Doublet Group distance statistics: 52644

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 4, 2, 1, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.037 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.001, 0.021, 0.042, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.021 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.011, 0.038, 0.064, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.038 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.007, 0.034, 0.061, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.034 std_dev=0.027
N1	B	0, 0.129, 0.368, 0.608, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.368 std_dev=0.239
C2	B	0, 0.149, 0.406, 0.662, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.406 std_dev=0.256
O4'	A	0, -0.083, 0.176, 0.435, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.176 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.151, 0.423, 0.696, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.423 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.201, 0.476, 0.752, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.476 std_dev=0.276
C2'	A	0, -0.049, 0.233, 0.514, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.233 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.136, 0.423, 0.709, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.423 std_dev=0.286
C5	B	0, 0.213, 0.515, 0.817, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.515 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.278, 0.590, 0.902, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.590 std_dev=0.312
N9	B	0, 0.266, 0.583, 0.900, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.583 std_dev=0.317
N6	B	0, 0.135, 0.459, 0.783, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.459 std_dev=0.324
O4'	B	0, 0.249, 0.646, 1.043, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.646 std_dev=0.397
C8	B	0, 0.307, 0.704, 1.102, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.704 std_dev=0.398
N7	B	0, 0.276, 0.678, 1.081, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.678 std_dev=0.403
C3'	A	0, -0.141, 0.306, 0.754, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.306 std_dev=0.448
C4'	A	0, -0.065, 0.385, 0.834, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.385 std_dev=0.449
C2'	B	0, 0.243, 0.728, 1.213, 2.040 max_d=2.040 avg_d=0.728 std_dev=0.485
O2'	A	0, -0.104, 0.390, 0.885, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.390 std_dev=0.494
O2'	B	0, 0.226, 0.758, 1.289, 2.260 max_d=2.260 avg_d=0.758 std_dev=0.532
C4'	B	0, 0.204, 0.769, 1.333, 2.312 max_d=2.312 avg_d=0.769 std_dev=0.565
C5'	A	0, 0.082, 0.686, 1.290, 2.652 max_d=2.652 avg_d=0.686 std_dev=0.604
C3'	B	0, 0.181, 0.840, 1.499, 2.812 max_d=2.812 avg_d=0.840 std_dev=0.659
O5'	A	0, -0.014, 0.650, 1.314, 2.827 max_d=2.827 avg_d=0.650 std_dev=0.664
O3'	A	0, -0.294, 0.390, 1.074, 2.791 max_d=2.791 avg_d=0.390 std_dev=0.684
C5'	B	0, 0.083, 0.882, 1.681, 3.320 max_d=3.320 avg_d=0.882 std_dev=0.799
OP2	B	0, 0.065, 0.899, 1.734, 3.521 max_d=3.521 avg_d=0.899 std_dev=0.834
O3'	B	0, 0.107, 0.957, 1.808, 3.669 max_d=3.669 avg_d=0.957 std_dev=0.851
OP1	B	0, 0.062, 0.939, 1.815, 3.622 max_d=3.622 avg_d=0.939 std_dev=0.876
P	B	0, 0.040, 0.916, 1.793, 3.659 max_d=3.659 avg_d=0.916 std_dev=0.877
O5'	B	0, -0.005, 0.919, 1.844, 3.901 max_d=3.901 avg_d=0.919 std_dev=0.925
P	A	0, -0.405, 0.896, 2.197, 5.241 max_d=5.241 avg_d=0.896 std_dev=1.301
OP2	A	0, -0.224, 1.207, 2.638, 5.626 max_d=5.626 avg_d=1.207 std_dev=1.431
OP1	A	0, -0.413, 1.215, 2.843, 6.418 max_d=6.418 avg_d=1.215 std_dev=1.628

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.20	0.00	0.17	0.02	0.16	0.31	0.17
C2	0.05	0.00	0.20	0.18	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.17	0.10	0.32	0.02	0.14	0.67	0.45
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.13	0.08	0.09	0.15	0.23	0.20	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.06	0.40	0.24	0.21
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.17	0.00	0.20	0.02	0.22	0.16	0.21	0.17	0.16	0.20	0.13	0.02	0.00	0.01	0.13	0.23	0.45	0.18	0.15
C4	0.02	0.01	0.10	0.17	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.05	0.36	0.01	0.20	0.69	0.50
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.07	0.09	0.07	0.11	0.05	0.18	0.02	0.00	0.01	0.08	0.32	0.22	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.07	0.02	0.46	0.01	0.42	0.88	0.69
C5'	0.05	0.09	0.13	0.02	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.16	0.11	0.09	0.08	0.17	0.10	0.08	0.12	0.01	0.01	0.16	0.11	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.10	0.04	0.47	0.01	0.45	0.94	0.73
C8	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.21	0.05	0.06	0.49	0.01	0.45	0.82	0.67
N1	0.04	0.01	0.15	0.21	0.02	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.13	0.07	0.40	0.02	0.29	0.83	0.61
N2	0.05	0.00	0.23	0.17	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.21	0.12	0.27	0.03	0.11	0.59	0.38
N3	0.05	0.00	0.20	0.16	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.18	0.10	0.28	0.02	0.10	0.57	0.37
N7	0.02	0.00	0.05	0.20	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.08	0.05	0.53	0.01	0.58	0.97	0.80
N9	0.00	0.02	0.01	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.08	0.01	0.34	0.01	0.19	0.61	0.45
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.13	0.18	0.20	0.08	0.20	0.21	0.15	0.10	0.08	0.24	0.13	0.00	0.04	0.12	0.15	0.24	0.44	0.29	0.24
O3'	0.20	0.17	0.02	0.00	0.10	0.02	0.07	0.12	0.10	0.05	0.13	0.21	0.18	0.08	0.08	0.04	0.00	0.15	0.07	0.11	0.49	0.30	0.11
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.12	0.10	0.05	0.01	0.12	0.15	0.00	0.25	0.03	0.15	0.33	0.19
O5'	0.17	0.32	0.20	0.13	0.36	0.01	0.46	0.01	0.47	0.49	0.40	0.27	0.28	0.53	0.34	0.15	0.07	0.25	0.00	0.52	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.06	0.23	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.24	0.11	0.03	0.52	0.00	0.58	1.05	0.83
OP1	0.16	0.14	0.40	0.45	0.20	0.32	0.42	0.11	0.45	0.45	0.29	0.11	0.10	0.58	0.19	0.44	0.49	0.15	0.01	0.58	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.67	0.24	0.18	0.69	0.22	0.88	0.19	0.94	0.82	0.83	0.59	0.57	0.97	0.61	0.29	0.30	0.33	0.01	1.05	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.45	0.21	0.15	0.50	0.09	0.69	0.01	0.73	0.67	0.61	0.38	0.37	0.80	0.45	0.24	0.11	0.19	0.00	0.83	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.25	0.29	0.23	0.17	0.17	0.18	0.17	0.20	0.18	0.20	0.23	0.29	0.22	0.17	0.36	0.31	0.18	0.19	0.22	0.35	0.21
C2	0.17	0.24	0.30	0.26	0.16	0.17	0.15	0.13	0.18	0.14	0.19	0.22	0.27	0.17	0.15	0.34	0.34	0.14	0.13	0.25	0.43	0.26
C2'	0.30	0.36	0.45	0.36	0.24	0.24	0.14	0.16	0.15	0.15	0.25	0.36	0.21	0.15	0.22	0.55	0.45	0.19	0.15	0.26	0.40	0.25
C3'	0.39	0.38	0.51	0.44	0.33	0.34	0.25	0.26	0.22	0.28	0.29	0.40	0.18	0.24	0.33	0.59	0.51	0.30	0.22	0.43	0.59	0.42
C4	0.17	0.24	0.26	0.22	0.16	0.15	0.16	0.13	0.18	0.15	0.20	0.22	0.26	0.19	0.15	0.32	0.28	0.15	0.14	0.24	0.38	0.22
C4'	0.26	0.27	0.37	0.30	0.21	0.23	0.17	0.17	0.16	0.18	0.20	0.27	0.19	0.17	0.21	0.44	0.37	0.20	0.16	0.32	0.47	0.31
C5	0.17	0.23	0.23	0.20	0.16	0.15	0.16	0.13	0.17	0.15	0.19	0.21	0.24	0.18	0.15	0.27	0.24	0.15	0.15	0.26	0.38	0.23
C5'	0.30	0.32	0.39	0.33	0.27	0.26	0.22	0.22	0.22	0.22	0.27	0.32	0.21	0.20	0.26	0.45	0.38	0.24	0.23	0.40	0.52	0.37
C6	0.16	0.22	0.22	0.19	0.16	0.15	0.15	0.12	0.15	0.14	0.18	0.20	0.22	0.16	0.15	0.25	0.24	0.14	0.14	0.28	0.41	0.26
C8	0.18	0.24	0.24	0.20	0.17	0.16	0.18	0.16	0.18	0.18	0.20	0.22	0.25	0.20	0.17	0.29	0.24	0.17	0.18	0.25	0.35	0.22
N1	0.16	0.23	0.25	0.22	0.15	0.15	0.14	0.12	0.16	0.13	0.18	0.21	0.24	0.15	0.14	0.28	0.29	0.13	0.13	0.28	0.44	0.28
N2	0.19	0.24	0.34	0.31	0.16	0.20	0.16	0.17	0.19	0.16	0.20	0.23	0.27	0.18	0.16	0.39	0.40	0.16	0.16	0.26	0.47	0.30
N3	0.18	0.25	0.30	0.25	0.16	0.16	0.16	0.13	0.19	0.15	0.20	0.23	0.27	0.18	0.15	0.36	0.33	0.15	0.13	0.23	0.40	0.23
N7	0.18	0.23	0.22	0.19	0.17	0.16	0.17	0.15	0.17	0.17	0.20	0.21	0.23	0.19	0.17	0.26	0.22	0.16	0.18	0.26	0.36	0.23
N9	0.18	0.25	0.26	0.21	0.17	0.15	0.17	0.14	0.19	0.17	0.20	0.23	0.26	0.20	0.16	0.32	0.28	0.16	0.16	0.23	0.35	0.21
O2'	0.17	0.28	0.18	0.13	0.25	0.22	0.37	0.35	0.40	0.37	0.32	0.24	0.55	0.46	0.25	0.29	0.18	0.30	0.43	0.29	0.25	0.30
O3'	0.29	0.24	0.38	0.32	0.22	0.27	0.20	0.24	0.19	0.25	0.19	0.25	0.24	0.24	0.25	0.44	0.38	0.25	0.22	0.35	0.52	0.35
O4'	0.19	0.23	0.27	0.22	0.18	0.17	0.18	0.16	0.20	0.18	0.21	0.22	0.26	0.20	0.17	0.33	0.28	0.18	0.18	0.23	0.36	0.22
O5'	0.47	0.52	0.59	0.52	0.45	0.41	0.41	0.34	0.41	0.41	0.47	0.51	0.36	0.38	0.44	0.63	0.59	0.37	0.30	0.59	0.70	0.53
O6	0.18	0.20	0.21	0.19	0.17	0.17	0.16	0.15	0.15	0.16	0.18	0.19	0.18	0.16	0.17	0.23	0.22	0.16	0.17	0.32	0.42	0.29
OP1	0.48	0.47	0.55	0.53	0.47	0.45	0.48	0.42	0.47	0.51	0.46	0.47	0.48	0.51	0.48	0.55	0.57	0.42	0.43	0.79	0.91	0.72
OP2	1.03	0.98	1.11	1.06	1.01	0.97	1.01	0.92	0.98	1.04	0.97	0.99	0.97	1.03	1.02	1.13	1.10	0.95	0.90	1.22	1.33	1.16
P	0.77	0.75	0.86	0.82	0.76	0.73	0.75	0.67	0.74	0.77	0.74	0.76	0.72	0.76	0.76	0.87	0.86	0.69	0.66	0.99	1.10	0.92

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.34	0.20
C2	0.05	0.00	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.22	0.06	0.13	0.26	0.51	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.09	0.12	0.16	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.14	0.20	0.10
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.12	0.15	0.16	0.09	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.03	0.10	0.23	0.49	0.30
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.07	0.06	0.05	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.06
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.11	0.31	0.52	0.33
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.04	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.12	0.03	0.13	0.35	0.53	0.35
C8	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.14	0.03	0.11	0.23	0.45	0.28
N1	0.05	0.00	0.12	0.15	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.18	0.05	0.14	0.33	0.54	0.35
N3	0.04	0.01	0.16	0.16	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.05	0.12	0.21	0.48	0.30
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.13	0.40	0.53	0.35
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.12	0.32	0.51	0.32
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.17	0.43	0.26
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.10	0.13	0.05	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.18	0.19	0.08
O3'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.10	0.01	0.08	0.02	0.12	0.14	0.18	0.20	0.11	0.12	0.04	0.03	0.00	0.01	0.07	0.36	0.12	0.14
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.32	0.20
O5'	0.03	0.13	0.04	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.13	0.11	0.14	0.12	0.13	0.12	0.07	0.03	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.26	0.14	0.21	0.23	0.12	0.31	0.12	0.35	0.23	0.33	0.21	0.40	0.32	0.17	0.18	0.36	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.51	0.20	0.10	0.49	0.14	0.52	0.04	0.53	0.45	0.54	0.48	0.53	0.51	0.43	0.19	0.12	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.33	0.10	0.06	0.30	0.06	0.33	0.01	0.35	0.28	0.35	0.30	0.35	0.32	0.26	0.08	0.14	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00