Doublet Group distance statistics: 52634

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 3, 3, 7, 11, 8, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.012, 0.026, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.015, 0.032, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.032 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.019, 0.038, 0.057, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.027, 0.053, 0.078, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.053 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.032, 0.062, 0.092, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.062 std_dev=0.030
N1	B	0, 0.203, 0.354, 0.505, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.354 std_dev=0.151
C2	B	0, 0.171, 0.334, 0.496, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.334 std_dev=0.162
N3	B	0, 0.305, 0.468, 0.632, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.468 std_dev=0.163
C6	B	0, 0.398, 0.578, 0.757, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.578 std_dev=0.180
N6	B	0, 0.457, 0.672, 0.887, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.672 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.466, 0.685, 0.905, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.685 std_dev=0.220
C5	B	0, 0.513, 0.764, 1.015, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.764 std_dev=0.251
O4'	A	0, -0.088, 0.179, 0.445, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.179 std_dev=0.267
C2'	A	0, -0.080, 0.207, 0.494, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.207 std_dev=0.287
N9	B	0, 0.606, 0.925, 1.244, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.925 std_dev=0.319
C2'	B	0, 0.831, 1.160, 1.490, 1.745 max_d=1.745 avg_d=1.160 std_dev=0.330
O2'	A	0, -0.067, 0.265, 0.598, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.265 std_dev=0.333
C1'	B	0, 0.626, 0.959, 1.292, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.959 std_dev=0.333
C4'	A	0, -0.110, 0.249, 0.609, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.249 std_dev=0.359
N7	B	0, 0.657, 1.048, 1.439, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.048 std_dev=0.391
O2'	B	0, 0.559, 0.957, 1.354, 2.303 max_d=2.303 avg_d=0.957 std_dev=0.398
C8	B	0, 0.705, 1.133, 1.561, 2.047 max_d=2.047 avg_d=1.133 std_dev=0.428
C3'	A	0, -0.144, 0.290, 0.724, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.290 std_dev=0.434
C3'	B	0, 1.328, 1.847, 2.366, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.847 std_dev=0.519
O4'	B	0, 0.999, 1.578, 2.157, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.578 std_dev=0.579
O3'	B	0, 1.623, 2.230, 2.837, 2.890 max_d=2.890 avg_d=2.230 std_dev=0.607
O3'	A	0, -0.189, 0.424, 1.038, 2.502 max_d=2.502 avg_d=0.424 std_dev=0.613
C4'	B	0, 1.341, 1.969, 2.598, 2.746 max_d=2.746 avg_d=1.969 std_dev=0.629
C5'	A	0, -0.159, 0.498, 1.155, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.498 std_dev=0.657
C5'	B	0, 1.942, 2.712, 3.482, 3.651 max_d=3.651 avg_d=2.712 std_dev=0.770
O5'	A	0, -0.182, 0.802, 1.785, 4.332 max_d=4.332 avg_d=0.802 std_dev=0.983
O5'	B	0, 2.100, 3.481, 4.863, 4.745 max_d=4.745 avg_d=3.481 std_dev=1.381
P	A	0, -0.120, 1.262, 2.643, 6.116 max_d=6.116 avg_d=1.262 std_dev=1.381
OP1	A	0, 0.224, 1.630, 3.035, 6.501 max_d=6.501 avg_d=1.630 std_dev=1.405
OP2	A	0, -0.454, 1.339, 3.131, 7.562 max_d=7.562 avg_d=1.339 std_dev=1.792
P	B	0, 3.188, 5.396, 7.604, 7.267 max_d=7.267 avg_d=5.396 std_dev=2.208
OP2	B	0, 3.735, 6.099, 8.462, 8.080 max_d=8.080 avg_d=6.099 std_dev=2.363
OP1	B	0, 3.902, 6.457, 9.011, 8.492 max_d=8.492 avg_d=6.457 std_dev=2.554

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.18	0.01	0.17	0.28	0.18
C2	0.02	0.00	0.15	0.23	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.28	0.02	0.23	0.01	0.21	0.44	0.28
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.09	0.11	0.18	0.16	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.05	0.20	0.10	0.07
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.12	0.00	0.08	0.02	0.11	0.13	0.18	0.28	0.22	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.20	0.07	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.32	0.01	0.29	0.56	0.39
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.09	0.13	0.10	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.03	0.07	0.19	0.07	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.45	0.01	0.46	0.79	0.56
C5'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.11	0.12	0.13	0.16	0.12	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.15	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.42	0.01	0.46	0.79	0.55
C8	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.04	0.58	0.02	0.56	0.88	0.66
N1	0.02	0.00	0.11	0.18	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.22	0.02	0.32	0.01	0.32	0.61	0.41
N2	0.04	0.00	0.18	0.28	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.36	0.03	0.18	0.01	0.19	0.33	0.20
N3	0.02	0.00	0.16	0.22	0.00	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.26	0.02	0.20	0.01	0.18	0.38	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.59	0.02	0.63	1.00	0.73
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.37	0.02	0.31	0.57	0.41
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.07	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.12	0.05	0.36	0.13	0.17
O3'	0.02	0.28	0.02	0.00	0.13	0.02	0.08	0.02	0.13	0.15	0.22	0.36	0.26	0.12	0.04	0.04	0.00	0.02	0.20	0.11	0.32	0.35	0.27
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.18	0.04	0.16	0.24	0.17
O5'	0.18	0.23	0.07	0.07	0.32	0.03	0.45	0.01	0.42	0.58	0.32	0.18	0.20	0.59	0.37	0.12	0.20	0.18	0.00	0.48	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.11	0.04	0.48	0.00	0.56	0.92	0.64
OP1	0.17	0.21	0.20	0.20	0.29	0.19	0.46	0.15	0.46	0.56	0.32	0.19	0.18	0.63	0.31	0.36	0.32	0.16	0.02	0.56	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.44	0.10	0.07	0.56	0.07	0.79	0.13	0.79	0.88	0.61	0.33	0.38	1.00	0.57	0.13	0.35	0.24	0.01	0.92	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.28	0.07	0.09	0.39	0.07	0.56	0.01	0.55	0.66	0.41	0.20	0.24	0.73	0.41	0.17	0.27	0.17	0.00	0.64	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.38	0.62	0.09	0.35	0.10	0.55	0.11	0.11	0.10	0.10	0.15	0.12	0.10	0.19	0.69	0.09	0.87	1.42	1.48	1.13
C2	0.10	0.11	0.35	0.55	0.09	0.27	0.10	0.43	0.12	0.10	0.11	0.10	0.16	0.11	0.09	0.17	0.58	0.07	0.78	1.16	1.29	0.94
C2'	0.15	0.14	0.25	0.45	0.13	0.16	0.14	0.33	0.15	0.14	0.14	0.14	0.19	0.15	0.13	0.14	0.53	0.19	0.68	1.15	1.26	0.89
C3'	0.25	0.23	0.19	0.37	0.23	0.14	0.22	0.26	0.22	0.23	0.22	0.23	0.23	0.22	0.23	0.18	0.46	0.31	0.62	1.08	1.21	0.83
C4	0.10	0.10	0.31	0.54	0.08	0.28	0.10	0.47	0.10	0.10	0.09	0.10	0.14	0.11	0.09	0.15	0.57	0.07	0.81	1.28	1.40	1.04
C4'	0.12	0.13	0.30	0.54	0.11	0.24	0.12	0.44	0.13	0.12	0.13	0.12	0.16	0.14	0.11	0.16	0.63	0.14	0.79	1.35	1.42	1.05
C5	0.11	0.11	0.24	0.45	0.09	0.24	0.10	0.42	0.10	0.11	0.09	0.10	0.14	0.12	0.10	0.15	0.47	0.09	0.77	1.21	1.35	1.00
C5'	0.14	0.15	0.25	0.49	0.13	0.20	0.15	0.40	0.16	0.15	0.15	0.14	0.19	0.16	0.14	0.15	0.59	0.17	0.76	1.35	1.42	1.05
C6	0.11	0.12	0.21	0.40	0.10	0.21	0.11	0.37	0.10	0.11	0.10	0.11	0.14	0.12	0.10	0.16	0.40	0.10	0.72	1.10	1.27	0.92
C8	0.11	0.10	0.26	0.49	0.09	0.27	0.10	0.47	0.10	0.12	0.09	0.10	0.14	0.13	0.10	0.15	0.52	0.09	0.81	1.33	1.43	1.08
N1	0.10	0.11	0.27	0.45	0.09	0.22	0.10	0.38	0.10	0.10	0.09	0.10	0.15	0.11	0.09	0.14	0.46	0.08	0.73	1.08	1.24	0.89
N2	0.11	0.13	0.42	0.59	0.12	0.28	0.12	0.43	0.14	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.11	0.23	0.64	0.08	0.76	1.11	1.23	0.89
N3	0.10	0.11	0.37	0.59	0.09	0.30	0.10	0.48	0.11	0.10	0.11	0.11	0.15	0.11	0.10	0.19	0.64	0.07	0.82	1.27	1.37	1.02
N7	0.12	0.11	0.22	0.43	0.10	0.24	0.11	0.43	0.11	0.13	0.10	0.11	0.14	0.13	0.11	0.16	0.44	0.10	0.76	1.24	1.37	1.02
N9	0.10	0.10	0.32	0.55	0.09	0.30	0.10	0.50	0.10	0.11	0.09	0.10	0.14	0.12	0.09	0.16	0.60	0.08	0.83	1.35	1.44	1.09
O2'	0.09	0.11	0.35	0.55	0.10	0.24	0.13	0.41	0.15	0.12	0.13	0.10	0.19	0.14	0.10	0.17	0.64	0.12	0.75	1.24	1.32	0.95
O3'	0.34	0.30	0.18	0.30	0.30	0.21	0.29	0.24	0.27	0.30	0.28	0.31	0.27	0.29	0.31	0.23	0.41	0.43	0.55	0.95	1.11	0.72
O4'	0.12	0.11	0.40	0.66	0.10	0.39	0.10	0.60	0.10	0.12	0.10	0.11	0.13	0.12	0.11	0.21	0.75	0.10	0.93	1.53	1.57	1.21
O5'	0.28	0.23	0.45	0.69	0.30	0.45	0.36	0.65	0.36	0.38	0.29	0.24	0.44	0.41	0.31	0.31	0.79	0.31	0.96	1.49	1.57	1.21
O6	0.14	0.15	0.18	0.33	0.13	0.18	0.13	0.32	0.12	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.20	0.30	0.12	0.66	0.99	1.19	0.85
OP1	0.27	0.22	0.38	0.62	0.30	0.41	0.39	0.61	0.40	0.42	0.29	0.22	0.50	0.46	0.32	0.26	0.70	0.32	0.94	1.50	1.59	1.22
OP2	0.58	0.50	0.74	0.98	0.62	0.78	0.72	0.98	0.72	0.76	0.59	0.51	0.83	0.81	0.65	0.59	1.05	0.61	1.28	1.74	1.83	1.49
P	0.38	0.32	0.54	0.80	0.41	0.58	0.49	0.79	0.49	0.52	0.39	0.33	0.59	0.56	0.44	0.40	0.89	0.41	1.10	1.63	1.70	1.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.20	0.16	0.21	0.11
C2	0.03	0.00	0.28	0.40	0.01	0.15	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.41	0.08	0.57	0.74	0.88	0.59
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.13	0.01	0.05	0.07	0.11	0.15	0.20	0.29	0.07	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.21	0.21	0.28	0.16
C3'	0.01	0.40	0.00	0.00	0.24	0.00	0.20	0.02	0.27	0.16	0.35	0.37	0.25	0.15	0.10	0.02	0.00	0.01	0.15	0.24	0.24	0.12
C4	0.02	0.01	0.13	0.24	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.04	0.49	0.52	0.67	0.44
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.14	0.10	0.15	0.13	0.14	0.11	0.06	0.11	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.13
C5	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.02	0.54	0.61	0.80	0.56
C5'	0.03	0.26	0.07	0.02	0.19	0.00	0.22	0.00	0.26	0.15	0.27	0.21	0.28	0.20	0.12	0.05	0.08	0.02	0.01	0.16	0.09	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.27	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.23	0.03	0.60	0.76	0.97	0.68
C8	0.01	0.01	0.15	0.16	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.16	0.16	0.07	0.38	0.32	0.44	0.31
N1	0.02	0.00	0.20	0.35	0.01	0.15	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.35	0.06	0.61	0.81	0.99	0.68
N3	0.03	0.00	0.29	0.37	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.37	0.09	0.50	0.59	0.72	0.47
N6	0.02	0.01	0.07	0.25	0.01	0.14	0.01	0.28	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.19	0.03	0.62	0.82	1.04	0.75
N7	0.01	0.01	0.10	0.15	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.11	0.05	0.48	0.50	0.67	0.49
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.37	0.31	0.42	0.26
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.06	0.11	0.11	0.05	0.10	0.16	0.08	0.10	0.13	0.17	0.08	0.00	0.07	0.10	0.12	0.25	0.23	0.20
O3'	0.12	0.41	0.03	0.00	0.20	0.01	0.13	0.08	0.23	0.16	0.35	0.37	0.19	0.11	0.05	0.07	0.00	0.09	0.17	0.33	0.24	0.17
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.09	0.03	0.05	0.01	0.10	0.09	0.00	0.14	0.20	0.20	0.20
O5'	0.20	0.57	0.21	0.15	0.49	0.01	0.54	0.01	0.60	0.38	0.61	0.50	0.62	0.48	0.37	0.12	0.17	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.16	0.74	0.21	0.24	0.52	0.16	0.61	0.16	0.76	0.32	0.81	0.59	0.82	0.50	0.31	0.25	0.33	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.88	0.28	0.24	0.67	0.12	0.80	0.09	0.97	0.44	0.99	0.72	1.04	0.67	0.42	0.23	0.24	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.59	0.16	0.12	0.44	0.13	0.56	0.02	0.68	0.31	0.68	0.47	0.75	0.49	0.26	0.20	0.17	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00