Doublet Group distance statistics: 52631

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 10, 6, 11, 20, 8, 8, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.007, 0.029, 0.050, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.029 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.017, 0.040, 0.063, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.040 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.020, 0.050, 0.080, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.050 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.023, 0.060, 0.096, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.060 std_dev=0.037
C4	B	0, 0.128, 0.267, 0.405, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.267 std_dev=0.139
C5	B	0, 0.137, 0.304, 0.472, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.304 std_dev=0.168
N9	B	0, 0.171, 0.347, 0.524, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.347 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.168, 0.348, 0.528, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.348 std_dev=0.180
N3	B	0, 0.168, 0.358, 0.548, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.358 std_dev=0.190
N1	B	0, 0.146, 0.340, 0.534, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.340 std_dev=0.194
C2	B	0, 0.142, 0.359, 0.576, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.359 std_dev=0.217
C8	B	0, 0.162, 0.411, 0.659, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.411 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.277, 0.528, 0.778, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.528 std_dev=0.251
N7	B	0, 0.173, 0.433, 0.694, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.433 std_dev=0.260
N6	B	0, 0.213, 0.494, 0.775, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.494 std_dev=0.281
O4'	B	0, 0.347, 0.660, 0.973, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.660 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.358, 0.760, 1.162, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.760 std_dev=0.402
C2'	B	0, 0.272, 0.684, 1.097, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.684 std_dev=0.412
C3'	B	0, 0.209, 0.652, 1.095, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.652 std_dev=0.443
O5'	B	0, 0.363, 0.839, 1.315, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.839 std_dev=0.476
O4'	A	0, 0.026, 0.517, 1.008, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.517 std_dev=0.491
C2'	A	0, 0.032, 0.536, 1.040, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.536 std_dev=0.504
C5'	B	0, 0.408, 0.959, 1.510, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.959 std_dev=0.551
O3'	B	0, 0.324, 0.909, 1.495, 2.830 max_d=2.830 avg_d=0.909 std_dev=0.586
O2'	B	0, 0.448, 1.060, 1.672, 2.932 max_d=2.932 avg_d=1.060 std_dev=0.612
P	B	0, 0.352, 1.065, 1.777, 3.716 max_d=3.716 avg_d=1.065 std_dev=0.713
O2'	A	0, 0.005, 0.749, 1.492, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.749 std_dev=0.744
OP2	B	0, 0.323, 1.108, 1.892, 4.281 max_d=4.281 avg_d=1.108 std_dev=0.784
OP1	B	0, 0.527, 1.369, 2.210, 4.412 max_d=4.412 avg_d=1.369 std_dev=0.842
C4'	A	0, 0.021, 0.877, 1.733, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.877 std_dev=0.856
C3'	A	0, 0.052, 0.920, 1.789, 2.217 max_d=2.217 avg_d=0.920 std_dev=0.868
C5'	A	0, 0.101, 1.205, 2.310, 3.154 max_d=3.154 avg_d=1.205 std_dev=1.105
O3'	A	0, 0.095, 1.390, 2.686, 3.470 max_d=3.470 avg_d=1.390 std_dev=1.295
O5'	A	0, 0.081, 1.413, 2.745, 4.370 max_d=4.370 avg_d=1.413 std_dev=1.332
P	A	0, 0.192, 1.670, 3.148, 4.460 max_d=4.460 avg_d=1.670 std_dev=1.478
OP2	A	0, 0.276, 1.828, 3.380, 5.007 max_d=5.007 avg_d=1.828 std_dev=1.552
OP1	A	0, 0.234, 1.813, 3.391, 5.067 max_d=5.067 avg_d=1.813 std_dev=1.578

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.38	0.01	0.16	0.02	0.15	0.29	0.17
C2	0.03	0.00	0.42	0.42	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.27	0.16	0.24	0.02	0.23	0.29	0.26
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.23	0.02	0.13	0.19	0.21	0.16	0.34	0.49	0.41	0.07	0.03	0.00	0.04	0.02	0.29	0.18	0.28	0.39	0.26
C3'	0.01	0.42	0.00	0.00	0.38	0.01	0.46	0.02	0.51	0.36	0.48	0.39	0.35	0.45	0.28	0.02	0.01	0.03	0.24	0.55	0.21	0.31	0.22
C4	0.02	0.01	0.23	0.38	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.14	0.09	0.24	0.01	0.23	0.27	0.26
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.16	0.20	0.13	0.11	0.09	0.22	0.11	0.33	0.04	0.00	0.02	0.19	0.13	0.19	0.07
C5	0.01	0.01	0.13	0.46	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.33	0.17	0.04	0.33	0.02	0.32	0.32	0.36
C5'	0.06	0.11	0.19	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.15	0.11	0.09	0.25	0.10	0.15	0.22	0.02	0.01	0.24	0.14	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.21	0.51	0.01	0.16	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.23	0.07	0.36	0.01	0.34	0.36	0.38
C8	0.01	0.01	0.16	0.36	0.01	0.20	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.39	0.16	0.11	0.32	0.03	0.31	0.27	0.36
N1	0.03	0.01	0.34	0.48	0.01	0.13	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.22	0.23	0.13	0.31	0.01	0.29	0.33	0.32
N2	0.04	0.01	0.49	0.39	0.01	0.11	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.35	0.20	0.21	0.02	0.21	0.29	0.24
N3	0.03	0.01	0.41	0.35	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.28	0.16	0.19	0.01	0.19	0.27	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.45	0.01	0.22	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.42	0.24	0.06	0.38	0.03	0.38	0.35	0.44
N9	0.01	0.01	0.03	0.28	0.01	0.11	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.24	0.10	0.01	0.21	0.02	0.21	0.25	0.23
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.21	0.33	0.33	0.15	0.31	0.39	0.22	0.20	0.14	0.42	0.24	0.00	0.09	0.22	0.19	0.36	0.17	0.34	0.15
O3'	0.38	0.27	0.04	0.01	0.14	0.04	0.17	0.22	0.23	0.16	0.23	0.35	0.28	0.24	0.10	0.09	0.00	0.26	0.41	0.30	0.50	0.48	0.39
O4'	0.01	0.16	0.02	0.03	0.09	0.00	0.04	0.02	0.07	0.11	0.13	0.20	0.16	0.06	0.01	0.22	0.26	0.00	0.14	0.05	0.19	0.32	0.18
O5'	0.16	0.24	0.29	0.24	0.24	0.02	0.33	0.01	0.36	0.32	0.31	0.21	0.19	0.38	0.21	0.19	0.41	0.14	0.00	0.41	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.18	0.55	0.01	0.19	0.02	0.24	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.36	0.30	0.05	0.41	0.00	0.40	0.42	0.44
OP1	0.15	0.23	0.28	0.21	0.23	0.13	0.32	0.14	0.34	0.31	0.29	0.21	0.19	0.38	0.21	0.17	0.50	0.19	0.02	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.29	0.39	0.31	0.27	0.19	0.32	0.16	0.36	0.27	0.33	0.29	0.27	0.35	0.25	0.34	0.48	0.32	0.02	0.42	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.26	0.26	0.22	0.26	0.07	0.36	0.02	0.38	0.36	0.32	0.24	0.23	0.44	0.23	0.15	0.39	0.18	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.28	0.31	0.10	0.16	0.09	0.21	0.10	0.08	0.11	0.16	0.17	0.10	0.10	0.26	0.30	0.14	0.33	0.45	0.47	0.36
C2	0.14	0.15	0.28	0.30	0.11	0.16	0.10	0.21	0.13	0.09	0.12	0.16	0.21	0.11	0.10	0.24	0.29	0.14	0.31	0.42	0.45	0.34
C2'	0.48	0.46	0.48	0.46	0.41	0.48	0.34	0.47	0.32	0.36	0.37	0.48	0.27	0.32	0.42	0.54	0.54	0.51	0.43	0.37	0.37	0.25
C3'	0.56	0.54	0.46	0.46	0.54	0.55	0.54	0.59	0.53	0.55	0.53	0.55	0.53	0.54	0.55	0.51	0.50	0.63	0.55	0.50	0.50	0.42
C4	0.13	0.16	0.25	0.30	0.10	0.15	0.09	0.21	0.10	0.08	0.11	0.16	0.17	0.10	0.09	0.24	0.27	0.12	0.33	0.44	0.47	0.36
C4'	0.19	0.21	0.25	0.26	0.15	0.16	0.13	0.19	0.13	0.12	0.16	0.20	0.16	0.12	0.14	0.28	0.28	0.23	0.33	0.40	0.41	0.29
C5	0.12	0.18	0.22	0.29	0.11	0.14	0.09	0.22	0.10	0.08	0.13	0.16	0.15	0.10	0.09	0.23	0.24	0.10	0.35	0.44	0.47	0.38
C5'	0.21	0.23	0.23	0.26	0.18	0.17	0.16	0.22	0.16	0.15	0.19	0.23	0.18	0.16	0.17	0.28	0.28	0.26	0.35	0.41	0.43	0.31
C6	0.12	0.19	0.20	0.29	0.11	0.13	0.09	0.22	0.09	0.08	0.14	0.17	0.15	0.10	0.09	0.23	0.23	0.10	0.35	0.43	0.47	0.37
C8	0.12	0.17	0.23	0.30	0.11	0.14	0.09	0.23	0.10	0.08	0.13	0.16	0.14	0.10	0.09	0.25	0.26	0.10	0.36	0.46	0.49	0.39
N1	0.13	0.17	0.24	0.29	0.11	0.14	0.09	0.21	0.12	0.09	0.12	0.16	0.20	0.11	0.10	0.22	0.25	0.12	0.32	0.41	0.45	0.35
N2	0.16	0.14	0.31	0.30	0.12	0.17	0.12	0.20	0.16	0.11	0.16	0.16	0.22	0.12	0.12	0.26	0.32	0.17	0.30	0.41	0.44	0.32
N3	0.14	0.15	0.28	0.31	0.10	0.16	0.10	0.21	0.12	0.09	0.11	0.15	0.20	0.11	0.10	0.25	0.30	0.14	0.32	0.43	0.46	0.35
N7	0.12	0.18	0.20	0.30	0.11	0.14	0.09	0.24	0.10	0.09	0.14	0.16	0.13	0.10	0.09	0.24	0.25	0.10	0.37	0.46	0.49	0.40
N9	0.13	0.16	0.25	0.30	0.10	0.15	0.09	0.22	0.10	0.08	0.11	0.16	0.16	0.10	0.09	0.25	0.28	0.12	0.34	0.45	0.48	0.37
O2'	0.23	0.22	0.30	0.25	0.21	0.21	0.24	0.19	0.27	0.22	0.23	0.22	0.35	0.26	0.21	0.32	0.32	0.26	0.36	0.47	0.55	0.44
O3'	0.35	0.32	0.34	0.28	0.30	0.33	0.28	0.31	0.27	0.30	0.28	0.33	0.29	0.29	0.31	0.42	0.41	0.44	0.37	0.28	0.30	0.21
O4'	0.20	0.21	0.35	0.39	0.20	0.23	0.21	0.27	0.21	0.21	0.20	0.21	0.25	0.22	0.20	0.30	0.36	0.18	0.44	0.56	0.58	0.49
O5'	0.36	0.38	0.31	0.32	0.35	0.32	0.34	0.35	0.34	0.33	0.36	0.37	0.35	0.33	0.34	0.38	0.33	0.41	0.45	0.42	0.42	0.35
O6	0.12	0.21	0.17	0.28	0.12	0.13	0.09	0.23	0.10	0.09	0.18	0.17	0.13	0.10	0.10	0.23	0.21	0.10	0.36	0.44	0.47	0.38
OP1	0.35	0.39	0.33	0.31	0.34	0.30	0.32	0.30	0.33	0.30	0.36	0.38	0.31	0.30	0.33	0.41	0.30	0.39	0.42	0.38	0.35	0.29
OP2	0.41	0.46	0.38	0.38	0.40	0.35	0.37	0.34	0.38	0.35	0.43	0.45	0.35	0.34	0.38	0.45	0.32	0.42	0.44	0.42	0.39	0.33
P	0.38	0.43	0.38	0.38	0.37	0.32	0.34	0.30	0.35	0.32	0.40	0.42	0.32	0.31	0.36	0.44	0.33	0.39	0.43	0.39	0.35	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.17	0.00	0.16	0.22	0.36	0.25
C2	0.04	0.00	0.18	0.18	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.23	0.12	0.27	0.31	0.37	0.26
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.10	0.01	0.06	0.11	0.09	0.11	0.14	0.18	0.08	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.32	0.40	0.34	0.26
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.16	0.01	0.21	0.02	0.22	0.22	0.20	0.16	0.25	0.25	0.14	0.02	0.01	0.02	0.28	0.43	0.23	0.20
C4	0.02	0.01	0.10	0.16	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.06	0.26	0.27	0.35	0.24
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.06	0.06	0.11	0.14	0.06	0.17	0.02	0.00	0.01	0.16	0.28	0.11
C5	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.11	0.04	0.32	0.31	0.36	0.26
C5'	0.05	0.13	0.11	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.16	0.11	0.23	0.21	0.11	0.06	0.12	0.01	0.01	0.21	0.28	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.22	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.06	0.33	0.34	0.37	0.28
C8	0.01	0.01	0.11	0.22	0.01	0.14	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.17	0.07	0.31	0.26	0.36	0.23
N1	0.03	0.00	0.14	0.20	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.09	0.31	0.33	0.38	0.28
N3	0.04	0.00	0.18	0.16	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.24	0.12	0.24	0.28	0.36	0.24
N6	0.02	0.01	0.08	0.25	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.19	0.16	0.05	0.37	0.37	0.39	0.32
N7	0.01	0.01	0.08	0.25	0.01	0.14	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.18	0.05	0.35	0.31	0.36	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.07	0.01	0.24	0.23	0.35	0.23
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.11	0.17	0.16	0.06	0.16	0.20	0.14	0.13	0.19	0.21	0.11	0.00	0.04	0.13	0.19	0.32	0.38	0.23
O3'	0.17	0.23	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.12	0.13	0.17	0.17	0.24	0.16	0.18	0.07	0.04	0.00	0.12	0.31	0.61	0.40	0.36
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.09	0.12	0.05	0.05	0.01	0.13	0.12	0.00	0.15	0.28	0.45	0.36
O5'	0.16	0.27	0.32	0.28	0.26	0.01	0.32	0.01	0.33	0.31	0.31	0.24	0.37	0.35	0.24	0.19	0.31	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.31	0.40	0.43	0.27	0.16	0.31	0.21	0.34	0.26	0.33	0.28	0.37	0.31	0.23	0.32	0.61	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.37	0.34	0.23	0.35	0.28	0.36	0.28	0.37	0.36	0.38	0.36	0.39	0.36	0.35	0.38	0.40	0.45	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.26	0.26	0.20	0.24	0.11	0.26	0.01	0.28	0.23	0.28	0.24	0.32	0.27	0.23	0.23	0.36	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00