Doublet Group distance statistics: 52636

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 6, 7, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.013, 0.023, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.024, 0.048, 0.071, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.048 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.027, 0.057, 0.087, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.057 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.027, 0.070, 0.113, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.070 std_dev=0.043
C4	B	0, 0.168, 0.268, 0.367, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.268 std_dev=0.099
N9	B	0, 0.184, 0.313, 0.441, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.313 std_dev=0.128
N1	B	0, 0.136, 0.271, 0.406, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.271 std_dev=0.135
C5	B	0, 0.119, 0.254, 0.389, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.254 std_dev=0.135
C6	B	0, 0.157, 0.301, 0.445, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.301 std_dev=0.144
C1'	B	0, 0.337, 0.538, 0.738, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.538 std_dev=0.201
O4'	B	0, 0.168, 0.376, 0.585, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.376 std_dev=0.208
C8	B	0, 0.131, 0.350, 0.569, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.350 std_dev=0.219
C4'	B	0, 0.260, 0.485, 0.711, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.485 std_dev=0.225
C2	B	0, 0.188, 0.422, 0.656, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.422 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.229, 0.470, 0.711, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.470 std_dev=0.241
N6	B	0, 0.284, 0.560, 0.836, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.560 std_dev=0.276
N7	B	0, 0.138, 0.431, 0.724, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.431 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.408, 0.782, 1.157, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.782 std_dev=0.374
C5'	B	0, 0.495, 0.877, 1.259, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.877 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.523, 0.912, 1.302, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.912 std_dev=0.390
C2'	A	0, 0.242, 0.693, 1.144, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.693 std_dev=0.451
O4'	A	0, 0.205, 0.673, 1.142, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.673 std_dev=0.468
O5'	B	0, 0.523, 1.008, 1.493, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.008 std_dev=0.485
O2'	B	0, 0.714, 1.235, 1.755, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.235 std_dev=0.521
O3'	B	0, 0.467, 0.991, 1.516, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.991 std_dev=0.525
O2'	A	0, 0.180, 0.714, 1.248, 2.651 max_d=2.651 avg_d=0.714 std_dev=0.534
C3'	A	0, 0.416, 1.119, 1.822, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.119 std_dev=0.703
O5'	A	0, 0.463, 1.175, 1.888, 3.165 max_d=3.165 avg_d=1.175 std_dev=0.713
C4'	A	0, 0.346, 1.078, 1.809, 2.934 max_d=2.934 avg_d=1.078 std_dev=0.731
P	B	0, 0.678, 1.441, 2.204, 3.207 max_d=3.207 avg_d=1.441 std_dev=0.763
OP1	B	0, 0.725, 1.601, 2.477, 3.427 max_d=3.427 avg_d=1.601 std_dev=0.876
O3'	A	0, 0.629, 1.544, 2.459, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.544 std_dev=0.915
OP2	B	0, 0.740, 1.682, 2.625, 3.886 max_d=3.886 avg_d=1.682 std_dev=0.943
P	A	0, 1.198, 2.202, 3.207, 4.408 max_d=4.408 avg_d=2.202 std_dev=1.004
C5'	A	0, 0.619, 1.781, 2.942, 4.614 max_d=4.614 avg_d=1.781 std_dev=1.161
OP2	A	0, 1.141, 2.477, 3.814, 5.428 max_d=5.428 avg_d=2.477 std_dev=1.336
OP1	A	0, 1.660, 3.003, 4.345, 5.736 max_d=5.736 avg_d=3.003 std_dev=1.343

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.12	0.01	0.29	0.03	0.41	0.38	0.35
C2	0.04	0.00	0.32	0.35	0.01	0.13	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.42	0.15	0.43	0.04	0.68	0.81	0.59
C2'	0.00	0.32	0.00	0.01	0.17	0.02	0.11	0.06	0.17	0.12	0.26	0.38	0.31	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.29	0.14	0.50	0.35	0.31
C3'	0.01	0.35	0.01	0.00	0.24	0.01	0.25	0.02	0.30	0.21	0.34	0.39	0.31	0.23	0.14	0.03	0.01	0.02	0.27	0.31	0.50	0.28	0.26
C4	0.02	0.01	0.17	0.24	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.08	0.47	0.02	0.63	0.84	0.61
C4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.16	0.11	0.17	0.12	0.16	0.07	0.17	0.02	0.01	0.02	0.13	0.27	0.21	0.11
C5	0.02	0.01	0.11	0.25	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.22	0.04	0.57	0.02	0.71	1.11	0.75
C5'	0.03	0.14	0.06	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.17	0.22	0.14	0.17	0.13	0.23	0.10	0.11	0.10	0.02	0.01	0.21	0.21	0.25	0.02
C6	0.02	0.02	0.17	0.30	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.30	0.07	0.57	0.01	0.76	1.18	0.78
C8	0.02	0.02	0.12	0.21	0.01	0.16	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.16	0.10	0.61	0.03	0.59	1.04	0.72
N1	0.03	0.01	0.26	0.34	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.15	0.38	0.12	0.51	0.03	0.74	1.02	0.70
N2	0.06	0.01	0.38	0.39	0.02	0.17	0.02	0.17	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.26	0.51	0.19	0.39	0.06	0.68	0.71	0.54
N3	0.04	0.01	0.31	0.31	0.01	0.12	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.18	0.37	0.14	0.40	0.03	0.63	0.69	0.53
N7	0.02	0.02	0.05	0.23	0.01	0.16	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.21	0.18	0.06	0.64	0.03	0.70	1.26	0.83
N9	0.01	0.02	0.03	0.14	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.46	0.03	0.54	0.74	0.56
O2'	0.02	0.19	0.01	0.03	0.10	0.17	0.14	0.11	0.13	0.21	0.15	0.26	0.18	0.21	0.10	0.00	0.06	0.12	0.12	0.15	0.40	0.37	0.19
O3'	0.12	0.42	0.03	0.01	0.23	0.02	0.22	0.10	0.30	0.16	0.38	0.51	0.37	0.18	0.08	0.06	0.00	0.07	0.30	0.31	0.48	0.45	0.29
O4'	0.01	0.15	0.02	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.10	0.12	0.19	0.14	0.06	0.01	0.12	0.07	0.00	0.28	0.06	0.34	0.34	0.34
O5'	0.29	0.43	0.29	0.27	0.47	0.02	0.57	0.01	0.57	0.61	0.51	0.39	0.40	0.64	0.46	0.12	0.30	0.28	0.00	0.61	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.04	0.14	0.31	0.02	0.13	0.02	0.21	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.15	0.31	0.06	0.61	0.00	0.80	1.32	0.85
OP1	0.41	0.68	0.50	0.50	0.63	0.27	0.71	0.21	0.76	0.59	0.74	0.68	0.63	0.70	0.54	0.40	0.48	0.34	0.03	0.80	0.00	0.02	0.01
OP2	0.38	0.81	0.35	0.28	0.84	0.21	1.11	0.25	1.18	1.04	1.02	0.71	0.69	1.26	0.74	0.37	0.45	0.34	0.02	1.32	0.02	0.00	0.01
P	0.35	0.59	0.31	0.26	0.61	0.11	0.75	0.02	0.78	0.72	0.70	0.54	0.53	0.83	0.56	0.19	0.29	0.34	0.01	0.85	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.23	0.25	0.13	0.16	0.14	0.17	0.16	0.13	0.13	0.15	0.23	0.16	0.13	0.27	0.32	0.13	0.26	0.33	0.42	0.30
C2	0.14	0.12	0.22	0.24	0.12	0.15	0.14	0.16	0.17	0.13	0.13	0.13	0.24	0.15	0.12	0.24	0.30	0.12	0.25	0.31	0.40	0.28
C2'	0.34	0.31	0.39	0.38	0.30	0.34	0.27	0.28	0.26	0.28	0.27	0.33	0.28	0.27	0.30	0.44	0.44	0.33	0.22	0.21	0.26	0.20
C3'	0.43	0.38	0.40	0.39	0.40	0.42	0.40	0.38	0.39	0.42	0.37	0.40	0.41	0.42	0.41	0.43	0.41	0.45	0.31	0.28	0.31	0.30
C4	0.13	0.14	0.20	0.22	0.12	0.14	0.14	0.15	0.16	0.13	0.12	0.14	0.23	0.16	0.12	0.23	0.27	0.12	0.25	0.32	0.42	0.29
C4'	0.16	0.15	0.17	0.17	0.14	0.13	0.16	0.12	0.17	0.16	0.13	0.16	0.25	0.19	0.14	0.22	0.24	0.18	0.16	0.23	0.34	0.20
C5	0.13	0.15	0.16	0.18	0.12	0.12	0.14	0.16	0.15	0.14	0.13	0.14	0.22	0.17	0.12	0.20	0.22	0.13	0.25	0.33	0.43	0.31
C5'	0.20	0.17	0.16	0.16	0.18	0.17	0.23	0.16	0.23	0.24	0.18	0.18	0.31	0.27	0.20	0.22	0.21	0.24	0.17	0.26	0.34	0.22
C6	0.13	0.15	0.15	0.17	0.12	0.12	0.14	0.16	0.15	0.14	0.13	0.14	0.23	0.17	0.12	0.18	0.21	0.13	0.25	0.33	0.43	0.31
C8	0.13	0.15	0.17	0.19	0.12	0.13	0.14	0.15	0.15	0.14	0.13	0.15	0.21	0.17	0.12	0.22	0.24	0.13	0.25	0.33	0.43	0.31
N1	0.13	0.14	0.17	0.20	0.12	0.13	0.14	0.16	0.16	0.13	0.12	0.13	0.24	0.16	0.12	0.20	0.24	0.12	0.25	0.31	0.41	0.29
N2	0.15	0.10	0.25	0.28	0.12	0.18	0.14	0.18	0.18	0.13	0.15	0.12	0.24	0.15	0.13	0.26	0.35	0.14	0.26	0.32	0.39	0.28
N3	0.14	0.12	0.22	0.25	0.12	0.16	0.14	0.16	0.17	0.13	0.13	0.13	0.24	0.16	0.12	0.25	0.31	0.12	0.25	0.32	0.41	0.28
N7	0.13	0.16	0.15	0.17	0.12	0.12	0.14	0.16	0.14	0.15	0.13	0.14	0.21	0.17	0.12	0.19	0.21	0.13	0.25	0.34	0.43	0.32
N9	0.14	0.14	0.20	0.22	0.12	0.14	0.14	0.15	0.15	0.14	0.13	0.14	0.23	0.16	0.12	0.24	0.28	0.12	0.24	0.32	0.42	0.29
O2'	0.26	0.22	0.34	0.33	0.20	0.26	0.17	0.23	0.18	0.18	0.18	0.25	0.23	0.17	0.21	0.40	0.42	0.25	0.24	0.27	0.36	0.26
O3'	0.55	0.47	0.48	0.46	0.49	0.53	0.48	0.51	0.45	0.51	0.43	0.50	0.45	0.50	0.52	0.52	0.45	0.58	0.42	0.39	0.40	0.43
O4'	0.20	0.20	0.27	0.29	0.18	0.21	0.19	0.24	0.20	0.19	0.18	0.21	0.26	0.21	0.18	0.29	0.35	0.19	0.33	0.43	0.51	0.38
O5'	0.50	0.52	0.54	0.60	0.52	0.53	0.55	0.57	0.55	0.55	0.54	0.52	0.58	0.56	0.52	0.49	0.64	0.50	0.67	0.73	0.81	0.68
O6	0.14	0.16	0.13	0.16	0.13	0.14	0.15	0.19	0.15	0.16	0.14	0.14	0.22	0.18	0.14	0.16	0.18	0.15	0.27	0.36	0.45	0.34
OP1	0.87	0.85	0.84	0.85	0.86	0.86	0.85	0.87	0.84	0.87	0.84	0.86	0.83	0.87	0.87	0.83	0.84	0.89	0.87	0.91	0.96	0.90
OP2	1.06	1.01	1.01	1.11	1.11	1.11	1.21	1.21	1.21	1.24	1.10	1.01	1.31	1.29	1.14	0.90	1.08	1.11	1.32	1.42	1.55	1.39
P	0.74	0.73	0.73	0.80	0.76	0.77	0.80	0.83	0.80	0.81	0.76	0.73	0.83	0.83	0.77	0.66	0.81	0.76	0.91	0.99	1.08	0.95

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.13	0.13	0.13
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.16	0.04	0.18	0.21	0.30	0.21
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.10	0.06	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.11	0.15	0.07
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.12	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.14	0.18	0.20	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.17	0.19	0.25	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.05	0.08	0.10	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.06	0.06
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.23	0.26	0.33	0.26
C5'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.07	0.18	0.19	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.25	0.30	0.39	0.30
C8	0.02	0.02	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.17	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.22	0.22	0.23	0.22
N1	0.04	0.00	0.09	0.13	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.13	0.16	0.04	0.22	0.27	0.37	0.26
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.14	0.04	0.15	0.17	0.24	0.17
N6	0.03	0.01	0.06	0.13	0.02	0.08	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.16	0.03	0.28	0.36	0.45	0.35
N7	0.02	0.02	0.04	0.12	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.26	0.29	0.34	0.29
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.15	0.16	0.18	0.15
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.09	0.04	0.13	0.13	0.09	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.09	0.11	0.07
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.15	0.13	0.16	0.14	0.16	0.14	0.07	0.05	0.00	0.02	0.20	0.28	0.29	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.21	0.20	0.21
O5'	0.08	0.18	0.09	0.14	0.17	0.02	0.23	0.01	0.25	0.22	0.22	0.15	0.28	0.26	0.15	0.07	0.20	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.21	0.11	0.18	0.19	0.09	0.26	0.09	0.30	0.22	0.27	0.17	0.36	0.29	0.16	0.09	0.28	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.30	0.15	0.20	0.25	0.06	0.33	0.03	0.39	0.23	0.37	0.24	0.45	0.34	0.18	0.11	0.29	0.20	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.21	0.07	0.14	0.19	0.06	0.26	0.01	0.30	0.22	0.26	0.17	0.35	0.29	0.15	0.07	0.22	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00