Doublet Group distance statistics: 52648

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.013, 0.024, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.003, 0.021, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.006, 0.026, 0.047, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.027, 0.052, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.052 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.004, 0.034, 0.063, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.034 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.027, 0.057, 0.087, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.057 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.026, 0.060, 0.093, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.060 std_dev=0.033
C2	B	0, 0.212, 0.384, 0.557, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.384 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.144, 0.334, 0.523, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.334 std_dev=0.189
C6	B	0, 0.153, 0.357, 0.561, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.357 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.268, 0.477, 0.686, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.477 std_dev=0.209
C4	B	0, 0.227, 0.458, 0.688, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.458 std_dev=0.230
C5	B	0, 0.158, 0.393, 0.629, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.393 std_dev=0.235
N6	B	0, 0.231, 0.483, 0.735, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.483 std_dev=0.252
N7	B	0, 0.228, 0.518, 0.808, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.518 std_dev=0.290
N9	B	0, 0.277, 0.594, 0.912, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.594 std_dev=0.317
C8	B	0, 0.256, 0.594, 0.932, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.594 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.352, 0.747, 1.141, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.747 std_dev=0.395
O4'	B	0, 0.390, 0.846, 1.303, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.846 std_dev=0.457
C2'	B	0, 0.324, 0.798, 1.272, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.798 std_dev=0.474
C4'	B	0, 0.413, 0.912, 1.411, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.912 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.464, 0.965, 1.465, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.965 std_dev=0.501
C3'	B	0, 0.358, 0.861, 1.364, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.861 std_dev=0.503
O2'	B	0, 0.379, 0.906, 1.433, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.906 std_dev=0.527
C5'	B	0, 0.461, 0.997, 1.532, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.997 std_dev=0.536
P	B	0, 0.459, 1.020, 1.582, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.020 std_dev=0.561
OP2	B	0, 0.438, 1.000, 1.563, 1.638 max_d=1.638 avg_d=1.000 std_dev=0.563
O3'	B	0, 0.348, 0.943, 1.538, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.943 std_dev=0.595
O4'	A	0, 0.012, 0.640, 1.268, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.640 std_dev=0.628
C2'	A	0, 0.030, 0.665, 1.300, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.665 std_dev=0.635
OP1	B	0, 0.554, 1.331, 2.108, 2.382 max_d=2.382 avg_d=1.331 std_dev=0.777
O2'	A	0, -0.002, 0.947, 1.896, 2.237 max_d=2.237 avg_d=0.947 std_dev=0.949
C3'	A	0, 0.064, 1.013, 1.962, 2.486 max_d=2.486 avg_d=1.013 std_dev=0.949
C4'	A	0, 0.041, 1.002, 1.964, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.002 std_dev=0.961
O3'	A	0, 0.151, 1.408, 2.665, 3.100 max_d=3.100 avg_d=1.408 std_dev=1.257
C5'	A	0, 0.101, 1.421, 2.740, 3.528 max_d=3.528 avg_d=1.421 std_dev=1.319
O5'	A	0, 0.212, 1.643, 3.074, 3.509 max_d=3.509 avg_d=1.643 std_dev=1.431
OP2	A	0, 0.685, 2.313, 3.941, 4.123 max_d=4.123 avg_d=2.313 std_dev=1.628
P	A	0, 0.420, 2.420, 4.420, 4.616 max_d=4.616 avg_d=2.420 std_dev=2.000
OP1	A	0, 0.664, 3.195, 5.727, 6.050 max_d=6.050 avg_d=3.195 std_dev=2.532

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.10	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.31	0.01	0.18	0.03	0.26	0.28	0.17
C2	0.06	0.00	0.38	0.30	0.02	0.15	0.02	0.22	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.30	0.35	0.29	0.24	0.04	0.44	0.35	0.25
C2'	0.01	0.38	0.00	0.00	0.20	0.02	0.10	0.23	0.18	0.18	0.30	0.46	0.37	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.38	0.13	0.46	0.49	0.36
C3'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.29	0.01	0.37	0.03	0.38	0.34	0.35	0.30	0.26	0.40	0.24	0.01	0.01	0.02	0.23	0.42	0.58	0.28	0.32
C4	0.03	0.02	0.20	0.29	0.00	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.17	0.15	0.25	0.02	0.41	0.35	0.26
C4'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.08	0.24	0.09	0.22	0.15	0.21	0.08	0.31	0.03	0.00	0.03	0.11	0.24	0.18	0.06
C5	0.02	0.02	0.10	0.37	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.32	0.13	0.07	0.34	0.02	0.50	0.47	0.37
C5'	0.10	0.22	0.23	0.03	0.13	0.01	0.14	0.00	0.16	0.21	0.18	0.28	0.21	0.21	0.09	0.09	0.21	0.02	0.02	0.19	0.08	0.20	0.03
C6	0.03	0.02	0.18	0.38	0.02	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.32	0.17	0.13	0.34	0.01	0.55	0.53	0.41
C8	0.02	0.03	0.18	0.34	0.01	0.24	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.43	0.18	0.18	0.36	0.03	0.42	0.40	0.33
N1	0.04	0.01	0.30	0.35	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.27	0.25	0.23	0.28	0.04	0.51	0.45	0.34
N2	0.07	0.00	0.46	0.30	0.02	0.22	0.02	0.28	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.39	0.46	0.35	0.25	0.06	0.44	0.33	0.23
N3	0.05	0.01	0.37	0.26	0.01	0.15	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.28	0.36	0.29	0.23	0.03	0.39	0.30	0.22
N7	0.02	0.03	0.09	0.40	0.01	0.21	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.44	0.22	0.10	0.42	0.03	0.53	0.52	0.43
N9	0.01	0.03	0.02	0.24	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.22	0.07	0.01	0.22	0.02	0.34	0.31	0.22
O2'	0.01	0.30	0.01	0.01	0.21	0.31	0.32	0.09	0.32	0.43	0.27	0.39	0.28	0.44	0.22	0.00	0.04	0.21	0.30	0.38	0.49	0.54	0.31
O3'	0.31	0.35	0.02	0.01	0.17	0.03	0.13	0.21	0.17	0.18	0.25	0.46	0.36	0.22	0.07	0.04	0.00	0.23	0.33	0.20	0.99	0.56	0.61
O4'	0.01	0.29	0.02	0.02	0.15	0.00	0.07	0.02	0.13	0.18	0.23	0.35	0.29	0.10	0.01	0.21	0.23	0.00	0.11	0.10	0.14	0.27	0.15
O5'	0.18	0.24	0.38	0.23	0.25	0.03	0.34	0.02	0.34	0.36	0.28	0.25	0.23	0.42	0.22	0.30	0.33	0.11	0.00	0.40	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.04	0.13	0.42	0.02	0.11	0.02	0.19	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.02	0.38	0.20	0.10	0.40	0.00	0.63	0.63	0.49
OP1	0.26	0.44	0.46	0.58	0.41	0.24	0.50	0.08	0.55	0.42	0.51	0.44	0.39	0.53	0.34	0.49	0.99	0.14	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.35	0.49	0.28	0.35	0.18	0.47	0.20	0.53	0.40	0.45	0.33	0.30	0.52	0.31	0.54	0.56	0.27	0.01	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.25	0.36	0.32	0.26	0.06	0.37	0.03	0.41	0.33	0.34	0.23	0.22	0.43	0.22	0.31	0.61	0.15	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.21	0.23	0.21	0.20	0.25	0.14	0.29	0.14	0.16	0.13	0.25	0.23	0.16	0.21	0.29	0.20	0.29	0.36	0.32	0.36	0.31
C2	0.25	0.18	0.20	0.20	0.17	0.22	0.13	0.28	0.15	0.16	0.10	0.23	0.26	0.15	0.20	0.23	0.19	0.25	0.39	0.35	0.34	0.32
C2'	0.52	0.43	0.60	0.57	0.40	0.52	0.29	0.46	0.25	0.33	0.30	0.48	0.23	0.26	0.42	0.68	0.62	0.48	0.54	0.39	0.28	0.35
C3'	0.57	0.47	0.57	0.55	0.48	0.56	0.42	0.53	0.39	0.46	0.39	0.52	0.40	0.42	0.50	0.64	0.55	0.56	0.61	0.50	0.42	0.48
C4	0.24	0.22	0.19	0.19	0.19	0.22	0.14	0.28	0.14	0.16	0.12	0.24	0.24	0.16	0.20	0.23	0.17	0.25	0.37	0.34	0.36	0.32
C4'	0.36	0.27	0.34	0.31	0.25	0.33	0.15	0.34	0.11	0.19	0.14	0.32	0.17	0.14	0.28	0.43	0.30	0.36	0.41	0.37	0.39	0.35
C5	0.22	0.25	0.18	0.17	0.19	0.21	0.15	0.28	0.15	0.16	0.16	0.25	0.23	0.17	0.19	0.22	0.15	0.23	0.37	0.34	0.38	0.33
C5'	0.38	0.32	0.38	0.35	0.29	0.36	0.18	0.38	0.15	0.22	0.20	0.36	0.18	0.17	0.31	0.44	0.35	0.37	0.47	0.44	0.44	0.41
C6	0.22	0.26	0.18	0.17	0.19	0.20	0.15	0.27	0.14	0.17	0.17	0.25	0.23	0.18	0.19	0.22	0.15	0.22	0.36	0.35	0.38	0.33
C8	0.24	0.25	0.19	0.18	0.20	0.22	0.16	0.29	0.16	0.17	0.17	0.26	0.23	0.18	0.20	0.23	0.16	0.25	0.37	0.35	0.39	0.34
N1	0.22	0.23	0.18	0.18	0.18	0.20	0.13	0.27	0.14	0.16	0.10	0.24	0.25	0.16	0.19	0.22	0.16	0.22	0.37	0.34	0.36	0.32
N2	0.26	0.12	0.22	0.22	0.16	0.23	0.13	0.28	0.18	0.16	0.17	0.20	0.27	0.15	0.20	0.24	0.22	0.26	0.39	0.35	0.31	0.30
N3	0.25	0.18	0.21	0.21	0.18	0.23	0.13	0.28	0.14	0.16	0.10	0.23	0.25	0.15	0.20	0.24	0.20	0.26	0.39	0.34	0.34	0.32
N7	0.22	0.26	0.18	0.17	0.20	0.21	0.17	0.29	0.17	0.17	0.19	0.25	0.23	0.19	0.20	0.21	0.15	0.23	0.37	0.36	0.40	0.35
N9	0.25	0.22	0.20	0.19	0.19	0.23	0.15	0.28	0.15	0.16	0.14	0.25	0.24	0.16	0.20	0.24	0.17	0.26	0.37	0.34	0.37	0.33
O2'	0.41	0.29	0.45	0.41	0.30	0.40	0.29	0.36	0.31	0.30	0.26	0.33	0.42	0.31	0.32	0.56	0.48	0.42	0.33	0.25	0.37	0.29
O3'	0.59	0.43	0.57	0.52	0.42	0.57	0.30	0.51	0.24	0.37	0.29	0.50	0.22	0.29	0.46	0.70	0.53	0.58	0.46	0.39	0.36	0.38
O4'	0.44	0.37	0.41	0.38	0.36	0.42	0.30	0.45	0.27	0.33	0.28	0.41	0.29	0.31	0.39	0.46	0.37	0.44	0.47	0.49	0.53	0.47
O5'	0.50	0.46	0.46	0.46	0.43	0.48	0.36	0.54	0.32	0.39	0.36	0.49	0.30	0.34	0.45	0.49	0.44	0.50	0.67	0.59	0.56	0.58
O6	0.22	0.28	0.20	0.18	0.21	0.21	0.18	0.27	0.17	0.19	0.23	0.25	0.21	0.20	0.20	0.24	0.17	0.22	0.34	0.35	0.39	0.34
OP1	1.02	0.86	0.90	0.86	0.87	0.97	0.75	0.97	0.67	0.83	0.71	0.93	0.57	0.73	0.91	0.99	0.80	1.04	1.02	0.87	0.76	0.89
OP2	0.65	0.60	0.57	0.61	0.60	0.65	0.55	0.71	0.53	0.58	0.54	0.63	0.55	0.55	0.61	0.57	0.58	0.67	0.87	0.71	0.66	0.73
P	0.56	0.50	0.49	0.50	0.49	0.54	0.41	0.60	0.39	0.45	0.41	0.54	0.38	0.40	0.50	0.51	0.47	0.58	0.74	0.63	0.59	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.22	0.05
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.02	0.02	0.03	0.11	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.14	0.13	0.07	0.26	0.20	0.23	0.17
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.09	0.06	0.10	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.22	0.07
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.12	0.08	0.10	0.07	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.15	0.18	0.08
C4	0.02	0.02	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.06	0.04	0.26	0.17	0.20	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.05	0.02	0.12	0.12	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.15	0.15	0.03
C5	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.19	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.08	0.05	0.05	0.33	0.24	0.24	0.22
C5'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.12	0.01	0.19	0.00	0.20	0.20	0.16	0.08	0.24	0.23	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.06	0.01
C6	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.08	0.02	0.20	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.10	0.06	0.07	0.34	0.27	0.29	0.27
C8	0.03	0.03	0.09	0.12	0.01	0.12	0.02	0.20	0.03	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.31	0.20	0.21	0.17
N1	0.04	0.01	0.06	0.08	0.02	0.05	0.02	0.16	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.12	0.10	0.07	0.31	0.25	0.26	0.23
N3	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.13	0.13	0.06	0.22	0.16	0.19	0.12
N6	0.06	0.03	0.06	0.07	0.04	0.12	0.03	0.24	0.01	0.07	0.03	0.03	0.00	0.07	0.06	0.11	0.06	0.09	0.37	0.34	0.37	0.34
N7	0.03	0.03	0.07	0.11	0.01	0.12	0.01	0.23	0.03	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.07	0.11	0.05	0.37	0.26	0.25	0.25
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.03	0.11	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.22	0.14	0.20	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.08	0.04	0.08	0.05	0.10	0.07	0.12	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.03	0.04	0.04	0.16	0.20	0.04
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.13	0.10	0.13	0.06	0.11	0.03	0.03	0.00	0.01	0.13	0.21	0.16	0.11
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.10	0.24	0.10
O5'	0.12	0.26	0.05	0.06	0.26	0.02	0.33	0.01	0.34	0.31	0.31	0.22	0.37	0.37	0.22	0.04	0.13	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.10	0.20	0.13	0.15	0.17	0.15	0.24	0.17	0.27	0.20	0.25	0.16	0.34	0.26	0.14	0.16	0.21	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.23	0.22	0.18	0.20	0.15	0.24	0.06	0.29	0.21	0.26	0.19	0.37	0.25	0.20	0.20	0.16	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.17	0.07	0.08	0.14	0.03	0.22	0.01	0.27	0.17	0.23	0.12	0.34	0.25	0.09	0.04	0.11	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00