Doublet Group distance statistics: 52632

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 13, 10, 2, 3, 7, 1, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.014, 0.032, 0.051, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.016, 0.041, 0.066, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.041 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.016, 0.044, 0.071, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.044 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.004, 0.034, 0.064, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.034 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.020, 0.052, 0.083, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.052 std_dev=0.031
C5	B	0, 0.215, 0.376, 0.536, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.376 std_dev=0.161
C4	B	0, 0.215, 0.377, 0.539, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.377 std_dev=0.162
N9	B	0, 0.281, 0.449, 0.618, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.449 std_dev=0.168
C8	B	0, 0.318, 0.501, 0.685, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.501 std_dev=0.184
N7	B	0, 0.308, 0.528, 0.748, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.528 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.154, 0.423, 0.691, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.423 std_dev=0.268
C1'	B	0, 0.387, 0.665, 0.943, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.665 std_dev=0.278
O4'	B	0, 0.447, 0.733, 1.018, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.733 std_dev=0.286
O4'	A	0, 0.022, 0.310, 0.597, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.310 std_dev=0.288
C2'	A	0, 0.041, 0.334, 0.627, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.334 std_dev=0.293
N3	B	0, 0.147, 0.492, 0.836, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.492 std_dev=0.344
N1	B	0, 0.088, 0.439, 0.791, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.439 std_dev=0.351
O2'	A	0, 0.123, 0.501, 0.878, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.501 std_dev=0.377
C2	B	0, 0.085, 0.489, 0.893, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.489 std_dev=0.404
N6	B	0, 0.158, 0.582, 1.005, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.582 std_dev=0.424
C4'	B	0, 0.493, 0.923, 1.353, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.923 std_dev=0.430
C3'	B	0, 0.486, 0.925, 1.364, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.925 std_dev=0.439
C2'	B	0, 0.352, 0.808, 1.263, 2.524 max_d=2.524 avg_d=0.808 std_dev=0.456
C4'	A	0, -0.008, 0.462, 0.933, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.462 std_dev=0.471
O5'	B	0, 0.405, 0.885, 1.365, 2.149 max_d=2.149 avg_d=0.885 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.485, 0.987, 1.489, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.987 std_dev=0.502
C3'	A	0, -0.006, 0.544, 1.094, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.544 std_dev=0.550
O3'	B	0, 0.563, 1.192, 1.820, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.192 std_dev=0.628
C5'	A	0, 0.040, 0.756, 1.473, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.756 std_dev=0.717
O2'	B	0, 0.262, 1.012, 1.762, 4.449 max_d=4.449 avg_d=1.012 std_dev=0.750
P	B	0, 0.318, 1.093, 1.868, 2.934 max_d=2.934 avg_d=1.093 std_dev=0.775
O5'	A	0, 0.083, 0.860, 1.637, 3.218 max_d=3.218 avg_d=0.860 std_dev=0.777
O3'	A	0, -0.127, 0.799, 1.726, 3.203 max_d=3.203 avg_d=0.799 std_dev=0.926
OP1	B	0, 0.354, 1.303, 2.252, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.303 std_dev=0.949
OP2	B	0, 0.189, 1.333, 2.478, 3.992 max_d=3.992 avg_d=1.333 std_dev=1.145
P	A	0, 0.023, 1.216, 2.409, 4.600 max_d=4.600 avg_d=1.216 std_dev=1.193
OP2	A	0, 0.013, 1.325, 2.636, 6.818 max_d=6.818 avg_d=1.325 std_dev=1.312
OP1	A	0, -0.030, 1.428, 2.886, 4.988 max_d=4.988 avg_d=1.428 std_dev=1.458

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.18	0.01	0.19	0.02	0.11	0.34	0.23
C2	0.04	0.00	0.23	0.24	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.32	0.14	0.23	0.01	0.14	0.50	0.33
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.02	0.07	0.12	0.11	0.11	0.18	0.27	0.23	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.09	0.28	0.42	0.31
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.19	0.00	0.23	0.02	0.25	0.25	0.25	0.25	0.21	0.26	0.15	0.02	0.01	0.02	0.10	0.27	0.09	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.12	0.19	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.17	0.07	0.24	0.02	0.13	0.51	0.33
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.06	0.10	0.07	0.13	0.06	0.20	0.02	0.00	0.02	0.10	0.09	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.23	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.14	0.04	0.30	0.02	0.17	0.63	0.38
C5'	0.06	0.10	0.12	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.10	0.11	0.09	0.15	0.07	0.08	0.14	0.02	0.01	0.14	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.25	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.19	0.06	0.30	0.01	0.19	0.66	0.40
C8	0.01	0.01	0.11	0.25	0.00	0.13	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.19	0.08	0.30	0.03	0.15	0.59	0.36
N1	0.03	0.00	0.18	0.25	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.26	0.10	0.27	0.01	0.17	0.59	0.37
N2	0.05	0.01	0.27	0.25	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.41	0.16	0.21	0.02	0.14	0.47	0.32
N3	0.03	0.01	0.23	0.21	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.31	0.13	0.21	0.01	0.13	0.45	0.31
N7	0.01	0.01	0.07	0.26	0.00	0.13	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.20	0.05	0.33	0.03	0.20	0.68	0.41
N9	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.01	0.23	0.02	0.11	0.47	0.30
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.16	0.20	0.22	0.08	0.23	0.24	0.20	0.21	0.17	0.26	0.14	0.00	0.06	0.13	0.19	0.26	0.21	0.42	0.23
O3'	0.18	0.32	0.02	0.01	0.17	0.02	0.14	0.14	0.19	0.19	0.26	0.41	0.31	0.20	0.06	0.06	0.00	0.12	0.21	0.20	0.26	0.23	0.20
O4'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.16	0.13	0.05	0.01	0.13	0.12	0.00	0.14	0.05	0.13	0.24	0.20
O5'	0.19	0.23	0.28	0.10	0.24	0.02	0.30	0.01	0.30	0.30	0.27	0.21	0.21	0.33	0.23	0.19	0.21	0.14	0.00	0.33	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.27	0.02	0.10	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.26	0.20	0.05	0.33	0.00	0.23	0.72	0.43
OP1	0.11	0.14	0.28	0.09	0.13	0.09	0.17	0.08	0.19	0.15	0.17	0.14	0.13	0.20	0.11	0.21	0.26	0.13	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.50	0.42	0.14	0.51	0.08	0.63	0.02	0.66	0.59	0.59	0.47	0.45	0.68	0.47	0.42	0.23	0.24	0.03	0.72	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.33	0.31	0.10	0.33	0.06	0.38	0.01	0.40	0.36	0.37	0.32	0.31	0.41	0.30	0.23	0.20	0.20	0.01	0.43	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.27	0.21	0.11	0.15	0.13	0.11	0.16	0.11	0.09	0.20	0.31	0.18	0.11	0.33	0.20	0.16	0.17	0.23	0.43	0.26
C2	0.18	0.16	0.24	0.19	0.10	0.12	0.12	0.09	0.19	0.10	0.11	0.19	0.32	0.16	0.11	0.28	0.17	0.15	0.17	0.22	0.41	0.25
C2'	0.24	0.23	0.29	0.26	0.24	0.24	0.31	0.24	0.34	0.30	0.26	0.24	0.47	0.36	0.24	0.35	0.30	0.26	0.25	0.28	0.45	0.33
C3'	0.28	0.26	0.26	0.26	0.32	0.29	0.41	0.33	0.43	0.42	0.33	0.26	0.55	0.48	0.33	0.27	0.28	0.34	0.35	0.40	0.55	0.45
C4	0.17	0.21	0.22	0.18	0.11	0.11	0.12	0.10	0.15	0.12	0.10	0.22	0.30	0.18	0.10	0.27	0.16	0.14	0.18	0.25	0.45	0.29
C4'	0.12	0.13	0.20	0.16	0.11	0.09	0.20	0.13	0.23	0.20	0.13	0.14	0.37	0.27	0.12	0.25	0.16	0.15	0.21	0.28	0.48	0.33
C5	0.15	0.27	0.18	0.17	0.13	0.09	0.12	0.12	0.13	0.14	0.16	0.24	0.27	0.20	0.11	0.23	0.14	0.12	0.21	0.31	0.50	0.34
C5'	0.13	0.16	0.19	0.18	0.13	0.11	0.22	0.18	0.23	0.23	0.15	0.16	0.35	0.29	0.14	0.23	0.18	0.16	0.26	0.35	0.54	0.39
C6	0.15	0.30	0.17	0.17	0.14	0.09	0.12	0.13	0.12	0.14	0.21	0.25	0.27	0.19	0.12	0.21	0.14	0.12	0.21	0.32	0.50	0.34
C8	0.16	0.26	0.19	0.17	0.12	0.09	0.13	0.12	0.13	0.15	0.14	0.24	0.27	0.21	0.10	0.25	0.14	0.12	0.21	0.32	0.52	0.35
N1	0.16	0.25	0.19	0.17	0.12	0.09	0.12	0.10	0.15	0.11	0.13	0.22	0.31	0.17	0.11	0.23	0.14	0.13	0.18	0.25	0.44	0.29
N2	0.19	0.11	0.28	0.22	0.11	0.16	0.14	0.12	0.23	0.11	0.21	0.15	0.32	0.15	0.12	0.31	0.21	0.18	0.18	0.22	0.39	0.23
N3	0.18	0.15	0.26	0.20	0.10	0.13	0.12	0.10	0.18	0.10	0.10	0.19	0.32	0.16	0.11	0.30	0.19	0.16	0.17	0.22	0.41	0.25
N7	0.15	0.29	0.17	0.17	0.13	0.09	0.13	0.15	0.12	0.16	0.18	0.25	0.25	0.22	0.11	0.22	0.14	0.12	0.24	0.36	0.55	0.38
N9	0.17	0.21	0.23	0.19	0.11	0.11	0.12	0.10	0.15	0.12	0.10	0.22	0.29	0.19	0.10	0.28	0.16	0.14	0.18	0.26	0.46	0.30
O2'	0.17	0.16	0.27	0.24	0.19	0.18	0.31	0.21	0.37	0.28	0.27	0.15	0.51	0.36	0.19	0.32	0.27	0.19	0.28	0.31	0.49	0.37
O3'	0.30	0.28	0.28	0.32	0.37	0.34	0.48	0.41	0.50	0.48	0.39	0.27	0.61	0.55	0.38	0.23	0.36	0.37	0.47	0.53	0.68	0.59
O4'	0.22	0.23	0.31	0.27	0.15	0.19	0.13	0.16	0.15	0.13	0.13	0.25	0.26	0.17	0.15	0.36	0.25	0.18	0.23	0.30	0.48	0.32
O5'	0.28	0.30	0.29	0.31	0.28	0.28	0.32	0.32	0.32	0.35	0.28	0.30	0.41	0.39	0.29	0.30	0.32	0.30	0.41	0.51	0.71	0.54
O6	0.16	0.35	0.15	0.19	0.17	0.12	0.14	0.18	0.15	0.17	0.30	0.28	0.22	0.21	0.14	0.21	0.17	0.13	0.25	0.38	0.55	0.39
OP1	0.22	0.29	0.25	0.23	0.22	0.20	0.23	0.23	0.22	0.25	0.24	0.27	0.27	0.28	0.22	0.29	0.24	0.24	0.31	0.43	0.63	0.46
OP2	0.61	0.65	0.60	0.61	0.62	0.61	0.64	0.63	0.64	0.65	0.64	0.63	0.66	0.66	0.62	0.60	0.62	0.62	0.72	0.82	1.02	0.84
P	0.40	0.46	0.43	0.41	0.39	0.37	0.37	0.36	0.37	0.37	0.41	0.45	0.38	0.38	0.38	0.46	0.43	0.38	0.45	0.56	0.75	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.10	0.18	0.18	0.16
C2	0.02	0.00	0.18	0.17	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.23	0.08	0.16	0.18	0.34	0.21
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.09	0.09	0.07	0.14	0.18	0.08	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.20	0.30	0.35	0.26
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.15	0.14	0.16	0.16	0.16	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.18	0.23	0.29	0.19
C4	0.01	0.01	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.13	0.04	0.16	0.18	0.31	0.21
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.06	0.07	0.08	0.09	0.04	0.11	0.02	0.00	0.01	0.14	0.04	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.03	0.20	0.24	0.40	0.28
C5'	0.04	0.11	0.09	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.12	0.10	0.15	0.15	0.08	0.05	0.08	0.02	0.01	0.08	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.05	0.21	0.26	0.44	0.30
C8	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.11	0.06	0.18	0.21	0.32	0.25
N1	0.02	0.00	0.14	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.07	0.19	0.23	0.40	0.26
N3	0.02	0.00	0.18	0.16	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.22	0.08	0.14	0.17	0.29	0.19
N6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.12	0.04	0.24	0.33	0.50	0.35
N7	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.11	0.04	0.22	0.28	0.42	0.31
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.13	0.16	0.26	0.18
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.11	0.09	0.05	0.09	0.14	0.10	0.13	0.11	0.14	0.07	0.00	0.05	0.07	0.15	0.30	0.37	0.24
O3'	0.13	0.23	0.03	0.01	0.13	0.02	0.10	0.08	0.13	0.11	0.19	0.22	0.12	0.11	0.07	0.05	0.00	0.09	0.22	0.32	0.37	0.26
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.08	0.04	0.04	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.20	0.17	0.20
O5'	0.10	0.16	0.20	0.18	0.16	0.01	0.20	0.01	0.21	0.18	0.19	0.14	0.24	0.22	0.13	0.15	0.22	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.18	0.30	0.23	0.18	0.14	0.24	0.08	0.26	0.21	0.23	0.17	0.33	0.28	0.16	0.30	0.32	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.34	0.35	0.29	0.31	0.04	0.40	0.05	0.44	0.32	0.40	0.29	0.50	0.42	0.26	0.37	0.37	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.21	0.26	0.19	0.21	0.06	0.28	0.02	0.30	0.25	0.26	0.19	0.35	0.31	0.18	0.24	0.26	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00