Doublet Group distance statistics: 52615

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 4, 5, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.014, 0.034, 0.055, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.056, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C4	B	0, 0.184, 0.327, 0.470, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.327 std_dev=0.143
N3	B	0, 0.138, 0.283, 0.429, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.283 std_dev=0.146
O2'	A	0, 0.143, 0.299, 0.454, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.299 std_dev=0.155
C2'	A	0, 0.088, 0.263, 0.439, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.263 std_dev=0.176
O4	B	0, 0.230, 0.406, 0.582, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.406 std_dev=0.176
O4'	A	0, 0.081, 0.259, 0.437, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.259 std_dev=0.178
C2	B	0, 0.130, 0.318, 0.506, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.318 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.213, 0.421, 0.629, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.421 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.109, 0.321, 0.533, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.321 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.171, 0.392, 0.614, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.392 std_dev=0.222
OP2	B	0, 0.194, 0.435, 0.677, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.435 std_dev=0.241
O5'	B	0, 0.198, 0.455, 0.712, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.455 std_dev=0.257
O2	B	0, 0.208, 0.470, 0.733, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.470 std_dev=0.262
P	B	0, 0.193, 0.474, 0.756, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.474 std_dev=0.281
C4'	A	0, 0.139, 0.426, 0.712, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.426 std_dev=0.286
C3'	A	0, 0.129, 0.435, 0.742, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.435 std_dev=0.306
C1'	B	0, 0.127, 0.443, 0.760, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.443 std_dev=0.316
C2'	B	0, 0.229, 0.580, 0.931, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.580 std_dev=0.351
C3'	B	0, 0.272, 0.626, 0.979, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.626 std_dev=0.353
O4'	B	0, 0.084, 0.438, 0.793, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.438 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.172, 0.531, 0.891, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.531 std_dev=0.360
OP1	B	0, 0.192, 0.565, 0.937, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.565 std_dev=0.373
C4'	B	0, 0.164, 0.546, 0.927, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.546 std_dev=0.382
C5'	A	0, 0.278, 0.720, 1.162, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.720 std_dev=0.442
O3'	A	0, 0.189, 0.634, 1.079, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.634 std_dev=0.445
O2'	B	0, 0.263, 0.736, 1.208, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.736 std_dev=0.473
O5'	A	0, 0.281, 0.783, 1.286, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.783 std_dev=0.502
O3'	B	0, 0.308, 0.836, 1.364, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.836 std_dev=0.528
P	A	0, 0.498, 1.090, 1.681, 2.160 max_d=2.160 avg_d=1.090 std_dev=0.592
OP1	A	0, 0.543, 1.307, 2.070, 3.619 max_d=3.619 avg_d=1.307 std_dev=0.764
OP2	A	0, 0.249, 1.167, 2.086, 3.109 max_d=3.109 avg_d=1.167 std_dev=0.918

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.28	0.26	0.11
C2	0.03	0.00	0.16	0.22	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.27	0.03	0.28	0.01	0.55	0.33	0.34
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.07	0.02	0.09	0.07	0.13	0.18	0.15	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.21	0.16	0.12
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.01	0.13	0.02	0.17	0.12	0.20	0.25	0.19	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.10	0.17	0.24	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.02	0.26	0.01	0.53	0.36	0.30
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.12	0.10	0.12	0.09	0.12	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.11	0.17	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.03	0.33	0.01	0.66	0.47	0.39
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.15	0.01	0.22	0.00	0.22	0.23	0.19	0.15	0.13	0.26	0.14	0.06	0.04	0.02	0.01	0.26	0.22	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.17	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.03	0.35	0.00	0.72	0.48	0.44
C8	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.03	0.30	0.02	0.57	0.51	0.29
N1	0.03	0.00	0.13	0.20	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.26	0.03	0.33	0.01	0.66	0.41	0.40
N2	0.04	0.00	0.18	0.25	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.33	0.04	0.27	0.02	0.52	0.30	0.32
N3	0.03	0.00	0.15	0.19	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.23	0.03	0.24	0.01	0.48	0.30	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.35	0.01	0.69	0.58	0.40
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.21	0.01	0.45	0.36	0.22
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.09	0.06	0.08	0.06	0.11	0.04	0.15	0.19	0.15	0.05	0.04	0.00	0.05	0.05	0.06	0.11	0.15	0.11	0.07
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.15	0.01	0.15	0.04	0.21	0.14	0.26	0.33	0.23	0.14	0.07	0.05	0.00	0.01	0.12	0.21	0.39	0.27	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.03	0.32	0.26	0.13
O5'	0.08	0.28	0.10	0.10	0.26	0.01	0.33	0.01	0.35	0.30	0.33	0.27	0.24	0.35	0.21	0.06	0.12	0.08	0.00	0.39	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.03	0.39	0.00	0.79	0.54	0.49
OP1	0.28	0.55	0.21	0.24	0.53	0.17	0.66	0.22	0.72	0.57	0.66	0.52	0.48	0.69	0.45	0.15	0.39	0.32	0.01	0.79	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.33	0.16	0.13	0.36	0.13	0.47	0.22	0.48	0.51	0.41	0.30	0.30	0.58	0.36	0.11	0.27	0.26	0.02	0.54	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.34	0.12	0.11	0.30	0.04	0.39	0.01	0.44	0.29	0.40	0.32	0.28	0.40	0.22	0.07	0.12	0.13	0.00	0.49	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.13	0.26	0.26	0.12	0.20	0.13	0.17	0.13	0.14	0.11	0.16	0.32	0.32	0.14	0.16	0.15	0.15	0.15	0.14
C2	0.17	0.16	0.27	0.28	0.16	0.19	0.16	0.17	0.16	0.16	0.16	0.19	0.30	0.34	0.17	0.15	0.17	0.17	0.19	0.17
C2'	0.30	0.22	0.38	0.37	0.19	0.31	0.21	0.28	0.24	0.25	0.19	0.25	0.44	0.43	0.19	0.28	0.26	0.26	0.23	0.23
C3'	0.41	0.32	0.46	0.45	0.24	0.42	0.28	0.40	0.33	0.35	0.26	0.36	0.51	0.49	0.22	0.40	0.37	0.37	0.35	0.36
C4	0.16	0.12	0.24	0.24	0.12	0.17	0.13	0.15	0.13	0.13	0.11	0.16	0.29	0.29	0.15	0.13	0.14	0.14	0.16	0.14
C4'	0.30	0.23	0.34	0.34	0.17	0.31	0.19	0.29	0.23	0.25	0.17	0.26	0.40	0.38	0.16	0.30	0.27	0.26	0.27	0.27
C5	0.14	0.11	0.21	0.20	0.11	0.15	0.12	0.12	0.11	0.11	0.09	0.17	0.26	0.24	0.14	0.12	0.12	0.12	0.15	0.12
C5'	0.38	0.31	0.39	0.39	0.27	0.38	0.30	0.37	0.32	0.34	0.27	0.33	0.43	0.41	0.26	0.38	0.37	0.37	0.40	0.39
C6	0.13	0.11	0.20	0.19	0.12	0.14	0.13	0.11	0.12	0.11	0.10	0.17	0.24	0.23	0.15	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12
C8	0.15	0.12	0.22	0.20	0.10	0.16	0.11	0.13	0.11	0.12	0.09	0.17	0.27	0.25	0.13	0.13	0.12	0.11	0.14	0.11
N1	0.14	0.14	0.23	0.23	0.15	0.16	0.15	0.14	0.15	0.13	0.15	0.19	0.26	0.28	0.17	0.13	0.15	0.15	0.18	0.15
N2	0.20	0.19	0.32	0.32	0.18	0.21	0.19	0.20	0.19	0.19	0.18	0.23	0.33	0.40	0.18	0.19	0.20	0.20	0.22	0.20
N3	0.17	0.14	0.27	0.28	0.14	0.19	0.15	0.17	0.15	0.15	0.13	0.17	0.31	0.34	0.16	0.15	0.17	0.16	0.18	0.17
N7	0.15	0.12	0.20	0.19	0.10	0.15	0.11	0.11	0.11	0.12	0.09	0.18	0.25	0.22	0.13	0.13	0.11	0.10	0.13	0.11
N9	0.16	0.12	0.24	0.23	0.11	0.17	0.12	0.15	0.12	0.13	0.10	0.16	0.30	0.29	0.14	0.14	0.14	0.13	0.15	0.13
O2'	0.26	0.20	0.35	0.35	0.20	0.28	0.22	0.25	0.23	0.23	0.18	0.21	0.42	0.42	0.21	0.25	0.23	0.24	0.19	0.20
O3'	0.52	0.40	0.55	0.54	0.32	0.53	0.37	0.51	0.42	0.44	0.33	0.43	0.61	0.58	0.28	0.52	0.47	0.47	0.43	0.45
O4'	0.18	0.13	0.25	0.24	0.11	0.19	0.12	0.17	0.13	0.14	0.10	0.17	0.30	0.30	0.13	0.17	0.15	0.15	0.16	0.15
O5'	0.50	0.43	0.49	0.50	0.38	0.50	0.42	0.50	0.45	0.46	0.39	0.44	0.51	0.50	0.36	0.50	0.51	0.51	0.53	0.53
O6	0.13	0.12	0.17	0.16	0.11	0.13	0.12	0.10	0.11	0.11	0.09	0.19	0.22	0.19	0.15	0.12	0.10	0.10	0.14	0.11
OP1	0.85	0.81	0.85	0.85	0.85	0.85	0.89	0.86	0.89	0.85	0.80	0.76	0.85	0.85	0.84	0.85	0.91	0.91	0.94	0.94
OP2	0.43	0.43	0.41	0.41	0.47	0.43	0.45	0.46	0.42	0.42	0.45	0.43	0.43	0.41	0.53	0.45	0.48	0.51	0.58	0.55
P	0.60	0.54	0.58	0.59	0.52	0.60	0.56	0.62	0.58	0.58	0.51	0.53	0.59	0.58	0.49	0.62	0.64	0.64	0.68	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.13	0.01	0.04	0.08	0.09	0.12	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01	0.09	0.02	0.07	0.17	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.14	0.11	0.07
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.01	0.16	0.08	0.12	0.16	0.01	0.01	0.14	0.01	0.10	0.18	0.16	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.00	0.02	0.16	0.18	0.22	0.18
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.05	0.03	0.06	0.02	0.08	0.00	0.02	0.09	0.04	0.02
C5	0.02	0.00	0.07	0.16	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.05	0.17	0.20	0.23	0.20
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.12	0.06	0.07	0.03	0.06	0.03	0.12	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.16	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.06	0.14	0.15	0.16	0.15
N1	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.08	0.08	0.10	0.09
N3	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.14	0.01	0.03	0.12	0.13	0.17	0.14
O2	0.02	0.01	0.17	0.16	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.19	0.01	0.07	0.07	0.08	0.09	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.06	0.02	0.07	0.16	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06	0.16	0.10	0.07
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.16	0.02	0.19	0.03	0.17	0.08	0.14	0.19	0.04	0.00	0.17	0.02	0.13	0.26	0.23	0.18
O4	0.02	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.03	0.17	0.21	0.25	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.07	0.06	0.02	0.03	0.00	0.08	0.07	0.09	0.09
O5'	0.03	0.08	0.06	0.10	0.16	0.02	0.17	0.01	0.14	0.08	0.12	0.07	0.06	0.13	0.17	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.09	0.14	0.18	0.18	0.09	0.20	0.07	0.15	0.08	0.13	0.08	0.16	0.26	0.21	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.12	0.11	0.16	0.22	0.04	0.23	0.02	0.16	0.10	0.17	0.09	0.10	0.23	0.25	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.07	0.12	0.18	0.02	0.20	0.01	0.15	0.09	0.14	0.08	0.07	0.18	0.21	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00