Doublet Group distance statistics: 52626

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C5	B	0, 0.000, 0.140, 0.280, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.140 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.000, 0.172, 0.343, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.172 std_dev=0.172
O4	B	0, 0.000, 0.177, 0.353, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.177 std_dev=0.177
C4	B	0, 0.000, 0.177, 0.354, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.177 std_dev=0.177
C6	B	0, 0.000, 0.183, 0.365, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.183 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.000, 0.259, 0.518, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.259 std_dev=0.259
O4'	A	0, 0.000, 0.287, 0.574, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.287 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.000, 0.339, 0.679, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.339 std_dev=0.339
N3	B	0, 0.000, 0.343, 0.685, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.343 std_dev=0.343
C1'	B	0, 0.000, 0.432, 0.863, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.432 std_dev=0.432
O2'	B	0, 0.000, 0.435, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.435 std_dev=0.435
C2	B	0, 0.000, 0.438, 0.875, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.438 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.000, 0.442, 0.883, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.442 std_dev=0.442
C4'	A	0, 0.000, 0.472, 0.943, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.472 std_dev=0.472
C3'	A	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
C3'	B	0, 0.000, 0.497, 0.995, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.497 std_dev=0.497
O4'	B	0, 0.000, 0.498, 0.995, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.498 std_dev=0.498
O3'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
C4'	B	0, 0.000, 0.554, 1.108, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.554 std_dev=0.554
C5'	B	0, 0.000, 0.604, 1.208, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.604 std_dev=0.604
O3'	A	0, 0.000, 0.606, 1.211, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.606 std_dev=0.606
O2	B	0, 0.000, 0.615, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.615 std_dev=0.615
OP2	B	0, 0.000, 0.627, 1.253, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.627 std_dev=0.627
P	B	0, 0.000, 0.679, 1.358, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.679 std_dev=0.679
OP1	B	0, 0.000, 0.687, 1.374, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.687 std_dev=0.687
O5'	B	0, 0.000, 0.702, 1.404, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.702 std_dev=0.702
C5'	A	0, 0.000, 0.763, 1.527, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.763 std_dev=0.763
O5'	A	0, 0.000, 0.877, 1.755, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.877 std_dev=0.877
OP2	A	0, 0.000, 1.024, 2.047, 2.047 max_d=2.047 avg_d=1.024 std_dev=1.024
P	A	0, 0.000, 1.041, 2.083, 2.083 max_d=2.083 avg_d=1.041 std_dev=1.041
OP1	A	0, 0.000, 1.185, 2.370, 2.370 max_d=2.370 avg_d=1.185 std_dev=1.185

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.07	0.02
C2	0.01	0.00	0.14	0.22	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.01	0.10	0.00	0.09	0.07	0.09
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.03	0.04	0.02	0.07	0.04	0.11	0.17	0.14	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.02	0.06	0.01
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.15	0.00	0.13	0.01	0.17	0.01	0.21	0.24	0.19	0.06	0.07	0.03	0.01	0.00	0.05	0.17	0.02	0.01	0.02
C4	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04
C4'	0.01	0.10	0.03	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.10	0.04	0.11	0.11	0.09	0.06	0.05	0.10	0.05	0.00	0.01	0.11	0.00	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.14	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05
C5'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.11	0.04	0.11	0.11	0.08	0.07	0.04	0.11	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.02	0.03
C6	0.01	0.00	0.07	0.17	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.02	0.09	0.00	0.08	0.06	0.08
C8	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02	0.03	0.09	0.02
N1	0.02	0.00	0.11	0.21	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.01	0.11	0.01	0.10	0.08	0.10
N2	0.02	0.00	0.17	0.24	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.29	0.01	0.12	0.01	0.11	0.09	0.10
N3	0.01	0.00	0.14	0.19	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00
O2'	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.07	0.08	0.02	0.08	0.01	0.08
O3'	0.03	0.25	0.03	0.01	0.16	0.05	0.14	0.06	0.18	0.01	0.23	0.29	0.22	0.05	0.07	0.07	0.00	0.04	0.09	0.17	0.01	0.02	0.05
O4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.04	0.00	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01
O5'	0.04	0.10	0.00	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.09	0.03	0.11	0.12	0.07	0.02	0.00	0.08	0.09	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.00	0.06	0.17	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.04	0.11	0.00	0.09	0.08	0.10
OP1	0.03	0.09	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.03	0.10	0.11	0.06	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.07	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.09	0.08	0.09	0.04	0.04	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.09	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.08	0.02	0.10	0.10	0.06	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
C2	0.01	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00
C2'	0.10	0.01	0.11	0.11	0.01	0.12	0.04	0.11	0.08	0.07	0.03	0.01	0.10	0.13	0.05	0.10	0.08	0.07	0.05	0.08
C3'	0.21	0.12	0.20	0.20	0.12	0.23	0.18	0.22	0.21	0.19	0.09	0.09	0.18	0.20	0.08	0.22	0.18	0.17	0.15	0.18
C4	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.08	0.04	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C4'	0.11	0.04	0.08	0.09	0.04	0.12	0.09	0.12	0.11	0.09	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.12	0.08	0.07	0.06	0.09
C5	0.01	0.04	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.04	0.05	0.05	0.03
C5'	0.12	0.06	0.08	0.08	0.06	0.13	0.11	0.13	0.13	0.11	0.04	0.04	0.06	0.07	0.03	0.14	0.09	0.07	0.06	0.09
C6	0.01	0.03	0.03	0.03	0.08	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.05	0.03	0.11	0.02	0.05	0.06	0.05	0.04
C8	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.03	0.00	0.11	0.02	0.03	0.05	0.05	0.03
N1	0.00	0.04	0.03	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
N2	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.07	0.07	0.05	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
N3	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.00	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
N7	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.05	0.06	0.05	0.04
N9	0.00	0.05	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.08	0.04	0.02	0.01	0.11	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01
O2'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.11	0.02	0.07	0.02	0.05	0.07	0.14	0.15	0.04	0.00	0.14	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04
O3'	0.25	0.14	0.24	0.24	0.14	0.27	0.22	0.26	0.25	0.22	0.11	0.10	0.23	0.25	0.10	0.26	0.21	0.21	0.18	0.22
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
O5'	0.14	0.07	0.09	0.08	0.07	0.13	0.12	0.13	0.14	0.12	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.15	0.08	0.07	0.05	0.09
O6	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.06	0.04	0.07	0.01	0.07	0.06	0.12	0.05	0.08	0.09	0.08	0.07
OP1	0.13	0.07	0.08	0.08	0.07	0.13	0.12	0.13	0.14	0.12	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03	0.15	0.07	0.06	0.04	0.08
OP2	0.12	0.07	0.07	0.06	0.07	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.13	0.05	0.04	0.02	0.06
P	0.12	0.07	0.07	0.07	0.07	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.05	0.05	0.05	0.04	0.03	0.14	0.06	0.04	0.03	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03
C2	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.06
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.10	0.00	0.01	0.11	0.09	0.10	0.07
C5'	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.01	0.11	0.08	0.08	0.06
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04
O2	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.01	0.02	0.08	0.07	0.11	0.09
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.08	0.04	0.05	0.07
O3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.10	0.02	0.01	0.11	0.02	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.05	0.06
O4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00
O5'	0.01	0.03	0.05	0.08	0.05	0.01	0.11	0.00	0.11	0.02	0.01	0.08	0.08	0.10	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.05	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.04	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.04	0.09	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00