Doublet Group distance statistics: 52617

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.009, 0.027, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.040 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.008, 0.043, 0.079, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.043 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.017, 0.054, 0.091, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.054 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.014, 0.053, 0.092, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.053 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.019, 0.087, 0.154, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.087 std_dev=0.067
C4'	A	0, 0.018, 0.086, 0.153, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.086 std_dev=0.067
O5'	A	0, 0.065, 0.166, 0.268, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.166 std_dev=0.102
C5'	A	0, 0.015, 0.134, 0.253, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.134 std_dev=0.119
C3'	A	0, -0.004, 0.122, 0.247, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.122 std_dev=0.125
OP1	A	0, 0.067, 0.197, 0.326, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.197 std_dev=0.130
O2'	A	0, 0.047, 0.179, 0.310, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.179 std_dev=0.132
P	A	0, 0.087, 0.243, 0.400, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.243 std_dev=0.156
C2'	B	0, 0.168, 0.328, 0.488, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.328 std_dev=0.160
C3'	B	0, 0.179, 0.344, 0.509, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.344 std_dev=0.165
O3'	A	0, -0.002, 0.174, 0.351, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.174 std_dev=0.177
C4	B	0, 0.018, 0.202, 0.385, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.202 std_dev=0.183
O4	B	0, 0.071, 0.256, 0.441, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.256 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.131, 0.341, 0.551, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.341 std_dev=0.210
N1	B	0, 0.063, 0.273, 0.483, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.273 std_dev=0.210
O2'	B	0, 0.240, 0.481, 0.721, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.481 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.005, 0.254, 0.502, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.254 std_dev=0.249
O3'	B	0, 0.181, 0.430, 0.679, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.430 std_dev=0.249
C5	B	0, -0.032, 0.230, 0.492, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.230 std_dev=0.262
C4'	B	0, 0.159, 0.428, 0.696, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.428 std_dev=0.268
OP2	A	0, 0.069, 0.343, 0.618, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.343 std_dev=0.275
N3	B	0, -0.013, 0.263, 0.538, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.263 std_dev=0.275
O4'	B	0, 0.108, 0.400, 0.693, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.400 std_dev=0.292
C2	B	0, -0.002, 0.303, 0.607, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.303 std_dev=0.305
OP1	B	0, 0.157, 0.489, 0.822, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.489 std_dev=0.333
P	B	0, 0.099, 0.462, 0.825, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.462 std_dev=0.363
OP2	B	0, 0.068, 0.487, 0.905, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.487 std_dev=0.418
C5'	B	0, 0.078, 0.504, 0.931, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.504 std_dev=0.427
O2	B	0, -0.075, 0.391, 0.857, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.391 std_dev=0.466
O5'	B	0, 0.007, 0.500, 0.992, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.500 std_dev=0.493

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.09	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.07	0.05	0.10	0.05	0.03	0.00	0.00	0.07	0.08	0.07	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02
C5	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.10	0.09
C5'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.07	0.00	0.07	0.11	0.09
C8	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.08	0.02	0.07	0.08	0.08
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.07	0.00	0.06	0.10	0.08
N2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.06	0.01	0.06	0.09	0.07
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02	0.06	0.01	0.06	0.08	0.07
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.08	0.02	0.07	0.10	0.09
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.07	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.03	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.08	0.12	0.09	0.05	0.03	0.00	0.07	0.03	0.05	0.06	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.10	0.05	0.07	0.04	0.11	0.04	0.07	0.00	0.01	0.10	0.09	0.12	0.17	0.11
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.05	0.11	0.08
O5'	0.04	0.06	0.03	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.05	0.10	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.09	0.03	0.08	0.00	0.07	0.13	0.11
OP1	0.03	0.06	0.04	0.07	0.06	0.03	0.07	0.03	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.12	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.09	0.05	0.12	0.08	0.03	0.10	0.02	0.11	0.08	0.10	0.09	0.08	0.10	0.07	0.05	0.17	0.11	0.02	0.13	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.03	0.07	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.08	0.08	0.07	0.07	0.09	0.06	0.04	0.11	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.24	0.07	0.05	0.19	0.13	0.14	0.13	0.15	0.20	0.24	0.28	0.14	0.13	0.18	0.23	0.11	0.06	0.18	0.13
C2	0.18	0.22	0.08	0.05	0.19	0.13	0.15	0.14	0.16	0.19	0.23	0.24	0.14	0.09	0.18	0.21	0.14	0.05	0.16	0.12
C2'	0.17	0.19	0.04	0.06	0.18	0.13	0.16	0.14	0.16	0.18	0.20	0.21	0.09	0.13	0.19	0.23	0.14	0.06	0.14	0.11
C3'	0.18	0.20	0.05	0.05	0.20	0.15	0.19	0.18	0.19	0.19	0.21	0.20	0.09	0.11	0.22	0.24	0.18	0.06	0.11	0.08
C4	0.17	0.21	0.08	0.06	0.17	0.12	0.13	0.12	0.14	0.18	0.22	0.24	0.15	0.12	0.17	0.20	0.11	0.07	0.18	0.14
C4'	0.19	0.23	0.07	0.05	0.19	0.13	0.16	0.14	0.16	0.20	0.23	0.25	0.13	0.13	0.19	0.23	0.13	0.06	0.16	0.12
C5	0.15	0.18	0.09	0.06	0.15	0.10	0.12	0.10	0.12	0.15	0.19	0.20	0.14	0.13	0.15	0.18	0.10	0.10	0.19	0.16
C5'	0.18	0.21	0.07	0.05	0.18	0.13	0.15	0.14	0.16	0.19	0.22	0.24	0.13	0.12	0.18	0.22	0.13	0.08	0.17	0.13
C6	0.13	0.15	0.08	0.06	0.13	0.10	0.11	0.10	0.11	0.13	0.16	0.16	0.13	0.12	0.14	0.16	0.11	0.11	0.19	0.16
C8	0.16	0.19	0.09	0.07	0.15	0.10	0.11	0.10	0.12	0.16	0.20	0.22	0.15	0.15	0.15	0.18	0.09	0.11	0.20	0.16
N1	0.15	0.17	0.08	0.06	0.16	0.11	0.13	0.12	0.13	0.16	0.19	0.17	0.13	0.10	0.16	0.18	0.13	0.08	0.17	0.14
N2	0.20	0.25	0.09	0.05	0.20	0.15	0.17	0.16	0.18	0.21	0.26	0.26	0.14	0.08	0.17	0.24	0.16	0.04	0.13	0.09
N3	0.19	0.23	0.08	0.05	0.19	0.13	0.15	0.14	0.16	0.20	0.24	0.26	0.15	0.10	0.18	0.22	0.13	0.05	0.16	0.12
N7	0.14	0.17	0.09	0.07	0.14	0.10	0.11	0.10	0.11	0.15	0.18	0.20	0.14	0.14	0.14	0.17	0.09	0.12	0.20	0.17
N9	0.17	0.22	0.08	0.06	0.17	0.11	0.13	0.11	0.14	0.18	0.22	0.25	0.15	0.13	0.17	0.20	0.10	0.08	0.19	0.15
O2'	0.18	0.21	0.07	0.10	0.20	0.13	0.17	0.14	0.17	0.19	0.22	0.23	0.06	0.18	0.21	0.23	0.13	0.08	0.16	0.13
O3'	0.16	0.17	0.04	0.05	0.21	0.15	0.21	0.19	0.19	0.18	0.18	0.15	0.07	0.12	0.23	0.24	0.20	0.05	0.09	0.07
O4'	0.19	0.25	0.08	0.06	0.18	0.12	0.13	0.12	0.14	0.20	0.24	0.29	0.16	0.13	0.17	0.22	0.10	0.07	0.20	0.15
O5'	0.19	0.22	0.06	0.04	0.19	0.13	0.16	0.14	0.16	0.19	0.22	0.24	0.12	0.12	0.19	0.23	0.14	0.10	0.17	0.13
O6	0.10	0.10	0.08	0.07	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.10	0.11	0.11	0.11	0.12	0.09	0.12	0.09	0.15	0.21	0.18
OP1	0.16	0.19	0.05	0.05	0.16	0.12	0.14	0.13	0.14	0.17	0.19	0.21	0.11	0.13	0.16	0.21	0.13	0.13	0.19	0.16
OP2	0.21	0.24	0.10	0.08	0.22	0.15	0.18	0.17	0.18	0.21	0.25	0.26	0.14	0.15	0.22	0.24	0.17	0.14	0.18	0.15
P	0.20	0.24	0.08	0.06	0.21	0.15	0.18	0.16	0.18	0.21	0.24	0.26	0.13	0.12	0.21	0.24	0.16	0.11	0.16	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.08	0.16	0.19
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.02	0.03	0.17	0.25	0.26
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.08	0.12	0.10
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.09	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.10	0.01	0.05	0.16	0.09	0.06
C4	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.00	0.04	0.05	0.23	0.30	0.28
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07
C5	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01	0.05	0.05	0.22	0.29	0.27
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.01	0.05	0.05	0.18	0.26	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.16	0.24	0.25
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.00	0.02	0.04	0.21	0.28	0.28
O2	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.03	0.15	0.24	0.25
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.03	0.03	0.07	0.09	0.00	0.09	0.08	0.05	0.03	0.08	0.11	0.10
O3'	0.03	0.04	0.04	0.01	0.12	0.03	0.15	0.04	0.12	0.04	0.07	0.08	0.09	0.00	0.14	0.03	0.12	0.27	0.10	0.05
O4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.00	0.04	0.06	0.25	0.31	0.28
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.04	0.00	0.05	0.14	0.14	0.18
O5'	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.12	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.17	0.08	0.16	0.23	0.04	0.22	0.04	0.18	0.16	0.21	0.15	0.08	0.27	0.25	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.25	0.12	0.09	0.30	0.07	0.29	0.01	0.26	0.24	0.28	0.24	0.11	0.10	0.31	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.26	0.10	0.06	0.28	0.07	0.27	0.01	0.26	0.25	0.28	0.25	0.10	0.05	0.28	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00