Doublet Group distance statistics: 52635

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 4, 4, 3, 2, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.019, 0.033, 0.047, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.020, 0.037, 0.054, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.037 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.024, 0.045, 0.067, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.045 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.020, 0.046, 0.073, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.046 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.031, 0.059, 0.087, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.059 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.030, 0.072, 0.113, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.072 std_dev=0.042
C8	A	0, 0.034, 0.082, 0.130, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.082 std_dev=0.048
N3	B	0, 0.217, 0.423, 0.629, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.423 std_dev=0.206
C2	B	0, 0.235, 0.442, 0.648, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.442 std_dev=0.206
N1	B	0, 0.237, 0.476, 0.716, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.476 std_dev=0.240
C4	B	0, 0.188, 0.428, 0.668, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.428 std_dev=0.240
C5	B	0, 0.240, 0.512, 0.785, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.512 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.255, 0.535, 0.815, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.535 std_dev=0.280
C1'	B	0, 0.188, 0.469, 0.749, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.469 std_dev=0.280
N9	B	0, 0.167, 0.450, 0.733, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.450 std_dev=0.283
C8	B	0, 0.223, 0.563, 0.902, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.563 std_dev=0.339
O4'	A	0, -0.065, 0.276, 0.616, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.276 std_dev=0.341
C2'	A	0, -0.035, 0.308, 0.650, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.308 std_dev=0.342
N7	B	0, 0.267, 0.613, 0.959, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.613 std_dev=0.346
C2'	B	0, 0.254, 0.603, 0.953, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.603 std_dev=0.349
O4'	B	0, 0.230, 0.590, 0.949, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.590 std_dev=0.360
N6	B	0, 0.309, 0.679, 1.048, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.679 std_dev=0.370
C3'	B	0, 0.316, 0.761, 1.206, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.761 std_dev=0.445
O2'	B	0, 0.242, 0.688, 1.134, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.688 std_dev=0.446
C4'	B	0, 0.278, 0.737, 1.197, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.737 std_dev=0.460
OP2	B	0, 0.348, 0.810, 1.271, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.810 std_dev=0.462
O2'	A	0, -0.027, 0.470, 0.967, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.470 std_dev=0.497
P	B	0, 0.305, 0.827, 1.350, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.827 std_dev=0.523
O5'	B	0, 0.308, 0.831, 1.354, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.831 std_dev=0.523
C4'	A	0, -0.101, 0.440, 0.981, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.440 std_dev=0.541
C5'	B	0, 0.324, 0.869, 1.414, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.869 std_dev=0.545
C3'	A	0, -0.087, 0.460, 1.006, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.460 std_dev=0.547
OP1	B	0, 0.368, 0.954, 1.540, 2.156 max_d=2.156 avg_d=0.954 std_dev=0.586
O3'	B	0, 0.356, 0.995, 1.634, 2.852 max_d=2.852 avg_d=0.995 std_dev=0.639
C5'	A	0, -0.081, 0.674, 1.429, 2.905 max_d=2.905 avg_d=0.674 std_dev=0.755
O3'	A	0, -0.133, 0.648, 1.430, 2.904 max_d=2.904 avg_d=0.648 std_dev=0.782
O5'	A	0, -0.013, 0.848, 1.708, 3.643 max_d=3.643 avg_d=0.848 std_dev=0.861
P	A	0, 0.126, 1.176, 2.226, 3.529 max_d=3.529 avg_d=1.176 std_dev=1.050
OP2	A	0, 0.145, 1.219, 2.294, 3.250 max_d=3.250 avg_d=1.219 std_dev=1.074
OP1	A	0, 0.177, 1.436, 2.696, 3.971 max_d=3.971 avg_d=1.436 std_dev=1.260

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.15	0.01	0.14	0.02	0.19	0.32	0.18
C2	0.05	0.00	0.29	0.29	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.32	0.14	0.23	0.02	0.37	0.44	0.31
C2'	0.01	0.29	0.00	0.02	0.16	0.03	0.10	0.13	0.15	0.12	0.23	0.35	0.28	0.07	0.04	0.01	0.05	0.02	0.21	0.12	0.35	0.46	0.29
C3'	0.02	0.29	0.02	0.00	0.23	0.01	0.26	0.03	0.30	0.22	0.30	0.30	0.25	0.26	0.16	0.04	0.01	0.02	0.16	0.31	0.28	0.22	0.15
C4	0.02	0.01	0.16	0.23	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.08	0.23	0.02	0.30	0.37	0.26
C4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.15	0.09	0.10	0.07	0.15	0.07	0.21	0.04	0.01	0.03	0.13	0.12	0.17	0.05
C5	0.02	0.02	0.10	0.26	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.22	0.05	0.29	0.01	0.33	0.40	0.31
C5'	0.06	0.15	0.13	0.03	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.20	0.18	0.16	0.14	0.22	0.12	0.10	0.11	0.02	0.01	0.23	0.08	0.11	0.03
C6	0.03	0.02	0.15	0.30	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.17	0.27	0.07	0.30	0.01	0.39	0.46	0.36
C8	0.02	0.02	0.12	0.22	0.01	0.15	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.23	0.19	0.11	0.29	0.02	0.25	0.32	0.24
N1	0.04	0.01	0.23	0.30	0.02	0.09	0.02	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.30	0.11	0.27	0.02	0.40	0.47	0.35
N2	0.06	0.01	0.35	0.30	0.02	0.10	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.25	0.37	0.17	0.23	0.03	0.39	0.45	0.31
N3	0.05	0.01	0.28	0.25	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.28	0.14	0.21	0.02	0.32	0.39	0.26
N7	0.02	0.02	0.07	0.26	0.01	0.15	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.24	0.23	0.08	0.33	0.03	0.31	0.37	0.31
N9	0.01	0.02	0.04	0.16	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.12	0.03	0.20	0.02	0.23	0.33	0.20
O2'	0.02	0.18	0.01	0.04	0.11	0.21	0.17	0.10	0.17	0.23	0.15	0.25	0.17	0.24	0.12	0.00	0.08	0.14	0.15	0.20	0.25	0.45	0.20
O3'	0.15	0.32	0.05	0.01	0.20	0.04	0.22	0.11	0.27	0.19	0.30	0.37	0.28	0.23	0.12	0.08	0.00	0.10	0.22	0.28	0.41	0.27	0.25
O4'	0.01	0.14	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.07	0.11	0.11	0.17	0.14	0.08	0.03	0.14	0.10	0.00	0.11	0.06	0.13	0.28	0.17
O5'	0.14	0.23	0.21	0.16	0.23	0.03	0.29	0.01	0.30	0.29	0.27	0.23	0.21	0.33	0.20	0.15	0.22	0.11	0.00	0.34	0.04	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.12	0.31	0.02	0.13	0.01	0.23	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.20	0.28	0.06	0.34	0.00	0.42	0.49	0.40
OP1	0.19	0.37	0.35	0.28	0.30	0.12	0.33	0.08	0.39	0.25	0.40	0.39	0.32	0.31	0.23	0.25	0.41	0.13	0.04	0.42	0.00	0.03	0.01
OP2	0.32	0.44	0.46	0.22	0.37	0.17	0.40	0.11	0.46	0.32	0.47	0.45	0.39	0.37	0.33	0.45	0.27	0.28	0.03	0.49	0.03	0.00	0.01
P	0.18	0.31	0.29	0.15	0.26	0.05	0.31	0.03	0.36	0.24	0.35	0.31	0.26	0.31	0.20	0.20	0.25	0.17	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.23	0.25	0.10	0.15	0.08	0.15	0.10	0.09	0.08	0.15	0.17	0.11	0.10	0.30	0.42	0.19	0.18	0.19	0.26	0.17
C2	0.15	0.13	0.25	0.29	0.10	0.17	0.09	0.17	0.12	0.09	0.09	0.15	0.20	0.10	0.11	0.30	0.42	0.16	0.19	0.21	0.27	0.19
C2'	0.41	0.36	0.40	0.37	0.33	0.40	0.27	0.36	0.24	0.30	0.28	0.38	0.22	0.26	0.34	0.49	0.51	0.44	0.32	0.29	0.29	0.27
C3'	0.52	0.43	0.45	0.42	0.45	0.51	0.42	0.51	0.38	0.47	0.38	0.47	0.37	0.44	0.48	0.52	0.52	0.58	0.48	0.44	0.44	0.45
C4	0.13	0.14	0.22	0.25	0.09	0.13	0.08	0.13	0.10	0.09	0.08	0.15	0.18	0.11	0.09	0.28	0.39	0.15	0.18	0.19	0.27	0.18
C4'	0.26	0.19	0.25	0.25	0.20	0.24	0.18	0.24	0.15	0.22	0.13	0.22	0.19	0.21	0.22	0.32	0.40	0.32	0.26	0.24	0.29	0.23
C5	0.11	0.15	0.19	0.22	0.09	0.10	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10	0.14	0.17	0.13	0.09	0.28	0.33	0.14	0.19	0.20	0.28	0.19
C5'	0.32	0.23	0.30	0.31	0.27	0.31	0.27	0.34	0.24	0.32	0.20	0.27	0.27	0.32	0.30	0.34	0.42	0.39	0.37	0.36	0.42	0.36
C6	0.11	0.16	0.19	0.22	0.10	0.10	0.10	0.12	0.10	0.10	0.11	0.14	0.18	0.13	0.09	0.28	0.31	0.13	0.18	0.20	0.28	0.19
C8	0.12	0.15	0.19	0.21	0.10	0.11	0.10	0.13	0.10	0.12	0.10	0.14	0.17	0.14	0.10	0.27	0.34	0.16	0.20	0.21	0.28	0.20
N1	0.12	0.14	0.21	0.25	0.09	0.13	0.08	0.13	0.11	0.08	0.07	0.14	0.19	0.10	0.09	0.29	0.36	0.13	0.18	0.20	0.27	0.18
N2	0.19	0.14	0.30	0.33	0.14	0.22	0.13	0.22	0.16	0.12	0.14	0.18	0.22	0.13	0.15	0.32	0.47	0.19	0.22	0.25	0.29	0.22
N3	0.15	0.13	0.26	0.28	0.10	0.17	0.09	0.16	0.11	0.08	0.08	0.15	0.19	0.10	0.11	0.30	0.43	0.17	0.19	0.21	0.27	0.18
N7	0.12	0.16	0.18	0.20	0.10	0.10	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.14	0.17	0.15	0.10	0.27	0.31	0.15	0.20	0.21	0.29	0.21
N9	0.13	0.14	0.22	0.24	0.09	0.13	0.09	0.13	0.10	0.09	0.09	0.15	0.17	0.12	0.09	0.28	0.39	0.16	0.18	0.19	0.27	0.18
O2'	0.28	0.22	0.32	0.30	0.20	0.28	0.15	0.26	0.15	0.17	0.16	0.25	0.20	0.15	0.21	0.39	0.48	0.31	0.23	0.20	0.23	0.18
O3'	0.60	0.46	0.52	0.49	0.49	0.60	0.43	0.59	0.37	0.50	0.38	0.52	0.32	0.44	0.53	0.59	0.58	0.67	0.53	0.49	0.44	0.49
O4'	0.15	0.16	0.27	0.31	0.11	0.16	0.10	0.17	0.11	0.11	0.11	0.16	0.18	0.13	0.11	0.31	0.46	0.17	0.23	0.26	0.32	0.23
O5'	0.43	0.32	0.36	0.37	0.38	0.42	0.39	0.46	0.36	0.45	0.31	0.35	0.38	0.44	0.42	0.39	0.42	0.50	0.49	0.48	0.52	0.48
O6	0.13	0.17	0.17	0.19	0.12	0.10	0.13	0.13	0.13	0.14	0.15	0.15	0.18	0.16	0.12	0.29	0.26	0.14	0.19	0.22	0.29	0.22
OP1	0.72	0.50	0.61	0.62	0.62	0.73	0.61	0.78	0.53	0.71	0.46	0.58	0.52	0.68	0.69	0.64	0.60	0.82	0.79	0.75	0.74	0.75
OP2	0.68	0.52	0.61	0.65	0.62	0.70	0.62	0.75	0.56	0.71	0.50	0.57	0.56	0.69	0.67	0.61	0.63	0.76	0.78	0.76	0.77	0.76
P	0.55	0.39	0.48	0.51	0.49	0.55	0.50	0.61	0.44	0.57	0.38	0.44	0.46	0.56	0.54	0.48	0.52	0.62	0.64	0.64	0.66	0.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.14	0.01	0.13	0.17	0.20	0.13
C2	0.03	0.00	0.16	0.18	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.23	0.08	0.15	0.18	0.24	0.14
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.11	0.09	0.08	0.13	0.16	0.08	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.22	0.35	0.33	0.27
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.15	0.01	0.18	0.03	0.20	0.18	0.19	0.16	0.22	0.20	0.12	0.03	0.01	0.02	0.11	0.26	0.18	0.13
C4	0.02	0.01	0.09	0.15	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.05	0.14	0.15	0.22	0.13
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.05	0.09	0.09	0.04	0.16	0.02	0.01	0.02	0.14	0.09	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.18	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.13	0.05	0.15	0.15	0.23	0.15
C5'	0.05	0.08	0.11	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.08	0.13	0.12	0.07	0.07	0.11	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01
C6	0.02	0.02	0.09	0.20	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.06	0.16	0.16	0.24	0.16
C8	0.02	0.02	0.08	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.14	0.08	0.14	0.13	0.21	0.13
N1	0.03	0.01	0.13	0.19	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.19	0.07	0.15	0.17	0.25	0.15
N3	0.04	0.01	0.16	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.23	0.08	0.15	0.18	0.23	0.13
N6	0.03	0.02	0.08	0.22	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.18	0.06	0.17	0.18	0.25	0.18
N7	0.02	0.02	0.06	0.20	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.17	0.15	0.07	0.16	0.14	0.22	0.15
N9	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.07	0.03	0.14	0.14	0.21	0.12
O2'	0.02	0.14	0.01	0.03	0.11	0.16	0.15	0.07	0.16	0.14	0.15	0.12	0.17	0.17	0.09	0.00	0.05	0.12	0.16	0.31	0.35	0.22
O3'	0.14	0.23	0.03	0.01	0.14	0.02	0.13	0.11	0.16	0.14	0.19	0.23	0.18	0.15	0.07	0.05	0.00	0.11	0.19	0.35	0.26	0.22
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.08	0.06	0.07	0.03	0.12	0.11	0.00	0.10	0.10	0.15	0.11
O5'	0.13	0.15	0.22	0.11	0.14	0.02	0.15	0.01	0.16	0.14	0.15	0.15	0.17	0.16	0.14	0.16	0.19	0.10	0.00	0.03	0.04	0.01
OP1	0.17	0.18	0.35	0.26	0.15	0.14	0.15	0.12	0.16	0.13	0.17	0.18	0.18	0.14	0.14	0.31	0.35	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.24	0.33	0.18	0.22	0.09	0.23	0.05	0.24	0.21	0.25	0.23	0.25	0.22	0.21	0.35	0.26	0.15	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.14	0.27	0.13	0.13	0.04	0.15	0.01	0.16	0.13	0.15	0.13	0.18	0.15	0.12	0.22	0.22	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00