0.20	0.24	0.30	0.47	0.35	0.34
O4	0.02	0.01	0.05	0.42	0.00	0.15	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.40	0.20	0.00	0.04	0.50	0.45	0.46	0.46
O4'	0.00	0.11	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.02	0.11	0.02	0.08	0.17	0.22	0.24	0.04	0.00	0.19	0.19	0.29	0.18
O5'	0.31	0.37	0.57	0.18	0.48	0.01	0.52	0.01	0.48	0.38	0.42	0.32	0.38	0.30	0.50	0.19	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.30	0.33	0.62	0.30	0.42	0.13	0.44	0.21	0.39	0.33	0.37	0.30	0.45	0.47	0.45	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.33	0.67	0.09	0.41	0.22	0.42	0.27	0.35	0.33	0.37	0.32	0.71	0.35	0.46	0.29	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.32	0.59	0.14	0.42	0.05	0.44	0.01	0.38	0.31	0.37	0.29	0.45	0.34	0.46	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00